基因總覽
BRPF3（bromodomain and PHD finger containing 3）是蛋白質編碼基因，其產物為 Bromodomain and PHD finger-containing protein 3。蛋白質具有多種辨識與結構相關區域，包括一個 Bromo domain、兩個 PHD-type zinc finger、一個 C2HC pre-PHD-type zinc finger，以及一個 PWWP domain；另有數段被註記為無序區。這些結構特色構成其蛋白質架構。來源將 BRPF3 描述為多種組蛋白乙醯轉移酶複合體的支架亞基；其主要角色與組蛋白 H3 乙醯化及 DNA 複製起始有關，具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000357641 ★ | 36,196,744–36,232,790 | 13 |
| ENST00000968964 | 36,196,006–36,232,790 | 13 |
| ENST00000339717 | 36,196,554–36,232,790 | 11 |
| ENST00000534694 | 36,196,554–36,232,790 | 9 |
| ENST00000926623 | 36,196,554–36,232,790 | 12 |
| ENST00000926624 | 36,196,554–36,232,790 | 13 |
| ENST00000926625 | 36,196,554–36,232,790 | 12 |
| ENST00000968965 | 36,196,554–36,232,790 | 10 |
| ENST00001056892 | 36,196,554–36,232,790 | 12 |
| ENST00001133407 | 36,196,554–36,232,790 | 13 |
| ENST00000926626 | 36,197,385–36,232,790 | 13 |
| ENST00000926627 | 36,197,385–36,232,790 | 13 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BRPF3 是多種組蛋白乙醯轉移酶（HAT）複合體的支架亞基，參與 MOZ/MORF 與 HBO1 複合體。這些複合體具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性；來源亦特別指出 BRPF3 是 MOZ/MORF 複合體的組成部分，而該複合體具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性。作為支架亞基，BRPF3 的功能與複合體組成及其組蛋白修飾作用相連。
BRPF3 也參與 DNA 複製起始。它能引導 KAT7/HBO1 將乙醯化作用的特異性導向組蛋白 H3 的 Lys-14，形成 H3K14ac。這項修飾與複製起點的活化相連，因而有助於 DNA 複製起始。來源所描述的作用方向是 BRPF3 協助 KAT7/HBO1 偏向 H3K14 乙醯化，進而促進複製起點活化；未進一步提供其他調控步驟或條件。
因此，BRPF3 的功能涵蓋兩個相互關聯的層面：參與具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性的複合體，以及協助 KAT7/HBO1 的修飾特異性連結至 DNA 複製起始所需的複製起點活化。
Promoter 與基因調控
>BRPF3 ENST00000357641 GRCh38 chr6:36195744-36196844 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAGGCAAAAGGGGGTGGCAATGGAGCCCTTTTCTTTATTTTTTTGTTTTTTTAGATCAAAACAAAAGCC AGTTTGGTCTGATGCTGCCATTTGTCAAGCATCTTTTAGAAAGCCGCCTAATGCATTAAATTAACCAAGT CAGGTTTAAAGTGTTTCCCATGCCCACAGTGACAGACGAGTTACCAGGCATGCTTAAGCAGACTGTCAAA CTTTTGTTTACTCCTTTTAAACGGAAAGTCAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGATGTGTGGTGCGGA ACAAGACGCTCACCTGTACACAACAAAGGCAGGTCTTTCCCGGCTGTCCTCACTGGGGGAGGGGATGGAC AATCGCTAGACCTTTGTCCTCAGGTCCTGGGCATGGGGGTTAGGGGAGACGCGACTTTCTGGGAGTCGTG CAGGCACCTGCAGTCAAGAAACTACATATTGGTTTTGACCTCAATGACTGCCCTGGCTTAACCTTTGGAG AGGCCCTTTAGTTCGGGGAGGGGGCTTGCTGCTCCAAACCGTAGCCACGTCACCCACAAGGACTGGGGAG GAAATGACTGACCGCTCAAGAGTCAGGGACCCCTGTCTCTCCCAACTAGACCCGAACGTCCACAGCCCTC TTATCGGGCTCGCCCCGTGGCGGGCAGGGCCGTGGTGCGCAGGGATCGCGGCGGGCGCAGACCCGGTCTC TTGCTCGGTGTCCCCGCCGCGCCCGCACCGCCACCGTGAGGCCGAGCCGGGGATGGTGCCCCGTGGCGGC GGCGGCGGCGCCTCCGCGCTCCTCTCCGCACCGCCCCGGCCGCCGCCGCGCCAGGCACGGGCGGGGGGAT TTTTTTCCCGTTTCCCCCTCTTTCGCGCTCTCGCTCCTGTTCAGCGGGAGAGCCCGCAGAGTCAGGGAGG GAGCGAGGGAAGGGGTGGAGGTGGCGGGGGGAGGCCGGAGGGGCGGATCCTGCCTGGGGGCTGATCCCTC CCTCCCCTCGGCCGGGCTCCGTGGCGGCAGCGGCAGCAGCGGCGGCTCCATTCCCCCTCCTCCCCCGGGA GCGGCGGCGGCGGCCGGGCCGGGGCCCCAGCGCGGGCCGGGAGGGGGCACG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BRPF3_1 ↗ | 6:36,196,773 | 正股 | 36,196,724–36,196,783 |
| BRPF3_2 ↗ | 6:36,197,340 | 正股 | 36,197,291–36,197,350 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_5BHTBH · CTCF_binding_site · 36195214–36195235 · regulatory
ENSR6_B96XN · enhancer · 36195708–36196283 · regulatory
ENSR6_B96XR · promoter · 36196284–36196976 · regulatory
ENSR6_668X96 · CTCF_binding_site · 36196468–36196517 · regulatory
ENSR6_5BHTKX · CTCF_binding_site · 36196826–36196847 · regulatory
ENSR6_833PSD · enhancer · 36196977–36197192 · regulatory
ENSR6_9JCWR · promoter · 36197193–36197693 · regulatory
· motif · 36195200–36195211 · motif
· motif · 36195216–36195232 · motif
· motif · 36196100–36196114 · motif
· motif · 36196101–36196114 · motif
· motif · 36196198–36196205 · motif
· motif · 36196275–36196292 · motif
· motif · 36196470–36196486 · motif
· motif · 36196498–36196514 · motif
· motif · 36196552–36196565 · motif
· motif · 36196782–36196795 · motif
· motif · 36196782–36196795 · motif
· motif · 36196791–36196804 · motif
· motif · 36196794–36196807 · motif
· motif · 36196828–36196844 · motif
· motif · 36196972–36196982 · motif
· motif · 36196983–36196996 · motif
· motif · 36196998–36197011 · motif
· motif · 36197004–36197017 · motif
· motif · 36197080–36197093 · motif
· motif · 36197110–36197123 · motif
· motif · 36197145–36197158 · motif
· motif · 36197182–36197192 · motif
· motif · 36197229–36197239 · motif
· motif · 36197231–36197244 · motif
· motif · 36197240–36197250 · motif
· motif · 36197273–36197283 · motif
· motif · 36197296–36197309 · motif
· motif · 36197296–36197309 · motif
· motif · 36197428–36197438 · motif
· motif · 36197728–36197739 · motif
· motif · 36197844–36197859 · motif
· motif · 36198000–36198012 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1205 aa
Bromodomain and PHD finger-containing protein 3 長 1,205 個胺基酸。其註解包含 Bromo domain（589–693）、PWWP domain（1076–1159）、兩個 PHD-type zinc finger（212–262、323–387），以及 C2HC pre-PHD-type zinc finger（266–299）。另有多段區域被註記為無序區，包括 1–27、75–121、387–472、779–897、907–926 與 931–1015。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BRPF3 的細胞定位註記為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊，也未區分異構型的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- NCK1P16333 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFE2L2Q16236 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACTR3P61158 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADRB2P07550 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHATP28329-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIN2CQ14957 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HRASP01112 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPA5P11021 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMNAP02545 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCP1P17987 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSG101Q99816 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q9Y649Q9Y649 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BRPF3 是部分 HBO1 複合體的組成成分；該複合體由 KAT7/HBO1、MEAF6、ING4 或 ING5，以及 BRPF3 組成。它也可作為 MOZ/MORF 複合體的成員；該複合體至少包含 ING5、KAT6A、KAT6B、MEAF6，以及 BRPF1、BRD1/BRPF2 或 BRPF3 其中之一。此外，BRPF3 與 KAT7/HBO1 有直接交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BRPF3 是多種組蛋白乙醯轉移酶（HAT）複合體的支架亞基，例如具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性的 MOZ/MORF 與 HBO1 複合體。它也參與 DNA 複製起始，透過引導 KAT7/HBO1 將作用特異性轉向組蛋白 H3 Lys-14 乙醯化（H3K14ac），促進複製起點活化；BRPF3 亦為具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性的 MOZ/MORF 複合體成員。 | 含實驗來源 | 證據與來源Scaffold subunit of various histone acetyltransferase (HAT) complexes, such as the MOZ/MORF and HBO1 complexes, which have a histone H3 acetyltransferase activity. Plays a role in DNA replication initiation by directing KAT7/HBO1 specificity towards histone H3 'Lys-14' acetylation (H3K14ac), thereby facilitating the activation of replication origins. Component of the MOZ/MORF complex which has a histone H3 acetyltransferase activity PMID 16387653 ↗ · PMID 26620551 ↗ · PMID 26677226 ↗ |
| 交互作用 | BRPF3 是部分 HBO1 複合體的成分，該複合體由 KAT7/HBO1、MEAF6、ING4 或 ING5，以及 BRPF3 組成。它也可成為 MOZ/MORF 複合體成員；該複合體至少包含 ING5、KAT6A、KAT6B、MEAF6，並由 BRPF1、BRD1/BRPF2 或 BRPF3 擇一組成。此外，BRPF3 與 KAT7/HBO1 直接交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of some HBO1 complex composed of KAT7/HBO1, MEAF6, ING4 or ING5, and BRPF3. Component of the MOZ/MORF complex composed at least of ING5, KAT6A, KAT6B, MEAF6 and one of BRPF1, BRD1/BRPF2 and BRPF3. Interacts with KAT7/HBO1; the interaction is direct PMID 16387653 ↗ · PMID 18794358 ↗ · PMID 26620551 ↗ · PMID 26677226 ↗ |
| 細胞定位 | BRPF3 的細胞定位為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGGCGGCAGCGGCAGCAGCGGCGGCTCCATTCCCCCTCC40TCCCCCGGGAGCGGCGGCGGCGGCCGGGCCGGGGCCCCAG80CGCGGGCCGGGAGGGGGCACGGCGGAGGCCACGGAGGCAG120GCGCGGGAGAAGACCGCGCTCCGCTTCCCGGGCCGCGCCG160ACCTGCTCGGCGGCCTGCCCGCCCGCGCCCAGGGGCCCCG200AACGGTGGGGCCGGGCAGGCGGCTGAGGCCTGTCCCCTCA240GTTCCCAGGTGCCATGAGGAAGCCTCGTCGGAAGTCCCGG280CAGAATGCCGAGGGCCGGCGTTCCCCGTCCCCCTACAGTC320TCAAGTGCTCACCCACCCGGGAGACCCTGACATATGCCCA360GGCCCAGCGGATTGTCGAGGTAGACATTGATGGACGCCTG400CATCGTATCAGCATCTATGACCCACTCAAAATCATTACTG440AAGATGAGCTAACTGCCCAGGATATCACCGAATGCAATAG480TAACAAGGAAAACAGTGAACAGCCTCAGTTCCCTGGCAAG520TCCAAGAAACCCTCATCCAAGGGCAAAAAGAAGGAATCCT560GCTCCAAGCATGCATCTGGTACTTCCTTCCACCTCCCACA600GCCCAGCTTCCGTATGGTGGACTCAGGCATCCAGCCAGAA640GCACCCCCGCTGCCTGCTGCCTACTACCGCTACATTGAGA680AGCCACCTGAAGACCTGGATGCAGAGGTAGAGTATGACAT720GGATGAGGAGGACCTTGCCTGGCTGGACATGGTGAATGAA760AAACGGCGAGTAGATGGGCACAGTTTGGTGTCTGCAGATA800CCTTTGAGCTGCTGGTAGACCGGCTTGAGAAAGAGTCATA840CTTGGAGAGTCGCAGCAGTGGGGCCCAACAGTCACTCATC880GATGAAGACGCTTTCTGCTGTGTGTGCCTGGATGATGAAT920GTCACAATAGCAATGTTATTCTCTTCTGTGACATCTGCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。