演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BRI3BPBNAS1

BRI3 binding protein

BRI3BP(BRI3 binding protein)是蛋白質編碼基因,其產物涉及腫瘤形成,並可能透過穩定 p53/TP53 發揮作用。

Homo sapiens12q24.31UniProt Q8WY22
OFFICIAL SYMBOL
BRI3BP
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q8WY22
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BRI3BP 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 BRI3 binding protein。其產物為多次穿膜蛋白,定位於粒線體外膜。現有資料指出,它與腫瘤形成有關,可能透過穩定 p53/TP53 發揮作用;但其具體作用方式與相關條件,來源未提供進一步說明。

Official symbol
BRI3BP
Gene name
BRI3 binding protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14251
UniProt
Q8WY22
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BNAS1KG19HCCR-2HCCRBP-3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.31
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegBRI3BPpq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:124,993,617–125,031,231
Gene span
37,615 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000341446 ★124,993,645–125,031,2313
ENST00000671775124,993,617–125,031,2313
ENST00000672415124,993,617–125,031,2313
ENST00001118685124,993,617–125,027,6243
ENST00001118686124,993,617–125,031,2312

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BRI3BP 被描述為參與腫瘤形成的蛋白質。現有資料提出,它可能藉由穩定 p53/TP53 發揮作用;此處使用「可能」表示其作用方式帶有不確定性,不能據此視為已確立的機制。

來源未進一步說明 BRI3BP 如何影響 p53/TP53 的穩定性,也未提供相關實驗條件、細胞或生物系統、腫瘤類型,以及對腫瘤形成造成何種具體影響。因此,能支持的功能描述限於其與腫瘤形成相關,以及可能透過穩定 p53/TP53 發揮作用,不宜延伸為特定分子路徑或疾病因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 124993645 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BRI3BP ENST00000341446 GRCh38 chr12:124992645-124993745 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCATTTTGTATTCTTTGGATTGGCAAAAATTGAGTTTTATTTTCTTGGTTGTCTAAAAAAAATGTTGGTT
AGACTTGATTTGTTTGATTTAGGATGCAAACAGGGTCCTTGCATTGCATGGGTTATTATGGCTCTTAAGT
CTTTAAAACCAATTATCCTCCTCTTCGCTCACCTTTTATACCAATTATTTATTGAACAAACTGGGTCGTT
TGTTTGGTAGAATGCCCCACATGCTGGAGTTGGTTGGTTGCTTCTGCTGCTTCTAAGTTTTCCTTATCTG
CCATATTTCCTGTAAACTGTAGGTTTGATCTAGAGGCCCCATCAGGTTCATGCTCAACTTGTCTTGGCAA
GAATCCATCGCAGGTGGCGCTGGTACTTCCTGGCACTAAGATCGATTGGCGGGACCGGGACTTCGCGGCT
TAGCCCCTCCATTTTCAAGTTCCCCGCCAAACCCTCCCCTCTTGGTTGTACCCATTTCTGATGATCATCG
CGTGAATCCATCATTCTATTGAGGGGTGCCAAATAATTTTCGGATTCTCTCATTCATCCTCATGTATTAG
CTGGACTTTGTAAAAGAAAGTCCCTCCCCAACTATTTTGGGGCTCTGAAATACAGTTCATTCAGGAAGGG
CAGGAGGATGCCTGATGCTTTCTTGTTATTTAAAATTTTCAGGATGAATGAGCTGATGCCCACGAGGGCG
AATTTTGGGGTACCATTATAATACATTCAGGGAGATTACATATATGTCTATTTCATGTTTTTCAATCAGT
TGCAGTCACTTTCCTGGTTGAAGCTGTTGCAAGTTTTACAGGCACGGGTTGCTTTTCCACGGATAAGTTA
AAAAAGAGAATTTTTTTTTAAATGATGAGAAGCCGCACCGGGTCGGGGCAGGCTTCCGGGAGGCGGGCGC
GGGGCCCCGGGGCCGGGTCGCGTTGGTCCCGCGCCGGGGGCGGGGCGCGGCGTGGGCTGGGCCGTGCGCC
TTTGCGCGCGGGGCGGGGCAGGTGGCGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCTGTGGGTAAAGGCGCGGCGCGCGG
CCCCCGAGCGCGCCAACCTTGCCCTAGCCGGAGCCCGCTGCGGCCCAGCGC
BRI3BP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BRI3BP_1 ↗12:124,993,651正股124,993,602–124,993,661

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_93SLGW · promoter · 124989121–124989575 · regulatory

ENSR12_BWRQJ · promoter · 124993155–124993715 · regulatory

ENSR12_D87FX · enhancer · 124993716–124995905 · regulatory

ENSR12_85N85B · enhancer · 124997048–124997238 · regulatory

· motif · 124989070–124989080 · motif

· motif · 124989120–124989129 · motif

· motif · 124989120–124989131 · motif

· motif · 124989120–124989131 · motif

· motif · 124989421–124989432 · motif

· motif · 124992928–124992937 · motif

· motif · 124993018–124993027 · motif

· motif · 124993018–124993029 · motif

· motif · 124993084–124993095 · motif

· motif · 124993535–124993544 · motif

· motif · 124993535–124993546 · motif

· motif · 124993585–124993598 · motif

· motif · 124994049–124994058 · motif

· motif · 124994149–124994164 · motif

· motif · 124994436–124994449 · motif

· motif · 124994436–124994449 · motif

· motif · 124994622–124994635 · motif

· motif · 124994622–124994635 · motif

· motif · 124994643–124994656 · motif

· motif · 124994643–124994656 · motif

· motif · 124994693–124994705 · motif

· motif · 124994746–124994757 · motif

· motif · 124994746–124994757 · motif

· motif · 124994781–124994789 · motif

· motif · 124994797–124994810 · motif

· motif · 124994797–124994810 · motif

· motif · 124995438–124995455 · motif

· motif · 124995604–124995619 · motif

· motif · 124997848–124997863 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:251 aa

1 aa251 aa跨膜區
依 Q8WY22 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BRI3BP 蛋白長 251 個胺基酸。序列註解預測有四段螺旋型跨膜區,分別位於第 13–33、第 125–145、第 146–166 與第 185–205 個胺基酸位置。

跨膜區Helical13–33 aa
跨膜區Helical125–145 aa
跨膜區Helical146–166 aa
跨膜區Helical185–205 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8WY22…

AlphaFold · Q8WY22

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion outer membrane

BRI3BP 被註記為多次穿膜蛋白,定位於粒線體外膜。 現有資料未提供其定位隨條件改變的情形或不同異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BNAS1BRI3BPBRI3LETMD1TMEM238L
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BRI3BP 與 LETMD1 及 TMEM238L 有互作紀錄。它也與 BRI3 的異構型 1 和異構型 2 互作,其中與異構型 2 的互作弱於異構型 1;另有資料將其與 BRI3 的互作描述為弱。來源未指出這些互作形成特定複合體或具有何種功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BRI3BP 與腫瘤形成有關,並可能透過穩定 p53/TP53 發揮作用;來源未進一步說明此作用的條件或具體機制,因此保留其可能性。含實驗來源
證據與來源

Involved in tumorigenesis and may function by stabilizing p53/TP53

PMID 17943721 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BRI3BP 與 LETMD1、TMEM238L 有互作紀錄,也與 BRI3 的異構型 1 和異構型 2 互作;與異構型 2 的互作較弱,另有紀錄將其與 BRI3 的互作描述為弱。含實驗來源
證據與來源

Interacts with LETMD1. Interacts with BRI3 (isoforms 1 and 2); the interaction with isoform 2 is weaker than with isoform 1. Interacts with BRI3; the interaction is weak. Interacts with TMEM238L

PMID 11860200 ↗ · PMID 17943721 ↗ · PMID 30983867 ↗ · PMID 33112233 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BRI3BP 被註記為多次穿膜蛋白,定位於粒線體外膜;該資料未說明定位變化的條件或異構型間差異。推論支持
證據與來源

Mitochondrion outer membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 17943721 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000341446 · 6,703 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GGTGGCGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCTGTGGGTAAAGGCG40
41CGGCGCGCGGCCCCCGAGCGCGCCAACCTTGCCCTAGCCG80
81GAGCCCGCTGCGGCCCAGCGCACGGCCCTCACCCCGCATC120
121GCGACCCCGCGCCCCGCCGGCCGAGCATGGGCGCGCGCGC160
161CTCAGGCGGGCCCCTGGCCCGGGCCGGGCTCCTGCTGCTG200
201CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCGGGCTGCTGGCCCCGGGCG240
241CGCAGGGGGCGCGGGGCCGCGGCGGCGCGGAGAAGAACAG280
281CTACCGCCGCACGGTCAACACCTTCTCCCAGAGCGTCAGC320
321AGCCTGTTCGGCGAGGACAACGTGCGCGCCGCTCAGAAGT360
361TCTTGGCCAGGCTGACTGAGAGATTTGTGCTGGGAGTGGA400
401TATGTTCGTGGAGACACTGTGGAAAGTCTGGACCGAGCTC440
441TTGGATGTTCTTGGACTTGACGTCTCCAACCTGTCCCAGT480
481ATTTCAGCCCAGCCTCGGTGTCCAGCAGCCCGGCCCGCGC520
521GCTCCTGCTGGTCGGCGTCGTCCTCCTGGCCTACTGGTTC560
561TTGTCCCTGACCCTGGGCTTCACTTTCAGCGTCCTGCACG600
601TGGTGTTCGGCCGCTTCTTCTGGATCGTGCGGGTCGTCCT640
641GTTTTCCATGTCCTGCGTGTACATCCTGCACAAGTACGAG680
681GGCGAGCCGGAGAACGCGGTGCTGCCGCTGTGCTTCGTGG720
721TGGCCGTCTACTTCATGACCGGGCCCATGGGCTTCTACTG760
761GCGAAGCAGTCCCAGCGGCCCCAGCAACCCCAGCAACCCC800
801AGCGTGGAGGAGAAGCTGGAGCACCTGGAGAAGCAGGTCA840
841GACTGCTCAACATCCGTCTCAACCGGGTGCTCGAGAGCCT880
881GGACCGCTCCAAGGACAAGTGAAGGTCAGCCGGCCGGGCG920
921GGTCCACAGTTACCAGCACGCTGTCTCAGAAAACGAAAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。