演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BMXETK

BMX non-receptor tyrosine kinase

BMX 是 TEC subfamily 的非受體型酪胺酸激酶,參與多種訊號傳遞,與細胞骨架調節、細胞移動及存活等過程有關。

Homo sapiensXp22.2UniProt P51813
OFFICIAL SYMBOL
BMX
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P51813
PDB / ALPHAFOLD
3SXR
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BMX non-receptor tyrosine kinase 是由蛋白質編碼基因 BMX 產生的非受體型酪胺酸激酶,屬於 protein kinase superfamily 中的 Tyr protein kinase family,並歸入 TEC subfamily。這類蛋白質具有激酶活性,可參與細胞內訊號傳遞;與受體型激酶不同,BMX 本身不是受體。其蛋白質由多個功能區域構成,包括 PH、Btk-type zinc finger、SH2 與 protein kinase domains,另有 CAV1-binding motif。這些結構特色提供理解其分子性質的基礎;BMX 所參與的訊號與生物學過程則依細胞情境而異。

Official symbol
BMX
Gene name
BMX non-receptor tyrosine kinase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1079
UniProt
P51813
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ETKPSCTK3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp22.2
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegBMXpq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:15,464,246–15,556,529
Gene span
92,284 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000348343 ★15,500,807–15,556,51919
ENST0000035760715,464,246–15,556,52919
ENST0000086719715,500,758–15,556,52919
ENST0000086719815,500,758–15,556,52916
ENST0000094287615,500,758–15,556,52919
ENST0000113382415,500,758–15,556,52919
ENST0000094287515,500,807–15,556,52919
ENST0000034201415,507,318–15,556,52919

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BMX 是多種訊號傳遞過程中的調節因子,與 actin 重組、細胞移動、增殖與存活、細胞黏附及凋亡的調控相關。它參與由生長因子受體、細胞激素受體、G protein-coupled receptors、抗原受體及 integrins 所刺激的訊號傳遞。其酪胺酸激酶活性可催化蛋白質酪胺酸殘基的磷酸化,反應中使用 ATP,並生成 ADP。

在 integrin 相關訊號中,BMX 會促進 BCAR1 的酪胺酸磷酸化;integrins 對 BMX 的活化則由 PTK2/FAK1 介導。PTK2/FAK1 是 integrin 訊號的重要媒介,這條訊號與 actin 細胞骨架調節及細胞運動性相關。BMX 也參與 TNF 誘導的血管新生,並涉及 TEK 與 FLT1 受體的訊號傳遞;這兩類受體與血管新生有關。

BMX 是 STAT3 磷酸化與活化所必需的因子,而 STAT3 是參與細胞分化的轉錄因子。BMX 也與 interleukin-6(IL6)誘導的分化有關。此外,它在不同細胞系統中參與對細胞外壓力的適應性保護,包括唾液上皮細胞、腦內皮細胞及真皮纖維母細胞。這些作用顯示 BMX 可連結外界訊號與細胞的分化、存活及環境應答。

BMX 可能透過與胞內體蛋白 RUFY1 互作,參與內吞作用的調控;也可能參與造血細胞的生長與分化,以及心內膜和動脈內皮細胞中的訊號傳遞。這些功能描述包含可能性表述,適用範圍依來源所述,不宜視為所有細胞情境中均已確立的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 15500807 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BMX ENST00000348343 GRCh38 chrX:15499807-15500907 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCCCATACTCTACTGTAATTAAACCACTATTTGTGGTTCCCCCCCCCCCCACACAGACACATAAGCCCC
TTGAAGATGTGGGCTGCCTCTCTTCTGTTTGCTCTTGTGTCTCCAACCCCTAACGGAATGCTCAGCACAT
GGCAGGTTCTCAAATAAGACTTGACTGAACGAATTAATAGAAATGATGCTAATTCCATGTACACTCAAAA
GAATACCTCTTTGAAAGCCAGTAGCTTCACTCTCTTCTGCCAACCCAAGACTTCTTCACATCATAGATAC
TTACAAATAAGTTACAGTAAGCAACAATTTATAAGTAAACACAGTGTGTCAATGCATGCCAAAAGGATGA
TTACTTTTCTTGGCTATCCATAGCAGGACATAAAATATGTCCTTAGATTTATTACAGATGGCCAGCCGGT
ATGCACCAGAGAAAATAGTGGAATGGGGGAAGCCAAAAGTTGTGAGTCTGTCATAATGATGTCAAGTGAC
ACACTTTTTCATTGCGATCTAGGTGTACCATACCTTAGCAAAAACAATCTATTTTCCATTTCTGGATTTC
TTAATAACTTAAACTATATAAATAAGCTCCTTTTCCATCATATGAACTGTTCTTACATATTCTCTGGCCT
TCCTTTGTCCAAATGTTGAGTTGAAGTTTTCATTGCATATTCTCTGTGCACTTTGCATTACCTAATGGTT
TCCTGGCTCATGTGAGAGAAGTCAGCGTCAGCAGTCGGGTTTTGCCGAGATATTTTCTTGTCCTTTCCAG
CATAGAGCTCTACAAACAAAGGCAGGGTTATCACATGTACCCGAGAGCTGCCTGGGAAAAGTGGGAGCTA
TAGTTATCAAAATTGGAAACTTTATGAAGTATGCTTTTGTCTCCGTTTTTGTTGCGTTCAATCAGATCAA
CAAGTGTTGGCTAAGTGTTGAGCGTGGTTTCCTGTGGGATTGTGTAAGGCTCTGTAGGACAATAAACGTG
TTGGGGGCACTGAGTAATGTAGCCATTTCTGACCCGGCAGCCAGGAAAATGTGAAACAATTTGCTTCTGG
AAACAGGACAGCCGGGGCCGTGTTCCTGCAACAGCAGACCAAGCACCGCGG
BMX 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BMX_1 ↗X:15,500,807正股15,500,758–15,500,817
BMX_2 ↗X:15,507,310正股15,507,261–15,507,320

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_9864D · enhancer · 15497965–15498226 · regulatory

ENSRX_55MFFD · CTCF_binding_site · 15498075–15498096 · regulatory

· motif · 15498077–15498093 · motif

IL6 可透過 phosphatidylinositol 3-kinase(PI3-kinase)路徑活化 BMX。其活化可能由 phosphoinositides 與 PH domain 結合所促成;來源將此機制表述為可能性。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:675 aa

1 aa675 aa結構域基序鋅指
依 P51813 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BMX 蛋白質長 675 個胺基酸,具有 PH domain(第 4–111 位)、Btk-type zinc finger(第 113–149 位)、SH2 domain(第 296–392 位)及 protein kinase domain(第 417–675 位);另含位於第 596–603 位的 CAV1-binding motif。BMX 每個亞基可結合一個鋅離子。

結構域PH4–111 aa
結構域SH2296–392 aa
結構域Protein kinase417–675 aa
鋅指Btk-type113–149 aa
基序CAV1-binding596–603 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3SXR…

PDB · 3SXR

X-ray · 2.40 A · A/B=411-675

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

在細胞展開時,若與 BCAR1 形成複合體,BMX 會定位於細胞邊緣;此定位描述限定於該複合體狀態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ETKBMXBIRC2HSP90AB1PIM1PTPN21STAT3YWHAE
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BMX 與 BCAR1、CAV1、MYD88、PTK2/FAK1、RUFY1、RUFY2、STAT3、TIRAP 及 TNFRSF1B 有互作記錄。來源列出這些互作對象,但未逐一界定其是否形成同一複合體或各自的功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BMX 是非受體型酪胺酸激酶,參與多種訊號調節,涉及 actin 重組、細胞移動、增殖與存活、黏附及凋亡;也參與多類受體訊號、BCAR1 磷酸化、血管新生、STAT3 活化與 IL6 誘導分化,並可能涉及壓力保護、內吞及造血細胞生長分化。含實驗來源
證據與來源

Non-receptor tyrosine kinase that plays central but diverse modulatory roles in various signaling processes involved in the regulation of actin reorganization, cell migration, cell proliferation and survival, cell adhesion, and apoptosis. Participates in signal transduction stimulated by growth factor receptors, cytokine receptors, G protein-coupled receptors, antigen receptors and integrins. Induces tyrosine phosphorylation of BCAR1 in response to integrin regulation. Activation of BMX by integrins is mediated by PTK2/FAK1, a key mediator of integrin signaling events leading to the regulation of actin cytoskeleton and cell motility. Plays a critical role in TNF-induced angiogenesis, and implicated in the signaling of TEK and FLT1 receptors, 2 important receptor families essential for angiogenesis. Required for the phosphorylation and activation of STAT3, a transcription factor involved in cell differentiation. Also involved in interleukin-6 (IL6) induced differentiation. Also plays a role in programming adaptive cytoprotection against extracellular stress in different cell systems, salivary epithelial cells, brain endothelial cells, and dermal fibroblasts. May be involved in regulation of endocytosis through its interaction with an endosomal protein RUFY1. May also play a role in the growth and differentiation of hematopoietic cells; as well as in signal transduction in endocardial and arterial endothelial cells

PMID 10688651 ↗ · PMID 11331870 ↗ · PMID 12370298 ↗ · PMID 12832404 ↗ · PMID 15788485 ↗ · PMID 18292575 ↗ · PMID 9520419 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+)推論支持
證據與來源

L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性BMX 的每個亞基可結合一個鋅離子。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BMX 與 BCAR1、CAV1、MYD88、PTK2/FAK1、RUFY1、RUFY2、STAT3、TIRAP 及 TNFRSF1B 有互作記錄。含實驗來源
證據與來源

Interacts with BCAR1, CAV1, MYD88, PTK2/FAK1, RUFY1, RUFY2, STAT3, TIRAP and TNFRSF1B

PMID 10688651 ↗ · PMID 11331870 ↗ · PMID 11751885 ↗ · PMID 11877430 ↗ · PMID 12370298 ↗ · PMID 12832404 ↗ · PMID 18292575 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BMX 位於細胞質;當 BMX 與 BCAR1 形成複合體時,在展開中的細胞會定位於細胞邊緣。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Localizes to the edges of spreading cells when complexed with BCAR1

PMID 12832404 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控IL6 可透過 phosphatidylinositol 3-kinase(PI3-kinase)路徑活化 BMX;活化可能是 phosphoinositides 與 PH domain 結合所致。含實驗來源
證據與來源

Activated by IL6/interleukin-6 through phosphatidylinositol 3-kinase (PI3-kinase) pathway. It is likely that activation occurs through binding of phosphoinositides to the PH domain

PMID 11331870 ↗ · PMID 9520419 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000348343 · 2,543 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCATTTCTGACCCGGCAGCCAGGAAAATGTGAAACAAT40
41TTGCTTCTGGAAACAGGACAGCCGGGGCCGTGTTCCTGCA80
81ACAGCAGACCAAGCACCGCGGCGGACCCAGGCAAGCACGG120
121AACAAGCTGAGACGGATGATAATATGGATACAAAATCTAT160
161TCTAGAAGAACTTCTTCTCAAAAGATCACAGCAAAAGAAG200
201AAAATGTCACCAAATAATTACAAAGAACGGCTTTTTGTTT240
241TGACCAAAACAAACCTTTCCTACTATGAATATGACAAAAT280
281GAAAAGGGGCAGCAGAAAAGGATCCATTGAAATTAAGAAA320
321ATCAGATGTGTGGAGAAAGTAAATCTCGAGGAGCAGACGC360
361CTGTAGAGAGACAGTACCCATTTCAGATTGTCTATAAAGA400
401TGGGCTTCTCTATGTCTATGCATCAAATGAAGAGAGCCGA440
441AGTCAGTGGTTGAAAGCATTACAAAAAGAGATAAGGGGTA480
481ACCCCCACCTGCTGGTCAAGTACCATAGTGGGTTCTTCGT520
521GGACGGGAAGTTCCTGTGTTGCCAGCAGAGCTGTAAAGCA560
561GCCCCAGGATGTACCCTCTGGGAAGCATATGCTAATCTGC600
601ATACTGCAGTCAATGAAGAGAAACACAGAGTTCCCACCTT640
641CCCAGACAGAGTGCTGAAGATACCTCGGGCAGTTCCTGTT680
681CTCAAAATGGATGCACCATCTTCAAGTACCACTCTAGCCC720
721AATATGACAACGAATCAAAGAAAAACTATGGCTCCCAGCC760
761ACCATCTTCAAGTACCAGTCTAGCGCAATATGACAGCAAC800
801TCAAAGAAAATCTATGGCTCCCAGCCAAACTTCAACATGC840
841AGTATATTCCAAGGGAAGACTTCCCTGACTGGTGGCAAGT880
881AAGAAAACTGAAAAGTAGCAGCAGCAGTGAAGATGTTGCA920
921AGCAGTAACCAAAAAGAAAGAAATGTGAATCACACCACCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。