基因總覽
BDKRB2 是蛋白質編碼基因,產物 bradykinin receptor B2 屬於 G protein-coupled receptor 1 家族中的 bradykinin receptor 子家族及 BDKRB2 次子家族。此蛋白質為多次穿越膜的受體,具有七段跨膜螺旋;其胞外與胞質區段分布於膜兩側,形成跨膜受體的基本架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000554311 ★ | 96,204,839–96,244,164 | 3 |
| ENST00000877850 | 96,204,526–96,244,461 | 3 |
| ENST00000877851 | 96,204,526–96,244,164 | 4 |
| ENST00000877852 | 96,204,526–96,244,164 | 3 |
| ENST00000968196 | 96,204,526–96,243,832 | 4 |
| ENST00001100161 | 96,204,526–96,244,166 | 3 |
| ENST00001120724 | 96,204,526–96,249,490 | 3 |
| ENST00001137746 | 96,204,526–96,244,164 | 3 |
| ENST00000542454 | 96,204,679–96,244,166 | 3 |
| ENST00000539359 | 96,204,839–96,241,607 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
bradykinin receptor B2 是 bradykinin 的受體。它與 G proteins 相關聯,將受體訊號連結至 phosphatidylinositol-calcium 第二信使系統。
此受體的功能描述指出兩個相連的要點:辨識 bradykinin,以及透過 G proteins 啟動第二信使系統。來源未進一步說明受體如何辨識配體、涉及哪些下游分子步驟,或此訊號在特定細胞及生理過程中的作用,因此不宜據此延伸至未載明的機制或生物學效應。
Promoter 與基因調控
>BDKRB2 ENST00000554311 GRCh38 chr14:96203839-96204939 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACCACACAGCCAGGCCAGGGAGGGCCTTCACTCAAGAGCCTACAGCCAGTTCACAGCCAAGCCAGGGCT AGCGCCCAGGCCACCCATAAACTGATCTGAGACTCTGTTTCCCTGTCTCCATGATGATGGGATCAGGCTT GATTGCTGGTTTGTAGGCTTGTTATGAATCAAGTCACAGGGAAGAGGAGCTGATGGGCTGGGGGGACGTC CTCTGGCCCTCCTGTCTCTTCCCCAGATCCACTGGGCCCACTCTTATCTGTTCTCTTCTGAAGGAAGGGT TTTAAGGCTTCAAAAAAAAATGTTTTGAAAGTCCCTGCCCTTTCCAGCTCCTACCGTCTCAGCCCTGGGA GTGTAAAGTGCTGCAGATAGTTAGTAAGTCTTTGAGCAAAACTGAGAAAGCCAGCCTGAGCCTTGACATG GGAGAAACCTCCGCCATACATCTCCGAAGAAACGGCCGCGTGTCTCAGGGGAGCGCAAACACCCGTACCC AGGAAACAGGACAGCTTCTGCCACTGTCGCCCTTGGGAGCCGTACGTGGCATACAAAGAAATCCCAGGAC TCCGCCTGCCCACCTGGCCACCCTCTGTTTACACCTTCCGCGTAAACGCCCACTGTTTACATCCAAAACT CAGACACAAAATAACCACCTCAAGAAGATAAATAATGATAAGAAATAAATGTTACGCGAGGCAAATTTAT TCACATGGGGCTTCCCAGGCCACTTTGTGGTCAGCCGGGAGGGACGTTTTTGCCGTCCCACGACTCCAAC GGGCAGCCGGGCTACGCAAACATGGAAATCTTCCAAGAGCCTCCCTGGCCCCCAGGGCTCAGAGGGTGGC AGAGCGGAGAGCGAAGGTGGCCGCAGCCTTCCCGGCCCCACAGCCAGCCTGGCTCCAGCTGGGCAGGAGT GCAGAGCTCAGCTGGAGGCGGAGGGGGAAGTGCCCAGGAGGCTGATGACATCACTACCCAGCCCTTGAAA GATGAGCTGTTCCCGCCGCCACTCCAGCTCTGGCTTCTGGGCTCCGAGGAGGGGTGGGGACGGTGGGGAC GGTGGGGACATCAGGCTGCCCCGCAGTACCAGGGAGCGACTGAAGTGCCCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 9 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BDKRB2_2 ↗ | 14:96,204,605 | 正股 | 96,204,556–96,204,615 |
| BDKRB2_1 ↗ | 14:96,204,839 | 正股 | 96,204,790–96,204,849 |
| BDKRB2_6 ↗ | 14:96,237,183 | 正股 | 96,237,134–96,237,193 |
| BDKRB2_8 ↗ | 14:96,238,747 | 正股 | 96,238,698–96,238,757 |
| BDKRB2_3 ↗ | 14:96,239,108 | 正股 | 96,239,059–96,239,118 |
| BDKRB2_4 ↗ | 14:96,241,391 | 正股 | 96,241,342–96,241,401 |
| BDKRB2_9 ↗ | 14:96,241,694 | 正股 | 96,241,645–96,241,704 |
| BDKRB2_5 ↗ | 14:96,243,064 | 正股 | 96,243,015–96,243,074 |
| BDKRB2_7 ↗ | 14:96,243,501 | 正股 | 96,243,452–96,243,511 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_93F6ZQ · enhancer · 96203682–96203989 · regulatory
ENSR14_BP4HG · promoter · 96204189–96204854 · regulatory
ENSR14_CCJQB · enhancer · 96204855–96206364 · regulatory
ENSR14_5SLZ5X · CTCF_binding_site · 96205515–96205536 · regulatory
ENSR14_5SLZ7L · CTCF_binding_site · 96205870–96205891 · regulatory
ENSR14_5SLZ99 · CTCF_binding_site · 96206231–96206252 · regulatory
· motif · 96204791–96204804 · motif
· motif · 96204791–96204804 · motif
· motif · 96205517–96205533 · motif
· motif · 96205872–96205888 · motif
· motif · 96206233–96206249 · motif
· motif · 96206534–96206545 · motif
· motif · 96208168–96208180 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:391 aa
bradykinin receptor B2 長 391 個胺基酸,具有七段螺旋型跨膜區域。其胞外區段位於第 1–60、119–131、199–221 與 293–311 位胺基酸;胞質區段位於第 85–93、154–175、249–267 與 336–391 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
bradykinin receptor B2 位於細胞膜,是多次穿越膜的蛋白質。 此資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- KNG1P01042 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
bradykinin receptor B2 與 PECAM1 有互作,並與 PECAM1 和 GNAQ 形成複合體。資料未指出這些關係是否代表直接結合,也未描述其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | bradykinin receptor B2 是 bradykinin 的受體,並與 G proteins 相關聯;這種關聯可啟動 phosphatidylinositol-calcium 第二信使系統。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for bradykinin. It is associated with G proteins that activate a phosphatidylinositol-calcium second messenger system PMID 1314587 ↗ · PMID 1329734 ↗ |
| 交互作用 | bradykinin receptor B2 與 PECAM1 互作,並與 PECAM1 和 GNAQ 形成複合體。來源未進一步說明互作是否為直接結合或其功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | bradykinin receptor B2 位於細胞膜,屬於多次穿越膜的蛋白質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTCCAGCTCTGGCTTCTGGGCTCCGAGGAGGGGTGGGGA40CGGTGGGGACGGTGGGGACATCAGGCTGCCCCGCAGTACC80AGGGAGCGACTGAAGTGCCCATGCCGCTTGCTCCGGAGAA120GCCCAGGTGTGGCCTCACTCACATCCCACTCTGAGTCCAA160ATGTTCTCTCCCTGGAAGATATCAATGTTTCTGTCTGTTC200GTGAGGACTCCGTGCCCACCACGGCCTCTTTCAGCGCCGA240CATGCTCAATGTCACCTTGCAAGGGCCCACTCTTAACGGG280ACCTTTGCCCAGAGCAAATGCCCCCAAGTGGAGTGGCTGG320GCTGGCTCAACACCATCCAGCCCCCCTTCCTCTGGGTGCT360GTTCGTGCTGGCCACCCTAGAGAACATCTTTGTCCTCAGC400GTCTTCTGCCTGCACAAGAGCAGCTGCACGGTGGCAGAGA440TCTACCTGGGGAACCTGGCCGCAGCAGACCTGATCCTGGC480CTGCGGGCTGCCCTTCTGGGCCATCACCATCTCCAACAAC520TTCGACTGGCTCTTTGGGGAGACGCTCTGCCGCGTGGTGA560ATGCCATTATCTCCATGAACCTGTACAGCAGCATCTGTTT600CCTGATGCTGGTGAGCATCGACCGCTACCTGGCCCTGGTG640AAAACCATGTCCATGGGCCGGATGCGCGGCGTGCGCTGGG680CCAAGCTCTACAGCTTGGTGATCTGGGGGTGTACGCTGCT720CCTGAGCTCACCCATGCTGGTGTTCCGGACCATGAAGGAG760TACAGCGATGAGGGCCACAACGTCACCGCTTGTGTCATCA800GCTACCCATCCCTCATCTGGGAAGTGTTCACCAACATGCT840CCTGAATGTCGTGGGCTTCCTGCTGCCCCTGAGTGTCATC880ACCTTCTGCACGATGCAGATCATGCAGGTGCTGCGGAACA920ACGAGATGCAGAAGTTCAAGGAGATCCAGACAGAGAGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。