基因總覽
AURKC 是蛋白質編碼基因,其產物 Aurora kinase C 屬於蛋白激酶超家族中的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶家族,並歸入 Aurora 子家族。它是染色體乘客複合體(CPC)的組成成員;該複合體是有絲分裂的重要調節者。Aurora kinase C 也參與減數分裂,尤其與精子生成相關。蛋白質具有蛋白激酶結構域,並含有來源註記為無序的區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302804 ★ | 57,231,023–57,235,548 | 7 |
| ENST00000923144 | 57,231,002–57,235,551 | 7 |
| ENST00001141006 | 57,231,002–57,235,551 | 7 |
| ENST00000415300 | 57,231,009–57,235,417 | 7 |
| ENST00000599062 | 57,231,249–57,235,417 | 7 |
| ENST00000598785 | 57,231,619–57,235,551 | 6 |
| ENST00000594599 | 57,232,618–57,235,548 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Aurora kinase C 是 CPC 的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶成員。CPC 在有絲分裂中具有關鍵調節作用,並在著絲點協助確保染色體正確排列與分離;該複合體也對染色質誘導的微管穩定及紡錘體組裝不可或缺。這些作用使染色體乘客複合體能參與有絲分裂期間的染色體處理與分配。
Aurora kinase C 可磷酸化組蛋白 H3 的 Ser-10 與 Ser-28,與 Aurora kinase B(AURKB)在此作用相同。此外,它會磷酸化 CPC 次單元 BIRC5/survivin 與 INCENP,並因此提高自身活性。這些磷酸化作用連結了複合體組成與激酶活性的調節。
其受質也包括參與細胞分裂的蛋白質 TACC1;Aurora kinase C 可磷酸化 TACC1 的 Ser-228。來源亦指出,Aurora kinase C 與 AURKB 具有重複的細胞功能,且在 AURKB 敲低時能夠補償。此結果支持兩者在部分細胞功能上存在重疊,但不表示兩者在所有作用中完全相同。
除有絲分裂外,Aurora kinase C 也參與減數分裂,尤其與精子生成有關。這使其功能涵蓋一般細胞分裂相關過程及生殖細胞形成;來源未進一步界定其在減數分裂各階段的具體作用。
Promoter 與基因調控
>AURKC ENST00000302804 GRCh38 chr19:57230023-57231123 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTTTGTTTTTGGGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGTTCTCCTTCTGTCG CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTC TTGCCTCAGCCTTTTGAGTAGGTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTAGTAGA AACGGGGTTTCGCCCTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTGCCTACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCC TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCACGCCAGGCCTTCAATTATATTTCTGCAAGATATGT TCCCTGTCTAAAAGAATTCAATTTTTAATGTTTTTGAAACTTATGTGTTTGCTAAACAAATACGTGGGGG CTGATTTTACGATCTGAGGCCAAATCCACAAACTGATTACAGGGTCCAACAAATATTTGGCGAGTGGGAG GAGAGGGGTAAGTGAGCTGGACTGGTGGCGTCCTGGCTGTGAGCAGGCACAGCCGCAGGCTTCAGGGAGC CCCATCGCGGTGACCCTGGAGAGTGGCCTGAATCGGACGTGACCTTGAAGCAAGGTGGTTTTGGGGTCGC CGGCTGCACAAGGCGCGAAGTGGTTTAGGGTCACGGGCTGCACGAGGCTCCAGCACGTCAGGAGTGGGCG TCTGTTCATTCCCACGTGCATCGCGGCTCTCTCCTAGTTGACGCATGCACACCCCGTGGGTGTATGCGTT GTTCATTCCCACAACGGCCATCACCACCTCTCCGCACCCTCTGTCTCCTTCCTTCTCGGGCCTCACCCCT GGCCCTCGCTTTCAGTGCCCAGCCCGGACCGCAGCACTCCAGTTCCGCCCCAACCCGGGAACCCTGGACT GAGGCTCCCGTTTCTGTCCTTTCTATTGGGCGCACTTCCGATGGCGTCAGGAATTTCAGCCAATAGGAGC CAGCCAGGAAGTACCTCTCTGAGCGGTTGGTGCCGGGTATAAAAGAAGGCCGCGCAGCCACGGCTGCTCA CGACGCCGCGGATCCCGAAGCCTGTGTAGCAGTGAGACATCAGTGAGGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| AURKC_1 ↗ | 19:57,231,073 | 正股 | 57,231,024–57,231,083 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_83NFMQ · promoter · 57230833–57231033 · regulatory
· motif · 57233294–57233302 · motif
· motif · 57233294–57233309 · motif
AURKC 的表現受細胞週期調控,在 G2 期與 M 期增加。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:309 aa
Aurora kinase C 長 309 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族中的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶家族 Aurora 子家族。其蛋白激酶結構域位於第 43 至 293 個胺基酸;第 1 至 33 個胺基酸被註記為無序區域。第 292 至 309 個胺基酸區段則有與 BIRC5 互作的註記。
蛋白質三維結構
細胞內定位
有絲分裂前期至中期,Aurora kinase C 分布於凝縮染色體;進入後期後,它與已分離的染色體解離,並重新分布至紡錘體中區微管,最後在細胞質分裂期間留於中體。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Chromosome;Chromosome, centromere。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- BIRC5O15392 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- BIRC7Q96CA5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CADPSA2RRN7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCENPQ9NQS7 · UniProt INTERACTION · 20 experiments
- OTX2P32243-2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
Aurora kinase C 是染色體乘客複合體(CPC)的成員。CPC 至少包含 BIRC5/survivin、CDCA8/borealin、INCENP,以及 AURKB 或 AURKC;來源指出,主要存在分別含 AURKB 與 AURKC 的複合體。在 CPC 中,Aurora kinase C 與 BIRC5/survivin 及 INCENP 直接互作;另有與 TACC1 互作的記載。
疾病與遺傳關聯
AURKC 的變異與精子生成障礙 5(Spermatogenic failure 5,SPGF5)相關。這是一種由精子生成缺陷造成的不孕症;受影響男性的精液中,近乎 100% 的精子形態異常,特徵包括多鞭毛、活動力低、頭部過大且形狀不規則,以及中段與頂體異常。來源將此疾病描述為由影響 AURKC 的變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Aurora kinase C 是染色體乘客複合體(CPC)的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶成員。CPC 協助有絲分裂時染色體正確排列與分離,並參與微管穩定及紡錘體組裝;Aurora kinase C 也參與減數分裂,尤其是精子生成。它與 AURKB 有重疊的細胞功能,可補償 AURKB 敲低,並磷酸化組蛋白 H3、BIRC5/survivin、INCENP 及 TACC1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase component of the chromosomal passenger complex (CPC), a complex that acts as a key regulator of mitosis. The CPC complex has essential functions at the centromere in ensuring correct chromosome alignment and segregation and is required for chromatin-induced microtubule stabilization and spindle assembly. Also plays a role in meiosis and more particularly in spermatogenesis. Has redundant cellular functions with AURKB and can rescue an AURKB knockdown. Like AURKB, AURKC phosphorylates histone H3 at 'Ser-10' and 'Ser-28'. AURKC phosphorylates the CPC complex subunits BIRC5/survivin and INCENP leading to increased AURKC activity. Phosphorylates TACC1, another protein involved in cell division, at 'Ser-228' PMID 15316025 ↗ · PMID 15499654 ↗ · PMID 15670791 ↗ · PMID 15938719 ↗ · PMID 21493633 ↗ · PMID 21531210 ↗ · PMID 27332895 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 染色體乘客複合體(CPC)至少由 BIRC5/survivin、CDCA8/borealin、INCENP,以及 AURKB 或 AURKC 組成;主要存在分別含 AURKB 或 AURKC 的複合體。Aurora kinase C 在 CPC 中直接與 BIRC5/survivin、INCENP 互作,另與 TACC1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the chromosomal passenger complex (CPC) composed of at least BIRC5/survivin, CDCA8/borealin, INCENP, AURKB or AURKC; predominantly independent AURKB- and AURKC-containing complexes exist; in the complex interacts directly with BIRC5/survivin and INCENP. Interacts with TACC1 PMID 15316025 ↗ · PMID 15499654 ↗ · PMID 15938719 ↗ · PMID 21531210 ↗ · PMID 27332895 ↗ |
| 細胞定位 | Aurora kinase C 在有絲分裂前期至中期分布於凝縮染色體;進入後期後,會與已分離的染色體解離並轉至紡錘體中區微管,之後於細胞質分裂期間留在中體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome; Chromosome, centromere; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Distributes in the condensed chromosomes during prophase to metaphase. After entering anaphase, there is a dissociation from separated chromosomes and a redistribution to midzone microtubules, and finally remains in the midbody during cytokinesis PMID 27332895 ↗ · PMID 15938719 ↗ |
| 調控 | AURKC 的表現受細胞週期調控,在 G2 期與 M 期會增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Expression is cell cycle-regulated, with an increase during G2 and M phases PMID 10066797 ↗ · PMID 15499654 ↗ |
| 疾病關聯 | 精子生成障礙 5(SPGF5)是不孕症,與精子生成缺陷有關,來源指出其由影響 AURKC 的變異造成。受影響男性的精液中,近乎 100% 精子形態異常,包括多鞭毛、活動力低、頭部過大且不規則,以及中段與頂體異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spermatogenic failure 5 SPGF5 An infertility disorder caused by spermatogenesis defects. Semen from affected men show close to 100% morphologically abnormal multiflagellar spermatozoa with low motility, oversized irregular heads, and abnormal midpiece and acrosome. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 243060 PMID 17435757 ↗ · PMID 21733974 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGCGGTTGGTGCCGGGTATAAAAGAAGGCCGCGCAGCCA40CGGCTGCTCACGACGCCGCGGATCCCGAAGCCTGTGTAGC80AGTGAGACATCAGTGAGGCTGCAGGACGAGCAGGATTGGA120AGCGCCCCGGCCAGAAAGTGACCCCCCACCCCTTTCAGGA160CCCTGTGAACGGGAACAGCCATCCAGAGGGTTCAGGAAGG200CGTCCGCGCCCTCACCTCTTCTCCCCATGAGCTCCCCCAG240AGCTGTGGTGCAGCTGGGCAAAGCTCAACCTGCAGGCGAA280GAGTTGGCTACAGCAAACCAAACAGCCCAGCAGCCCAGCA320GCCCAGCCATGCGGCGCCTCACAGTCGATGACTTTGAAAT360CGGGCGTCCCCTGGGCAAGGGGAAATTTGGGAATGTGTAC400CTGGCTCGGCTCAAGGAAAGCCATTTCATTGTGGCCCTGA440AGGTTCTCTTCAAGTCGCAGATAGAGAAGGAAGGACTGGA480GCACCAGCTGCGCCGGGAAATTGAGATCCAGGCTCATCTA520CAACACCCCAATATCCTGCGCCTGTATAACTATTTCCATG560ATGCACGCCGGGTGTACCTGATTCTGGAATATGCTCCAAG600GGGTGAGCTCTACAAGGAGCTGCAGAAAAGCGAGAAATTA640GATGAACAGCGCACAGCCACGATAATAGAGGAGTTGGCAG680ATGCCCTGACCTACTGCCATGACAAGAAAGTGATTCACAG720AGATATTAAGCCAGAGAACCTGCTGCTGGGGTTCAGGGGT760GAGGTGAAGATTGCAGATTTTGGCTGGTCTGTGCACACCC800CCTCCCTGAGGAGGAAGACAATGTGTGGGACACTGGACTA840CTTGCCGCCAGAAATGATTGAGGGGAGAACATATGATGAA880AAGGTGGATTTGTGGTGCATTGGAGTGCTCTGCTATGAGC920TGCTGGTGGGATATCCACCCTTTGAGAGCGCCTCCCACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。