基因總覽
BNIP2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 BCL2 interacting protein 2。其蛋白質產物長 314 個胺基酸，具有 CRAL-TRIO 結構域；蛋白質序列另有兩段被註記為無序區。現有資料將其與細胞死亡抑制及特定蛋白質互作相聯繫。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000607373 ★ | 59,659,146–59,689,320 | 10 |
| ENST00000439052 | 59,659,146–59,689,487 | 11 |
| ENST00000415213 | 59,659,146–59,688,926 | 10 |
| ENST00000897496 | 59,659,146–59,689,487 | 10 |
| ENST00000897497 | 59,659,146–59,689,487 | 9 |
| ENST00000897498 | 59,659,146–59,689,487 | 9 |
| ENST00000897499 | 59,659,146–59,689,487 | 10 |
| ENST00000897500 | 59,659,146–59,689,487 | 8 |
| ENST00000897501 | 59,659,146–59,689,487 | 11 |
| ENST00000897502 | 59,659,146–59,688,926 | 11 |
| ENST00000921900 | 59,659,146–59,689,487 | 10 |
| ENST00000921901 | 59,659,146–59,689,487 | 9 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BNIP2 的蛋白質產物被認為與抑制細胞死亡有關。現有功能註記指出這項關聯，但未提供作用途徑、實驗條件或其影響程度，因此不能據此進一步界定其如何調節細胞死亡。
BNIP2 也與 BCL-2 及 adenovirus E1B 19 kDa proteins 有互作關係。資料未說明互作發生的細胞情境、分子方式，或這些互作是否直接造成細胞死亡抑制；目前可確認的功能描述僅限於這些互作與細胞死亡抑制的關聯。
Promoter 與基因調控
>BNIP2 ENST00000607373 GRCh38 chr15:59689220-59690320 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTGTTTTATTAACTTGTCAAAAACTAATTGAAAATTGAAAAAAATAAACCGACCGTTCCCCCAGTGAAG AGAAGCACTGCTGTAAAGCTTTTCACACTCAAATATTACCAAACTCTAAGGTCGCTTCTGAGGCCTAACT CCCCAAAATGATGCCTCGGATATTTTTCCTCGCCTTATTTCTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTT TCCTTTTTCCTTTTATTTGAGACGGAGTTTTTGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTC GGCTCACTGCAAACTCCAACTCCGCCTCCGCCTCCGCCCTCGCCTCCTGAGTAGTTGGGATTACAGACGC GCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTGTTTAGTAGAGACGAGGTGTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT CTCGAGCTCTTGACCTCCGGTAATCCACCCGCCTCGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAACC ACCGCGCCCGACCTCCTCCCCTTATTTCATCCATTTTATAATTCACATTATTGATCGCTGATAATTGCAC CTATTGTAATGATACTGATAATTGCACCTGTTGTAATAATATTGATATTGATAATTGCACCTATTGTATT ACAATATTATTATTGATATCGATAATTTCACCTACTGTAATGATCAATAAAGGCAGGCAGAAAGAAAACA AAAGTAACTGAAACTACCAGGCAGCGTCCCTGCGAACAGCAAAGAGGGAAGAAACGCCTTGAGGCGTAGT AACGCCACCAATAAGGAGTCGACGCGACGGGTCCGCCCACAGGCAAGGAAGGCCGACCCCGCGAGTGCAG GCGCGAGCGCTAGCCCGTGACGTCTGAGGGGGTTGGGGGGATGCTGTGTGGGTTTCAAGAAGACGCCACG CCTCCGCCGCCGCCACGCCCCCGCCGCCTCCACCGCCGGCTGCCGCGCCCGGAGGAGGTCGGGATGTTAT CACTTCCGCCGGGGCTTCTCACTGTGTCCGGGTCAGCTGCTGCCGCCGACGCCGTACCGCTGCGGCCGGG GGATTGGGCCGGGGTCTCCACCGCCGACCGAGGGGAGCGGGCTCCGCTCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BNIP2_2 ↗ | 15:59,689,152 | 負股 | 59,689,142–59,689,201 |
| BNIP2_1 ↗ | 15:59,689,320 | 負股 | 59,689,310–59,689,369 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_BFSS5 · enhancer · 59685759–59686287 · regulatory
ENSR15_9TNMF · enhancer · 59686411–59686710 · regulatory
ENSR15_9TNMW · promoter · 59688027–59688527 · regulatory
ENSR15_9TNN3 · enhancer · 59688528–59688915 · regulatory
ENSR15_BFSSL · promoter · 59688916–59689820 · regulatory
ENSR15_9TNNR · enhancer · 59691063–59691571 · regulatory
· motif · 59685895–59685906 · motif
· motif · 59686115–59686127 · motif
· motif · 59686499–59686510 · motif
· motif · 59686550–59686563 · motif
· motif · 59686674–59686687 · motif
· motif · 59686674–59686687 · motif
· motif · 59688092–59688101 · motif
· motif · 59688092–59688103 · motif
· motif · 59688092–59688103 · motif
· motif · 59688695–59688706 · motif
· motif · 59688695–59688706 · motif
· motif · 59688964–59688975 · motif
· motif · 59689122–59689139 · motif
· motif · 59689331–59689340 · motif
· motif · 59689341–59689356 · motif
· motif · 59689384–59689397 · motif
· motif · 59689389–59689399 · motif
· motif · 59689395–59689408 · motif
· motif · 59689401–59689414 · motif
· motif · 59689406–59689416 · motif
· motif · 59689443–59689453 · motif
· motif · 59689459–59689475 · motif
· motif · 59689767–59689780 · motif
· motif · 59689847–59689869 · motif
· motif · 59689847–59689869 · motif
· motif · 59690220–59690232 · motif
· motif · 59692949–59692958 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：314 aa
BNIP2 蛋白質長 314 個胺基酸。其第 147–304 位胺基酸範圍具有 CRAL-TRIO 結構域；第 1–21 位與第 76–100 位則分別註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BNIP2 位於細胞質，包括核周區域；資料也指出它分布於核膜區域及其他細胞質結構。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 46 個夥伴
- ABHD4Q8TB40 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGPAT3Q9NRZ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APOBEC3BQ9UH17-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BNIP3Q12983 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BNIP5P0C671 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHODLQ9H9P2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPLX4Q7Z7G2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYB5R3P00387 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DESI2Q9BSY9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DGAT2L6Q6ZPD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DHRS1Q96LJ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EI24O14681 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERLIN1O75477 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAHD1Q6P587-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM3CQ92520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FATE1Q969F0 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FRKP42685 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- GORABQ5T7V8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR152Q8TDT2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRAMD2AQ8IUY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSC2O15499 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNK5O95279 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLC1Q07866 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BNIP2 被認為與抑制細胞死亡有關，並與 BCL-2 及 adenovirus E1B 19 kDa proteins 互作。資料未進一步交代細胞死亡抑制的作用方式、互作條件或因果關係。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Implicated in the suppression of cell death. Interacts with the BCL-2 and adenovirus E1B 19 kDa proteins |
| 細胞定位 | BNIP2 被記載位於細胞質及其核周區域，也分布於核膜區域和其他細胞質結構；資料未說明定位是否會隨條件或細胞狀態改變。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, perinuclear region; Localizes to the nuclear envelope region and to other cytoplasmic structures |
核酸與蛋白質序列
ACTGTGTCCGGGTCAGCTGCTGCCGCCGACGCCGTACCGC40TGCGGCCGGGGGATTGGGCCGGGGTCTCCACCGCCGACCG80AGGGGAGCGGGCTCCGCTCGGCCCTGCTTTTTGCGACCTG120GCCGTCAGCCCCACGTCGCCGGCCTGGAGGGGCGAAGAGG160ACGAGGGGGCCAAGGCTTCCTCCGGGGACATTGGCTCCCT200GGATTATCAAGAGTTTGTAGTTGACATTGAATCCAGGCTG240AGGATGGAAGGTGTGGAACTTAAAGAAGAATGGCAAGATG280AAGATTTTCCGATACCTTTACCAGAAGATGATAGTATTGA320AGCAGATATACTAGCTATAACTGGACCAGAGGACCAGCCT360GGCTCACTAGAAGTTAATGGAAATAAAGTGAGAAAGAAAC400TAATGGCTCCAGACATTAGCCTGACACTGGATCCTAGTGA440TGGCTCTGTATTGTCAGATGATTTGGATGAAAGTGGGGAG480ATTGACTTAGATGGCTTAGACACACCGTCAGAGAATAGTA520ATGAGTTTGAGTGGGAAGATGATCTTCCAAAACCCAAGAC560TACTGAAGTAATTAGGAAAGGCTCAATTACTGAATACACA600GCAGCAGAGGAAAAAGAAGATGGACGACGCTGGCGTATGT640TCAGGATTGGAGAACAGGACCACAGGGTTGATATGAAGGC680AATTGAACCCTATAAAAAAGTTATCAGCCATGGGGGATAT720TATGGGGATGGATTAAATGCCATTGTTGTGTTTGCTGTCT760GTTTCATGCCTGAAAGTAGTCAGCCTAACTATAGATACCT800GATGGACAATCTTTTTAAATATGTTATTGGCACTTTGGAG840CTATTAGTAGCAGAAAACTACATGATAGTTTATTTAAATG880GTGCAACAACTCGAAGAAAAATGCCCAGTCTGGGATGGCT920CAGGAAATGTTATCAGCAAATTGATAGAAGGTTACGGAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。