演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BLCAPBC10

BLCAP apoptosis inducing factor

BLCAP apoptosis inducing factor 是 BLCAP 家族的短小蛋白質,具有兩段跨膜螺旋;資料指出它可抑制腫瘤生長,並參與細胞週期與細胞凋亡調控。

Homo sapiens20q11.23UniProt P62952
OFFICIAL SYMBOL
BLCAP
CHROMOSOME
20
UNIPROT
P62952
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BLCAP 基因是位於人類第 20 號染色體的蛋白質編碼基因,產物名稱為 BLCAP apoptosis inducing factor。此蛋白質屬於 BLCAP 家族,全長 87 個胺基酸,序列中有兩段螺旋型跨膜區域,分別位於第 19 至 39 個及第 43 至 63 個胺基酸。這些資料勾勒出其短小且含多個跨膜區段的基本特徵;其已知生物學角色涉及細胞增殖、細胞週期與細胞凋亡的調控,具體作用則見功能說明。

Official symbol
BLCAP
Gene name
BLCAP apoptosis inducing factor
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1055
UniProt
P62952
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BC10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020q11.23
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegBLCAPpq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr20:37,492,472–37,528,100
Gene span
35,629 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000373537 ★37,517,417–37,527,8762
ENST0000039713737,516,275–37,527,7322
ENST0000041454237,516,275–37,528,1003
ENST0000039713537,516,275–37,527,7462
ENST0000039713437,516,275–37,520,3032
ENST0000039713137,516,275–37,524,5512
ENST0000089426237,516,275–37,528,1003
ENST0000089426337,516,275–37,528,1003
ENST0000089426437,516,275–37,527,7463
ENST0000089426537,516,275–37,527,7323
ENST0000089426637,516,275–37,524,5513
ENST0000091721837,516,275–37,522,4943

顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BLCAP 被描述為腫瘤抑制因子,能促使細胞在 G(1)/S 檢查點停滯,並誘導細胞凋亡。來源指出,這些作用涉及依賴 RB1 的機制;同時,所述細胞週期停滯與凋亡作用不依賴 p53/TP53,也不依賴 NF-kappa-B。這些描述界定了其調控細胞生長與存活的作用方式,但未提供更細部的分子步驟。

除了影響細胞週期進程與凋亡,BLCAP 也會調節參與細胞增殖、細胞週期及細胞凋亡調控的基因表現。因此,其功能不只表現在檢查點停滯或細胞死亡結果,也包括改變相關基因的表現,進而介入這些生物學過程。來源未指出受調節基因的名稱,也未描述基因表現變化的方向或具體方式。

綜合這些資料,BLCAP 的主要功能特色是透過 RB1 相關、但不依賴 p53/TP53 與 NF-kappa-B 的機制,促進 G(1)/S 期停滯及細胞凋亡,並調節與增殖、細胞週期和凋亡有關的基因表現。這些作用支持其腫瘤抑制因子的定位;來源沒有進一步說明其在特定癌別或組織中的作用情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 37527876 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BLCAP ENST00000373537 GRCh38 chr20:37527776-37528876 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCAACTCTGCCGCTTCCCAGCTCCAGATCTGGGACAAATGTTCTTTCTGCCTAGAACATTTCCCCTCTC
ACTCTTACCCTAATCGTCCTTTGTTTCTCAACCTAAATGCCATCTTCCCAAGGAGGTTCCACCCTTTCCC
TACATTAGTACTCCATTAATTTCTCCTAACACTCTCTACTTCTTCTCACAGCACTTCCCATGATGTGTAA
TTATGTATTGATTAAAGTCACTAATATACAGTGATTATATGACTGTCTCCCCGCCTACCCGCCATTAGAC
TGGCAGTGCCTTGAGGTCAGGGACAGACCCAGGTTACCGACTCTACCTGCCCTTAGCACTGCGCTTGGGT
ACAGTAAGCGCCCAAGGAATATGCTTAATTAGCTAATAAATGACTACACGGACTCATTCAAGCCTCATAA
AAGCCCTAAGGTGGGCATTTCAACAGAAGCCGGGTCGGGGTGGGCGAGGGGCTCGCTGGCCCAAGGTACG
GGGCAAGTGGGGGAGCCGAGGCCTGACCCAAGGCAGTCCCAAGTTCTGAGCCCGGACCTTTCAGCTCCTG
AGCCTTGGCTGCATGATGAAACGCTAGGGAGGGGGTGGACTTTGAGCCACGAGAAGGTTTTCCCGGAGTC
CACGGACCATCCACGCGGGCAAGAACGAAGCGGGTTCACCAACATGAACACAACCCGGCCCGCCCAGCGC
TCACGGAGTAAGGATCACAATCTGCTGCATATGCATGAGGGGACCCGGCCGCGCTTCGGGGCTGTCCACA
CTGCGCCTGATAAAAATTATTCGGGCTTGAAGATCTCGGGGCTCCCAGAGTTTTGTAAAAGTGCATACAA
AGTCCTCAAAGGTGGTCTGTGGCTGATATTTACGGGAAATGGGGCGAGGATGAGCCCCCACTTCGGACCT
TGTGATCAGGCGTTTGCGGTAGACAGCCCGATCCCAGGATGGGTCCTCGGCCGGCTCGACTAGAAGACTA
AGGGGGCGTCTCCCCGGCTTCCTGCGGCGTCGGTGGCGAGCTGAGGTGGAGGCAGGCTGCGGCAGACGGC
GACAGTGGCGGCGGCGCCATGGCAGGGCTTGCAGGTACCGTGGCGTCAACC
BLCAP 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BLCAP_2 ↗20:37,524,452負股37,524,442–37,524,501
BLCAP_1 ↗20:37,527,875負股37,527,865–37,527,924

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_834R9J · enhancer · 37524324–37524540 · regulatory

ENSR20_9JW5T · promoter · 37524541–37525041 · regulatory

ENSR20_C5PJK · enhancer · 37525827–37527049 · regulatory

ENSR20_9JW6L · promoter · 37527050–37527550 · regulatory

ENSR20_B9G4F · promoter · 37527713–37528421 · regulatory

· motif · 37524647–37524660 · motif

· motif · 37524647–37524660 · motif

· motif · 37525155–37525172 · motif

· motif · 37525164–37525172 · motif

· motif · 37526379–37526392 · motif

· motif · 37527666–37527677 · motif

· motif · 37527729–37527739 · motif

· motif · 37527858–37527875 · motif

· motif · 37527945–37527960 · motif

· motif · 37528012–37528027 · motif

· motif · 37528140–37528153 · motif

· motif · 37528140–37528153 · motif

· motif · 37528141–37528155 · motif

· motif · 37528268–37528282 · motif

· motif · 37528268–37528283 · motif

· motif · 37528268–37528283 · motif

· motif · 37528492–37528506 · motif

· motif · 37528600–37528610 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:87 aa

1 aa87 aa跨膜區
依 P62952 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BLCAP apoptosis inducing factor 全長 87 個胺基酸,屬於 BLCAP 家族。其序列具有兩段螺旋型跨膜區域:第 19–39 個胺基酸及第 43–63 個胺基酸。資料未提供其他結構域或功能區域註解。

跨膜區Helical19–39 aa
跨膜區Helical43–63 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P62952…

AlphaFold · P62952

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Membrane

BLCAP apoptosis inducing factor 記錄於細胞質、細胞核及膜,並被標示為多次跨膜蛋白。 來源未提供不同定位之間的轉換條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 17 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BC10BLCAPASGR1CLDND2CYSRT1ESR1FAM241BGIMAP1GJA5GOSR2HOXA1LEMD1LRATMFSD5NOTCH2NLASKAP1SSMEM1TMEM14BTMEM237
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BLCAP 與磷酸化及未磷酸化的 RB1 皆有交互作用。它也會與 STAT3 交互作用;細胞受到 IL6 刺激及 STAT3 磷酸化會促進此交互作用。來源未將這些關係描述為特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BLCAP 被描述為腫瘤抑制因子,可促使細胞在 G(1)/S 檢查點停滯並誘導細胞凋亡;這些作用涉及 RB1,但不依賴 p53/TP53 或 NF-kappa-B。此外,BLCAP 會調節參與細胞增殖、細胞週期及細胞凋亡調控的基因表現。含實驗來源
證據與來源

Acts as a tumor suppressor; induces growth arrest at G(1)/S checkpoint and apoptosis via RB1-dependent and p53/TP53- and NF-kappa-B-independent mechanisms. Modulates expression of genes involved in the regulation of proliferation, cell cycle and apoptosis

PMID 16675915 ↗ · PMID 17031575 ↗ · PMID 21844121 ↗ · PMID 26986503 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BLCAP 與磷酸化及未磷酸化的 RB1 皆有交互作用;它也會與 STAT3 交互作用,而細胞受到 IL6 刺激及 STAT3 磷酸化會促進 BLCAP 與 STAT3 的交互作用。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RB1 (phosphorylated and unphosphorylated). Interacts with STAT3; the interaction is promoted by cell stimulation with IL6 and phosphorylation of STAT3

PMID 26986503 ↗ · PMID 29190807 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BLCAP apoptosis inducing factor 記錄於細胞質、細胞核及膜,並被標示為多次跨膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 19783793 ↗ · PMID 22969892 ↗ · PMID 29190807 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000373537 · 2,018 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTGCGGCGTCGGTGGCGAGCTGAGGTGGAGGCAGGCTGC40
41GGCAGACGGCGACAGTGGCGGCGGCGCCATGGCAGGGCTT80
81GCAGGATCCCTGCTGCCTTGGTGATCCCGGGCTGACAGCC120
121AGAGAGCACAGCGGCTCAGCTCCTGGAGAGTGAGGGTTGA160
161AGAAAGCGGAGGGCAGCCGCCTGCGCCCGCTGGCTCCCAT200
201TAGGTCGGTTCCTGCAGCGGTGCCCGGCAGCCTTGGTGAA240
241GGCCCTGCCCGGCAGAGATCATGTATTGCCTCCAGTGGCT280
281GCTGCCCGTCCTCCTCATCCCCAAGCCCCTCAACCCCGCC320
321CTGTGGTTCAGCCACTCCATGTTCATGGGCTTCTACCTGC360
361TCAGCTTCCTCCTGGAACGGAAGCCTTGCACAATTTGTGC400
401CTTGGTTTTCCTGGCAGCCCTGTTCCTTATCTGCTATAGC440
441TGCTGGGGAAACTGTTTCCTGTACCACTGCTCCGATTCCC480
481CGCTTCCAGAATCGGCGCATGATCCCGGCGTTGTGGGCAC520
521CTAACGGCCTGCCCTGTTAGCTTTCCAAGGAAGCAGAAGA560
561CGGGAGGGGAGGCATTGACATAGGTCATAAAGCATTGGAG600
601TTTCAAATCCCGCAGCCTCGCGGGTGTCACATTCCTGACG640
641GCGCCTTTTTGGCCTGTGATGTTTTATCCTTACAATGTGA680
681ATAATGGCACTGACCGGTGCTTTTATTGTAAAGTCCTATA720
721GTCGTGGGTGGTCTTGTGGTTGTGTGTGTTCTGTCCCCAT760
761CTAGGTCCTGGCTGGCCGCATGACCACCCCTCTCGCCTCA800
801TTACTGTGAGGAGTCTGGGTCCATCCTGGTCAGCTGCCCC840
841AATGTGACCTGGGGCAGATAAAATGCCAGTCTCATTGTCA880
881CCTCTGTGACCCCTCCTTGTCAGGGTCTCCTTCCTTCCCA920
921GAATGTTACTGACTCCTCAGTCCCTCTTCTGGTTTCCCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。