演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BLVRBSDR43U1

biliverdin reductase B

BLVRB 編碼 biliverdin reductase B,屬於 BLVRB family。此酵素兼具 NAD(P)H 依賴型還原酶與 S-nitroso-CoA 依賴型亞硝基轉移酶活性。

Homo sapiens19q13.2UniProt P30043
OFFICIAL SYMBOL
BLVRB
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P30043
PDB / ALPHAFOLD
1HDO
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BLVRB 是蛋白質編碼基因,其產物 biliverdin reductase B 歸屬於 BLVRB family。這種酵素具有兩類催化能力:可作為 NAD(P)H 依賴型還原酶,也可作為 S-nitroso-CoA 依賴型亞硝基轉移酶。來源指出,它在胎兒發育期間參與血基質降解,並在成人組織中與造血、中間代謝及胰島素訊號調節相關。這些不同角色反映 biliverdin reductase B 的功能範圍不只涉及單一底物或生理過程;各項具體反應與作用條件見下方功能說明。

Official symbol
BLVRB
Gene name
biliverdin reductase B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1063
UniProt
P30043
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SDR43U1FLR

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25BLVRBpq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:40,446,758–40,465,826
Gene span
19,069 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000263368 ★40,447,768–40,465,7455
ENST0000064351940,446,758–40,465,8264
ENST0000059548340,446,758–40,465,8264
ENST0000085874940,446,758–40,465,8264
ENST0000085875040,446,758–40,465,8265
ENST0000085875140,446,758–40,465,8265
ENST0000092683840,446,758–40,465,8264
ENST0000103119240,446,758–40,465,8265
ENST0000114231840,446,758–40,465,8265
ENST0000092683740,447,789–40,465,8265
ENST0000103119140,447,794–40,465,8265
ENST0000085875240,447,797–40,465,8265

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

biliverdin reductase B 具有廣泛的氧化還原酵素活性,可利用 NAD(P)H 還原多種底物,包括 riboflavin、FAD、FMN、biliverdins、methemoglobin 與 PQQ。它也能在 FMN 和 NADPH 存在時,將與複合物結合的 Fe(3+) 還原為 Fe(2+)。來源列出的反應亦包括以 NADP(+) 為相關輔因子的 riboflavin 還原,以及 FMNH2 分別與 NAD(+) 或 NADP(+) 配對的反應。

在胎兒肝臟中,biliverdin reductase B 可將 biliverdin IXbeta 還原為 bilirubin IXbeta,參與胎兒血基質分解。biliverdin IXbeta 是胎兒主要的血基質分解產物,但成人體內沒有此物質;該酵素不會還原 bilirubin IXalpha。這些底物差異與發育階段限制,界定了其在胎兒血基質代謝中的作用。

此酵素也可作為蛋白質亞硝基轉移酶,催化包括 HMOX2、INSR 與 IRS1 在內的目標蛋白質半胱胺酸殘基亞硝基化。S-nitroso-CoA 依賴型反應採「乒乓」機制:BLVRB 先與 S-nitroso-CoA 及蛋白質底物結合,接著一氧化氮基團先轉移至 BLVRB 的 Cys-109 和 Cys-188,再由 S-nitroso-BLVRB 轉交給蛋白質底物。

在胰島素訊號中,BLVRB 介導 INSR 和 IRS1 的亞硝基化,並因此抑制這兩種蛋白質及胰島素訊號。成人組織中的相關功能還包括造血與中間代謝調節;來源列出的代謝途徑涵蓋 glutaminolysis、glycolysis、TCA cycle 和 pentose phosphate pathway。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 40465745 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BLVRB ENST00000263368 GRCh38 chr19:40465645-40466745 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGCCGCACACTCCCCGGCAGTCACAAACAGTGTCATAGGCCCACACATCACGCACAGCTTCACAGCCACA
GTGTCACACACTCTACACACTCGAACCTTCATAGCAGTCGCCCCGCACATGCTGCACCGCCGCACCTCAC
ACATCATAGTCACAGGGGGTCACAATGAGCAGCTCAACACAGACACCCACAGCCACACACTCGAATGGGG
TCCCGGTGTCACACATCCTTACACGAGACATGTGGTGTCACACACTGTCACAGTCTAATTAGTCTCACGC
TTCCATGTAGCACACCTCACACGTCCCACACCCTATCGTACAGGCTGACGCAGTGTCACCCACGGTGTCA
CCACAAGGTCACAAAAGAACAGAATCAATGCCTGCCACACGTGGTGTCACGCACGTGTAGTCACACTGTA
ACACGGGATCACACTCAGAGGATGACACAAGGTGTCACCCACAGTCCTGCTTGCCCTCCGGGTCACTGAG
TCACACAGGGTCATATAAGTGCATAGGTACGCCGTGACACAGTGTCTTACATCCAAGTGCACACACACAC
TCTGTCCTCCTAACTTTCTCCCCTTGCTGGTTCTGGGAGGCCCTGGGGCTTAGAGTGCGCCCCAGATCCG
CTCCAGGCTCCGGGAGAGGGGGCGTGAGCTACGAGAGGCCGTGGGTGAGGCTCGCCTGGCCCCGCCCCTC
TCCGGGAGGTGGAGCGCGGAGGCAGGGCGCTGAGTGACAAGTTATCTCGGCTCCGTCCACTCTATTTGTT
GCTATGTGGAGGCGTGGCCTTCTGTGGCCCCGCCTTCCAGTCTAAGTGGCGCGCAGAGAGGGCGGTGCTG
GACGGTGAGCGAATGCAAGCTGACGCCTGCCCCGCCCATCCGCGTTAGGCCCCGCCCCTTGACCTGAGCC
GCGGGCGGAGAGTCTGAGGCGTGGCCCTTCGAGCCAGCTCCGCCCCGTTGTTCCTGGCTTGAGTAGGGCA
GAGAGCACCGCCCAGCAGCCAGTGGGTTCCCGCGCGTGCCGAGACTCTGAGGCCTTGCACCCCCACGATC
CCGTACGATGGCCGTCAAGAAGATCGCGATCTTCGGCGCCACTGGCCAGAC
BLVRB 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BLVRB_1 ↗19:40,465,745負股40,465,735–40,465,794

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BB2RT · enhancer · 40461752–40462276 · regulatory

ENSR19_BB2S4 · enhancer · 40463013–40463963 · regulatory

ENSR19_C62F6 · enhancer · 40464250–40465734 · regulatory

ENSR19_BB2SG · promoter · 40465735–40466251 · regulatory

ENSR19_5CHZLQ · CTCF_binding_site · 40466028–40466049 · regulatory

ENSR19_5CHZMX · CTCF_binding_site · 40466285–40466306 · regulatory

ENSR19_9L3N5 · promoter · 40466511–40467011 · regulatory

ENSR19_BB2SM · enhancer · 40467012–40467774 · regulatory

· motif · 40461850–40461865 · motif

· motif · 40461851–40461865 · motif

· motif · 40461886–40461899 · motif

· motif · 40461892–40461907 · motif

· motif · 40461946–40461957 · motif

· motif · 40462057–40462072 · motif

· motif · 40462136–40462149 · motif

· motif · 40464563–40464571 · motif

· motif · 40464617–40464628 · motif

· motif · 40465233–40465246 · motif

· motif · 40465233–40465246 · motif

· motif · 40465304–40465321 · motif

· motif · 40465313–40465321 · motif

· motif · 40465313–40465330 · motif

· motif · 40465630–40465643 · motif

· motif · 40465847–40465857 · motif

· motif · 40465867–40465877 · motif

· motif · 40465958–40465968 · motif

· motif · 40466030–40466046 · motif

· motif · 40466047–40466057 · motif

· motif · 40466085–40466098 · motif

· motif · 40466088–40466098 · motif

· motif · 40466252–40466260 · motif

· motif · 40466252–40466267 · motif

· motif · 40466287–40466303 · motif

· motif · 40466337–40466346 · motif

· motif · 40466351–40466360 · motif

· motif · 40466351–40466360 · motif

· motif · 40466436–40466458 · motif

· motif · 40466436–40466458 · motif

· motif · 40466519–40466531 · motif

· motif · 40466583–40466590 · motif

· motif · 40466752–40466761 · motif

· motif · 40466831–40466847 · motif

· motif · 40466831–40466847 · motif

· motif · 40466863–40466870 · motif

· motif · 40466968–40466975 · motif

· motif · 40467419–40467434 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:206 aa

biliverdin reductase B 屬於 BLVRB family。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1HDO…

PDB · 1HDO

X-ray · 1.15 A · A=1-206

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

來源將 BLVRB 的細胞內定位記載於細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SDR43U1BLVRBANXA10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源記載 biliverdin reductase B 以單體形式存在;此資訊描述其亞基狀態,未指出它與其他蛋白質形成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

10 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 10 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能biliverdin reductase B 兼具 NAD(P)H 依賴型還原酶與 S-nitroso-CoA 依賴型亞硝基轉移酶活性。它在胎兒肝臟參與血基質分解,成人則與造血、中間代謝及胰島素訊號調節相關;可還原多種黃素、biliverdins 等底物,但不還原 bilirubin IXalpha。其亞硝基轉移採乒乓機制,並可藉由 INSR 與 IRS1 的亞硝基化抑制胰島素訊號。含實驗來源
證據與來源

Enzyme that can both act as a NAD(P)H-dependent reductase and a S-nitroso-CoA-dependent nitrosyltransferase. Promotes fetal heme degradation during development. Also expressed in adult tissues, where it acts as a regulator of hematopoiesis, intermediary metabolism (glutaminolysis, glycolysis, TCA cycle and pentose phosphate pathway) and insulin signaling. Has a broad specificity oxidoreductase activity by catalyzing the NAD(P)H-dependent reduction of a variety of flavins, such as riboflavin, FAD or FMN, biliverdins, methemoglobin and PQQ (pyrroloquinoline quinone). Contributes to fetal heme catabolism by catalyzing reduction of biliverdin IXbeta into bilirubin IXbeta in the liver. Biliverdin IXbeta, which constitutes the major heme catabolite in the fetus is not present in adult. Does not reduce bilirubin IXalpha. Can also reduce the complexed Fe(3+) iron to Fe(2+) in the presence of FMN and NADPH. Acts as a protein nitrosyltransferase by catalyzing nitrosylation of cysteine residues of target proteins, such as HMOX2, INSR and IRS1. S-nitroso-CoA-dependent nitrosyltransferase activity is mediated via a 'ping-pong' mechanism: BLVRB first associates with both S-nitroso-CoA and protein substrate, nitric oxide group is then transferred from S-nitroso-CoA to Cys-109 and Cys-188 residues of BLVRB and from S-nitroso-BLVRB to the protein substrate. Inhibits insulin signaling by mediating nitrosylation of INSR and IRS1, leading to their inhibition

PMID 10620517 ↗ · PMID 10858451 ↗ · PMID 18241201 ↗ · PMID 27207795 ↗ · PMID 29500232 ↗ · PMID 38056462 ↗ · PMID 7929092 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性reduced riboflavin + NADP(+) = riboflavin + NADPH + 2 H(+)含實驗來源
證據與來源

reduced riboflavin + NADP(+) = riboflavin + NADPH + 2 H(+)

PMID 10620517 ↗ · PMID 18241201 ↗ · PMID 27207795 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性bilirubin IXbeta + NADP(+) = biliverdin IXbeta + NADPH + H(+)含實驗來源
證據與來源

bilirubin IXbeta + NADP(+) = biliverdin IXbeta + NADPH + H(+)

PMID 10858451 ↗ · PMID 18241201 ↗ · PMID 7929092 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性FMNH2 + NAD(+) = FMN + NADH + 2 H(+)含實驗來源
證據與來源

FMNH2 + NAD(+) = FMN + NADH + 2 H(+)

PMID 18241201 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性FMNH2 + NADP(+) = FMN + NADPH + 2 H(+)含實驗來源
證據與來源

FMNH2 + NADP(+) = FMN + NADPH + 2 H(+)

PMID 18241201 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-nitroso-CoA + L-cysteinyl-[protein] = S-nitroso-L-cysteinyl-[protein] + CoA含實驗來源
證據與來源

S-nitroso-CoA + L-cysteinyl-[protein] = S-nitroso-L-cysteinyl-[protein] + CoA

PMID 38056462 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-CoA = S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + CoA含實驗來源
證據與來源

L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-CoA = S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + CoA

PMID 38056462 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + L-cysteinyl-[protein] = L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-L-cysteinyl-[protein]含實驗來源
證據與來源

S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + L-cysteinyl-[protein] = L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-L-cysteinyl-[protein]

PMID 38056462 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer含實驗來源
證據與來源

Monomer

PMID 11224564 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BLVRB 的細胞內定位記載為細胞質。此項定位資料未提供會改變定位的條件、不同異構型之間的定位差異,或定位隨時間變動的資訊,因此僅能說明來源所列的細胞區域。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 38056462 ↗ · PMID 7929092 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 10 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000263368 · 799 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGGGTTCCCGCGCGTGCCGAGACTCTGAGGCCTTGCAC40
41CCCCACGATCCCGTACGATGGCCGTCAAGAAGATCGCGAT80
81CTTCGGCGCCACTGGCCAGACCGGGCTCACCACCCTGGCG120
121CAGGCGGTGCAAGCAGGTTACGAAGTGACAGTGCTGGTGC160
161GGGACTCCTCCAGGCTGCCATCAGAGGGGCCCCGGCCGGC200
201CCACGTGGTAGTGGGAGATGTTCTGCAGGCAGCCGATGTG240
241GACAAGACCGTGGCTGGGCAGGACGCTGTCATCGTGCTGC280
281TGGGCACCCGCAATGACCTCAGTCCCACGACAGTGATGTC320
321CGAGGGCGCCCGGAACATTGTGGCAGCCATGAAGGCTCAT360
361GGTGTGGACAAGGTCGTGGCCTGCACCTCGGCTTTCCTGC400
401TCTGGGACCCTACCAAGGTGCCCCCACGACTGCAGGCTGT440
441GACTGATGACCACATCCGGATGCACAAGGTGCTGCGGGAA480
481TCAGGCCTGAAGTACGTGGCTGTGATGCCGCCACACATAG520
521GAGACCAGCCACTAACTGGGGCGTACACAGTGACCCTGGA560
561TGGACGAGGGCCCTCAAGGGTCATCTCCAAACATGACCTG600
601GGCCATTTCATGCTGCGCTGCCTCACCACCGATGAGTACG640
641ACGGACACAGCACCTACCCCTCCCACCAGTACCAGTAGCA680
681CTCTGTCCCCATCTGGGAGGGTGGCATTCTGGGACATGAG720
721GAGCAAAGGAAGGGGGCAATAAATGTTGAGCCAAGAGCTT760
761CAAATTACTCTAGAGAAACCGACTGTGTGACTCTTCCTC799

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。