基因總覽
BNIP3L 的正式名稱為 BCL2 interacting protein 3 like，屬於蛋白質編碼基因，其產物歸於 NIP3 family。這種蛋白質長 219 個胺基酸，帶有 BH3 motif，並在靠近 C 端處具有單次跨膜區段；其 N 端一段序列則註記為無序區。這些特徵構成辨識此蛋白質的基本資訊。BNIP3L 的主要角色與細胞凋亡及粒線體品質管控有關；其功能也涉及與抗凋亡蛋白及其他細胞蛋白的作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380629 ★ | 26,383,054–26,413,127 | 6 |
| ENST00000877444 | 26,383,037–26,413,129 | 7 |
| ENST00000877445 | 26,383,037–26,413,120 | 7 |
| ENST00001118597 | 26,383,037–26,460,893 | 6 |
| ENST00001121861 | 26,383,037–26,500,393 | 6 |
| ENST00001121862 | 26,383,037–26,466,674 | 6 |
| ENST00001121863 | 26,383,037–26,413,120 | 7 |
| ENST00001121864 | 26,383,037–26,410,989 | 6 |
| ENST00001121865 | 26,383,037–26,410,913 | 5 |
| ENST00001131342 | 26,383,037–26,395,407 | 3 |
| ENST00001139060 | 26,383,037–26,413,127 | 6 |
| ENST00000523949 | 26,383,197–26,505,636 | 6 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BNIP3L 可誘導細胞凋亡，並能與病毒及細胞來源的抗凋亡蛋白互作。它可克服 BCL-2 與 BCL-XL 的抑制作用，但若 BCL-XL 表現量很高，細胞凋亡仍會受到抑制。另一方面，BNIP3L 也能抑制由 BNIP3 誘發的細胞凋亡，顯示其對凋亡的影響會依相關分子與條件而異。
BNIP3L 亦參與粒線體品質管控。粒線體受損時，它與 SPATA18/MIEAP 的作用涉及粒線體蛋白質分解代謝過程（亦稱 MALM），使粒線體內受損蛋白質得以降解。這項功能的描述限定於粒線體損傷的情境。
在粒線體外膜，SPATA18/MIEAP、BNIP3 與 BNIP3L/NIX 的物理交互作用會調節粒線體雙層膜孔洞的開啟，進而介導溶酶體蛋白質由細胞質移至粒線體基質。來源指出這個孔洞調節與蛋白質轉運相連，但未進一步說明其分子細節。BNIP3L 可能具有腫瘤抑制功能；此處為可能性描述，而非確定的功能結論。
Promoter 與基因調控
>BNIP3L ENST00000380629 GRCh38 chr8:26382054-26383154 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGTTAAATAATTTACAGCATATGGAAAATAAATTTCAGATGGATTAGAGCTCTAAATGTAAAGTTAAGC CTATAAGAAAATTAGAAAAAGTTATAAGGGAATTATAGATTAGTAATCTTGGTGTGACTGTCTCCCCAAG CCATGTAAGAATGATAAATCTGATTACATGAAAACCTTAAGCTTCTACAGAGTGAAAAAAACAAATTAAA AGACAAGTTAGAGACTGCGAGAAACATATGTCACTCATAAATCAGACCAAGGAGACTGGACGAAGACATG GAGATGTGAAGTAGGAGGTGTGCTCAGGAACATAGTTTAATGTCATCCACGTACAGGATAAACGGCTTCC CACGTCATGTCCCAGAAATCGATTAGTCGATGGGATTTGGGTGAGTACTTTCTTCTCTCTGTTTTCCTGA ATTTTTCTTTTTTCTTTCTTCCCCTTTCTTCTTTCTCTTTTTTTCAGAATGATGGTGTGTTTGTAATCGA CATTTTAAAAATTCTGTAACAATTAAATTTGGGGGCGGCCTTCCCTTGTTTCCCGTATGGAGTGTTGATG TTTCAGCAGCTTTATTTGGAGTTTACACGTGGAGGCACCTGGGTTTGGGGATTCCTTTGTGTCCCCAAGA CACCTATTGCAGAAGTGAGTCCTAAGAGGTAGAAAACAGATGCGTGCGCAGGGCTGGGTGAAGCACTGTG GAGCCTGTGTGAGAGGAGGCACGGGCGCGAACACAGGAGCGCACTTCCTCATTCCGTTTCTCCTCATCCT CTCTCCCACTGCCACTGGCATCACTCATCCCATCCGGTCATCCCAAGTCACACGCAAGAGTTCGTTCCCG GCGCGCGCGTCAGCCTGACTCGAGCGTCTCCACGTCCGGGGCCCGCAGGGGAGCGCCCCTGCCCCGTCCG GTCGCTTGTTGTGTTGTCATCACGTGGCCTGGGCGGGCCCTGACGTCAGGGGCAGGGGAGGGACGGCGCA GGCGCAGAAAAGGGGGCGGCGGACTCGGCTTGTTGTGTTGCTGCCTGAGTGCCGGAGACGGTCCTGCTGC TGCCGCAGTCCTGCCAGCTGTCCGACAATGTCGTCCCACCTAGTCGAGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BNIP3L_1 ↗ | 8:26,383,068 | 正股 | 26,383,019–26,383,078 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_B78CX · enhancer · 26382300–26382930 · regulatory
ENSR8_9DGQ2 · promoter · 26382931–26383425 · regulatory
ENSR8_C4LNK · enhancer · 26383426–26384702 · regulatory
ENSR8_9DGQQ · enhancer · 26385552–26385968 · regulatory
· motif · 26381611–26381620 · motif
· motif · 26381611–26381622 · motif
· motif · 26381611–26381622 · motif
· motif · 26381625–26381634 · motif
· motif · 26382637–26382646 · motif
· motif · 26382637–26382646 · motif
· motif · 26382795–26382806 · motif
· motif · 26382795–26382806 · motif
· motif · 26382795–26382808 · motif
· motif · 26382852–26382861 · motif
· motif · 26382982–26382991 · motif
· motif · 26382982–26382991 · motif
· motif · 26383028–26383039 · motif
· motif · 26383028–26383039 · motif
· motif · 26383264–26383274 · motif
· motif · 26383384–26383394 · motif
· motif · 26383536–26383549 · motif
· motif · 26383566–26383579 · motif
· motif · 26383642–26383655 · motif
· motif · 26383690–26383699 · motif
· motif · 26383807–26383829 · motif
· motif · 26383807–26383829 · motif
· motif · 26383812–26383821 · motif
· motif · 26383812–26383821 · motif
· motif · 26385900–26385909 · motif
· motif · 26386040–26386049 · motif
· motif · 26386040–26386049 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：219 aa
BNIP3L 長 219 個胺基酸，屬於 NIP3 family。其第 126–148 位胺基酸區段含有 BH3 motif；第 188–208 位則是螺旋型跨膜區段。第 1–101 位被註記為無序區。這些序列特徵描述其功能區域與膜嵌入部分。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BNIP3L 位於核膜、內質網及粒線體外膜，並被註記為單次跨膜蛋白。 在粒線體外膜，BNIP3L 與 SPATA18 共定位；來源未提供其他定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- ADIPOQQ15848 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP13A2Q9NQ11 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BADQ92934 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BCL2P10415 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BNIP3Q12983 · UniProt INTERACTION · 25 experiments
- CLEC7AQ9BXN2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- CYB5BO43169 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FATE1Q969F0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPL1Q9H0R8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPL2P60520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LDLRAD1Q5T700 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MALLQ13021 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NR4A1P22736-1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SMCO4Q9NRQ5 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TMEM11P17152 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- TMEM120BA0PK00 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMPRSS4Q9NRS4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNMDQ9H2S6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- E1BP03247 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ORF10A0A663DJA2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
BNIP3L 可自我結合，也與 BNIP3、STEAP3 及 PPTC7 互作；PPTC7 的互作會促進 BNIP3L 降解。BNIP3L 透過 BH3 domain 與 SPATA18 的 coiled-coil domains 互作。感染情境下，BNIP3L 分別與 human adenovirus-2 的 E1B 19 kDa protein，以及 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus protein VIRF-1 互作。來源另述 SPATA18/MIEAP、BNIP3 與 BNIP3L/NIX 在粒線體外膜的物理交互作用，與孔洞開啟調節相關。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BNIP3L 可誘導細胞凋亡，並與病毒及細胞抗凋亡蛋白互作；它能克服 BCL-2 與 BCL-XL 的抑制，但 BCL-XL 高量表現仍會抑制凋亡。BNIP3L 也抑制 BNIP3 誘導的凋亡。粒線體受損時，BNIP3L 與 SPATA18/MIEAP 參與 MALM，促使受損粒線體蛋白質降解；三者在粒線體外膜的物理作用則調節雙層膜孔洞開啟，介導溶酶體蛋白質移入粒線體基質。它可能具有腫瘤抑制功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Induces apoptosis. Interacts with viral and cellular anti-apoptosis proteins. Can overcome the suppressors BCL-2 and BCL-XL, although high levels of BCL-XL expression will inhibit apoptosis. Inhibits apoptosis induced by BNIP3. Involved in mitochondrial quality control via its interaction with SPATA18/MIEAP: in response to mitochondrial damage, participates in mitochondrial protein catabolic process (also named MALM) leading to the degradation of damaged proteins inside mitochondria. The physical interaction of SPATA18/MIEAP, BNIP3 and BNIP3L/NIX at the mitochondrial outer membrane regulates the opening of a pore in the mitochondrial double membrane in order to mediate the translocation of lysosomal proteins from the cytoplasm to the mitochondrial matrix. May function as a tumor suppressor PMID 10381623 ↗ · PMID 21264228 ↗ |
| 交互作用 | BNIP3L 可與自身結合，也與 BNIP3、STEAP3 及 PPTC7 互作。它透過 BH3 domain 與 SPATA18 的 coiled-coil domains 互作；PPTC7 與 BNIP3L 的互作會促進 BNIP3L 降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Self-associates. Interacts with BNIP3 and STEAP3. Interacts (via BH3 domain) with SPATA18 (via coiled-coil domains). Interacts with PPTC7; this interaction promotes BNIP3L degradation PMID 10381623 ↗ · PMID 12606722 ↗ · PMID 21264228 ↗ · PMID 38992176 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，BNIP3L 與 human adenovirus-2 E1B 19 kDa protein 互作；來源未在此項敘述中提供其他作用方式或結果。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，BNIP3L 與 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus protein VIRF-1 互作；來源未在此項敘述中提供其他作用方式或結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus protein VIRF-1 PMID 31324791 ↗ |
| 細胞定位 | BNIP3L 被註記位於核膜、內質網及粒線體外膜，並屬單次跨膜蛋白。它與 SPATA18 在粒線體外膜共定位；此項定位資料未指出其他條件或異構型差異。 | 推論支持 | 證據與來源Nucleus envelope; Endoplasmic reticulum; Mitochondrion outer membrane; Membrane / Single-pass membrane protein; Colocalizes with SPATA18 at the mitochondrion outer membrane |
核酸與蛋白質序列
GGACTCGGCTTGTTGTGTTGCTGCCTGAGTGCCGGAGACG40GTCCTGCTGCTGCCGCAGTCCTGCCAGCTGTCCGACAATG80TCGTCCCACCTAGTCGAGCCGCCGCCGCCCCTGCACAACA120ACAACAACAACTGCGAGGAAAATGAGCAGTCTCTGCCCCC160GCCGGCCGGCCTCAACAGTTCCTGGGTGGAGCTACCCATG200AACAGCAGCAATGGCAATGATAATGGCAATGGGAAAAATG240GGGGGCTGGAACACGTACCATCCTCATCCTCCATCCACAA280TGGAGACATGGAGAAGATTCTTTTGGATGCACAACATGAA320TCAGGACAGAGTAGTTCCAGAGGCAGTTCTCACTGTGACA360GCCCTTCGCCACAAGAAGATGGGCAGATCATGTTTGATGT400GGAAATGCACACCAGCAGGGACCATAGCTCTCAGTCAGAA440GAAGAAGTTGTAGAAGGAGAGAAGGAAGTCGAGGCTTTGA480AGAAAAGTGCGGACTGGGTATCAGACTGGTCCAGTAGACC520CGAAAACATTCCACCCAAGGAGTTCCACTTCAGACACCCT560AAACGTTCTGTGTCTTTAAGCATGAGGAAAAGTGGAGCCA600TGAAGAAAGGGGGTATTTTCTCCGCAGAATTTCTGAAGGT640GTTCATTCCATCTCTCTTCCTTTCTCATGTTTTGGCTTTG680GGGCTAGGCATCTATATTGGAAAGCGACTGAGCACACCCT720CTGCCAGCACCTACTGAGGGAAAGGAAAAGCCCCTGGAAA760TGCGTGTGACCTGTGAAGTGGTGTATTGTCACAGTAGCTT800ATTTGAACTTGAGACCATTGTAAGCATGACCCAACCTACC840ACCCTGTTTTTACATATCCAATTCCAGTAACTCTCAAATT880CAATATTTTATTCAAACTCTGTTGAGGCATTTTACTAACC920TTATACCCTTTTTGGCCTGAAGACATTTTAGAATTTCCTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。