基因總覽
BLVRB 是蛋白質編碼基因,其產物 biliverdin reductase B 歸屬於 BLVRB family。這種酵素具有兩類催化能力:可作為 NAD(P)H 依賴型還原酶,也可作為 S-nitroso-CoA 依賴型亞硝基轉移酶。來源指出,它在胎兒發育期間參與血基質降解,並在成人組織中與造血、中間代謝及胰島素訊號調節相關。這些不同角色反映 biliverdin reductase B 的功能範圍不只涉及單一底物或生理過程;各項具體反應與作用條件見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263368 ★ | 40,447,768–40,465,745 | 5 |
| ENST00000643519 | 40,446,758–40,465,826 | 4 |
| ENST00000595483 | 40,446,758–40,465,826 | 4 |
| ENST00000858749 | 40,446,758–40,465,826 | 4 |
| ENST00000858750 | 40,446,758–40,465,826 | 5 |
| ENST00000858751 | 40,446,758–40,465,826 | 5 |
| ENST00000926838 | 40,446,758–40,465,826 | 4 |
| ENST00001031192 | 40,446,758–40,465,826 | 5 |
| ENST00001142318 | 40,446,758–40,465,826 | 5 |
| ENST00000926837 | 40,447,789–40,465,826 | 5 |
| ENST00001031191 | 40,447,794–40,465,826 | 5 |
| ENST00000858752 | 40,447,797–40,465,826 | 5 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
biliverdin reductase B 具有廣泛的氧化還原酵素活性,可利用 NAD(P)H 還原多種底物,包括 riboflavin、FAD、FMN、biliverdins、methemoglobin 與 PQQ。它也能在 FMN 和 NADPH 存在時,將與複合物結合的 Fe(3+) 還原為 Fe(2+)。來源列出的反應亦包括以 NADP(+) 為相關輔因子的 riboflavin 還原,以及 FMNH2 分別與 NAD(+) 或 NADP(+) 配對的反應。
在胎兒肝臟中,biliverdin reductase B 可將 biliverdin IXbeta 還原為 bilirubin IXbeta,參與胎兒血基質分解。biliverdin IXbeta 是胎兒主要的血基質分解產物,但成人體內沒有此物質;該酵素不會還原 bilirubin IXalpha。這些底物差異與發育階段限制,界定了其在胎兒血基質代謝中的作用。
此酵素也可作為蛋白質亞硝基轉移酶,催化包括 HMOX2、INSR 與 IRS1 在內的目標蛋白質半胱胺酸殘基亞硝基化。S-nitroso-CoA 依賴型反應採「乒乓」機制:BLVRB 先與 S-nitroso-CoA 及蛋白質底物結合,接著一氧化氮基團先轉移至 BLVRB 的 Cys-109 和 Cys-188,再由 S-nitroso-BLVRB 轉交給蛋白質底物。
在胰島素訊號中,BLVRB 介導 INSR 和 IRS1 的亞硝基化,並因此抑制這兩種蛋白質及胰島素訊號。成人組織中的相關功能還包括造血與中間代謝調節;來源列出的代謝途徑涵蓋 glutaminolysis、glycolysis、TCA cycle 和 pentose phosphate pathway。
Promoter 與基因調控
>BLVRB ENST00000263368 GRCh38 chr19:40465645-40466745 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCCGCACACTCCCCGGCAGTCACAAACAGTGTCATAGGCCCACACATCACGCACAGCTTCACAGCCACA GTGTCACACACTCTACACACTCGAACCTTCATAGCAGTCGCCCCGCACATGCTGCACCGCCGCACCTCAC ACATCATAGTCACAGGGGGTCACAATGAGCAGCTCAACACAGACACCCACAGCCACACACTCGAATGGGG TCCCGGTGTCACACATCCTTACACGAGACATGTGGTGTCACACACTGTCACAGTCTAATTAGTCTCACGC TTCCATGTAGCACACCTCACACGTCCCACACCCTATCGTACAGGCTGACGCAGTGTCACCCACGGTGTCA CCACAAGGTCACAAAAGAACAGAATCAATGCCTGCCACACGTGGTGTCACGCACGTGTAGTCACACTGTA ACACGGGATCACACTCAGAGGATGACACAAGGTGTCACCCACAGTCCTGCTTGCCCTCCGGGTCACTGAG TCACACAGGGTCATATAAGTGCATAGGTACGCCGTGACACAGTGTCTTACATCCAAGTGCACACACACAC TCTGTCCTCCTAACTTTCTCCCCTTGCTGGTTCTGGGAGGCCCTGGGGCTTAGAGTGCGCCCCAGATCCG CTCCAGGCTCCGGGAGAGGGGGCGTGAGCTACGAGAGGCCGTGGGTGAGGCTCGCCTGGCCCCGCCCCTC TCCGGGAGGTGGAGCGCGGAGGCAGGGCGCTGAGTGACAAGTTATCTCGGCTCCGTCCACTCTATTTGTT GCTATGTGGAGGCGTGGCCTTCTGTGGCCCCGCCTTCCAGTCTAAGTGGCGCGCAGAGAGGGCGGTGCTG GACGGTGAGCGAATGCAAGCTGACGCCTGCCCCGCCCATCCGCGTTAGGCCCCGCCCCTTGACCTGAGCC GCGGGCGGAGAGTCTGAGGCGTGGCCCTTCGAGCCAGCTCCGCCCCGTTGTTCCTGGCTTGAGTAGGGCA GAGAGCACCGCCCAGCAGCCAGTGGGTTCCCGCGCGTGCCGAGACTCTGAGGCCTTGCACCCCCACGATC CCGTACGATGGCCGTCAAGAAGATCGCGATCTTCGGCGCCACTGGCCAGAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BLVRB_1 ↗ | 19:40,465,745 | 負股 | 40,465,735–40,465,794 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BB2RT · enhancer · 40461752–40462276 · regulatory
ENSR19_BB2S4 · enhancer · 40463013–40463963 · regulatory
ENSR19_C62F6 · enhancer · 40464250–40465734 · regulatory
ENSR19_BB2SG · promoter · 40465735–40466251 · regulatory
ENSR19_5CHZLQ · CTCF_binding_site · 40466028–40466049 · regulatory
ENSR19_5CHZMX · CTCF_binding_site · 40466285–40466306 · regulatory
ENSR19_9L3N5 · promoter · 40466511–40467011 · regulatory
ENSR19_BB2SM · enhancer · 40467012–40467774 · regulatory
· motif · 40461850–40461865 · motif
· motif · 40461851–40461865 · motif
· motif · 40461886–40461899 · motif
· motif · 40461892–40461907 · motif
· motif · 40461946–40461957 · motif
· motif · 40462057–40462072 · motif
· motif · 40462136–40462149 · motif
· motif · 40464563–40464571 · motif
· motif · 40464617–40464628 · motif
· motif · 40465233–40465246 · motif
· motif · 40465233–40465246 · motif
· motif · 40465304–40465321 · motif
· motif · 40465313–40465321 · motif
· motif · 40465313–40465330 · motif
· motif · 40465630–40465643 · motif
· motif · 40465847–40465857 · motif
· motif · 40465867–40465877 · motif
· motif · 40465958–40465968 · motif
· motif · 40466030–40466046 · motif
· motif · 40466047–40466057 · motif
· motif · 40466085–40466098 · motif
· motif · 40466088–40466098 · motif
· motif · 40466252–40466260 · motif
· motif · 40466252–40466267 · motif
· motif · 40466287–40466303 · motif
· motif · 40466337–40466346 · motif
· motif · 40466351–40466360 · motif
· motif · 40466351–40466360 · motif
· motif · 40466436–40466458 · motif
· motif · 40466436–40466458 · motif
· motif · 40466519–40466531 · motif
· motif · 40466583–40466590 · motif
· motif · 40466752–40466761 · motif
· motif · 40466831–40466847 · motif
· motif · 40466831–40466847 · motif
· motif · 40466863–40466870 · motif
· motif · 40466968–40466975 · motif
· motif · 40467419–40467434 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 BLVRB 的細胞內定位記載於細胞質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- ANXA10Q9UJ72 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
來源記載 biliverdin reductase B 以單體形式存在;此資訊描述其亞基狀態,未指出它與其他蛋白質形成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 10 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | biliverdin reductase B 兼具 NAD(P)H 依賴型還原酶與 S-nitroso-CoA 依賴型亞硝基轉移酶活性。它在胎兒肝臟參與血基質分解,成人則與造血、中間代謝及胰島素訊號調節相關;可還原多種黃素、biliverdins 等底物,但不還原 bilirubin IXalpha。其亞硝基轉移採乒乓機制,並可藉由 INSR 與 IRS1 的亞硝基化抑制胰島素訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Enzyme that can both act as a NAD(P)H-dependent reductase and a S-nitroso-CoA-dependent nitrosyltransferase. Promotes fetal heme degradation during development. Also expressed in adult tissues, where it acts as a regulator of hematopoiesis, intermediary metabolism (glutaminolysis, glycolysis, TCA cycle and pentose phosphate pathway) and insulin signaling. Has a broad specificity oxidoreductase activity by catalyzing the NAD(P)H-dependent reduction of a variety of flavins, such as riboflavin, FAD or FMN, biliverdins, methemoglobin and PQQ (pyrroloquinoline quinone). Contributes to fetal heme catabolism by catalyzing reduction of biliverdin IXbeta into bilirubin IXbeta in the liver. Biliverdin IXbeta, which constitutes the major heme catabolite in the fetus is not present in adult. Does not reduce bilirubin IXalpha. Can also reduce the complexed Fe(3+) iron to Fe(2+) in the presence of FMN and NADPH. Acts as a protein nitrosyltransferase by catalyzing nitrosylation of cysteine residues of target proteins, such as HMOX2, INSR and IRS1. S-nitroso-CoA-dependent nitrosyltransferase activity is mediated via a 'ping-pong' mechanism: BLVRB first associates with both S-nitroso-CoA and protein substrate, nitric oxide group is then transferred from S-nitroso-CoA to Cys-109 and Cys-188 residues of BLVRB and from S-nitroso-BLVRB to the protein substrate. Inhibits insulin signaling by mediating nitrosylation of INSR and IRS1, leading to their inhibition PMID 10620517 ↗ · PMID 10858451 ↗ · PMID 18241201 ↗ · PMID 27207795 ↗ · PMID 29500232 ↗ · PMID 38056462 ↗ · PMID 7929092 ↗ |
| 分子活性 | reduced riboflavin + NADP(+) = riboflavin + NADPH + 2 H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源reduced riboflavin + NADP(+) = riboflavin + NADPH + 2 H(+) PMID 10620517 ↗ · PMID 18241201 ↗ · PMID 27207795 ↗ |
| 分子活性 | bilirubin IXbeta + NADP(+) = biliverdin IXbeta + NADPH + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源bilirubin IXbeta + NADP(+) = biliverdin IXbeta + NADPH + H(+) PMID 10858451 ↗ · PMID 18241201 ↗ · PMID 7929092 ↗ |
| 分子活性 | FMNH2 + NAD(+) = FMN + NADH + 2 H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | FMNH2 + NADP(+) = FMN + NADPH + 2 H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | S-nitroso-CoA + L-cysteinyl-[protein] = S-nitroso-L-cysteinyl-[protein] + CoA | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-CoA = S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + CoA | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + L-cysteinyl-[protein] = L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-L-cysteinyl-[protein] | 含實驗來源 | 證據與來源S-nitroso-L-cysteinyl-[SCAN] + L-cysteinyl-[protein] = L-cysteinyl-[SCAN] + S-nitroso-L-cysteinyl-[protein] PMID 38056462 ↗ |
| 交互作用 | Monomer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | BLVRB 的細胞內定位記載為細胞質。此項定位資料未提供會改變定位的條件、不同異構型之間的定位差異,或定位隨時間變動的資訊,因此僅能說明來源所列的細胞區域。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTGGGTTCCCGCGCGTGCCGAGACTCTGAGGCCTTGCAC40CCCCACGATCCCGTACGATGGCCGTCAAGAAGATCGCGAT80CTTCGGCGCCACTGGCCAGACCGGGCTCACCACCCTGGCG120CAGGCGGTGCAAGCAGGTTACGAAGTGACAGTGCTGGTGC160GGGACTCCTCCAGGCTGCCATCAGAGGGGCCCCGGCCGGC200CCACGTGGTAGTGGGAGATGTTCTGCAGGCAGCCGATGTG240GACAAGACCGTGGCTGGGCAGGACGCTGTCATCGTGCTGC280TGGGCACCCGCAATGACCTCAGTCCCACGACAGTGATGTC320CGAGGGCGCCCGGAACATTGTGGCAGCCATGAAGGCTCAT360GGTGTGGACAAGGTCGTGGCCTGCACCTCGGCTTTCCTGC400TCTGGGACCCTACCAAGGTGCCCCCACGACTGCAGGCTGT440GACTGATGACCACATCCGGATGCACAAGGTGCTGCGGGAA480TCAGGCCTGAAGTACGTGGCTGTGATGCCGCCACACATAG520GAGACCAGCCACTAACTGGGGCGTACACAGTGACCCTGGA560TGGACGAGGGCCCTCAAGGGTCATCTCCAAACATGACCTG600GGCCATTTCATGCTGCGCTGCCTCACCACCGATGAGTACG640ACGGACACAGCACCTACCCCTCCCACCAGTACCAGTAGCA680CTCTGTCCCCATCTGGGAGGGTGGCATTCTGGGACATGAG720GAGCAAAGGAAGGGGGCAATAAATGTTGAGCCAAGAGCTT760CAAATTACTCTAGAGAAACCGACTGTGTGACTCTTCCTC799cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。