基因總覽
BRINP2 的正式名稱為 BMP/retinoic acid inducible neural specific 2,屬於蛋白質編碼基因。其產物屬於 BRINP family;目前提供的資料未進一步說明此家族的共同特性或 BRINP2 的組織表現情形。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361539 ★ | 177,170,958–177,282,422 | 8 |
| ENST00000907914 | 177,170,890–177,282,422 | 8 |
| ENST00000926433 | 177,170,890–177,282,422 | 9 |
| ENST00000944005 | 177,170,890–177,282,422 | 8 |
| ENST00000944008 | 177,170,890–177,282,422 | 8 |
| ENST00000944009 | 177,170,890–177,282,422 | 8 |
| ENST00001143818 | 177,170,890–177,282,422 | 8 |
| ENST00000907915 | 177,170,932–177,282,422 | 9 |
| ENST00000944006 | 177,170,932–177,282,422 | 8 |
| ENST00000944007 | 177,170,959–177,282,422 | 8 |
| ENST00000926434 | 177,181,892–177,282,422 | 9 |
| ENST00000926435 | 177,181,892–177,282,422 | 8 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
依序列相似性推定,BRINP2 可能抑制神經元細胞增殖。資料將此作用連結至細胞週期轉換的負向調控,但未提供具體受影響的細胞週期階段、分子作用方式或實驗條件,因此不宜進一步推定其調控機制。
Promoter 與基因調控
>BRINP2 ENST00000361539 GRCh38 chr1:177169958-177171058 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCCCTTCTCCTTTCCTCCCTTTTCCCTCCACCTCCCTCCCTTTTTTCCTCCCTCCCTCTCTTTCAATTC ACAGGCCCAGCAACAGCACCTGCTTCACAGAAACAAGGCTGGTCCTGTTCTGATTTCTCTAGTCTTCCTT TAAAAACTAAACGGAGATGCACAGTCCCTCTTCCTGACACACACAGAAGTGAAAGGAGACACACAGAGGG AAAACACCACAGGCAAAACAATTCCCTTTTTTGGAGGGACATTTTTGAAACTTAATCTCTCCCCAGAAAC CTGAAGTTCTCCTCTTTGCCTTTGTCCTTACAGTCCTGGTGTGGGGGCAGAATGTTTCCTGATTTAGCTG TCCTGGCCTCTAAATCTGTTTCACTCTCTAGCCATCTTACTGGGTTCTTGCTCTCTTTTGCCTCTCTCTC CTCTTGGGTCTCTGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACTATTTCTCACTTGGGG GCTCATTTCTAATTAAGTAATCCAAGAGGCTAAAAAATGCACAAAACAACCAAATGAAACCTCAAATTAG ATGGAAAATGGCTCAGATGGGTCCCAATCTCTGGGAGTTCTAGTTAAGCAAGCAAACAAAATGGGCTGGG ATAAATGATTATTGTAACTCAGGAAGATTAGAAGAAAATGTAATTAGCTCCCCAGCTACTTCTTGTTCCC CAGCCTTTTTAAGAGTGTCCAACGCCCCACCCGTGAATGTACCCAAGGCTTCCTTATACACACCAAAAAG TCCCCACTGCAACGCTGGGAGGGTTAACAGAGCTGGTACCCCAGCCTGCCAGCTCACCAAAGGAGAGAGC GGTGAGGCTCAGAGCCCGCCCCCTGCCAAGCCGCCCAGCCAATGGGCACCTGTGGGGAGTGTGGCGCTGT GTCCCATTGGCTGCCAACCTACATGCATAAGAAAGAAAGAGAGAGGCAGGCAGGGCAGCATTGTTATCTT AAGACACTCATCTGGTGTCTGAGTCTGCAGGTGACACTGCTTAGGTACGGAGCGCGGAGTCGGAGCGGGG ACGCGCCGGGCTGCAGCTCTGGGATGCAATCCGCCTGCCTCGCAAGCTGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BRINP2_1 ↗ | 1:177,170,958 | 正股 | 177,170,909–177,170,968 |
| BRINP2_2 ↗ | 1:177,171,435 | 正股 | 177,171,386–177,171,445 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_94LBNP · promoter · 177170672–177170968 · regulatory
ENSR1_B3B6CF · enhancer · 177170969–177171544 · regulatory
ENSR1_53JN69H · CTCF_binding_site · 177171939–177171960 · regulatory
· motif · 177170810–177170820 · motif
· motif · 177171941–177171957 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:783 aa
BRINP2 蛋白質長 783 個胺基酸,屬於 BRINP family。其 N 端第 1–33 個胺基酸為訊號序列;第 85–281 個胺基酸區段註記為 MACPF domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BRINP2 被註記為分泌型蛋白質;資料未提供其分泌條件、細胞內運輸過程或不同異構型的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GAGTCTGCAGGTGACACTGCTTAGGTACGGAGCGCGGAGT40CGGAGCGGGGACGCGCCGGGCTGCAGCTCTGGGATGCAAT80CCGCCTGCCTCGCAAGCTGCTCGCCGCTGCGCTGGCAGCG120CTTACGCTGAGCTCGGAGGATCCCATTAGGACTTGCCCGG160GGATGTGCACCTGCCGTGCGCTCCGAGGTCAGTGGCAGGT200CTGCAGGCAGCCGAGGGAGCGGTGAAGCCGGAAGACCTGT240CTCTGCCCATGTGCAAGGCAGTGATTTCGGGTGAGAGAGC280GGGTGGGTGAGTCTCTTTAGAGTTGGAAAGAAGGCAAAAT320CTTGGGTTTCTCCTCGGCGGAGGGACAGGGGACTCCCCCA360GTTGGGTCTTGCACTTCCCTTACCTCTCCCACCCCGCGTG400CGCCCCGGCCCAGTGCCGAAGCCCCACTTCAAAGATGCTC440TGGGAGACCGGGATCCTGGCTGCTCAGCGGGAAGGCAGCA480GGCAAGTGGTCTAACGTTGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGCG520GCGGCGGCACCGACAGTAAAGCGGGGAGCAAGAGAATTTG560AAAAGAGACATCCGCTCCCTCTCACACGCTGAGGGGGAGG600CATTCGCGTTTCCCCAAATGAGAAAGAACCACAAGAAATC640ATGAAGTAAAAACTTTGGAAAGCTGCCACTGGAGATGTTG680CACAAAAACCTGGAATCTTTTAGGAGTCTCCTCCCAGTCG720TTGAAGGTTTGGGGAGCAGCTGATACAGCAAGGAGGGCTC760TTGCAAGGATTCAAGCTCCGAGCCCTGGAGGAGCAGCACG800GAGCGGGAGAGCGTGGCGAGAGAATGAAGAAACCAATCGC840CCGGGAGAAGCATGAGGTGGCAGTGTGGCACTCGGTTTAG880AGGGCTTCGGCCGGCGGTGGCCCCATGGACAGCCCTGCTG920GCACTGGGCCTGCCTGGCTGGGTGTTGGCTGTCTCAGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。