演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BPNT1

3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1

BPNT1 編碼 3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1,屬於肌醇單磷酸酶超家族的磷酸酶,可作用於多種含磷酸基底物。

Homo sapiens1q41UniProt O95861
OFFICIAL SYMBOL
BPNT1
CHROMOSOME
1
UNIPROT
O95861
PDB / ALPHAFOLD
2WEF
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BPNT1 是蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1。此蛋白質屬於肌醇單磷酸酶超家族,具有磷酸酶活性;來源所列的受質包括核苷酸衍生物與肌醇磷酸化合物。這些特性將 BPNT1 定位為可處理不同含磷酸基分子的酵素。現有資料未提供其胺基酸長度、結構域組成或其他蛋白質結構細節,因此不進一步描述其結構。

Official symbol
BPNT1
Gene name
3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1096
UniProt
O95861
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q41
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegBPNT1pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:220,057,079–220,119,267
Gene span
62,189 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000322067 ★220,057,482–220,089,7889
ENST00000916793220,057,079–220,089,85310
ENST00001077130220,057,079–220,089,8538
ENST00000414869220,057,482–220,089,8538
ENST00000544404220,057,482–220,089,8538
ENST00000861595220,057,482–220,090,46210
ENST00001145592220,057,482–220,089,8539
ENST00000469520220,057,484–220,090,46210
ENST00000354807220,057,530–220,089,85311
ENST00000851065220,057,614–220,119,26710
ENST00000861596220,058,516–220,089,8539
ENST00000463953220,062,811–220,089,7696

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BPNT1 的主要酵素作用之一,是將 3'(2')-phosphoadenosine 5'-phosphate(PAP)去磷酸化,產物為 AMP;資料列出的反應包括 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 adenosine 2',5'-bisphosphate 分別與水反應,生成 AMP 和磷酸。來源指出,BPNT1 可能藉由分解 PAP,避免其累積至有害程度。這項解讀帶有推測性:PAP 可抑制多種蛋白質,其中包括使用 PAPS 的酵素(例如 sulfotransferases)及 RNA processing enzymes。

BPNT1 也能處理肌醇磷酸化合物。它可將 inositol 1,4-bisphosphate 去磷酸化為 inositol 4-phosphate;另外,資料也列出 1D-myo-inositol 1,3,4-trisphosphate 生成 1D-myo-inositol 3,4-bisphosphate 的反應。這些反應支持 BPNT1 可能參與肌醇回收與 phosphoinositide 代謝,但來源以可能性描述此角色,並未將其表述為確定的生理功能。

此外,BPNT1 能水解 adenosine 3'-phosphate 5'-phosphosulfate(PAPS),形成 adenosine 5'-phosphosulfate(APS);這項活性是依序列相似性推定。資料亦指出,該酵素不作用於 3'-AMP、inositol-1-phosphate 或 inositol-1,4,5-triphosphate,顯示其受質範圍具有選擇性。每個 BPNT1 次單元可結合 3 個 Mg(2+) 離子;現有資料未進一步說明這項結合與各反應活性的關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 220089788 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BPNT1 ENST00000322067 GRCh38 chr1:220089688-220090788 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGAGCAGATCACCTGGGGTCAGGAGTTCAAG
ACCAGCCTGGCCAATATGATGAAACCCCGTCTCTACTTAAAAAACAAACAAAATTAGCCCGGCGTGGTGG
CGCGCCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTAAGGAGGAAGGATCGCTTGAACCCAGGAGGAGGAGGTTG
TAGTGAACCTAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGGATGAGACACTGCCCCCTTCCCCAAC
CACGCCCCCCAGTAAAAGATCCCATCTGTACACAAAAAATATTTTAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCGCA
CCTCCACCAGTAGTCCCAGCTACACGGAAGGCTGAGGCGGGAGGATGGCTTGAGCCTAGAAGTGGGAAGG
CAGCAGTGAGCCGTAATCGACTCTGGGCGACAGAGCAAGCTATCTATCGCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAGGTAAGCAAGCATCTTTGACACAATTCTGCATAAAGTTGCTGTGTTATTGCGTGGGGAG
TGGGAGGTGGAGGTGTGTGTGGTGGACCTGCTGAAGCCTGTCCACGGACCGCTAGGGGTTCGAAGTTAAA
TAGCCGCAGAGTGGTATCACTAATACAAAGAACATTTTAAAACAGTGAACTCTACGAAGTGGGCTGGAAG
ACAGCTGAAACCAAAACCAATCTTTTTTTTGTTTCAACACACTGTTGCTGGCTTAATGTGTTCTTTCCTT
CTTCTTTTTCTTTTTTTAGCCAATCTTTGAAAGTTGACACATCTTTCGCTTTTATTTAATGCAACAGGTG
ACTTGCACCTACGGAGAGCTTGGAGAAAACACGGACAAGTGGAATTTTCCCGCGGATCAGGAGTCTAAAG
AGGCAGTGTGAAATCGCTGTTGTGCGCTTGCGCGCAGTTTCCCGCATGCTCAGTAGCTGAGGTAGGGATG
CCATCCTTCTCAAAAGACTTATTGACAGTGCCAAAGCTCGGTACTGGACACAACGAGGGACCTGGGTCTA
CGATAACGCGCTTTTGCTCCTCCTGAAGTGTCTTTGGTCCAACGTTGTTCC
BPNT1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BPNT1_1 ↗1:220,089,788負股220,089,778–220,089,837

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_958CLF · enhancer · 220086205–220086637 · regulatory

ENSR1_53WQNPC · CTCF_binding_site · 220086352–220086373 · regulatory

ENSR1_B3LNBM · enhancer · 220088963–220089761 · regulatory

ENSR1_B3LNBP · promoter · 220089762–220090343 · regulatory

ENSR1_958CML · promoter · 220090452–220090731 · regulatory

ENSR1_958CNK · promoter · 220093642–220094142 · regulatory

ENSR1_53WQQ2N · CTCF_binding_site · 220093989–220094010 · regulatory

· motif · 220086354–220086370 · motif

· motif · 220086497–220086509 · motif

· motif · 220086500–220086507 · motif

· motif · 220086794–220086809 · motif

· motif · 220086799–220086811 · motif

· motif · 220086802–220086817 · motif

· motif · 220089827–220089838 · motif

· motif · 220089827–220089838 · motif

· motif · 220089845–220089856 · motif

· motif · 220089845–220089856 · motif

· motif · 220089892–220089903 · motif

· motif · 220089979–220089992 · motif

· motif · 220090078–220090091 · motif

· motif · 220090158–220090173 · motif

· motif · 220090158–220090173 · motif

· motif · 220090159–220090173 · motif

· motif · 220090160–220090173 · motif

· motif · 220090204–220090221 · motif

· motif · 220093780–220093795 · motif

· motif · 220093792–220093805 · motif

· motif · 220093947–220093962 · motif

· motif · 220093947–220093962 · motif

· motif · 220093969–220093979 · motif

· motif · 220093971–220093984 · motif

· motif · 220093989–220093999 · motif

· motif · 220093991–220094007 · motif

· motif · 220094016–220094027 · motif

· motif · 220094018–220094027 · motif

· motif · 220094066–220094076 · motif

· motif · 220094068–220094081 · motif

· motif · 220094093–220094103 · motif

· motif · 220094169–220094182 · motif

· motif · 220094175–220094188 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:308 aa

3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1 屬於肌醇單磷酸酶超家族。現有來源僅提供其家族歸屬,未列出結構域、功能區域或序列註解細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2WEF…

PDB · 2WEF

X-ray · 1.80 A · A=6-308

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BPNT1BPNT1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BPNT1 可將 3'(2')-phosphoadenosine 5'-phosphate(PAP)轉為 AMP,也能將 inositol 1,4-bisphosphate 轉為 inositol 4-phosphate;PAPS 水解為 APS 則是依序列相似性推定。BPNT1 可能藉由分解 PAP 防止其有毒累積;PAP 會抑制多種蛋白質,包括使用 PAPS 的 sulfotransferases 與 RNA processing enzymes。它也可能參與肌醇回收及 phosphoinositide 代謝,且不作用於 3'-AMP、inositol-1-phosphate 與 inositol-1,4,5-triphosphate。含實驗來源
證據與來源

Phosphatase that converts 3'(2')-phosphoadenosine 5'-phosphate (PAP) to AMP and inositol 1,4-bisphosphate (Ins(1,4)P2) to inositol 4-phosphate. Is also able to hydrolyze adenosine 3'-phosphate 5'-phosphosulfate (PAPS) to adenosine 5'-phosphosulfate (APS) (By similarity). Probably prevents the toxic accumulation of PAP, a compound which inhibits a variety of proteins, including PAPS-utilizing enzymes such as sulfotransferases, and RNA processing enzymes. Could also play a role in inositol recycling and phosphoinositide metabolism. Is not active on 3'-AMP, inositol-1-phosphate and inositol-1,4,5-triphosphate

PMID 10675562 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性adenosine 3',5'-bisphosphate + H2O = AMP + phosphate含實驗來源
證據與來源

adenosine 3',5'-bisphosphate + H2O = AMP + phosphate

PMID 10675562 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性adenosine 2',5'-bisphosphate + H2O = AMP + phosphate含實驗來源
證據與來源

adenosine 2',5'-bisphosphate + H2O = AMP + phosphate

PMID 10675562 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3'-phosphoadenylyl sulfate + H2O = adenosine 5'-phosphosulfate + phosphate推論支持
證據與來源

3'-phosphoadenylyl sulfate + H2O = adenosine 5'-phosphosulfate + phosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate + H2O = 1D-myo-inositol 4-phosphate + phosphate含實驗來源
證據與來源

1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate + H2O = 1D-myo-inositol 4-phosphate + phosphate

PMID 10675562 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性1D-myo-inositol 1,3,4-trisphosphate + H2O = 1D-myo-inositol 3,4-bisphosphate + phosphate推論支持
證據與來源

1D-myo-inositol 1,3,4-trisphosphate + H2O = 1D-myo-inositol 3,4-bisphosphate + phosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性每個 BPNT1 次單元可結合 3 個 Mg(2+) 離子。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 3 Mg(2+) ions per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000322067 · 2,400 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTGACAGTGCCAAAGCTCGGTACTGGACACAACGAGGGA40
41CCTGGGTCTACGATAACGCGCTTTTGCTCCTCCTGAAGTG80
81TCTTTGGTCCAACGTTGTTCCAGAGTGTACCATGGCTTCC120
121AGTAACACTGTGTTGATGCGGTTGGTAGCCTCCGCATATT160
161CTATTGCTCAAAAGGCAGGAATGATAGTCAGACGTGTTAT200
201TGCTGAAGGAGACCTGGGTATTGTGGAGAAGACCTGTGCA240
241ACAGACCTGCAGACCAAAGCTGACCGATTGGCACAGATGA280
281GCATATGTTCTTCATTGGCCCGGAAATTCCCCAAACTCAC320
321AATTATAGGGGAAGAGGATCTGCCTTCTGAGGAAGTGGAT360
361CAAGAGCTGATTGAAGACAGTCAGTGGGAAGAAATACTGA400
401AGCAACCATGCCCATCGCAGTACAGTGCTATTAAAGAAGA440
441AGATCTCGTGGTCTGGGTTGATCCTCTGGATGGAACCAAG480
481GAATATACCGAAGGTCTTCTTGACAATGTAACAGTTCTTA520
521TTGGAATTGCTTATGAAGGAAAAGCCATAGCAGGAGTTAT560
561TAACCAGCCATATTACAACTATGAGGCAGGACCAGATGCT600
601GTGTTGGGGAGGACAATCTGGGGAGTTTTAGGTTTAGGCG640
641CCTTTGGGTTTCAGCTGAAAGAAGTCCCTGCTGGGAAACA680
681CATTATCACAACTACTCGATCCCATAGCAACAAGTTGGTT720
721ACTGACTGTGTTGCTGCTATGAACCCCGATGCTGTGCTGC760
761GAGTAGGAGGAGCAGGAAATAAGATTATTCAGCTGATTGA800
801AGGCAAAGCCTCTGCTTATGTATTTGCAAGTCCTGGTTGT840
841AAGAAGTGGGATACTTGTGCTCCAGAAGTTATTTTACATG880
881CTGTGGGAGGCAAGTTAACCGATATCCATGGGAATGTTCT920
921TCAGTACCACAAGGATGTGAAGCATATGAACTCTGCAGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。