演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BIN3

bridging integrator 3

BIN3 是蛋白質編碼基因,產物參與細胞質分裂與隔膜形成,並與 F-actin 的定位有關。

Homo sapiens8p21.3UniProt Q9NQY0
OFFICIAL SYMBOL
BIN3
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q9NQY0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BIN3(bridging integrator 3)是蛋白質編碼基因。其產物與細胞質分裂及隔膜形成相關,並在這些過程中參與 F-actin 的定位。現有資料未提供更多關於蛋白質家族或整體結構的描述。

Official symbol
BIN3
Gene name
bridging integrator 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1054
UniProt
Q9NQY0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p21.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegBIN3pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:22,610,290–22,669,148
Gene span
58,859 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000276416 ★22,620,418–22,669,1219
ENST0000051951322,620,418–22,669,1137
ENST0000085325022,620,418–22,669,1489
ENST0000093925322,620,418–22,669,1489
ENST0000106621822,620,418–22,669,1487
ENST0000113920422,620,418–22,669,1489
ENST0000052029222,625,047–22,669,1487
ENST0000052226822,644,588–22,669,1482

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BIN3 的功能與細胞質分裂及隔膜形成有關。在這些細胞過程中,BIN3 參與 F-actin 的定位。現有資料未說明其如何影響 F-actin 的定位,也未提供作用條件或其他相關機制,因此無法進一步判定其在上述過程中的具體作用方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22669121 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BIN3 ENST00000276416 GRCh38 chr8:22669021-22670121 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCGAGGCAAGTCAGCTGCTTGCTTGGTCCTGTCTGTGTCTTAGCCATGGTAAGTTCCCTCTGCCTGGAGC
CTCGTCACCCCTCATCTCAGATTCACCTGGCTAGCCCCGATTCTGCCTTCAGGGCTTGGCTTACACACTG
GCTCCTCCTGGAAGCCTTCCCCAAAACCCCATGTGCTACTTCAGGGTCCCCTTCTAGGCTGCCACCACAC
CTCATTCTATCCTATCCTATAGCATGATTATAATTGCCTGCTTGTCTCTCCCTCCAGGAAAGTAGCTCTG
GGAAGGAACAAGAGCAGGGCAGATACTTCTCTGAGATAGCTGTATCCTAAGGTTGGCTCGGTACCTGACA
CTAATATTAGTGCAACTAGTATTAGTTAAATGAAGGAATAGAACGAATGGGGCAATTTACATCATTTGAG
TCCTGTAGAGGAGACCAAAGGGAAGGGCTGAAAGGCAGGGAACAACTCATACTCTGCGTCTTATTGTGTT
GAATAACTCTAGGAAACATTCCAACCTGAAAAGCACCTATCTATTGATATTCAGAGCCCTGTGCCATCTT
GGAAGGGAAACGTCCGTTTGTTTGTAACAGGTAATGCATGTGTGGTGTACAAACTGTAAAAGATAGGAAA
GAGCATTCAGAGAATGTAAGTTTTCCACTTTCTCCATCCCAAATGGCTTCTTCTCCCACAGACAATTGCT
GCCACTGTCTCTGGATTAGAAACCACTTGACAGAGGGGACAGCCCGGCTAAGGGCCCTGCATGGTCAGGT
GAAGAGATCTTTAGGAGTCAGTGTTGAAGGCAGAAAACGCCCCCAGAGGTTCCCCTCATCCCCCGTTGCA
GCCTGTGTGTCTAAGCGCTTGGCCAGAGCCAGAGAGTCGCCGGCAAGGGAAACTCCGCGGCGAGCACGCA
GCAGCAGAAGGGTTAACGCGCCGGGCTCCGCCTCCCAACCGCCTCTTCCGGGCAGAGAGGCGGGCTTACG
TCACTTCCTGGAGACTGGTTGAATCCGGAAGTGACCCTAGAGAAACGAGTTGTGGCTGAGGACCCCGGCG
GCAGACGCAGGTTCGGGACCATGAGCTGGTGAGTGAGGCCCAGGCGGCGGG
BIN3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BIN3_1 ↗8:22,669,121負股22,669,111–22,669,170

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_73BZNT · enhancer · 22667739–22667856 · regulatory

ENSR8_B6HGL · enhancer · 22668167–22669102 · regulatory

ENSR8_B6HGP · promoter · 22669103–22669638 · regulatory

ENSR8_57BZL5 · CTCF_binding_site · 22672455–22672476 · regulatory

ENSR8_57BZMT · CTCF_binding_site · 22672833–22672854 · regulatory

ENSR8_9BZZK · promoter · 22673093–22673593 · regulatory

ENSR8_57BZPC · CTCF_binding_site · 22673151–22673172 · regulatory

ENSR8_9BZZN · enhancer · 22673594–22673849 · regulatory

· motif · 22666673–22666688 · motif

· motif · 22666689–22666703 · motif

· motif · 22666689–22666704 · motif

· motif · 22668750–22668761 · motif

· motif · 22669109–22669118 · motif

· motif · 22669109–22669120 · motif

· motif · 22669109–22669120 · motif

· motif · 22669109–22669122 · motif

· motif · 22669129–22669140 · motif

· motif · 22669131–22669140 · motif

· motif · 22669136–22669149 · motif

· motif · 22669136–22669149 · motif

· motif · 22672457–22672473 · motif

· motif · 22672835–22672851 · motif

· motif · 22672955–22672968 · motif

· motif · 22672958–22672970 · motif

· motif · 22672961–22672968 · motif

· motif · 22672997–22673009 · motif

· motif · 22672999–22673006 · motif

· motif · 22673153–22673169 · motif

· motif · 22673312–22673325 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:253 aa

1 aa253 aa結構域功能區域
依 Q9NQY0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BIN3 蛋白長 253 個胺基酸。其第 9 至 232 位胺基酸被註記為 BAR domain;第 220 至 240 位則被註記為無序區。兩段註記在第 220 至 232 位範圍重疊。

結構域BAR9–232 aa
功能區域Disordered220–240 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NQY0…

AlphaFold · Q9NQY0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

BIN3 的定位資料列出細胞質與細胞骨架。 資料未說明定位是否會隨細胞條件改變,也未提供異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 10 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BIN3BIN3ABI2C14orf119DNMBPGINS4NXF1POLR1CRPRD1BTRIM69TXLNAUBL5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BIN3 參與細胞質分裂與隔膜形成;在這些過程中,其作用之一是協助 F-actin 的定位。資料未進一步說明定位作用的機制、發生條件或相關實驗系統。資料庫紀錄
證據與來源

Involved in cytokinesis and septation where it has a role in the localization of F-actin

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BIN3 的細胞內定位記錄為細胞質與細胞骨架。此資料未提供特定細胞條件、異構型差異或定位動態等細節。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000276416 · 1,836 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAATCCGGAAGTGACCCTAGAGAAACGAGTTGTGGCTGAG40
41GACCCCGGCGGCAGACGCAGGTTCGGGACCATGAGCTGGA80
81TTCCTTTTAAGATTGGGCAGCCCAAGAAACAGATTGTGCC120
121CAAAACAGTGGAGAGAGACTTTGAAAGGGAGTATGGAAAA160
161CTTCAGCAGCTGGAAGAGCAGACCCGGAGGCTGCAGAAAG200
201ACATGAAGAAGAGCACCGACGCAGACCTGGCCATGTCAAA240
241ATCTGCCGTGAAGATATCCTTGGACTTACTCTCCAATCCC280
281CTCTGTGAGCAAGACCAGGACCTTCTGAACATGGTGACGG320
321CCCTGGACACGGCCATGAAGCGGATGGATGCCTTCAATCA360
361GGAAAAGGTGAACCAGATCCAGAAGACTGTGATCGAGCCC400
401TTAAAAAAGTTCGGCAGTGTCTTCCCGAGCCTCAACATGG440
441CTGTGAAGAGGCGGGAACAGGCCTTGCAGGACTACAGGAG480
481GCTGCAGGCCAAGGTGGAGAAGTATGAGGAAAAGGAGAAG520
521ACGGGGCCAGTGCTGGCCAAGCTCCACCAGGCACGAGAGG560
561AGCTGCGGCCTGTGCGGGAGGACTTTGAAGCCAAGAACAG600
601GCAGCTGCTGGAGGAGATGCCGCGCTTCTACGGCAGCCGC640
641CTCGACTACTTCCAGCCCAGCTTTGAGTCCCTCATCCGAG680
681CTCAGGTTGTGTACTACTCGGAAATGCACAAGATCTTTGG720
721AGACCTGTCCCATCAGCTTGACCAGCCAGGCCACTCCGAT760
761GAGCAGCGGGAGCGGGAGAACGAGGCCAAACTCAGTGAGC800
801TCCGGGCCCTCTCCATTGTGGCCGATGACTGAATCCCCGT840
841CACTCTTGGAGGACTCCTGTGACGTGGTCAGCCTCATTCA880
881TCCTTGCCCTTCTCAGGGCTAGCTGCTCCTCTCACAGGCT920
921GGGGACAGAGGTGGCCCTGGTTCACTTGCCGGCCCTTTGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。