基因總覽
BPY2 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 basic charge Y-linked 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 Yq11.223。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000331070 ★ | 22,984,263–23,005,465 | 9 |
| ENST00000602732 | 22,973,819–22,992,376 | 5 |
| ENST00000382585 | 22,992,344–22,998,268 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>BPY2 ENST00000331070 GRCh38 chrY:22983263-22984363 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAATTTCTAGAATTTTATTCCATCATGACTCTGATACAAATCTTTGTCATGCACCATTGTGATTTCATTC TTAAGACTGGTTGAAGCCTACATATAAAATTTTGAGATCTCCCAGGGCCAACCTTGAAGTGGTTTGACTC TTCTCCCTGGGCCCTGCTCTCAGTAAGAATTTTGACATCACTGGATGCAGTAACCAGGTAATGTTATATT CTTGACTGCACCATGACACAGACATCATTGTGACATATTACTGTGTCCGTCACTTAAAAGATGTAACTCT CCTCTCTGGAATGGGCACTGCACATAGGATAGGATAGTCACATATTCATAGGCCAGGCACACAGGTGATG ATACTTTTTTTTTTTGCCAGGGCCATGCCCAAAAGAAGGCATTTTGACATATCAAAGGGCCTATCATGCA GGTAATATGACTCTTCTGCTTGGGATCTGCCCACCTGCATAGTGACACATTGCTAGGCCAGACACAAAGG TGATGGTACTGTTCAGCCAGGGACAGGCTTTAAGAAAAGTTTTATGGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTG TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTGAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAA CACGGTGAAACCCCATTTCTACTAAAAATACAAAAAAATAAGGCAGGTGCCATGGCAGGTGCCTGAAGTC CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGTCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGA TCGTGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAGCGAGGCTCCATCTCAAAAAAAAAAGAAAAAAGGAAGA AAGAAAAGAAAAGCTTTGTGACATATCTCTATGCCTATCACCTAGGTGATGTGACTTCCTGCTTGACCCT GCCCACATGGAGCATTGTGACATATGTGTGGAACCTGCACTTAGGTGATGTAACTCTCTTGACTGGGTCC TTTTCTAAGGGGGGCTTGTGAATATCTCAGGACCCAGGACCATGTGATATGGTATTCAGCCTTGTTTTTT CCCACATATTAAAGTGTGACATATACCTAAAGAAGCACCTAGGTGATATGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 22982034–22982045 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MAP1SQ66K74 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BPY2 與 MAP1S 及 UBE3A 有交互作用;其中與 UBE3A 的交互作用涉及其 HECT domain。來源未提供這些關係是否代表同一複合體或其功能後果。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | BPY2 與 MAP1S 及 UBE3A 有交互作用;與 UBE3A 的交互作用經由其 HECT domain。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AATATCTCAGGACCCAGGACCATGTGATATGGGCCCAACA40CCTGGATGATGTTACTCTTCTGCCTAGGTCATGCGTAAAG80AGGGAATTAGGGCATATTGCTTGGCCCAGTCCCGTAATGA120TATGACTCTCCTGCTTGTGCCAGAGCCACAGAAGTGTGCT160TGGTGACATAATCTTTGAGGCTGTCACATCACCAAGATTA200TATTGTATCACTGGACCAGCATAAAGCTGACACTTCTGAC240TATGCCCAGCCTTCAAATAATACTACACTGTATAATTGGC280TCAACACCCAGGTGATATTGTTCCATTTACCTGAGACCAG320ATAAAAAGCCTAATGATGACGCTTGTCCCCAGAGCCAGGA360CACGTGCAGGACAGGATCATTACTCTCATCCCTGCCCCAG400ATTTTCACAGGTGCTGCTTACAGAGGGCATCATGACATAT440TGCTTGACAAAGAACCTAAGTGATGTTAATATTCTGCATA480GGTTGCTAAAAAATGGGAATGTGAGAAATACCTTGCTTCA520GTCCAAAGTGGGCTTGCTGACATATTATGTGAAACTGTAC560CCGGGTGAAGTGACTCTTCTGACTAGGCCCAGCATACAAA600TGAGATTATGCTGTATCACTGGCTCAGTGTCGAGGCCCAG640ATCACAGAAGTAATTGTGCCATATGTGGAACAAGCAGCTA680AGCAATAGATAACATCCATCGTGGCTCTGCCTTCAAAGGG720AAATTTTACATATGTCACTGGGACCATCACCCAGATGATG760TCCTGCCCACTAAAAGAATTGTGACATAACGCTGACTGCA800AAAACTGGGTAATGCAACTCTCCTCTTTATTCTGGAGTCT840GCCAAAACAAGGGATTATCACATATTGCGGAGTCCAGCAC880CCAGGTAAAATTTTGTCATATACCCAGCTTCAGATACCAT920GCAATAATACAACTATCATACCTGGACCCAAAGAGGAGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。