演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BMP8BOP-2

bone morphogenetic protein 8b

BMP8B(bone morphogenetic protein 8b)是 TGF-beta 家族的分泌蛋白,與軟骨及骨形成相關;其作用也可能涉及鈣調節與骨骼恆定。

Homo sapiens1p34.2UniProt P34820
OFFICIAL SYMBOL
BMP8B
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P34820
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BMP8B 的正式名稱為 bone morphogenetic protein 8b,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸於 TGF-beta 家族。此蛋白質長 402 個胺基酸,序列起始端含有一段訊號胜肽,資料註解的位置為第 1 至第 19 個胺基酸。來源將其描述為分泌蛋白,並指出它與軟骨及骨形成有關;至於鈣調節與骨骼恆定方面的作用,則標示為依相似性推定。這些資訊概述了 BMP8B 的家族歸屬、基本序列特徵與主要生物學關聯。

Official symbol
BMP8B
Gene name
bone morphogenetic protein 8b
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1075
UniProt
P34820
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
OP-2BMP8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p34.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegBMP8Bpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:39,756,765–39,788,865
Gene span
32,101 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372827 ★39,757,182–39,788,8657
ENST0000114522939,756,765–39,788,8657
ENST0000110969339,762,168–39,788,8657

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BMP8B 被描述為可誘導軟骨與骨形成,顯示其功能與骨骼組織生成有關。來源也提出,它可能是上皮骨生成現象中的骨誘導因子;「可能」表示這項角色並非以確定語氣陳述,應與其誘導軟骨及骨形成的描述區分看待。

此外,BMP8B 可能參與鈣調節及骨骼恆定。這兩項作用的註記為依相似性推定,因此現有資料支持的是可能的功能關聯,而非在此來源中直接確認的作用機制。來源未提供鈣調節如何發生、涉及哪些分子或細胞,也未說明其對骨骼恆定的具體影響途徑。

整體而言,現有描述將 BMP8B 的主要功能指向軟骨與骨形成,並保留其可能參與上皮骨生成、鈣調節及骨骼恆定的角色。這些資訊未進一步界定作用條件或機制,因此不宜延伸為特定的細胞訊號路徑或生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39788865 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BMP8B ENST00000372827 GRCh38 chr1:39788765-39789865 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCATTTGTTAAAAGAGGAGGTTCCAGTGGTAGGTACCCCCTGACGATGTGCAAGCATCACAGAAATGAC
ACAAGACACACACTGAGAACATGCCTCGCGCGTGGCAAGTGCTGACTGTTACCTGCCATTATTAGGCTCC
CCCGCCGGGGTCTCAGGGCCTTGGCACAAGCTCTTCCCTCTGCTTGGAGCACTTTCCTCCACTGACCTTT
CCTGGCGCTCCAGGTCAACTCCAGGAGCCTTCCCAGTACAGTCTAGGTGCCTTCTCCTTCCGCAGCGCCT
GAACCACACAGGAATAAGTAAGGCGAGAGCGCGCCCAGAGAAGAGCAGAGAGTGCAGAAAGGGGCTGAGT
TAGTAGAGGCATTTCCGCGGGGATCCTTCTCCTGCCAGGCCTGCACCGGGGCCGTGGCGACTGAGAAGTG
CACAGGTGGCTCCCGGGTGCTCCAGAAGGGCCCCAGAGCTCCTGGCCCGGCTAAAGGCAGGAGGCGGGTG
CGCGTCTCCCCCGCGAAGCTGGATCAGTACTGGGGGCGCAGGGGGCGCACGCCGCGCAGCGAGGGCTGGC
GGGGGCGGCCTGCCTGGGGCGCTGCCCAGGCTCACGCGGGAGCCAGGTGGGGGCGCGGGGAGGAGCAGCT
GAGCAGGTGCCGGGAAGGAGGCGCCTGCAGCATGCCATGGCGACCCGCGCACGCGACGGCGGGGCGGCCG
GGTGGCACCACTGGCGGGACCGGAAGGGCGCCGCGGCCCTAGGATCTCTGCGCCGAGGCCCGCGGCGGAA
GCCACGACGGCCATGACCACGCTGACGCCCAGGCTGCGAGCCCCTCGCCCGGGCCGCCTGCCCACCCGCC
ACGCCCAGGTAGCACCTCGGGGTCTCCCCACCCGCGACACCGGCCGCAGCCCCGGGCCCCCTCGCAGGCG
TGGCCCCCGCTCCCAGGCCCCGCCCCCGCCCCCCCATTGGTCAGTCCCGGGGTGGGGGCGGGCGACGCGG
ACCGCTGGGCAGGGCAGGGCAGGGACTCGCGGGAACCGCACCAAGCGGGTGGCTGCAGGAGCTCGCCCAT
CGCCCCTGCGCTGCTCGGACCGCGGCCACAGCCGGACTGGCGGGTACGGCG
BMP8B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BMP8B_1 ↗1:39,788,855負股39,788,845–39,788,904

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B9W73 · enhancer · 39785450–39786123 · regulatory

ENSR1_B9W76 · enhancer · 39786277–39787065 · regulatory

ENSR1_836KRZ · promoter · 39788855–39788986 · regulatory

ENSR1_B9W7K · enhancer · 39788987–39789818 · regulatory

ENSR1_5CCNKJ · CTCF_binding_site · 39789247–39789268 · regulatory

· motif · 39785112–39785127 · motif

· motif · 39785403–39785410 · motif

· motif · 39786608–39786621 · motif

· motif · 39786608–39786621 · motif

· motif · 39787979–39787994 · motif

· motif · 39787984–39787996 · motif

· motif · 39787987–39788002 · motif

· motif · 39787988–39788001 · motif

· motif · 39789138–39789147 · motif

· motif · 39789225–39789234 · motif

· motif · 39789249–39789265 · motif

· motif · 39789257–39789273 · motif

· motif · 39789257–39789273 · motif

· motif · 39789427–39789443 · motif

· motif · 39789655–39789667 · motif

· motif · 39792591–39792604 · motif

· motif · 39792591–39792604 · motif

· motif · 39792947–39792959 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:402 aa

1 aa402 aa訊號胜肽
依 P34820 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BMP8B 蛋白質長 402 個胺基酸,屬於 TGF-beta 家族。序列第 1 至第 19 個胺基酸被註記為訊號胜肽;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。

訊號胜肽1–19 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P34820…

AlphaFold · P34820

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

BMP8B 被註記為分泌蛋白。 來源未提供定位改變的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
OP-2BMP8B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BMP8B 以二硫鍵連結形成同源二聚體。此資訊描述的是蛋白質亞基間的連結形式;來源未列出其他結合夥伴或複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BMP8B 可誘導軟骨與骨形成,並可能是上皮骨生成現象中的骨誘導因子。此外,它可能參與鈣調節及骨骼恆定;這些後續作用標示為依相似性推定。推論支持
證據與來源

Induces cartilage and bone formation. May be the osteoinductive factor responsible for the phenomenon of epithelial osteogenesis. Plays a role in calcium regulation and bone homeostasis (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BMP8B 以二硫鍵連結形成同源二聚體。推論支持
證據與來源

Homodimer; disulfide-linked

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372827 · 4,826 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGGACTCGCGGGAACCGCACCAAGCGGGTGGCTGCAGGA40
41GCTCGCCCATCGCCCCTGCGCTGCTCGGACCGCGGCCACA80
81GCCGGACTGGCGGGTACGGCGGCGACAGACGGATTGGCCG120
121AGAGTCCCAGTCCGCAGAGTAGCCCCGGCCTCGAGGCGGT160
161GGCGTCCGCGTCCTCTCGTCCAGGAGCCAGGACAGGTGTC200
201GCGCGGCGGGCGCTCCAGGGACCGCGCTGAGGCCGCGGTC240
241GCCGCCCGTCCCGCCCCGCCCCGCCGCCCGCCGCCCGCCG280
281AGCCCAGCCTCCTTGCCGTCGGGGCGTCCCCAGGCCCTGG320
321GTCGGCCGCGGAGCCGATGCGCGCCCGCTGAGCGCCCCAG360
361CTGAGCGCCCCCGGCCTGCCATGACCGCGCTCCCCGGCCC400
401GCTCTGGCTCCTGGGCCTGGCGCTATGCGCGCTGGGCGGG440
441GGCGGCCCCGGCCTGCGACCCCCGCCCGGCTGTCCCCAGC480
481GACGTCTGGGCGCGCGCGAGCGCCGGGACGTGCAGCGCGA520
521GATCCTGGCGGTGCTCGGGCTGCCTGGGCGGCCCCGGCCC560
561CGCGCGCCACCCGCCGCCTCCCGGCTGCCCGCGTCCGCGC600
601CGCTCTTCATGCTGGACCTGTACCACGCCATGGCCGGCGA640
641CGACGACGAGGACGGCGCGCCCGCGGAGCGGCGCCTGGGC680
681CGCGCCGACCTGGTCATGAGCTTCGTTAACATGGTGGAGC720
721GAGACCGTGCCCTGGGCCACCAGGAGCCCCATTGGAAGGA760
761GTTCCGCTTTGACCTGACCCAGATCCCGGCTGGGGAGGCG800
801GTCACAGCTGCGGAGTTCCGGATTTACAAGGTGCCCAGCA840
841TCCACCTGCTCAACAGGACCCTCCACGTCAGCATGTTCCA880
881GGTGGTCCAGGAGCAGTCCAACAGGGAGTCTGACTTGTTC920
921TTTTTGGATCTTCAGACGCTCCGAGCTGGAGACGAGGGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。