演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BACH2BTBD25

BACH transcriptional regulator 2

BACH2(BACH transcriptional regulator 2)是 bZIP 家族 CNC 次家族的轉錄調節蛋白,可依相似性資料作為轉錄抑制因子或活化因子,並與適應性免疫調節有關。

Homo sapiens6q15UniProt Q9BYV9
OFFICIAL SYMBOL
BACH2
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q9BYV9
PDB / ALPHAFOLD
3OHU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BACH2(BACH transcriptional regulator 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 bZIP 家族的 CNC 次家族。蛋白質全長 841 個胺基酸,具有位於序列前段的 BTB 結構域,以及靠近末端的 bZIP 結構域;後者包含 basic motif 與 leucine-zipper 區域。序列中另有多段預測為無序的區域,末端則註記有核輸出訊號。這些結構註解描述了蛋白質的組成特色;其轉錄調節作用與相關生物學角色詳述於功能段落。

Official symbol
BACH2
Gene name
BACH transcriptional regulator 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14078
UniProt
Q9BYV9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BTBD25

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q15
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegBACH2pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:89,926,528–90,296,982
Gene span
370,455 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000257749 ★89,926,528–90,296,8439
ENST0000040699889,926,528–90,296,9237
ENST0000034312289,926,528–90,296,9237
ENST0000093121789,926,528–90,296,9238
ENST0000093121889,926,528–90,296,9238
ENST0000096892289,926,528–90,278,2767
ENST0000114170789,926,528–90,296,9239
ENST0000069595289,932,408–90,206,6897
ENST0000045387789,932,408–90,296,7428
ENST0000110712489,948,881–90,296,9236

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BACH2 是轉錄調節因子,依相似性資料可作為轉錄抑制因子或活化因子,並能結合 Maf recognition elements(MARE)。資料亦指出,它在協調 MAFK 所介導的轉錄活化與抑制方面具有重要作用;這些敘述屬於相似性推論,並非在此資料中逐項提供實驗條件或作用機制細節。

在氧化壓力反應中,BACH2 可藉由抑制抗凋亡因子 HMOX1,誘導細胞凋亡。這項作用將轉錄調控與細胞對氧化壓力的反應連結起來;來源未進一步說明該調控的分子步驟或細胞類型,因此不宜延伸為更廣泛的機制主張。

此外,BACH2 被指出可正向調節 actin 進入細胞核,此項功能同樣來自相似性資料。來源未提供其調控方式或核內 actin 後續作用的細節。

在免疫系統方面,BACH2 是適應性免疫的重要調節因子,對維持調節性 T 細胞功能及 B 細胞成熟至關重要。這些角色使 BACH2 的轉錄調節與免疫細胞功能及成熟相連;來源未提供具體下游靶基因或不同免疫細胞中的作用差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 90296843 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BACH2 ENST00000257749 GRCh38 chr6:90296743-90297843 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGCAGAATTTTCTGGCCTTGGCAAGAGGTAAAGTTGCAGGCACCAGCACAACACTAACACAACCTTATT
TTATTGCAAATGTACATTCAGCCTAAATCCTAATTACCTTCTGTAAAATCCTAACCACCACCAAGCTTTC
TTCTGACAGGGCACTCACACGACGGCCTTTAAGGGCAGCAACAACATCCTAAGAGCCGCAGAAAGGAAAG
GCAGGGGAGAGTGGCTGGAAGGCAGTAGGAGCTGGGGCTGAAGCCCGGGAGGTTGGCTTTTAATGTCCTC
CTGAAATTGACCACTCTCTTTCCAAAAACACTGGCTTGGGGGCTTAAAGGTTCGCTCAGTAGGGCAGGCG
GAGGGCCTCCTGAAAAGGATTGAGAAGTCAACATTCAAAAGGCTGCTTTTACTCGCCCGGTCCCCACCCA
AAAGGGAGTCCGGTCAGCTTTGTGGGGGCCAGTGGAGCATCTTTTCTTGCCCTTCCGGGAAAACGCTAGC
TAACCCTGGGATCCCCGGTCCCGACGTCTGCTCTCCTTCCCCAGGTGCAGCACCTAGGGCTCTGGCCCCC
TCCCCACGTGCCACACCAGCCCTCACCACTACTCTCACCCTGCTATGCCCCCAACCCTCGTCTTTCGTGG
CCGGGAAGGCCAGGCCGAGCGGGGCGGTCAGCCGGGCCGGGAGGAGGGGGCTCTCCGGGCCGCGCGGCCG
CACAAAGCGGGGAGATCTGCTGCTGCGGCGGCATGAGGCGCGCCCCCTCCCGCGAGCCAGCGGAGCGCGC
GCGCCCGCCCCCGTCCCCCGCCCCCCGCCCCAGCCCCCGGAGCGCCATTCGCGGAGCGGCTTACGCTAGT
CGCCGGGCGTACCGCGCCCCAGCGGCCGGGGAGGTGCGCTGCCCGGCTCCCGTAAAGTTATTGTGAATGG
GGAGCGGGTGACGTCAGCGCCGAATGTCAACAATGTAGCGATTGAGAGTGTGGGCGTTCCGGGGAGAGCG
CAAGCCGCGCGGCGCGGAGCAAACAGCGCCGAGCCGCCGCCGCCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC
GGCAGCAGCGGCCGTGCACGCCCGGGCTGCGGTCGCACAGCGCTAACGTGA
BACH2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BACH2_2 ↗6:90,080,927負股90,080,917–90,080,976
BACH2_1 ↗6:90,296,843負股90,296,833–90,296,892

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_D6GXW · enhancer · 90294526–90296731 · regulatory

ENSR6_5R8FSL · CTCF_binding_site · 90295901–90295922 · regulatory

ENSR6_5R8FTS · CTCF_binding_site · 90296158–90296179 · regulatory

ENSR6_6DLPH9 · promoter · 90296732–90296785 · regulatory

ENSR6_84MND6 · promoter · 90296833–90296977 · regulatory

ENSR6_5R8G35 · CTCF_binding_site · 90297087–90297108 · regulatory

ENSR6_93BSNP · promoter · 90297147–90297647 · regulatory

ENSR6_BMWSX · enhancer · 90297648–90298457 · regulatory

· motif · 90291895–90291908 · motif

· motif · 90291923–90291936 · motif

· motif · 90293282–90293292 · motif

· motif · 90295161–90295174 · motif

· motif · 90295903–90295919 · motif

· motif · 90296160–90296176 · motif

· motif · 90296915–90296928 · motif

· motif · 90296915–90296928 · motif

· motif · 90297089–90297105 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:841 aa

1 aa841 aa結構域功能區域基序
依 Q9BYV9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BACH2 蛋白長 841 個胺基酸,屬於 bZIP 家族 CNC 次家族。其 BTB 結構域位於第 37–103 位,bZIP 結構域位於第 646–709 位;後者包含 basic motif(第 651–667 位)與 leucine-zipper(第 671–678 位)。序列另有數段註記為無序區,並在第 821–841 位標示核輸出訊號。

結構域BTB37–103 aa
結構域bZIP646–709 aa
功能區域Disordered153–173 aa
功能區域Disordered204–226 aa
功能區域Disordered246–329 aa
功能區域Disordered583–610 aa
功能區域Basic motif651–667 aa
功能區域Leucine-zipper671–678 aa
功能區域Disordered777–816 aa
基序Nuclear export signal821–841 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3OHU…

PDB · 3OHU

X-ray · 2.10 A · A/B/C/D/E/F=9-129

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

BACH2 位於細胞質與細胞核之間,並可在兩者間穿梭;其核質穿梭受磷酸化控制。 來源未提供不同異構型的定位差異,也未說明磷酸化造成定位改變的方向或具體條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 42 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BTBD25BACH2ANKRD55AP1M1BAHD1BATF3CBX8CCDC185CENPPCFAP58CTSZCWF19L2ELOAENPP7FAM161AFARS2FOSL2HMG20AINSYN2AKAT5LUZP4MAFFMAFGMAFKMCRS1MLXNXF1PSMC5RPL9P9RPP25SCNM1SLC43A1SMYD1TCEA2TRAF4TRIM42TSHZ2TULP3ZBTB24ZBTB34ZNF124ZNF438ZNF774ZNF792
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 42 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BACH2 可形成以雙硫鍵連結的同源二聚體。另有相似性資料指出,BACH2 可與 Maf-related transcription factors 形成異源二聚體;這項敘述屬於相似性推論,來源未列出特定因子或提供各異源二聚體的功能細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

BACH2 相關變異被列為常染色體顯性原發性免疫疾病 Immunodeficiency 60(IMD60)的致病原因。此疾病可表現為腸道發炎、反覆鼻竇與肺部感染、淋巴細胞成熟受損,以及程度不一的免疫球蛋白降低。來源將疾病與影響 BACH2 的變異相連,未提供特定變異或個別表現型的細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BACH2 可作為轉錄抑制因子或活化因子,並能結合 Maf recognition elements(MARE);它也參與協調 MAFK 所介導的轉錄活化與抑制,這些內容屬於相似性推論。氧化壓力下,BACH2 透過抑制抗凋亡因子 HMOX1 誘導細胞凋亡;此外,它可正向調節 actin 的核輸入,並對維持調節性 T 細胞功能及 B 細胞成熟至關重要。含實驗來源
證據與來源

Transcriptional regulator that acts as a repressor or activator (By similarity). Binds to Maf recognition elements (MARE) (By similarity). Plays an important role in coordinating transcription activation and repression by MAFK (By similarity). Induces apoptosis in response to oxidative stress through repression of the antiapoptotic factor HMOX1. Positively regulates the nuclear import of actin (By similarity). Is a key regulator of adaptive immunity, crucial for the maintenance of regulatory T-cell function and B-cell maturation

PMID 17018862 ↗ · PMID 28530713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BACH2 可形成以雙硫鍵連結的同源二聚體。另有相似性推論指出,BACH2 也可與 Maf-related transcription factors 形成異源二聚體;來源未列明具體因子。含實驗來源
證據與來源

Homodimer; disulfide-linked. Heterodimer of BACH2 and Maf-related transcription factors (By similarity)

PMID 22194330 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BACH2 位於細胞質與細胞核,並可在兩者間穿梭;這種核質穿梭受磷酸化控制。來源未說明磷酸化改變定位的方向或條件。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Nucleocytoplasmic shuttling is controlled by phosphorylation

PMID 17018862 ↗ · PMID 28530713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 BACH2 的變異可導致常染色體顯性原發性免疫疾病 Immunodeficiency 60(IMD60)。疾病特徵包括腸道發炎、反覆鼻竇與肺部感染、淋巴細胞成熟受損,以及免疫球蛋白生成程度不一地降低;來源未列出特定變異或個別表現差異。含實驗來源
證據與來源

Immunodeficiency 60 and autoimmunity IMD60 An autosomal dominant primary immunologic disorder characterized by intestinal inflammation, recurrent sino-pulmonary infections, impaired lymphocyte maturation, and variably decreased immunoglobulin production. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618394

PMID 28530713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000257749 · 9,215 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAACAGCGCCGAGCCGCCGCCGCCTCAGCAGCAGCAGCAG40
41CAGCAGCAGCGGCAGCAGCGGCCGTGCACGCCCGGGCTGC80
81GGTCGCACAGCGCTAACGTGAGCGGCCGCCGCCCTCGCCA120
121CCCCGCCTGCCCACTCCCGCCGCCGCCCCGCTCTCGCTTT160
161CCCCCCGGCCTCCCCTCGCCCCTTCCCCTCCCCCTTCCCG200
201GCGCACTCGGGGGGCTGGGAACGAGCTGCCATGTGATGCG240
241CGTCCCCTCCGCGAGCTTTCGGTGACCCACGAACTGCCCA280
281CCTCGCCGGCTGCCGGGAGGGGGCTGCGAGCCGGGAAGAC320
321GCGGGGAAGAGGAGGCGGAAAAGGACGCAAAGTTCTCCGG360
361CGAGCGCGTTCGTTCACATAGCTCCCAGTTTTAACATTTC400
401GCCACCTACTGAAGACATCATTTGGGACCAAGCTGATGAG440
441CCCTTGAAGCACAGCAGATAAGAGTGTTGCTGTTGATCAT480
481CTTTGCCTGGGAAGTTGAATGATAAAGCCAGAAGAAAGCA520
521TGCTTTCTGATCATTTGCAGCTGTCTGCTTCAGAAAGTGA560
561GGGCTCCAGGAATGAGGAGAATCTTCAAGAACTTCCTCGC600
601ACTGTGACATGTCTGATCCCTTGCTCCCATCCCTGCAGCA640
641TGAACAAGGTGGACACTCACTGACCTGTCACAAGGTTGCC680
681CCACAAAACTTTGGGGTCCATGTCTGAATGGATTGCCAGA720
721GCCTTCTCATCTCTCCCTTCGCCCAGTTCCCTGCATCCTA760
761AGACTCGAAGGCAGCACAGGACCTGGAAAAATTACATGGT800
801GTGAACGGCATGTCTGTGGATGAGAAGCCTGACTCCCCCA840
841TGTATGTGTATGAGTCCACAGTCCACTGCACCAACATCCT880
881CCTGGGCCTCAATGACCAGCGGAAAAAGGATATTCTCTGT920
921GACGTGACTTTGATCGTGGAGAGGAAGGAGTTCCGGGCCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。