基因總覽
ATXN2 是蛋白質編碼基因，產物 ataxin 2 屬於 ataxin-2 家族。其蛋白質序列長 1313 個胺基酸，含有 Sm 結構域，並有多段被註解為無序的區域。現有資料指出，ataxin 2 與 EGFR 運輸有關；其分子作用與此角色的細節見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000673436 ★ | 111,452,214–111,599,315 | 25 |
| ENST00000389154 | 111,452,214–111,488,612 | 10 |
| ENST00000672613 | 111,452,214–111,599,315 | 25 |
| ENST00000643669 | 111,452,214–111,599,315 | 26 |
| ENST00000608853 | 111,452,214–111,599,350 | 25 |
| ENST00000389153 | 111,452,214–111,599,676 | 24 |
| ENST00000673557 | 111,452,214–111,599,676 | 25 |
| ENST00000673283 | 111,452,214–111,599,676 | 23 |
| ENST00000673449 | 111,452,214–111,599,676 | 26 |
| ENST00000535949 | 111,452,214–111,599,673 | 22 |
| ENST00000542287 | 111,452,214–111,599,673 | 26 |
| ENST00000550104 | 111,452,214–111,599,676 | 25 |
顯示 12/75 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ataxin 2 參與 EGFR 的運輸，並在細胞膜處負向調節 EGFR 的內吞作用。這表示它與受體進入細胞的調控環節有關；現有資料未進一步說明其如何影響內吞步驟，也未提供其他細胞過程或下游結果的細節，因此不宜將作用延伸解讀為更廣泛的運輸功能。
Promoter 與基因調控
>ATXN2 ENST00000673436 GRCh38 chr12:111599215-111600315 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGTTTTGAGGTCGGCTCTGTCTCTACCGAGGGAGATCCCATTATCCGTAGTTCTACCAGTCCCAATCCC ATATATTTCCTTTAGAATCTCATGAATGAGGAAAAAGAAGTTCAAGTGAGGGAACATAGGTTCAAATGAA GGTCAGATACCTAAAAGAGTTTTCTGGTGACTGTGCGCGGCTGGGGTGGAAAAAGTGGGGAAAAGGTACC CAGATGTGGGTGGCCCCGGAGGGTTGCTCCACTCCAGCCCCGGCAGGGCAGGACAGCGCGGCCTGCCTGG TAGATGCCCCGAGCCACTGGAGCGCCTACTGTGTGGCGGGCGGGGGACGGCAGGAAAACGGCAGGATGCT GTGTCCCCTGAATCTGGCAGGGTTCTAGGTGCTTTACACGTAGCAAGACACATTCTCCGCCCCAAGGCAC TCGCAGTCAGTCCATTTTCTGGGTTGCATCAGGTGGGGGCAAACTAGGTCCCCGCAGAAGTGAAGATGCT GAAGGAATACAGTAGGAGAAGAAATGCTTCTCTCCTGTCCTCCACACCAGGCAGGCCCCAGAGGCTGAGA CCGACACGCCCTCCCCGAAGGGCAGACCCGCCTTGAGGAAGGCGGATCCGGGTAGGGACCGCCGCCTGGC CCTCACCCGACCCCCGAGAAAGCAACCCAGCGCGCCGCCCGCTCCTCACGTGTCCCTCCCGGCCCCGGGG CCACCTCACGTTCTGCTTCCGTCTGACCCCTCCGACTTCCGGTAAAGAGTCCCTATCCGCACCTCCGCTC CCACCCGGCGCCTCGGCGCGCCCGCCCTCCGATGCGCTCAGCGGCCGCAGCTCCTCGGAGTCCCGCGGTG GCCACCGAGTCTCGCCGCTTCGCCGCAGCCAGGTGGCCCGGGTGGCGCTCGCTCCAGCGGCCGGCGCGGC GGAGCGGGCGGGGCGGCGGTGGCGCGGCCCCGGGACCGTATCCCTCCGCCGCCCCTCCCCCGCCCGGCCC CGGCCCCCCTCCCTCCCGGCAGAGCTCGCCTCCCTCCGCCTCAGACTGTTTTGGTAGCAACGGCAACGGC GGCGGCGCGTTTCGGCCCGGCTCCCGGCGGCTCCTTGGTCTCGGCGGGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ATXN2_1 ↗ | 12:111,599,293 | 負股 | 111,599,283–111,599,342 |
| ATXN2_3 ↗ | 12:111,599,582 | 負股 | 111,599,572–111,599,631 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_5Z8PCP · CTCF_binding_site · 111597413–111597434 · regulatory
ENSR12_5Z8PJJ · CTCF_binding_site · 111598446–111598467 · regulatory
ENSR12_5Z8PL6 · CTCF_binding_site · 111598801–111598822 · regulatory
ENSR12_BS5ZP · promoter · 111599069–111599629 · regulatory
ENSR12_93M9ZM · promoter · 111599663–111600166 · regulatory
· motif · 111595677–111595688 · motif
· motif · 111595807–111595829 · motif
· motif · 111595807–111595829 · motif
· motif · 111597415–111597431 · motif
· motif · 111597552–111597572 · motif
· motif · 111598383–111598395 · motif
· motif · 111598448–111598464 · motif
· motif · 111598803–111598819 · motif
· motif · 111599499–111599514 · motif
· motif · 111599549–111599558 · motif
· motif · 111599571–111599582 · motif
· motif · 111599571–111599582 · motif
· motif · 111599573–111599582 · motif
· motif · 111599584–111599596 · motif
· motif · 111599586–111599593 · motif
· motif · 111599591–111599602 · motif
· motif · 111599632–111599641 · motif
· motif · 111599632–111599641 · motif
· motif · 111599634–111599650 · motif
· motif · 111599634–111599650 · motif
· motif · 111600314–111600326 · motif
· motif · 111600318–111600333 · motif
· motif · 111600318–111600333 · motif
· motif · 111600319–111600333 · motif
· motif · 111600320–111600333 · motif
· motif · 111600325–111600340 · motif
· motif · 111600325–111600340 · motif
· motif · 111600326–111600340 · motif
· motif · 111600333–111600355 · motif
· motif · 111600518–111600529 · motif
· motif · 111600681–111600692 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1313 aa
ataxin 2 長 1313 個胺基酸，屬於 ataxin-2 家族。序列第 267–344 位註解有 Sm 結構域；第 1–255、459–954 及 1137–1219 位則被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ataxin 2 定位於細胞質；未提供其在不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- DDX6P26196 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- G3BP1Q13283 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PABPC1P11940 · UniProt INTERACTION · 8 experiments · 2 筆來源紀錄
- SH3GL2Q99962 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SH3GL3Q99963 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- TARDBPQ13148 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG6P46379-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIN1Q9BTH3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BRK1Q8WUW1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD247P20963 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBFOX1Q9NWB1-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GL3Q8IVP1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STOML2Q9UJZ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SUMO3P55854 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VHLP40337-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q96E88Q96E88 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ataxin 2 可呈單體形式，也可形成同源二聚體，兩項註解均為相似性推定。資料記載它與 TARDBP 的互作依賴 RNA，並與 RBFOX1、SH3GL2、SH3GL3、EGFR、ATXN2L、SH3KBP1 及 CBL 互作；其中與 SH3KBP1、CBL 的互作為相似性推定。另有與多核糖體互作的記載。
疾病與遺傳關聯
ATXN2 的 CAG 重複擴增與脊髓小腦性共濟失調 2 型（SCA2）相關；部分患者的重複數約為 36 至 52，較長擴增與較早發病有關。SCA2 可呈現步態、手部、言語或眼球運動協調障礙，也可能伴隨低反射、肌陣攣、動作性顫抖或對多巴胺有反應的帕金森症狀；部分患者則僅呈現家族性帕金森症而沒有小腦徵象。另有資料指出，CAG 中間型擴增大於 23 次、但低於造成 SCA2 的門檻，可能與肌萎縮性側索硬化症易感性增加相關；此為風險關聯，並非因果定論。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ataxin 2 參與 EGFR 的運輸，並在細胞膜處負向調節 EGFR 的內吞作用。資料未進一步說明其如何調節內吞，也未提供相關的下游結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in EGFR trafficking, acting as negative regulator of endocytic EGFR internalization at the plasma membrane PMID 18602463 ↗ |
| 交互作用 | ataxin 2 可呈單體，也可形成同源二聚體，兩者均為相似性推定。它與 TARDBP 的互作依賴 RNA，並與 RBFOX1、SH3GL2、SH3GL3、SH3KBP1、CBL、EGFR、ATXN2L 及多核糖體互作；其中 SH3KBP1 與 CBL 的互作亦為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer (By similarity). Can also form homodimers (By similarity). Interacts with TARDBP; the interaction is RNA-dependent. Interacts with RBFOX1. Interacts with polyribosomes. Interacts with SH3GL2 and SH3GL3. Interacts with SH3KBP1 and CBL (By similarity). Interacts with EGFR. Interacts with ATXN2L PMID 10814712 ↗ · PMID 16835262 ↗ · PMID 18602463 ↗ · PMID 20740007 ↗ · PMID 23209657 ↗ |
| 細胞定位 | ataxin 2 位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | SCA2 是常染色體顯性小腦性共濟失調之一，臨床表現可包括進行性步態不協調，以及手部、言語和眼球運動協調不良；部分患者有低反射、肌陣攣、動作性顫抖或對多巴胺有反應的帕金森症狀，也有人僅呈現家族性帕金森症。此病由影響 ATXN2 的變異所致，其中 CAG 重複擴增在部分患者約為 36 至 52 次；較長擴增與較早發病相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spinocerebellar ataxia 2 SCA2 Spinocerebellar ataxia is a clinically and genetically heterogeneous group of cerebellar disorders. Patients show progressive incoordination of gait and often poor coordination of hands, speech and eye movements, due to cerebellum degeneration with variable involvement of the brainstem and spinal cord. SCA2 belongs to the autosomal dominant cerebellar ataxias type I (ADCA I) which are characterized by cerebellar ataxia in combination with additional clinical features like optic atrophy, ophthalmoplegia, bulbar and extrapyramidal signs, peripheral neuropathy and dementia. SCA2 is characterized by hyporeflexia, myoclonus and action tremor and dopamine-responsive parkinsonism. In some patients, SCA2 presents as pure familial parkinsonism without cerebellar signs. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry. SCA2 is caused by expansion of a CAG repeat resulting in about 36 to 52 repeats in some patients. Longer expansions result in earlier the expansion, onset of the disease MIM: 183090 PMID 8896555 ↗ · PMID 8896556 ↗ · PMID 8896557 ↗ |
| 疾病關聯 | 肌萎縮性側索硬化症會影響腦部上運動神經元，以及腦幹和脊髓下運動神經元，可導致致命性癱瘓，且沒有感覺異常。其成因可能涉及遺傳與環境因素，約 5–10% 個案具有遺傳性。ATXN2 變異與疾病易感性相關；CAG 中間型擴增大於 23 次、但低於造成 SCA2 的門檻，似乎會提高發病風險。 | 含實驗來源 | 證據與來源Amyotrophic lateral sclerosis 13 ALS13 A neurodegenerative disorder affecting upper motor neurons in the brain and lower motor neurons in the brain stem and spinal cord, resulting in fatal paralysis. Sensory abnormalities are absent. The pathologic hallmarks of the disease include pallor of the corticospinal tract due to loss of motor neurons, presence of ubiquitin-positive inclusions within surviving motor neurons, and deposition of pathologic aggregates. The etiology of amyotrophic lateral sclerosis is likely to be multifactorial, involving both genetic and environmental factors. The disease is inherited in 5-10% of the cases. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. An increased risk for developing amyotrophic lateral sclerosis seems to be conferred by CAG repeat intermediate expansions greater than 23 but below the threshold for developing spinocerebellar ataxia MIM: 183090 PMID 20740007 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGCTCGCCTCCCTCCGCCTCAGACTGTTTTGGTAGCAA40CGGCAACGGCGGCGGCGCGTTTCGGCCCGGCTCCCGGCGG80CTCCTTGGTCTCGGCGGGCCTCCCCGCCCCTTCGTCGTCC120TCCTTCTCCCCCTCGCCAGCCCGGGCGCCCCTCCGGCCGC160GCCAACCCGCGCCTCCCCGCTCGGCGCCCGCGCGTCCCCG200CCGCGTTCCGGCGTCTCCTTGGCGCGCCCGGCTCCCGGCT240GTCCCCGCCCGGCGTGCGAGCCGGTGTATGGGCCCCTCAC280CATGTCGCTGAAGCCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG320CAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC360AGCAGCCGCCGCCCGCGGCTGCCAATGTCCGCAAGCCCGG400CGGCAGCGGCCTTCTAGCGTCGCCCGCCGCCGCGCCTTCG440CCGTCCTCGTCCTCGGTCTCCTCGTCCTCGGCCACGGCTC480CCTCCTCGGTGGTCGCGGCGACCTCCGGCGGCGGGAGGCC520CGGCCTGGGCAGAGGTCGAAACAGTAACAAAGGACTGCCT560CAGTCTACGATTTCTTTTGATGGAATCTATGCAAATATGA600GGATGGTTCATATACTTACATCAGTTGTTGGCTCCAAATG640TGAAGTACAAGTGAAAAATGGAGGTATATATGAAGGAGTT680TTTAAAACTTACAGTCCGAAGTGTGATTTGGTACTTGATG720CCGCACATGAGAAAAGTACAGAATCCAGTTCGGGGCCGAA760ACGTGAAGAAATAATGGAGAGTATTTTGTTCAAATGTTCA800GACTTTGTTGTGGTACAGTTTAAAGATATGGACTCCAGTT840ATGCAAAAAGAGATGCTTTTACTGACTCTGCTATCAGTGC880TAAAGTGAATGGCGAACACAAAGAGAAGGACCTGGAGCCC920TGGGATGCAGGTGAACTCACAGCCAATGAGGAACTTGAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。