基因總覽
BCL2L12 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 BCL2 like 12。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 19q13.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000246784 ★ | 49,665,933–49,673,916 | 7 |
| ENST00000890457 | 49,664,622–49,673,917 | 7 |
| ENST00000619007 | 49,665,142–49,673,917 | 6 |
| ENST00000441864 | 49,665,142–49,673,917 | 7 |
| ENST00000246785 | 49,665,142–49,673,917 | 7 |
| ENST00000600947 | 49,665,142–49,673,917 | 5 |
| ENST00000598306 | 49,665,142–49,673,917 | 5 |
| ENST00000890458 | 49,665,142–49,673,917 | 6 |
| ENST00000890459 | 49,665,142–49,673,917 | 7 |
| ENST00000890460 | 49,665,142–49,673,917 | 6 |
| ENST00000934038 | 49,665,142–49,673,916 | 7 |
| ENST00000934040 | 49,665,142–49,673,917 | 7 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>BCL2L12 ENST00000246784 GRCh38 chr19:49664933-49666033 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGGGCCACGGCACAGGTCCTTCACCCATATTTTCGGGGGTACAAACAGGAAACCTCCTCTTCCCATCCTC CCATCCTCCCGAGAGGCTCTCTAATCAGCTAGGGTTCCTTCCCATATCCATGGCACATCCTTCCCCAGCG TCTTCAGTGCAGACCCTCCACTCCCTCAATTCCGCCAGTATAGACCTCCTCCCTCCCCCACATCATCGAA AGTAAGTATCCCCACTTTCAGGGTAGCATCCTCTTTCCCTAGTTATTTCAGTGCAGAATCGATTCACGTG TAAGCCTCTACCTCCTGCACTTACCCCAATGTAGACCCCCTTCCACAGTCCCCCTACAGAAGATCTCCCA AAACATTTCCAACACAGAACTTCCATTCAATTCCCCTCCGACTGCCCGCCTCCCTCCTCCAGGACAGAGC ACGCCCCAGGTTTCGAGACTGAACTACCCCCATCTACGGAGTCCACCCCTCCCTCTCTAGAACCCCCTCA GTGTAGACGCCTCCTCTTTTCCTCTTTCCTCCCTACTTTTTCTAGTTTTTCTGCAGCCGACCTCCAGCGT CGGCCACTGTAGCTCCTTCCTTGCTCCACTTTCCCCAGAGTACACAGCCTGCCTTTCCACTCTCCGTGCA GACCCATCCTCTTTCCCGCTCCTCGCTCTCGGACGCCACCAACGCTCTCCCGGGCTCTTCCGCGTTACCT ACGATGGAAGGTCGGGGCGTGCGGGCAGCTGGAACCCACCCCTGTCTTGGAGCTCCGGGTAGCTCTCAAA CTCGAGGCTGCGCACCCCCTTTCCCGTCAGCTGAGCTCTAGAGCGCTGGGGCTTTCTTTTTGATCGACTT CTTGAAATAAAACCAACTTTATCATTCTTTGGGTAACAGACCCAAAAGCCGATGGGACGGCCCGCTGGGC TGTTCCCGCCCCTATGCCCTTTTTTGGGTTTCCGGCCAGAGGCATGCTGGGAGCGTCACATGCAAATTGA GCGTGCACCCAGCGTTCCGCCCTTTCTACGCTGGGCCGGTTATCGACCCGGCCCAGTGCGCAGGCGCGGG AAAGTTGAACTAATAAAGTTTGTACGAGTTCAGTGGAGGAGACCGCAAGTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BCL2L12_2 ↗ | 19:49,664,618 | 正股 | 49,664,569–49,664,628 |
| BCL2L12_1 ↗ | 19:49,665,995 | 正股 | 49,665,946–49,666,005 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_5FNDWH · CTCF_binding_site · 49664765–49664786 · regulatory
ENSR19_9PP8M · promoter · 49664828–49665152 · regulatory
ENSR19_9PP8Q · promoter · 49665159–49665576 · regulatory
ENSR19_74WT2D · enhancer · 49665577–49665694 · regulatory
ENSR19_9PP8W · promoter · 49665695–49666023 · regulatory
ENSR19_5FNF63 · CTCF_binding_site · 49666181–49666202 · regulatory
· motif · 49661163–49661171 · motif
· motif · 49661504–49661519 · motif
· motif · 49661504–49661519 · motif
· motif · 49664141–49664153 · motif
· motif · 49664331–49664353 · motif
· motif · 49664402–49664417 · motif
· motif · 49664406–49664416 · motif
· motif · 49664522–49664532 · motif
· motif · 49664542–49664552 · motif
· motif · 49664669–49664678 · motif
· motif · 49664731–49664742 · motif
· motif · 49664765–49664775 · motif
· motif · 49664767–49664783 · motif
· motif · 49665617–49665628 · motif
· motif · 49665617–49665628 · motif
· motif · 49665969–49665980 · motif
· motif · 49665969–49665980 · motif
· motif · 49666022–49666030 · motif
· motif · 49666183–49666199 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:250 aa
BCL2L12 的產物屬於 Bcl-2 家族,全長 250 個胺基酸。序列註解指出,第 24 至 46 位為無序區域;第 227 至 238 位則含有 BH2 motif。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- BAXQ07812 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBCP0CG48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPA1BP08107 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CCTTTCTACGCTGGGCCGGTTATCGACCCGGCCCAGTGCG40CAGGCGCGGGAAAGTTGAACTAATAAAGTTTGTACGAGTT80CAGTGGAGGAGACCGCAAGTTGAGTGGAGGAGGCGGCGGT120GGGGCCCCGGACCAGGTGCCTCCATGGCAGGCTCTGAAGA160GCTGGGGCTCCGGGAAGACACGCTGAGGGTCCTAGCTGCC200TTCCTTAGGCGTGGTGAGGCTGCCGGGTCTCCTGTTCCAA240CTCCACCTAGAAGCCCTGCCCAAGAAGAGCCAACAGACTT280CCTGAGCCGCCTTCGAAGATGTCTTCCCTGCTCCCTGGGG320CGAGGAGCAGCCCCCTCTGAGTCCCCTCGGCCTTGCTCTC360TGCCCATCCGCCCCTGCTATGGTTTAGAGCCTGGCCCAGC400TACTCCAGACTTCTATGCTTTGGTGGCCCAGCGGCTGGAA440CAGCTGGTCCAAGAGCAGCTGAAATCTCCGCCCAGCCCAG480AATTACAGGGTCCCCCATCGACAGAGAAGGAAGCCATACT520GCGGAGGCTGGTGGCCCTGCTGGAGGAGGAGGCAGAAGTC560ATTAACCAGAAGCTGGCCTCGGACCCCGCCCTGCGCAGCA600AGCTGGTCCGCCTGTCCTCCGACTCTTTCGCCCGCCTGGT640GGAGCTGTTCTGTAGCCGGGATGACAGCTCTCGCCCAAGC680CGAGCATGCCCCGGGCCCCCGCCTCCTTCCCCGGAGCCCC720TGGCCCGCCTGGCCCTAGCCATGGAGCTGAGCCGGCGCGT760GGCCGGGCTGGGGGGCACCCTGGCCGGACTCAGCGTGGAG800CACGTGCACAGCTTCACGCCCTGGATCCAGGCCCACGGGG840GCTGGGAGGGCATCCTGGCTGTTTCACCCGTGGACTTGAA880CTTGCCATTGGACTGAGCTCTTTCTCAGAAGCTGCTACAA920GATGACACCTCATGTCCCTGCCCTCTTCGTGTGCTTTTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。