基因總覽
BMP6（bone morphogenetic protein 6）是由蛋白質編碼基因產生的 TGF-beta 家族生長因子。其蛋白質具有分泌訊號區，並含有多段被註記為無序的區域。BMP6 參與多種發育過程，與軟骨及骨形成相關；它也具有調節 HAMP 表現與鐵代謝的作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000283147 ★ | 7,726,099–7,881,728 | 7 |
| ENST00000946083 | 7,726,049–7,881,728 | 7 |
| ENST00001124916 | 7,726,049–7,731,869 | 2 |
| ENST00001141307 | 7,726,049–7,881,728 | 7 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BMP6 是 TGF-beta 超家族的生長因子，在多種發育過程中具有重要作用，包含軟骨與骨的形成。除了發育相關角色，BMP6 也參與 HAMP（hepcidin）表現及鐵代謝調節；來源指出，BMP6 可作為 hemojuvelin（HJV）的配體，並促進 HAMP 表現。此作用可能涉及其受體 BMPR1A（ALK3），但來源對這一路徑使用「可能」描述，並未將其限定為唯一機制。
在典型 BMP 訊號傳遞中，BMP6 與第一型受體 ACVR1 及第二型受體 ACVR2B 結合，啟動訊號級聯反應。接著 ACVR1 磷酸化 SMAD1/5/8；這些分子移至細胞核後，可作為轉錄活化因子或抑制因子，調節目標基因的轉錄。因此，BMP6 的作用可由細胞表面受體傳遞至細胞核，影響基因表現。
BMP6 也能透過非典型訊號路徑作用，例如 TAZ-Hippo 訊號級聯，藉由調節 VEGFR2 表現來調控 VEGF 訊號。這顯示 BMP6 的功能不只涉及發育及 HAMP 調節，也可連結至 VEGF 訊號調控；來源未進一步說明此途徑在不同生理情境中的作用範圍。
Promoter 與基因調控
>BMP6 ENST00000283147 GRCh38 chr6:7725099-7726199 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAACCTTCATGTTTTACGTGAATTTGCTTCTACGATCCATAGATGACTGGATGTTCTCGGGCGGGGTAA AGGCAAATGAATTTGTGTCCTCATTGGCAAATGGTGTTGGTGGTGGTGTTATCTTGTCTAAAATCCACAG GAACCTGTGTTTCAGGACCCTGTCTATTGTCCTGACCATTCAGAATGCATGCCAAGCCCCTGCTCTTCCT GGAGTTATCTTTATCACCTCTCCTCAAGTTTTATCTTGCACCATATAAGTCACATTGTATTTCAATATTA AAATGCAACATTAATAGATAAGCTGGAGAATCAAGACATTTCCAAGAAGACAGGGGACGCCTTTTCTAAT ATATCGTCTGATTACACCCTCTTTCTTTTGGGTGCTAGCTTAAGAAGCCAAACCAAAGCACAAATGAACA GAGAAGTCAACACATCCGACCCCAAACCCTCAGGACGCTGGCTTGGGTTACATGTGGCCCTCTCTGTGGT CAGTTTGTGAGTAGCCTCCCCGGAGGGTGTGTCCCAACTTCCAGCAGCTGCCGTGGAAAGCCACGTGTCC GCTAAACGCCTACATTACATCAATAAGAGAAACTAAGGAAGGGATGGAAAAGCTATCATTTTTCTTTTCT TCCTCAGTTCTGGCAGTATAGTGATTTAATCGCTGTTATTATTTTTATTTAGTTAAAGCATCAACTTAGG CCTTTTAAATGATGGTAAAAGAGAAAGCTTCAGATCGGGGTATTGGTCAGATCATTCTTACTAGCGATGA CCTCTTCGCCTTTGGCACCTCGCGGCTCTTCGCATGCCTCCAAGAATTCCCGGGTCTTGAAACCTACGCG CGGCGGAGGCGACGCCTCTCGGGAGAGGGAGGGTGAAAGAAGGGGCGGGGCTATTTAAATAGCCCGCGAG CTTCGCGTCCCCATTGGCTGCCAGCCTGTCGGTTACCGCGGGGCGGGGAGTCCCGGGGCTGGAGTGAGGT ACCTGAGCCGGGCGCGCAGCAGAAAGCCCACGTTGGCCGCTGCGGGGAGCGCGGCGTGGAGAGGCGGGAG ACCGAATTCCGGCGCCGCCGCCGCGGCCGCTGCTCGGTGCACTAGCCCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BMP6_1 ↗ | 6:7,726,860 | 正股 | 7,726,811–7,726,870 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_953QB · enhancer · 7721623–7722029 · regulatory
ENSR6_B3JDD · enhancer · 7722886–7723759 · regulatory
ENSR6_53S39J · CTCF_binding_site · 7723185–7723206 · regulatory
ENSR6_953RH · promoter · 7725609–7726109 · regulatory
ENSR6_53S3W5 · CTCF_binding_site · 7726773–7726794 · regulatory
ENSR6_53S3WG · CTCF_binding_site · 7726841–7726862 · regulatory
ENSR6_53S3XH · CTCF_binding_site · 7727064–7727085 · regulatory
ENSR6_CQP8 · enhancer · 7730503–7731531 · regulatory
· motif · 7723187–7723203 · motif
· motif · 7723233–7723242 · motif
· motif · 7726775–7726791 · motif
· motif · 7726843–7726859 · motif
· motif · 7727066–7727082 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：513 aa
BMP6 屬於 TGF-beta 家族，蛋白質長 513 個胺基酸。其序列包含第 1–20 位的訊號區；另有四段被註記為無序區，分別位於第 38–66、89–131、145–200 與 373–398 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BMP6 被註記為分泌蛋白；來源未提供其在特定條件下發生定位改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
BMP6 與 ACVR1 的互作需考慮其糖基化狀態；此互作可能誘導 HAMP 表現。它也與受體 ACVR2B、BMPR1A（ALK3）互作。與 HJV、SOSTDC1 的互作標示為相似性推定。BMP6 可在體外與 BMP2 形成異源二聚體，該複合體可結合 BMPR1A（ALK3），並可能誘導 HAMP 表現。ERFE 與 BMP6 互作時，會抑制 BMP 誘導的 HAMP 轉錄。
疾病與遺傳關聯
BMP6 基因變異與鐵過載的易感性相關，來源未將此關聯描述為單一變異直接造成疾病。此病症的外顯率不完全且隨年齡而異，通常成年後出現肝臟及全身鐵含量升高、血清 ferritin 增加、轉鐵蛋白飽和度正常或偏高，以及 hepcidin 不適當地偏低或維持正常。表型嚴重度也受年齡、性別及其他遺傳或後天因素影響，包括飲酒與體重增加。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BMP6 是 TGF-beta 超家族生長因子，參與多種發育過程，包括軟骨與骨形成。它可作為 HJV 的配體，調節 HAMP／hepcidin 表現及鐵代謝；促進 HAMP 表現可能涉及 BMPR1A（ALK3）。BMP6 也可透過 ACVR1 與 ACVR2B 啟動典型 BMP 訊號，使 ACVR1 磷酸化 SMAD1/5/8，後者進入細胞核調節目標基因轉錄；此外，TAZ-Hippo 路徑可藉由調節 VEGFR2 表現影響 VEGF 訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Growth factor of the TGF-beta superfamily that plays essential roles in many developmental processes including cartilage and bone formation. Also plays an important role in the regulation of HAMP/hepcidin expression and iron metabolism by acting as a ligand for hemojuvelin/HJV. Also acts to promote expression of HAMP, potentially via the interaction with its receptor BMPR1A/ALK3. Initiates the canonical BMP signaling cascade by associating with type I receptor ACVR1 and type II receptor ACVR2B. In turn, ACVR1 propagates signal by phosphorylating SMAD1/5/8 that travel to the nucleus and act as activators and repressors of transcription of target. Can also signal through non-canonical pathway such as TAZ-Hippo signaling cascade to modulate VEGF signaling by regulating VEGFR2 expression PMID 18070108 ↗ · PMID 26582087 ↗ · PMID 30097509 ↗ · PMID 31019025 ↗ · PMID 31800957 ↗ · PMID 33021694 ↗ |
| 交互作用 | BMP6 與 SOSTDC1、HJV、ACVR1、ACVR2B 及 BMPR1A（ALK3）互作；其中 SOSTDC1 與 HJV 的互作依相似性推定。BMP6 糖基化時與 ACVR1 的互作可能誘導 HAMP 表現。BMP6 與 ERFE 的互作會抑制 BMP 誘導的 HAMP 轉錄。BMP6 亦可在體外與 BMP2 形成異源二聚體，該複合體可結合 BMPR1A（ALK3），並可能誘導 HAMP 表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with SOSTDC1 (By similarity). Interacts (when glycosylated) with type I receptor ACVR1; the interaction may induce HAMP expression. Interacts with type II receptor ACVR2B. Interacts with Hemojuvelin/HJV (By similarity). Interacts with ERFE; the interaction inhibits BMP-induced transcription of HAMP. Interacts with BMPR1A/ALK3. Forms heterodimers with BMP2 in vitro; the heterodimer then binds to its receptor BMPR1A /ALK3 and may induce HAMP expression PMID 18070108 ↗ · PMID 30097509 ↗ · PMID 31800957 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | BMP6 基因變異與鐵過載易感性相關。此病症外顯率不完全且隨年齡改變，通常成年後表現為肝臟及全身鐵含量升高、血清 ferritin 增加、轉鐵蛋白飽和度正常或偏高，以及 hepcidin 不適當地偏低或正常。嚴重度受年齡、性別及其他遺傳或後天因素影響，包括飲酒與體重增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Iron overload IO A disorder of iron homeostasis with incomplete and age-dependent penetrance. It is characterized by adult onset of increased hepatic and systemic iron levels, increased serum ferritin, normal or high transferrin saturation, and inappropriately low or normal levels of hepcidin. The severity of the phenotype depends on age, sex, as well as additional genetic or acquired factors including alcohol consumption and increased body weight. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620121 PMID 26582087 ↗ · PMID 27590690 ↗ · PMID 27591421 ↗ · PMID 28335084 ↗ · PMID 31640930 ↗ · PMID 32464486 ↗ · PMID 34037557 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAAGCCCACGTTGGCCGCTGCGGGGAGCGCGGCGTGGA40GAGGCGGGAGACCGAATTCCGGCGCCGCCGCCGCGGCCGC80TGCTCGGTGCACTAGCCCCCTTCCTTCCCATCCTTTCTGC120GAGCGGGTTTGCTGGGCAGCCGGGCGACCGCCGAACGGAA160AGCAAGATCCTCGCCGCCTCCGCTTGAGGAGGCGTGCGGC200GCGCGGAGATTTTGAGTGGGAGCGACGGTGCCCGAGAGCT240CAGGGGCGCGGAGTTCGTGAGCGAGAAGGAAGTTAAACCT280CGCGGAATAGACTGGCATTTCGGGACGCCTTGTCGCCGCA320GCCTGGGCCCTGCAACGGGGTAAACTTCATGGTGGCCCTG360CGATCTGGGGAGGGGCGTGCGCCACGGTGATGCCGGGCAT400CTCCCGCAGCTCGTGAGCGGCCCCGCTCCCCGCTGCCCCG440GGTCCCACTCAGTCGCCAGGGAGAGCGCGGGGCAGCGCAC480GTGTGCGGCCAGCGAGGCCCAGAGTGACCGCGCCGCGACT520CGCAGGAGCCAGGGCGCAGGCTGCAGTGCAGCCCGGACTC560AGACGCACCTGGCCTGGACCGCGCGCCTCTAGAGACCTGC600GCGAGGCTGTGAGGCTCCCCTTCCTCCCCTCCAAGCGGTT640CTCCTGGTGATCGCCCCTTCGCCACCTCTCTAGCCTGGGC680AACTGGGGGCGCCCCGGACGACCATGAGAGATAAGGACTG720AGGGCCAGGAAGGGGAAGCGAGCCCGCCGAGAGGTGGCGG760GGACTGCTCACGCCAAGGGCCACAGCGGCCGCGCTCCGGC800CTCGCTCCGCCGCTCCACGCCTCGCGGGATCCGCGGGGGC840AGCCCGGCCGGGCGGGGATGCCGGGGCTGGGGCGGAGGGC880GCAGTGGCTGTGCTGGTGGTGGGGGCTGCTGTGCAGCTGC920TGCGGGCCCCCGCCGCTGCGGCCGCCCTTGCCCGCTGCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。