演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BLZF1JEM-1

basic leucine zipper nuclear factor 1

BLZF1(basic leucine zipper nuclear factor 1)是蛋白質編碼基因,其產物參與維持 Golgi apparatus 的正常結構,並與蛋白質由 ER 經 Golgi apparatus 運送至細胞表面的過程有關。

Homo sapiens1q24.2UniProt Q9H2G9
OFFICIAL SYMBOL
BLZF1
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9H2G9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BLZF1 是人類的蛋白質編碼基因,正式名稱為 basic leucine zipper nuclear factor 1。其蛋白質產物具有兩種異構型,定位資訊顯示兩者的細胞分布並不相同:Isoform 1 在異源表現時可於細胞核中檢測到,而 Isoform 2 位於細胞質。蛋白質序列註解指出,N 端第 1–58 個胺基酸區域為無序區;第 18–22 位另有 Tankyrase-binding motif,且 C 端第 394–400 位區域對與 GORASP2 互作至關重要。這些特徵提供了 BLZF1 蛋白質的基本分子概況;其對 Golgi apparatus 相關功能的作用則於下方說明。

Official symbol
BLZF1
Gene name
basic leucine zipper nuclear factor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1065
UniProt
Q9H2G9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
JEM-1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q24.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegBLZF1pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:169,367,967–169,397,302
Gene span
29,336 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367808 ★169,368,195–169,388,3057
ENST00000367807169,367,970–169,377,3833
ENST00000329281169,367,970–169,397,3028
ENST00000899416169,367,970–169,392,3288
ENST00000899417169,367,970–169,388,3057
ENST00000899418169,367,970–169,388,3056
ENST00000930510169,367,970–169,388,5818
ENST00000947216169,367,970–169,388,3057
ENST00001097531169,367,970–169,388,3056
ENST00001125333169,367,970–169,377,3834
ENST00001145775169,367,970–169,388,3057
ENST00000420531169,367,972–169,376,8943

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BLZF1 的功能與 Golgi apparatus 的結構維持及細胞內蛋白質運輸有關。資料指出,正常的 Golgi apparatus 結構需要 BLZF1;因此,BLZF1 的角色不只涉及單一蛋白質的定位,也關聯到細胞中此胞器的正常組織狀態。

在運輸方面,BLZF1 對蛋白質從內質網(ER)經 Golgi apparatus 前往細胞表面的路徑是必要的。這條路徑將蛋白質由 ER 送入 Golgi apparatus,再朝細胞表面運送;來源將 BLZF1 與整段運輸過程相連,但未進一步說明它在各運輸步驟中的具體分子作用,也未指出其對特定貨物蛋白的選擇方式。

BLZF1 與 GORASP2 及 GTP 結合型 RAB2 有互作,並被鑑定存在於含有 RAB2 與 GORASP2 的複合體中。這些互作資訊與其 Golgi apparatus 相關功能並列,但現有資料未界定複合體各成員在結構維持或運輸中的個別分工,也不能據此推定完整的作用機制。

綜合來源所述,BLZF1 的功能重點是支持 Golgi apparatus 的正常結構,並協助蛋白質沿 ER 至細胞表面的運輸路徑進行。資料未提供具體生物學過程以外的下游結果,因此不宜將此功能延伸為特定細胞表面蛋白、疾病或生理效應的主張。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 169368195 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BLZF1 ENST00000367808 GRCh38 chr1:169367195-169368295 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACCTAGAAGGTAACCAACTGGATAGAAGAGCGCTGATCCAACATACACCTGTTAATGGCCCTCGTGGGG
GCGTGGGGCAGTGCTCTGCCACTCAGAAAAGCAAAAAGACTCCAAGATCTAGGGAGATTCAGATCAGTGT
TGAGACAGTCACATACACACCACCCCATACTCTTAATAAAGCGCGTTAATGTGAATCTGTGAACATGAAA
AATGCCATGATGAACAATGCAAACACATAATGTTTGTTCAAAACAGGTTATTAGACTCGATGCCTTACCC
TAAATTTTCTGTTTCATTACTCTAGAGACTTAGTAACATTAGTGGAATTCAGGGTGCTGTAAGAAATACG
GAGAGCGAGGAGACTGCAGGAACAGCCCGTGGGAAGGGGGAAAGAGATAACGGGGAGAAGGTCGGGAGGA
CCGGACAACTTTAAGTGCCCATCCGCCCGAAGACTTGGAAAGCTAAGTAAGTAGGACCCCAGAGCCGTTC
TTCTGGCATCCCCTGGCACTCACCATTGTCTCAGGATCTCAGCACTAGAAAATAGGTATCGTTGAGACAG
GAAGACACCACCACCACCACCATCATACGGTTACTCAGGCAACAAAGCCCCGCCCACTGTCGCACGAGGC
GTGGGACGCCACCGCCCCACCTCTTCGTCCTTAGTGGCTGGGAGTAATCTCAGCTGCGTTCATCCAATCG
ACAGACCCGCCCCTCCACGCTGTCGCCTGGGGCTACGAGACGCCATTATTCTGTTTCCGGCAGTTTTACT
TCCGTTTGTTTAACAGCTGGCCCGGAAGTTTAAGTGAATATGCGGCTTGGGCTCCAAAAGTTGCTGTACG
GTATTTTATTTTAAAGTAGAAATCTGTCCGCTTTTCACTTACGGAGGCCTTACAGTGTGTGTTCTGTGTT
ACTTGAGTTTATACGCACTGCAGAATTTGTTTACCCTGCTCTTTTGGAAACGTATTCCGGAAGCGAAACC
CTGAGTAATCGGAAGTGGTTAGGAGTGAGAGAGCTGCTGGATATGCGGAGGGACTGGGCGGGTCGGCTTC
CGAATGGAAGAGGTCTGTGAGAAGTTAACCTGGTGATACCGATCCGAAGAG
BLZF1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BLZF1_1 ↗1:169,368,000正股169,367,951–169,368,010
BLZF1_2 ↗1:169,368,213正股169,368,164–169,368,223

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B38LHS · enhancer · 169363104–169363958 · regulatory

ENSR1_94H834 · enhancer · 169364855–169365361 · regulatory

ENSR1_B38LJD · enhancer · 169367152–169367786 · regulatory

ENSR1_94H83X · promoter · 169367787–169368205 · regulatory

ENSR1_B38LJJ · enhancer · 169368206–169368928 · regulatory

ENSR1_86ZG7Z · enhancer · 169371539–169371708 · regulatory

· motif · 169363560–169363577 · motif

· motif · 169363717–169363734 · motif

· motif · 169367743–169367757 · motif

· motif · 169367759–169367776 · motif

· motif · 169367932–169367942 · motif

· motif · 169367946–169367955 · motif

· motif · 169367961–169367970 · motif

· motif · 169367961–169367972 · motif

· motif · 169367961–169367972 · motif

· motif · 169367961–169367974 · motif

· motif · 169367961–169367975 · motif

· motif · 169367983–169367994 · motif

· motif · 169367983–169367994 · motif

· motif · 169367985–169367994 · motif

· motif · 169368158–169368169 · motif

· motif · 169368160–169368169 · motif

· motif · 169368161–169368175 · motif

· motif · 169368161–169368175 · motif

· motif · 169368177–169368191 · motif

· motif · 169370470–169370483 · motif

· motif · 169370470–169370483 · motif

BLZF1 的表現會受到 retinoids 上調。來源未提供此調控作用的條件、幅度或相關分子機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:400 aa

1 aa400 aa功能區域基序
依 Q9H2G9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BLZF1 蛋白質長 400 個胺基酸。第 1–58 位為無序區;第 18–22 位含 Tankyrase-binding motif。C 端第 394–400 位區域對與 GORASP2 的互作至關重要。

功能區域Disordered1–58 aa
功能區域Essential for interaction with GORASP2394–400 aa
基序Tankyrase-binding motif18–22 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H2G9…

AlphaFold · Q9H2G9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane;Nucleus;Cytoplasm

BLZF1 位於 Golgi apparatus 膜。 異構型定位有所差異:Isoform 1 在異源表現條件下可於細胞核檢測到,未在細胞質檢出;Isoform 2 位於細胞質,未在細胞核檢出。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
JEM-1BLZF1AKAP9AMOTL2ANKS1AAQP1BAG3BAG4BANPBCL6BEX2CARD9CCDC120CCNHCDC20BCDC37CDK18CFAP206CHCHD3CINPCLCNKACTNNA3ENKD1EPHB6ERCC3EXOC8FAM124BFAM90A1FBF1FGFR3FHL2FRMD6FRS3GEMGORASP2GRIN2CGSNHDAC4HOXA1HOXC8HRASIGFN1IKZF3IL16INO80BIQUBKANK2KAT5KCTD9KIF9KLHL38LGALS14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 108 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BLZF1 與 GORASP2 互作,也會與 GTP 結合型 RAB2 互作;來源指出它不與其他 Golgi Rab 蛋白互作。此外,BLZF1 被鑑定存在於含有 RAB2 和 GORASP2 的複合體中。這些資料分別支持互作及複合體關聯,未說明各成員間的功能分工。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BLZF1 對 Golgi apparatus 的正常結構是必要的,也參與蛋白質由內質網(ER)經 Golgi apparatus 運送至細胞表面的過程。含實驗來源
證據與來源

Required for normal Golgi structure and for protein transport from the endoplasmic reticulum (ER) through the Golgi apparatus to the cell surface

PMID 11739401 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BLZF1 與 GORASP2 互作,也會與 GTP 結合型 RAB2 互作,但不與其他 Golgi Rab 蛋白互作;此外,BLZF1 被鑑定存在於含有 RAB2 與 GORASP2 的複合體中。含實驗來源
證據與來源

Interacts with GORASP2. Interacts with the GTP-bound form of RAB2, but not with other Golgi Rab proteins. Identified in a complex with RAB2 and GORASP2

PMID 11739401 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BLZF1 的細胞定位包含 Golgi apparatus 膜。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane

PMID 11739401 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位異構型 1 在異源表現時可於細胞核中檢測到,未在細胞質中檢測到。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Nucleus; Detected in the nucleus upon heterologous expression. Not detected in the cytoplasm

PMID 11056056 ↗ · PMID 9129147 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位異構型 2 定位於細胞質,且未在細胞核中檢測到。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Cytoplasm; Not detected in the nucleus

PMID 11056056 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控Retinoids 會上調 BLZF1;來源未說明此調控的條件或作用機制。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by retinoids

PMID 11056056 ↗ · PMID 9129147 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367808 · 2,524 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGAGTGAGAGAGCTGCTGGATATGCGGAGGGACTGGGCG40
41GGTCGGCTTCCGAATGGAAGAGGTCTGTGAGAAGTTAACC80
81TGGTGATACCGATCCGAAGAGCCTATCAAGTGAAGCCCCC120
121TGAAATACGGAGAATAAGAATCTTAGAGGTTGTTCAGCAG160
161AAGTCTTGGAGTGCATTTTCAGTGGTTAAGGTGAAAAAAT200
201GACTACTAAAAATTTAGAAACCAAAGTCACCGTTACTTCA240
241TCCCCAATCCGAGGAGCAGGAGATGGAATGGAAACTGAGG280
281AACCACCTAAATCTGTTGAAGTTACCTCCGGAGTCCAATC320
321TAGAAAGCATCATAGTCTTCAGAGTCCATGGAAGAAAGCA360
361GTTCCATCAGAGAGCCCAGGAGTTCTTCAGCTAGGGAAAA400
401TGCTCACTGAAAAAGCAATGGAAGTTAAAGCTGTAAGAAT440
441ATTAGTTCCCAAAGCTGCTATAACTCATGATATCCCCAAC480
481AAAAATACAAAGGTTAAGTCTCTGGGACATCATAAAGGAG520
521AATTCCTTGGTCAGTCAGAGGGAGTTATAGAACCTAATAA560
561GGAACTCTCAGAGGTAAAGAATGTATTGGAAAAGCTCAAG600
601AATTCTGAAAGAAGGTTACTACAGGACAAAGAAGGTCTTT640
641CAAACCAGCTCCGTGTACAGACAGAGGTAAATCGTGAGTT680
681AAAAAAGTTACTGGTGGCTTCTGTTGGGGATGATCTTCAG720
721TATCACTTTGAACGTCTAGCCCGTGAGAAAAATCAGCTTA760
761TTTTAGAAAATGAAGCCCTAGGTCGAAACACAGCTCAGCT800
801TTCTGAACAGTTAGAACGTATGTCAATACAGTGTGATGTA840
841TGGCGAAGTAAATTCCTTGCAAGCAGGGTAATGGCAGATG880
881AGTTAACCAACTCAAGAGCAGCTTTACAGCGTCAAAACCG920
921TGATGCACACGGGGCTATACAAGATCTCCTAAGTGAACGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。