基因總覽
BIN3(bridging integrator 3)是蛋白質編碼基因。其產物與細胞質分裂及隔膜形成相關,並在這些過程中參與 F-actin 的定位。現有資料未提供更多關於蛋白質家族或整體結構的描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000276416 ★ | 22,620,418–22,669,121 | 9 |
| ENST00000519513 | 22,620,418–22,669,113 | 7 |
| ENST00000853250 | 22,620,418–22,669,148 | 9 |
| ENST00000939253 | 22,620,418–22,669,148 | 9 |
| ENST00001066218 | 22,620,418–22,669,148 | 7 |
| ENST00001139204 | 22,620,418–22,669,148 | 9 |
| ENST00000520292 | 22,625,047–22,669,148 | 7 |
| ENST00000522268 | 22,644,588–22,669,148 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BIN3 的功能與細胞質分裂及隔膜形成有關。在這些細胞過程中,BIN3 參與 F-actin 的定位。現有資料未說明其如何影響 F-actin 的定位,也未提供作用條件或其他相關機制,因此無法進一步判定其在上述過程中的具體作用方式。
Promoter 與基因調控
>BIN3 ENST00000276416 GRCh38 chr8:22669021-22670121 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCGAGGCAAGTCAGCTGCTTGCTTGGTCCTGTCTGTGTCTTAGCCATGGTAAGTTCCCTCTGCCTGGAGC CTCGTCACCCCTCATCTCAGATTCACCTGGCTAGCCCCGATTCTGCCTTCAGGGCTTGGCTTACACACTG GCTCCTCCTGGAAGCCTTCCCCAAAACCCCATGTGCTACTTCAGGGTCCCCTTCTAGGCTGCCACCACAC CTCATTCTATCCTATCCTATAGCATGATTATAATTGCCTGCTTGTCTCTCCCTCCAGGAAAGTAGCTCTG GGAAGGAACAAGAGCAGGGCAGATACTTCTCTGAGATAGCTGTATCCTAAGGTTGGCTCGGTACCTGACA CTAATATTAGTGCAACTAGTATTAGTTAAATGAAGGAATAGAACGAATGGGGCAATTTACATCATTTGAG TCCTGTAGAGGAGACCAAAGGGAAGGGCTGAAAGGCAGGGAACAACTCATACTCTGCGTCTTATTGTGTT GAATAACTCTAGGAAACATTCCAACCTGAAAAGCACCTATCTATTGATATTCAGAGCCCTGTGCCATCTT GGAAGGGAAACGTCCGTTTGTTTGTAACAGGTAATGCATGTGTGGTGTACAAACTGTAAAAGATAGGAAA GAGCATTCAGAGAATGTAAGTTTTCCACTTTCTCCATCCCAAATGGCTTCTTCTCCCACAGACAATTGCT GCCACTGTCTCTGGATTAGAAACCACTTGACAGAGGGGACAGCCCGGCTAAGGGCCCTGCATGGTCAGGT GAAGAGATCTTTAGGAGTCAGTGTTGAAGGCAGAAAACGCCCCCAGAGGTTCCCCTCATCCCCCGTTGCA GCCTGTGTGTCTAAGCGCTTGGCCAGAGCCAGAGAGTCGCCGGCAAGGGAAACTCCGCGGCGAGCACGCA GCAGCAGAAGGGTTAACGCGCCGGGCTCCGCCTCCCAACCGCCTCTTCCGGGCAGAGAGGCGGGCTTACG TCACTTCCTGGAGACTGGTTGAATCCGGAAGTGACCCTAGAGAAACGAGTTGTGGCTGAGGACCCCGGCG GCAGACGCAGGTTCGGGACCATGAGCTGGTGAGTGAGGCCCAGGCGGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BIN3_1 ↗ | 8:22,669,121 | 負股 | 22,669,111–22,669,170 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_73BZNT · enhancer · 22667739–22667856 · regulatory
ENSR8_B6HGL · enhancer · 22668167–22669102 · regulatory
ENSR8_B6HGP · promoter · 22669103–22669638 · regulatory
ENSR8_57BZL5 · CTCF_binding_site · 22672455–22672476 · regulatory
ENSR8_57BZMT · CTCF_binding_site · 22672833–22672854 · regulatory
ENSR8_9BZZK · promoter · 22673093–22673593 · regulatory
ENSR8_57BZPC · CTCF_binding_site · 22673151–22673172 · regulatory
ENSR8_9BZZN · enhancer · 22673594–22673849 · regulatory
· motif · 22666673–22666688 · motif
· motif · 22666689–22666703 · motif
· motif · 22666689–22666704 · motif
· motif · 22668750–22668761 · motif
· motif · 22669109–22669118 · motif
· motif · 22669109–22669120 · motif
· motif · 22669109–22669120 · motif
· motif · 22669109–22669122 · motif
· motif · 22669129–22669140 · motif
· motif · 22669131–22669140 · motif
· motif · 22669136–22669149 · motif
· motif · 22669136–22669149 · motif
· motif · 22672457–22672473 · motif
· motif · 22672835–22672851 · motif
· motif · 22672955–22672968 · motif
· motif · 22672958–22672970 · motif
· motif · 22672961–22672968 · motif
· motif · 22672997–22673009 · motif
· motif · 22672999–22673006 · motif
· motif · 22673153–22673169 · motif
· motif · 22673312–22673325 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:253 aa
BIN3 蛋白長 253 個胺基酸。其第 9 至 232 位胺基酸被註記為 BAR domain;第 220 至 240 位則被註記為無序區。兩段註記在第 220 至 232 位範圍重疊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BIN3 的定位資料列出細胞質與細胞骨架。 資料未說明定位是否會隨細胞條件改變,也未提供異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- ABI2Q9NYB9-2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- C14orf119Q9NWQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNMBPQ6XZF7 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GINS4Q9BRT9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NXF1Q9UBU9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POLR1CO15160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPRD1BQ9NQG5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM69Q86WT6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TXLNAP40222 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBL5Q9BZL1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
核酸與蛋白質序列
GAATCCGGAAGTGACCCTAGAGAAACGAGTTGTGGCTGAG40GACCCCGGCGGCAGACGCAGGTTCGGGACCATGAGCTGGA80TTCCTTTTAAGATTGGGCAGCCCAAGAAACAGATTGTGCC120CAAAACAGTGGAGAGAGACTTTGAAAGGGAGTATGGAAAA160CTTCAGCAGCTGGAAGAGCAGACCCGGAGGCTGCAGAAAG200ACATGAAGAAGAGCACCGACGCAGACCTGGCCATGTCAAA240ATCTGCCGTGAAGATATCCTTGGACTTACTCTCCAATCCC280CTCTGTGAGCAAGACCAGGACCTTCTGAACATGGTGACGG320CCCTGGACACGGCCATGAAGCGGATGGATGCCTTCAATCA360GGAAAAGGTGAACCAGATCCAGAAGACTGTGATCGAGCCC400TTAAAAAAGTTCGGCAGTGTCTTCCCGAGCCTCAACATGG440CTGTGAAGAGGCGGGAACAGGCCTTGCAGGACTACAGGAG480GCTGCAGGCCAAGGTGGAGAAGTATGAGGAAAAGGAGAAG520ACGGGGCCAGTGCTGGCCAAGCTCCACCAGGCACGAGAGG560AGCTGCGGCCTGTGCGGGAGGACTTTGAAGCCAAGAACAG600GCAGCTGCTGGAGGAGATGCCGCGCTTCTACGGCAGCCGC640CTCGACTACTTCCAGCCCAGCTTTGAGTCCCTCATCCGAG680CTCAGGTTGTGTACTACTCGGAAATGCACAAGATCTTTGG720AGACCTGTCCCATCAGCTTGACCAGCCAGGCCACTCCGAT760GAGCAGCGGGAGCGGGAGAACGAGGCCAAACTCAGTGAGC800TCCGGGCCCTCTCCATTGTGGCCGATGACTGAATCCCCGT840CACTCTTGGAGGACTCCTGTGACGTGGTCAGCCTCATTCA880TCCTTGCCCTTCTCAGGGCTAGCTGCTCCTCTCACAGGCT920GGGGACAGAGGTGGCCCTGGTTCACTTGCCGGCCCTTTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。