基因總覽
BCAS4 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 breast carcinoma amplified sequence 4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 20q13.13。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371608 ★ | 50,795,061–50,877,177 | 5 |
| ENST00000358791 | 50,794,894–50,877,178 | 6 |
| ENST00000912026 | 50,794,894–50,877,178 | 4 |
| ENST00000912027 | 50,794,894–50,877,178 | 5 |
| ENST00000912028 | 50,794,894–50,877,178 | 5 |
| ENST00000912029 | 50,794,894–50,877,178 | 4 |
| ENST00000912030 | 50,794,894–50,877,178 | 2 |
| ENST00000912031 | 50,794,894–50,877,178 | 4 |
| ENST00000912033 | 50,794,894–50,877,178 | 6 |
| ENST00000993680 | 50,794,894–50,877,178 | 6 |
| ENST00001079434 | 50,794,894–50,877,178 | 5 |
| ENST00001079435 | 50,794,894–50,877,178 | 5 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>BCAS4 ENST00000371608 GRCh38 chr20:50794061-50795161 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCAAAAAAAAAAAATTAATTAATTAAAAATAAAAATAAGTCATCAAACGAAAAATCAAAACTTCAGACT TGTCTTATACCTATTTGCCTTTTAGTACTTTCCTCATTAGCACTGTTGGGGTGGGAGATGAGGCGCACCT CGCTCTCTTCAGCCCCAAGGCTTGTAAAGGGTCTATCTAGGCCGGCCTCCGAGGGCATGGAGGGAGTGGG TGCGGTTGTGAAATGTAGTGCGCTCAATAGTTTCCTGGTGAAGTTTATTTTAAAATCCGCACCGAAGAGG AAGACGAGGACCGTCACACTCGGCCTTCCCTAAATTCCAGGACCCTCCGCCCGATGCAAACTAGATGCTT TAGTAGGATGGGAACGGGTGGGGGGCGGGCGGCTTTGGGCTTCCTCTAAGCTAGCGCCTCTCTAACCCGG ACGCCCGTTAGAATCACCCGGGGAGTTTTAGAAACTACCGATGCCCAAGCCCCACTCCGAAGGATTCCAA CTTAATCGGCCTGGTGCGAGGCCTGGCTTCCGGGCTTTTAAAAGCTTCCCGGGGATTCTATTTTACGGCC GGGTCCGGGGCCGGGAGCCTGTACTCTACCGGGATTCCGATGGGGAGGGGTGGCTTGCCCCAATAGTTCT CAAATTTAGCTTTGGGTCAACAATCTGGTTGGAACCACCTAACAAACATCAAAAGATCCTGATGCCCAGG TCTTAACCCAGAGACGGTGTGGTCCAGGCTTGGGAAATTCTAAAAGAGCTCCAGGTGACTGCCATCTGCA AGCGAGTTTGCAAAGCACTGATGCCCAGGTGCTGCGGGGGCGGGCGCAGCGCGCGCCGCTCGCCACTGGG TGGCGCTGCCCGCTCGGCCCGGCGCTCCTGGAGCTGCGAGCCGCGACCGCCGGGAGCGCACCTGCCCCGC CTCCGCCAGGCGGTCCGCGGGGCATGCAGCGGACCGGGGGCGGGGCTCCGAGGCCCGGGCGCAACCACGG GCTCCCAGGCAGCCTCCGCCAGCCGGACCCCGTCGCCCTCCTGATGCTGCTCGTGGACGCTGATCAGCCG GAGCCCATGCGCAGCGGGGCGCGCGAGCTCGCGCTCTTCCTGACCCCCGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BCAS4_1 ↗ | 20:50,795,061 | 正股 | 50,795,012–50,795,071 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_C7344 · enhancer · 50789977–50791641 · regulatory
ENSR20_5FXJZL · CTCF_binding_site · 50790794–50790815 · regulatory
ENSR20_C7349 · enhancer · 50792769–50793936 · regulatory
ENSR20_5FXKC8 · CTCF_binding_site · 50792870–50792891 · regulatory
ENSR20_5FXKHC · CTCF_binding_site · 50793765–50793786 · regulatory
ENSR20_BD46Q · promoter · 50794404–50795071 · regulatory
ENSR20_5FXKNK · CTCF_binding_site · 50794889–50794910 · regulatory
ENSR20_C734G · enhancer · 50795072–50796175 · regulatory
ENSR20_C734P · enhancer · 50798702–50799777 · regulatory
ENSR20_BD47K · enhancer · 50799902–50800515 · regulatory
· motif · 50790699–50790709 · motif
· motif · 50790705–50790715 · motif
· motif · 50790762–50790776 · motif
· motif · 50790796–50790812 · motif
· motif · 50790869–50790886 · motif
· motif · 50791174–50791185 · motif
· motif · 50792872–50792888 · motif
· motif · 50793767–50793783 · motif
· motif · 50793800–50793822 · motif
· motif · 50793800–50793822 · motif
· motif · 50794812–50794828 · motif
· motif · 50794812–50794828 · motif
· motif · 50794854–50794863 · motif
· motif · 50794861–50794874 · motif
· motif · 50794891–50794907 · motif
· motif · 50794957–50794966 · motif
· motif · 50794966–50794979 · motif
· motif · 50795001–50795014 · motif
· motif · 50795150–50795157 · motif
· motif · 50795202–50795219 · motif
· motif · 50795211–50795226 · motif
· motif · 50795658–50795667 · motif
· motif · 50795760–50795768 · motif
· motif · 50795760–50795777 · motif
· motif · 50796241–50796256 · motif
· motif · 50798523–50798534 · motif
· motif · 50798664–50798686 · motif
· motif · 50798664–50798686 · motif
· motif · 50798688–50798701 · motif
· motif · 50798688–50798701 · motif
· motif · 50799803–50799825 · motif
· motif · 50799803–50799825 · motif
· motif · 50800033–50800046 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：211 aa
BCAS4 是 cappuccino family 的蛋白質，長 211 個胺基酸。其第 1 至 21 位胺基酸被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BCAS4 的細胞內定位註記為細胞質；來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- DPY30Q9C005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENKD1Q9H0I2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
部分 breast carcinoma 細胞株中曾發現涉及 BCAS4 的染色體異常，具體為與 BCAS3 相關的 t(17;20)(q23;q13) 易位。此資料描述的是細胞株中的染色體異常，未指出其與疾病發生之間的因果關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | BCAS4 的定位註記為細胞質。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 部分 breast carcinoma 細胞株中發現涉及 BCAS4 的染色體異常，為與 BCAS3 相關的 t(17;20)(q23;q13) 易位；此資訊未說明該異常是否造成疾病。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving BCAS4 has been found in some breast carcinoma cell lines. Translocation t(17;20)(q23;q13) with BCAS3 |
核酸與蛋白質序列
AGCCGGACCCCGTCGCCCTCCTGATGCTGCTCGTGGACGC40TGATCAGCCGGAGCCCATGCGCAGCGGGGCGCGCGAGCTC80GCGCTCTTCCTGACCCCCGAGCCTGGGGCCGAGGCGAAGG120AGGTGGAGGAGACCATCGAGGGCATGCTCCTCAGGCTGGA160AGAGTTTTGCAGCCTGGCTGACCTGATCAGGAGTGATACT200TCACAGATCCTGGAGGAAAACATCCCAGTCCTTAAGGCCA240AACTGACAGAAATGCGTGGCATCTATGCCAAAGTGGACCG280GCTAGAGGCCTTCGTCAAGATGGTTGGACACCACGTCGCC320TTCCTGGAAGCAGACGTGCTTCAGGCTGAGCGGGACCATG360GGGCCTTCCCTCAGGCCCTGCGGAGGTGGCTGGGATCCGC400AGGGCTCCCCTCCTTCAGGAACAAGTCACCTGCACCGGTG440CCCGTGACGTACGAGCTGCCCACACTGTATAGGACGGAGG480ACTATTTTCCTGTGGACGCCGGGGAAGCACAGCACCACCC520CCGCACCTGCCCTCGGCCTTTGTGAGCTTTGTGGTCTTCC560CATCAGGAACGCTGGAAAGTGACATTGTGTACACACTGCA600GCTTGGGGGTTTTTTCTTTGTATTGCTGTTTATTTTATAT640TTTAAAAATATTTAAAAAAATGTCGAGATGGGGTCTCACT680ATGTTGTCCAGACTGATCTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGA720TCCACCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGGTGGGATTATGGGC760AGGAGCCTCCGTGCCCAGGCTGCTGCCATTTTCAAATTTC800CTCCCTGCCTCATGTGAGACCACAGGGTTTGGAGAAGCAG840TTGGAACCCACGTGTGGTGATGCCTCCCACATCGGCCTGC880TTGGGGTTCTACAGGGGTTGAGGGACCAGGCCTGGCCGGG920GCTGATGGACAGTGGGGACTTTCCTTCTCTCCATGATGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。