基因總覽
BLNK 是蛋白質編碼基因，其產物為 B cell linker。這是一種位於 B 細胞受體（BCR）下游的連接蛋白，能將 SYK kinase 與多種訊號路徑連結，並參與調節 B 細胞功能與發育。蛋白質全長 456 個胺基酸，含有 SH2 結構域及一段無序區域；這些結構註解構成其基本分子特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000224337 ★ | 96,189,171–96,271,569 | 17 |
| ENST00000371176 | 96,189,171–96,271,607 | 16 |
| ENST00000696514 | 96,189,171–96,271,607 | 17 |
| ENST00000413476 | 96,189,171–96,271,607 | 16 |
| ENST00000427367 | 96,189,171–96,271,607 | 14 |
| ENST00000896451 | 96,189,171–96,272,658 | 18 |
| ENST00000896452 | 96,189,171–96,271,607 | 16 |
| ENST00000896453 | 96,189,171–96,271,607 | 15 |
| ENST00001142353 | 96,189,171–96,271,607 | 17 |
| ENST00000696513 | 96,191,290–96,271,607 | 18 |
| ENST00000696248 | 96,191,973–96,271,398 | 13 |
| ENST00000696253 | 96,191,973–96,271,398 | 15 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BLNK 是 BCR 下游的中央連接蛋白，負責把 SYK kinase 與多種訊號路徑串接，協調 B 細胞受體訊號及其生物學結果。其功能涉及多種訊號分子的活化與調節，並與 B 細胞功能和發育有關。
在訊號傳遞方面，BLNK 參與 ERK/EPHB2、MAP kinase p38 與 JNK 的活化，並調節 AP1 活性；它也對 NF-kappa-B 與 NFAT 的活化很重要。BLNK 同時參與 BCR 介導的 PLCG1、PLCG2 活化及 Ca(2+) 動員，並且是 BCR 運送至晚期內體所必需的。來源另指出，BLNK 可能也參與 RAC1-JNK 路徑。
BLNK 對 B 細胞發育階段轉換具有關鍵作用，負責協調 pro-B cell 轉變為 pre-B cell。另一方面，BLNK 對 pre-BCR 介導的 MAP kinase 與 phosphatidyl-inositol 3 (PI3) kinase 訊號活化似乎並非必要，顯示其功能依受體階段與訊號路徑而異。此外，BLNK 可能在 BCR 誘發的 B 細胞凋亡中具有重要作用；此項作用在來源中以可能性描述。
Promoter 與基因調控
>BLNK ENST00000224337 GRCh38 chr10:96271469-96272569 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGCTGCTCTTTAAACAACAGGTAAATCAGCATTTTTCAGATTAGGCAGAAGGAAATATAAAGTCTTCCA GGAGGGAAGTAGAGTTCTCTGAATAGGTTCAGCCCCTACAGGTATGGCTCCCTCCTCCCAGCCTCACCCC ACCTGTCTGACCTTGAGATGGCCTCGTGTCTGGCGTGTCACTGGGTGTGATGAGCAAGTGGTGGACAGGA CAGAAAGAGGCAAATGCAAGGAGGGGAATGGCATTCTGCTTTTAGGACTTCAGAATGGCCTGATGTAGGA ATTGCATTGTTGTGAAACTGTTAGATTTGTTCTCATCTGACTTTTGGGTACATCCTGGTTTGTTTGAAAG CATCTGGCTATCGGCGAGGTAACTCCTGACTCTATCAGGCAATAAGGAGGCTGCACATCTGACGATAGAG TTCATCTCCCCTTTCCTGAGTCATCCATCCCTACCCCCAGATGAACAGAGAATTGCCCATCCCATTTTAA ATAGAGCTCCAGAAAAAGAGATACTCTAATTCTCTGAGTAAACTGTTACCACCATGCCACTGACAACCTG ATATTTATTTTTAAACGTATTGCCCGCATCGGGGGGTAGGAAAAAGCACAAAAATGCCATTTTTATATAA TGGTTCTATAAGTAGAAAAAGCTTATCCATAACTTTATGCAAATAAGCAGAAAGTCTCCAAGAGAGGTTC AGATGGACTTGATTACTCTGCTTTTCCTTGAGCCCAGGAAGTTCCCAGTTATAGCATGCACCTGCTGGAA ACAGACTATATGTGTTTGGGACAAACAGGAAGTAGTGACCAGCCAGAAACTTGTCCTAACCTGGTTACAA ATCTGATTGTAAAAGAAAGCAGCTGGAAAGAAATTTGCCTGCCCAATAGGTTTCATTATTAAAGTTTACA CAAAGTGGAGTAATCACCAAGCTGGCTGGCTATCCAGATCACATGATTATGTAGAAACATGAAACTTGAC TATGTGCTCGGGCAAGTTTTACTTCTCCCTAGAGCAGGGGTGTTTGCCAGCAGCCTGCACTCTCAGAAAT CAGACTTGAGTGGCCGGAACCCTTGAGACCAGAGGCTTACCATGCTGCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BLNK_1 ↗ | 10:96,271,518 | 負股 | 96,271,508–96,271,567 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_93F7N6 · enhancer · 96267271–96267740 · regulatory
ENSR10_BP4T7 · promoter · 96271388–96272059 · regulatory
ENSR10_93F7PP · promoter · 96272640–96272932 · regulatory
ENSR10_BP4TF · enhancer · 96272933–96273787 · regulatory
· motif · 96267299–96267314 · motif
· motif · 96267299–96267314 · motif
· motif · 96268529–96268541 · motif
· motif · 96268531–96268553 · motif
· motif · 96268531–96268553 · motif
· motif · 96268859–96268871 · motif
· motif · 96268861–96268872 · motif
· motif · 96270363–96270378 · motif
· motif · 96270363–96270378 · motif
· motif · 96271766–96271775 · motif
· motif · 96271766–96271777 · motif
· motif · 96271766–96271777 · motif
· motif · 96271893–96271906 · motif
· motif · 96272575–96272587 · motif
· motif · 96272577–96272584 · motif
· motif · 96272607–96272622 · motif
· motif · 96272650–96272665 · motif
· motif · 96273092–96273105 · motif
· motif · 96273470–96273479 · motif
· motif · 96273493–96273506 · motif
· motif · 96273493–96273506 · motif
· motif · 96273513–96273526 · motif
· motif · 96273527–96273540 · motif
· motif · 96273864–96273876 · motif
· motif · 96274050–96274065 · motif
· motif · 96276279–96276291 · motif
· motif · 96276364–96276377 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：456 aa
B-cell linker protein 長 456 個胺基酸。其第 346–453 位胺基酸區段註解為 SH2 結構域；第 36–301 位則為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BLNK 位於細胞質與細胞膜；BCR 活化會使其轉位至膜組分。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- ARP10275 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BTKQ06187 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CD2APQ9Y5K6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KITP10721 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RCJMB04_1g20Q5ZMQ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BLNK 與 PLCG1、VAV1 及 NCK1 的關聯依賴 B 細胞抗原受體；另與 VAV3、PLCG2 和 GRB2 互作。其 SH2 結構域可與 CD79A、SYK 及 SCIMP 互作。SYK 會磷酸化並活化 BLNK；BLNK 與 SCIMP 的互作則依賴 SCIMP Tyr-131 的磷酸化。
疾病與遺傳關聯
BLNK 變異與常染色體隱性遺傳的無丙種球蛋白血症 4（Agammaglobulinemia 4, autosomal recessive；AGM4）有關。此原發性免疫缺陷的特徵包括血清抗體極低或缺失、循環中的 B 細胞低下或缺失，原因是 B 細胞發育早期受阻；患者在生命最初幾年可能發生嚴重感染。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BLNK 是 B 細胞受體（BCR）下游的中央連接蛋白，將 SYK kinase 連結至多條訊號路徑，並調節 B 細胞功能與發育。它參與 ERK/EPHB2、MAP kinase p38、JNK、NF-kappa-B 和 NFAT 活化及 AP1 調節，也參與 BCR 介導的 PLCG1、PLCG2 活化、Ca(2+) 動員與 BCR 運送至晚期內體。它對 pre-BCR 介導的 MAP kinase 與 PI3 kinase 訊號似乎非必要；可能參與 RAC1-JNK 路徑及 BCR 誘發的 B 細胞凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as a central linker protein, downstream of the B-cell receptor (BCR), bridging the SYK kinase to a multitude of signaling pathways and regulating biological outcomes of B-cell function and development. Plays a role in the activation of ERK/EPHB2, MAP kinase p38 and JNK. Modulates AP1 activation. Important for the activation of NF-kappa-B and NFAT. Plays an important role in BCR-mediated PLCG1 and PLCG2 activation and Ca(2+) mobilization and is required for trafficking of the BCR to late endosomes. However, does not seem to be required for pre-BCR-mediated activation of MAP kinase and phosphatidyl-inositol 3 (PI3) kinase signaling. May be required for the RAC1-JNK pathway. Plays a critical role in orchestrating the pro-B cell to pre-B cell transition. May play an important role in BCR-induced B-cell apoptosis PMID 10583958 ↗ · PMID 15270728 ↗ · PMID 16912232 ↗ · PMID 9697839 ↗ |
| 交互作用 | BLNK 會依賴 B 細胞抗原受體與 PLCG1、VAV1、NCK1 產生關聯，並與 VAV3、PLCG2、GRB2 互作。其 SH2 結構域可與 CD79A、SYK 及 SCIMP 互作；SYK 會磷酸化並活化 BLNK，而 BLNK 與 SCIMP 的互作依賴 SCIMP Tyr-131 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Associates with PLCG1, VAV1 and NCK1 in a B-cell antigen receptor-dependent fashion. Interacts with VAV3, PLCG2 and GRB2. Interacts through its SH2 domain with CD79A. Interacts (via SH2 domain) with SYK; phosphorylated and activated by SYK. Interacts (via SH2 domain) with SCIMP; this interaction is dependent on phosphorylation of SCIMP 'Tyr-131' PMID 16912232 ↗ · PMID 18369315 ↗ · PMID 21930792 ↗ · PMID 9341187 ↗ · PMID 9697839 ↗ |
| 細胞定位 | BLNK 位於細胞質與細胞膜；BCR 活化會促使 BLNK 轉位至膜組分。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cell membrane; BCR activation results in the translocation to membrane fraction PMID 9697839 ↗ |
| 疾病關聯 | BLNK 變異會造成常染色體隱性遺傳的無丙種球蛋白血症 4（AGM4），一種原發性免疫缺陷。疾病源於 B 細胞發育早期受阻，患者血清抗體及循環 B 細胞極低或缺失，並可能在生命最初幾年發生嚴重感染。 | 含實驗來源 | 證據與來源Agammaglobulinemia 4, autosomal recessive AGM4 A primary immunodeficiency characterized by profoundly low or absent serum antibodies and low or absent circulating B-cells due to an early block of B-cell development. Affected individuals develop severe infections in the first years of life. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613502 PMID 10583958 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTTCTCCCTAGAGCAGGGGTGTTTGCCAGCAGCCTGCAC40TCTCAGAAATCAGACTTGAGTGGCCGGAACCCTTGAGACC80AGAGGCTTACCATGCTGCTCCCTAGGAGGGCCAGGAACTG120CTGACGTGACCACTGGACAGTTATTCGTGTCTCTTACAAT160TACCAAACAGAATGGACAAGCTTAATAAAATAACCGTCCC200CGCCAGTCAGAAGTTGAGGCAGCTTCAAAAGATGGTCCAT240GATATTAAAAACAATGAAGGTGGAATAATGAATAAAATCA280AAAAGCTAAAAGTCAAAGCACCTCCAAGTGTTCCTCGAAG320GGACTACGCTTCAGAGAGCCCTGCTGACGAAGAGGAGCAG360TGGTCCGATGACTTTGACAGCGACTATGAAAATCCAGATG400AGCACTCGGACTCAGAGATGTACGTGATGCCCGCCGAGGA440GAACGCTGATGACAGCTACGAGCCGCCTCCAGTAGAGCAG480GAAACCAGGCCGGTTCACCCAGCCCTGCCCTTCGCCAGAG520GCGAGTATATAGACAATCGATCAAGCCAGAGGCATTCCCC560ACCCTTCAGCAAGACACTTCCCAGTAAGCCCAGCTGGCCT600TCAGAGAAAGCAAGGCTCACCTCCACCCTGCCGGCCCTGA640CTGCTTTGCAGAAACCTCAAGTCCCACCCAAACCCAAAGG680CCTCCTTGAGGATGAGGCTGATTATGTGGTCCCCGTGGAA720GATAATGATGAAAACTATATTCATCCCACAGAAAGCAGTT760CACCTCCACCTGAAAAAGCTCCCATGGTGAATAGATCAAC800CAAGCCAAATTCCTCAACGCCCGCCTCTCCTCCAGGAACA840GCTTCAGGTCGAAACAGTGGGGCCTGGGAAACCAAGTCAC880CTCCACCAGCTGCACCATCCCCGTTGCCACGGGCCGGGAA920AAAACCAACGACACCACTGAAGACAACTCCAGTTGCCTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。