演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BCL7CSMARCJ3

BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7C

BCL7C 編碼 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7C;現有資料指出,它可能具有抗細胞凋亡作用。

Homo sapiens16p11.2UniProt Q8WUZ0
OFFICIAL SYMBOL
BCL7C
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q8WUZ0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BCL7C 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7C。現有資料提供其基因名稱與染色體位置,但未進一步說明其 RNA 或蛋白質的基本性質、家族歸屬或主要角色。

Official symbol
BCL7C
Gene name
BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7C
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1006
UniProt
Q8WUZ0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SMARCJ3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p11.2
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegBCL7Cpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:30,818,695–30,894,302
Gene span
75,608 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000215115 ★30,887,795–30,894,0776
ENST0000111355730,818,695–30,894,3026
ENST0000038031730,833,626–30,894,3026
ENST0000105699430,850,979–30,894,3026
ENST0000105699530,850,979–30,894,3026
ENST0000105699630,850,979–30,894,3027
ENST0000105699330,850,980–30,894,3026
ENST0000057262830,851,246–30,893,9426
ENST0000100013630,879,503–30,894,3026
ENST0000105699730,879,503–30,894,3026
ENST0000100013730,879,504–30,894,3026
ENST0000093661930,887,795–30,894,3026

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有註解提出,BCL7C 可能具有抗細胞凋亡作用;這項描述帶有不確定性,未提供作用機制、實驗條件或相關生物學過程的進一步細節。因此,目前只能將其視為可能的功能,不能據此確定 BCL7C 如何影響細胞凋亡。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 30894077 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BCL7C ENST00000215115 GRCh38 chr16:30893977-30895077 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCGATCACTATCTTGACTTTGGTGCACTATAAATTAGTTTTGTCTGGTTCTGAACGTAATACACCTGGA
ACCATCTAGTATGTACTGTTGCATTTGGCTTCTGTCACTCAAGATTTCATCATGCGACTTGTCTATGTTG
CTGTGTGTAGCCGGGCATGTCAATCCCGTTGCTGTGTCTATGTGCATGGTAGTGAGTAGGGCATCATTCA
TTTTCCATTCTGTTGATGGGTTATTTCCAGTTTGGGGCTGTTATGAAAGGGCTCTGAACATTCCCATGCA
CCCTCTTGATGCTCACACCTACACATTTCTGCTGGGTGTTGACAGCCTAGGAGTGGAACTGCTGGATCAC
AGAGGTGGCATATGTTCGGCTTCATTAGAAAACTGCCAGTTTTCCAAAATGTCTCTACCAATTTACACTC
CCCCAGAAATACAAGAGAGGTCCAGTCGCTCTACTTTCTCGCCTCCACACGGTGCGGTCTTTTTCACTTT
AGCCATTCTGGTGGTGGAGACCCACTCGTATTCGCAGCGCCTGGAGCGTAATTGGCACTCAGTTAACAAG
ACTGTTGAATGAATGGATGACTGAGTAAGTTGGGCGGTGTAGACCAACAGCCTGGCGAGGGCGGACACAC
GCACGCACTCCACACACAGCGTTTCGCGGACACCCACCGCGGCTCACGCAGCGCAGGACACAGACCCTGT
CGCGCACCCCGCGCCCACGTGGTCTGAACACACGGCCTCGGCCCTGCCTCGCGCGTCCGGTCGCAACTCC
CGCTCTCCGTCCCCAACTCGCGCGTCCGTCCCCAACTCCCGCTCTCGGCGGCGGGCAGGGGGCGCTGAGC
GTCCAGGCGCTCCAAGGGGGCGGGCCCGGGTCGGGGCGGGGCCGGCCGGGCTTCCAGGCCTGGGCTCTGG
CCGCCCGCGCCACCGGGCCGCTCCGGGGACAGGCCGGGGCGGGGCGCGGCGGCAGGAAACGGGGCGGGGA
CTTGCGGAGGCGTTGGGGACGAGAGAGGGCGCGGCCAACTCCAGGGGGGACGGCAGGCCGAGAGCGCGGC
GCCCGGGCCTGGCGCGGAGCCTGAGCCCGCCGGACGGGAGGCGGCCCCGCC
BCL7C 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BCL7C_1 ↗16:30,894,019負股30,894,009–30,894,068

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_5997C5 · CTCF_binding_site · 30894063–30894084 · regulatory

ENSR16_B85JN · promoter · 30894067–30894792 · regulatory

ENSR16_9G94M · promoter · 30895206–30895706 · regulatory

ENSR16_B85JZ · promoter · 30896124–30896648 · regulatory

ENSR16_C53R3 · enhancer · 30896649–30897707 · regulatory

· motif · 30893062–30893077 · motif

· motif · 30893106–30893123 · motif

· motif · 30893133–30893146 · motif

· motif · 30893138–30893150 · motif

· motif · 30893140–30893147 · motif

· motif · 30893873–30893883 · motif

· motif · 30894065–30894081 · motif

· motif · 30894084–30894097 · motif

· motif · 30895130–30895139 · motif

· motif · 30895747–30895756 · motif

· motif · 30896565–30896575 · motif

· motif · 30896606–30896616 · motif

· motif · 30897046–30897055 · motif

· motif · 30897120–30897130 · motif

· motif · 30897125–30897135 · motif

· motif · 30897131–30897141 · motif

· motif · 30897244–30897255 · motif

· motif · 30897378–30897393 · motif

· motif · 30897533–30897546 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:217 aa

1 aa217 aa功能區域
依 Q8WUZ0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BCL7C 屬於 BCL7 family,蛋白質長度為 217 個胺基酸。序列註解指出,第 49 至 217 位胺基酸區域為無序區;此區域的判定來自序列分析註解。

功能區域Disordered49–217 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8WUZ0…

AlphaFold · Q8WUZ0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SMARCJ3BCL7CSCIN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BCL7C 可能具有抑制細胞凋亡的作用,但此功能描述保留不確定性;資料未提供具體機制、作用條件或實驗結果,因此不能進一步確定其影響方式。推論支持
證據與來源

May play an anti-apoptotic role

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000215115 · 857 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGAGAGGGCGCGGCCAACTCCAGGGGGGACGGCAGGCCG40
41AGAGCGCGGCGCCCGGGCCTGGCGCGGAGCCTGAGCCCGC80
81CGGACGGGAGGCGGCCCCGCCGCGGGCTCGGCCCCGGCCC120
121CAGCCCCGCCAGCATGGCCGGCCGGACTGTACGGGCCGAG160
161ACCCGGAGCCGGGCCAAGGATGACATCAAGAAGGTGATGG200
201CGACCATCGAGAAGGTCCGGAGATGGGAGAAGCGATGGGT240
241GACTGTGGGCGACACTTCCCTTCGTATCTTCAAGTGGGTG280
281CCAGTGGTGGATCCCCAGGAGGAGGAGCGAAGGCGGGCAG320
321GTGGCGGGGCAGAGAGATCCCGTGGCCGGGAACGTCGGGG360
361CAGGGGCGCCAGTCCCCGAGGGGGTGGCCCTCTCATCCTG400
401CTGGATCTTAATGATGAGAACAGCAACCAGAGTTTCCATT440
441CGGAAGGTTCCCTGCAAAAGGGCACAGAGCCCAGTCCTGG480
481GGGCACCCCCCAGCCCAGCCGCCCTGTGTCACCTGCCGGA520
521CCCCCAGAAGGGGTCCCTGAGGAGGCTCAGCCCCCACGGC560
561TGGGCCAAGAGAGAGATCCCGGGGGCATAACTGCTGGCAG600
601CACCGACGAACCCCCAATGCTGACCAAGGAGGAGCCTGTT640
641CCAGAACTGCTGGAAGCTGAGGCCCCCGAAGCTTACCCTG680
681TCTTTGAGCCAGTGCCACCTGTCCCTGAGGCAGCCCAGGG720
721TGACACAGAGGACTCGGAGGGTGCCCCCCCACTCAAGCGC760
761ATCTGCCCAAATGCCCCTGACCCCTGAGAAGCCGGCCTGC800
801CTGTCCTGTTGCCCCAGGGGCCCCTTTGGCTTTTTACAAA840
841TAAAGACCCTTTTGTAA857

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。