基因總覽
AURKB(aurora kinase B)是蛋白質編碼基因,產物屬於蛋白激酶超家族中的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶家族,並歸入 Aurora 亞家族。其蛋白質是染色體乘客複合體(CPC)的激酶組成之一;CPC 是有絲分裂的重要調節複合體。AURKB 蛋白長 344 個胺基酸,含有蛋白激酶結構域,另有一段位於 N 端的無序區域。這些基本特徵使它能以激酶身分參與細胞分裂相關調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000585124 ★ | 8,204,734–8,210,575 | 9 |
| ENST00000932557 | 8,204,335–8,210,634 | 10 |
| ENST00000316199 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000534871 | 8,204,726–8,210,581 | 8 |
| ENST00000881953 | 8,204,726–8,210,343 | 8 |
| ENST00000932558 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000932559 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000932560 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000932561 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000932562 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000932563 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
| ENST00000932564 | 8,204,726–8,210,634 | 9 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
AURKB 是 CPC 的絲胺酸/蘇胺酸激酶組成,參與有絲分裂中的染色體排列與分離。CPC 在著絲點促進染色體正確排列和分配,也參與染色質誘導的微管穩定及紡錘體組裝。AURKB 有助於紡錘體微管與動粒形成雙極連結,並參與中央紡錘體及紡錘體中區的組裝、分裂溝形成,以及細胞質分裂的啟動。
其作用方式之一是磷酸化 CPC 亞基 BIRC5、CDCA8 與 INCENP;INCENP 磷酸化後會提高 AURKB 活性。其他受質包括著絲點或有絲分裂相關蛋白,以及組蛋白 H1.4、H3。AURKB 可在有絲分裂期間磷酸化組蛋白 H3 的 Ser-10 與 Ser-28;它也參與 BUB1 和 SGO1 定位至動粒。HASPIN 與 AURKB 形成的正回饋作用,則有助於 CPC 定位至著絲點。AURKB 磷酸化 VIM,並調控細胞質分裂期間 vimentin 絲的分配。
在細胞質分裂檢查點中,AURKB 磷酸化 CHMP4C,使具備切離能力的 VPS4A 和/或 VPS4B 保留於中體環,直到晚期細胞質分裂時檢查點訊號終止。這項延遲可避免細胞間染色體橋過早解除,並防止 DNA 損傷累積。AURKB 也參與紡錘體中區組裝與分裂溝形成,將染色體分離與細胞分裂的進程相連結。
AURKB 的作用亦延伸至其他細胞調控情境:它磷酸化 p53/TP53,並因此負向調節其轉錄活性;在靜止 B 細胞的活躍啟動子,則透過組蛋白 H3S28 磷酸化,影響組蛋白 H2A 泛素化及 USP16 的結合與活性。G2-M 轉換期間,AURKB 磷酸化 CGAS 的 N 端,抑制其液相分離與活化,進而避免 CGAS 誘發的自體免疫。另有資料指出,AURKB 可藉由磷酸化並活化 ZBP1,促進 PANoptosis;其對 ATXN10 的磷酸化也可能參與細胞質分裂調節及 ATXN10 的蛋白酶體降解。
Promoter 與基因調控
>AURKB ENST00000585124 GRCh38 chr17:8210475-8211575 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATAAATATCCACTGGTTATTTCATAGAAGGCCCAAAAATGTATTTATTTAACCCAGTAATGAAATCTGAG GGTTAGGAAGAGCAGAAAAGAAGGAAGTGTGGCAGGAAGGAGGAAAAATGAAAGTGGGCCCAAACAACAC GGCAGCTAACAGAGATCTTGCAACGAAAGGTCTATTGGTGGAAAAACTCCTCCCAGGAATGTCAGAACTT TTAAGAACGACATAGTAATGACACAAGAATAAACACACAGGCAAATGAGCAAACAACGGAATACAAAGTC TAGAAATAGACACAAGTAAATATGCTAACATTATATATCAAGGGCAGCATTTAAATTCTGTTGGGGCAGT TTGTTTAACAAATGGTGTTGACATAACTGGCGCTCCATCGGGCAGAGAAGTTAGACCCCAGCTCATACAT GCATAAGGATAAACTCCAGTTACATTAAAGATTTAATTTTTTTTATAAAAAGAAGAAGGCCGGGCACGGT GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAAGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGACAGGAGTTCGAG ACCAGATTGGCCAACACAGCGAAAACCCGTCTCTAATAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGG GCGCTTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGC AGCAAGCCCAGATAGCACCATTATACTCCAGCCTGAGCGACAGAGAGAGACCTGTCTCAAAAAAGGAAAA AAAAAAAGAAAAGAAAAAGCAAGATAATTCACTGGGGGAATTTGGGGAAACTTTCCTAAACTGGAAGCCA AGCGTGAGCCCTTCTCATTCCGCCTCTTCCATTGGGTTCCCATGACTTACGTCACAGGACATCGAGCCAA TGGGAACTAGGCATGGGCGACGAGCTTGCCCAATGGGGCCGGGGCGGGAGATTTGAAAAGTCCTTGGCCA GGGCGCGGCGTGGCAGATTCAGTTGTTTGCGGGCGGCCGGGAGAGTAGCAGTGCCTTGGACCCCAGGTGA GCTGGCCTCCTGTCGCAGGCCTTGCGCCGGGAGTGGGCAGATGATCAGGTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| AURKB_3 ↗ | 17:8,210,234 | 負股 | 8,210,224–8,210,283 |
| AURKB_1 ↗ | 17:8,210,575 | 負股 | 8,210,565–8,210,624 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_958ZK · enhancer · 8209831–8210213 · regulatory
ENSR17_B3LZT · promoter · 8210214–8211072 · regulatory
ENSR17_9592D · enhancer · 8212719–8212991 · regulatory
· motif · 8206523–8206534 · motif
· motif · 8209982–8209998 · motif
· motif · 8209982–8209998 · motif
· motif · 8210561–8210576 · motif
· motif · 8210679–8210692 · motif
· motif · 8210679–8210692 · motif
· motif · 8211391–8211402 · motif
· motif · 8212555–8212569 · motif
· motif · 8212555–8212569 · motif
· motif · 8212796–8212809 · motif
· motif · 8212796–8212810 · motif
AURKB 的表現量隨細胞週期變化:在 G1/S 期較低,至 G2 期與 M 期上升,並於 M 期後再次下降。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:344 aa
AURKB 蛋白長 344 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族中的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶家族及 Aurora 亞家族。其蛋白激酶結構域位於第 77 至 327 個胺基酸;第 1 至 22 個胺基酸則被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
AURKB 的位置會隨有絲分裂階段轉換:前期至中期位於染色體臂及內著絲點,後期至細胞質分裂期間則轉移至紡錘體中區與中體。 中期活化且帶有 Thr-232 磷酸化的形式,其正確定位可能依賴與 SPDYC 的交互作用;內著絲點定位則主要出現在 H3pT3 與 H2ApT12 磷酸化重疊的區域。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Chromosome;Chromosome, centromere;Chromosome, centromere, kinetochore;Midbody。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- BIRC5O15392 · UniProt INTERACTION · 13 experiments · 3 筆來源紀錄
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CDCA8Q53HL2 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- GAS2L3Q86XJ1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- H3-4Q16695 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- HSP90AA5PQ58FG0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- INCENPQ9NQS7 · UniProt INTERACTION · 23 experiments · 2 筆來源紀錄
- KAT5Q92993 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KLHL13Q9P2N7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KLHL9Q9P2J3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAPRE1Q15691 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- NPM1P06748 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PPP2R1AP30153 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEPTIN1Q8WYJ6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TACC1O75410-6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- USP29Q9HBJ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VRK1Q99986 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
AURKB 是 CPC 的組成之一;該複合體至少包含 BIRC5、CDCA8、INCENP,以及 AURKB 或 AURKC,並存在主要由 AURKB 或 AURKC 各自組成的複合體。AURKB 也與多種蛋白質有交互作用,包括 M 期的 RACGAP1、p53/TP53、NOC2L、NDC80、SIRT2、SEPTIN1 和 RNF2/RING1B。它與 SPDYC 的交互作用可能有助於有絲分裂前期及中期活化型 AURKB 的適當定位;此定位作用不同於單純指出兩者位於同一位置。
疾病與遺傳關聯
資料提出,AURKB 表現調控受干擾,可能是癌細胞染色體完整性異常的一種機制;所述可能途徑涉及其對細胞質分裂的顯性負向作用。這是可能機制的描述,並未將 AURKB 表現異常直接確立為癌症的致病原因。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | AURKB 是染色體乘客複合體(CPC)的絲胺酸/蘇胺酸激酶組成之一,參與有絲分裂中的染色體排列、分離、紡錘體組裝與細胞質分裂。它磷酸化多種細胞分裂相關蛋白,包括 CPC 亞基、組蛋白及 CHMP4C;後者促使 VPS4 保留於中體環,延後切離以避免染色體橋過早解除及 DNA 損傷累積。其作用也涉及 CGAS、ZBP1、p53/TP53 等調控。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase component of the chromosomal passenger complex (CPC), a complex that acts as a key regulator of mitosis. The CPC complex has essential functions at the centromere in ensuring correct chromosome alignment and segregation and is required for chromatin-induced microtubule stabilization and spindle assembly. Involved in the bipolar attachment of spindle microtubules to kinetochores and is a key regulator for the onset of cytokinesis during mitosis. Required for central/midzone spindle assembly and cleavage furrow formation. Key component of the cytokinesis checkpoint, a process required to delay abscission to prevent both premature resolution of intercellular chromosome bridges and accumulation of DNA damage: phosphorylates CHMP4C, leading to retain abscission-competent VPS4 (VPS4A and/or VPS4B) at the midbody ring until abscission checkpoint signaling is terminated at late cytokinesis. AURKB phosphorylates the CPC complex subunits BIRC5/survivin, CDCA8/borealin and INCENP. Phosphorylation of INCENP leads to increased AURKB activity. Other known AURKB substrates involved in centromeric functions and mitosis are CENPA, DES/desmin, GPAF, KIF2C, NSUN2, RACGAP1, SEPTIN1, VIM/vimentin, HASPIN, and histones H1.4 and H3. A positive feedback loop involving HASPIN and AURKB contributes to localization of CPC to centromeres. Phosphorylation of VIM controls vimentin filament segregation in cytokinetic process, whereas histone H3 is phosphorylated at 'Ser-10' and 'Ser-28' during mitosis (H3S10ph and H3S28ph, respectively). AURKB is also required for kinetochore localization of BUB1 and SGO1. Phosphorylation of p53/TP53 negatively regulates its transcriptional activity. Key regulator of active promoters in resting B- and T-lymphocytes: acts by mediating phosphorylation of H3S28ph at active promoters in resting B-cells, inhibiting RNF2/RING1B-mediated ubiquitination of histone H2A and enhancing binding and activity of the USP16 deubiquitinase at transcribed genes (By similarity). Acts as an inhibitor of CGAS during mitosis: catalyzes phosphorylation of the N-terminus of CGAS during the G2-M transition, blocking CGAS liquid phase separation and activation, and thereby preventing CGAS-induced autoimmunity. Acts as an activator of pyroptosis, apoptosis and necroptosis (PANoptosis) by mediating phosphorylation and activation of ZBP1. Phosphorylates KRT5 during anaphase and telophase (By similarity). Phosphorylates ATXN10 which promotes phosphorylation of ATXN10 by PLK1 and may play a role in the regulation of cytokinesis and stimulating the proteasomal degradation of ATXN10 PMID 11516652 ↗ · PMID 11756469 ↗ · PMID 11784863 ↗ · PMID 11856369 ↗ · PMID 12458200 ↗ · PMID 12686604 ↗ · PMID 12689593 ↗ · PMID 12925766 ↗ · PMID 14602875 ↗ · PMID 14610074 ↗ · PMID 14722118 ↗ · PMID 15020684 ↗ · PMID 15249581 ↗ · PMID 16103226 ↗ · PMID 17617734 ↗ · PMID 20959462 ↗ · PMID 21658950 ↗ · PMID 22422861 ↗ · PMID 24814515 ↗ · PMID 25666058 ↗ · PMID 26829474 ↗ · PMID 29449677 ↗ · PMID 33542149 ↗ · PMID 41310329 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) PMID 11784863 ↗ · PMID 11856369 ↗ · PMID 21511733 ↗ · PMID 25666058 ↗ · PMID 26829474 ↗ · PMID 33542149 ↗ · PMID 41310329 ↗ |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 14722118 ↗ · PMID 26829474 ↗ · PMID 33542149 ↗ · PMID 41310329 ↗ |
| 交互作用 | AURKB 是 CPC 的組成之一;CPC 至少由 BIRC5、CDCA8、INCENP 及 AURKB 或 AURKC 構成,且主要存在各自含 AURKB 或 AURKC 的複合體。AURKB 另與 RACGAP1、SPDYC、p53/TP53、NOC2L、CDCA1、EVI5、JTB、NDC80、PSMA3、RNF2/RING1B、SEPTIN1、SIRT2、TACC1 及 TTC28 交互作用;SPDYC 交互作用可能有助於活化型 AURKB 在特定有絲分裂階段正確定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the chromosomal passenger complex (CPC) composed of at least BIRC5/survivin, CDCA8/borealin, INCENP, AURKB or AURKC; predominantly independent AURKB- and AURKC-containing complexes exist. Associates with RACGAP1 during M phase. Interacts with SPDYC; this interaction may be required for proper localization of active, Thr-232-phosphorylated AURKB form during prometaphase and metaphase. Interacts with p53/TP53. Interacts (via the middle kinase domain) with NOC2L (via the N- and C-terminus domains). Interacts with CDCA1. Interacts with EVI5. Interacts with JTB. Interacts with NDC80. Interacts with PSMA3. Interacts with RNF2/RING1B (By similarity). Interacts with SEPTIN1. Interacts with SIRT2. Interacts with TACC1. Interacts with TTC28 PMID 11516652 ↗ · PMID 12689593 ↗ · PMID 12925766 ↗ · PMID 14602875 ↗ · PMID 14674694 ↗ · PMID 14722118 ↗ · PMID 15064709 ↗ · PMID 15249581 ↗ · PMID 16179162 ↗ · PMID 16764853 ↗ · PMID 17726514 ↗ · PMID 18591255 ↗ · PMID 20562864 ↗ · PMID 20605920 ↗ · PMID 20959462 ↗ · PMID 21225229 ↗ · PMID 23036704 ↗ · PMID 27332895 ↗ |
| 細胞定位 | AURKB 在有絲分裂前期至中期位於染色體臂及內著絲點,之後於後期至細胞質分裂期間轉移至紡錘體中區和中體。其活化且 Thr-232 磷酸化的形式在中期的正確定位可能依賴 SPDYC;內著絲點定位主要出現在有絲分裂特異性組蛋白磷酸化 H3pT3 與 H2ApT12 重疊的區域。AURKB 也在中體與 gamma tubulin 及 SIRT2 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome; Chromosome, centromere; Chromosome, centromere, kinetochore; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Midbody; Localizes on chromosome arms and inner centromeres from prophase through metaphase and then transferring to the spindle midzone and midbody from anaphase through cytokinesis. Colocalized with gamma tubulin in the midbody. Proper localization of the active, Thr-232-phosphorylated form during metaphase may be dependent upon interaction with SPDYC. Colocalized with SIRT2 during cytokinesis with the midbody. Localization (and probably targeting of the CPC) to the inner centromere occurs predominantly in regions with overlapping mitosis-specific histone phosphorylations H3pT3 and H2ApT12 PMID 20959462 ↗ · PMID 20929775 ↗ · PMID 11756469 ↗ · PMID 12925766 ↗ · PMID 26829474 ↗ · PMID 11516652 ↗ · PMID 12458200 ↗ · PMID 20605920 ↗ · PMID 16179162 ↗ · PMID 17726514 ↗ · PMID 23036704 ↗ |
| 調控 | AURKB 表現具有細胞週期調控特徵:在 G1/S 期處於低水平,於 G2 期與 M 期增加,並在 M 期結束後再次下降。 | 含實驗來源 | 證據與來源Expression is cell cycle-regulated, with a low in G1/S, an increase during G2 and M. Expression decreases again after M phase PMID 12925766 ↗ |
| 疾病關聯 | AURKB 表現調控受到干擾,可能是癌細胞染色體完整性受擾的一種機制;可能涉及 AURKB 對細胞質分裂的顯性負向作用。此描述指出的是可能機制,並未表示已確立直接因果關係。 | 推論支持 | 證據與來源Disruptive regulation of expression is a possible mechanism of the perturbation of chromosomal integrity in cancer cells through its dominant-negative effect on cytokinesis PMID 9809983 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTGTTTGCGGGCGGCCGGGAGAGTAGCAGTGCCTTGGA40CCCCAGCTCTCCTCCCCCTTTCTCTCTAAGGATGGCCCAG80AAGGAGAACTCCTACCCCTGGCCCTACGGCCGACAGACGG120CTCCATCTGGCCTGAGCACCCTGCCCCAGCGAGTCCTCCG160GAAAGAGCCTGTCACCCCATCTGCACTTGTCCTCATGAGC200CGCTCCAATGTCCAGCCCACAGCTGCCCCTGGCCAGAAGG240TGATGGAGAATAGCAGTGGGACACCCGACATCTTAACGCG280GCACTTCACAATTGATGACTTTGAGATTGGGCGTCCTCTG320GGCAAAGGCAAGTTTGGAAACGTGTACTTGGCTCGGGAGA360AGAAAAGCCATTTCATCGTGGCGCTCAAGGTCCTCTTCAA400GTCCCAGATAGAGAAGGAGGGCGTGGAGCATCAGCTGCGC440AGAGAGATCGAAATCCAGGCCCACCTGCACCATCCCAACA480TCCTGCGTCTCTACAACTATTTTTATGACCGGAGGAGGAT520CTACTTGATTCTAGAGTATGCCCCCCGCGGGGAGCTCTAC560AAGGAGCTGCAGAAGAGCTGCACATTTGACGAGCAGCGAA600CAGCCACGATCATGGAGGAGTTGGCAGATGCTCTAATGTA640CTGCCATGGGAAGAAGGTGATTCACAGAGACATAAAGCCA680GAAAATCTGCTCTTAGGGCTCAAGGGAGAGCTGAAGATTG720CTGACTTCGGCTGGTCTGTGCATGCGCCCTCCCTGAGGAG760GAAGACAATGTGTGGCACCCTGGACTACCTGCCCCCAGAG800ATGATTGAGGGGCGCATGCACAATGAGAAGGTGGATCTGT840GGTGCATTGGAGTGCTTTGCTATGAGCTGCTGGTGGGGAA880CCCACCCTTTGAGAGTGCATCACACAACGAGACCTATCGC920CGCATCGTCAAGGTGGACCTAAAGTTCCCCGCTTCCGTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。