演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ATP8B4ATPIM

ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative)

ATP8B4 是 P 型陽離子運輸 ATPase 家族的蛋白質,屬於 IV 型亞家族;它是 P4-ATPase 翻轉酶複合體的催化 α 次單元,與膜磷脂運輸相關。

Homo sapiens15q21.2UniProt Q8TF62
OFFICIAL SYMBOL
ATP8B4
CHROMOSOME
15
UNIPROT
Q8TF62
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ATP8B4(ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative))是蛋白質編碼基因,其產物屬於陽離子運輸 ATPase(P 型)家族的 IV 型亞家族。此蛋白質是多次穿膜蛋白,具有多段跨膜螺旋與胞質區域,並含有胞外側迴圈;序列註解也指出其 C 端有兩段預測為無序的區域。ATP8B4 的基本角色與 P4-ATPase 翻轉酶複合體相關,在複合體中擔任催化 α 次單元。這些家族與結構特徵提供其膜運輸角色的背景;具體的運輸方向及其可能涉及的細胞過程如下方功能段落所述。

Official symbol
ATP8B4
Gene name
ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13536
UniProt
Q8TF62
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ATPIMKIAA1939

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q21.2
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegATP8B4pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr15:49,858,238–50,182,947
Gene span
324,710 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000284509 ★49,858,238–50,119,23328
ENST0000055982949,858,238–50,114,51928
ENST0000089512749,858,238–50,182,94729
ENST0000089512849,858,238–50,119,71827
ENST0000089512949,858,238–50,119,71828
ENST0000089513049,858,238–50,113,37927
ENST0000089513149,858,238–50,113,37929
ENST0000089513249,858,238–50,113,37928
ENST0000096655249,858,238–50,182,94729
ENST0000096655349,858,238–50,113,37928
ENST0000097798749,979,408–50,182,94713
ENST0000097798849,979,408–50,113,37912

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ATP8B4 是 P4-ATPase 翻轉酶複合體的組成部分。此類複合體催化 ATP 水解,並將能量耦合至胺基磷脂跨膜轉運,使磷脂由膜的外側小葉移至內側小葉。這項轉位作用有助於維持不同膜小葉間不對稱的磷脂分布;來源將此功能描述為可能的作用(Probable),因此不宜視為對所有情境均已確立的結論。

其反應可概括為 ATP 與水反應生成 ADP 和磷酸,同時使磷脂由膜的一側轉移至另一側。換言之,ATP 水解與磷脂跨膜移動相耦合,磷脂轉運的方向則是由外側小葉朝內側小葉。資料未進一步指出 ATP8B4 對特定磷脂種類、膜區域或細胞條件的選擇性,故不延伸推定其底物範圍或作用情境。

磷脂跨膜轉位除了維持膜兩側的脂質分布,也被認為可能與囊泡形成,以及脂質訊號分子的攝取有關。這些過程在來源中以可能相關的方式提出,並未提供更具體的細胞機制或因果證據。就此而言,ATP8B4 所屬複合體的功能可連結膜脂質組成與膜相關運輸活動,但其在不同過程中的確切貢獻,仍須依來源保留為推測性描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 50119233 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ATP8B4 ENST00000284509 GRCh38 chr15:50119133-50120233 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAAACCTGAGGGCCCAGCGTGAGGATGTTCCAGGAGAGTGGAGTTGATGGTGCGCAGGGGATTAGCTTG
CTCTGGTTATAGAGACATGATTAAAATCTATTTGATTTCAGTACTTAACTGGCAAATCTGATGCAACTTC
TGGAAAATTCCTAGATGGCTTTAGGCATATTTAAAAGAAGCCATATTTTTCCTTTTAAAAATAGATATGC
ACCAAAATATTTTATTTTCATCTAATCCCGCTTTAACAACCAGAATCCCCTTAAAAGCAATTCCAAACTA
AAAGATGTAAATCCATTTCCTATGTGCATTTGTTCTTTGGTACCATCAGGGTTAATGTTTGCATCCTCTG
TGCTGAAATTAAGGATGTTGGGAAAGAAGTGTCATTGCTTTGCCTACTAAATGTCACTTGAGTATGCTTA
GCTTTCATCCATAAGAGAGCTGAACTTCCCCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGACAAAA
ACCCACTGCTGATTCTTTCATCTCTGCAAAAGCAGGTGGGAACTGCAAACAGATTTGCTTATCTTCCTCA
GTCAAGGGCTGGTAAAAGTTTGGTAAGTAGGCCTGGTAGCCGGTGTCCCCTTCCATTGTTCATTTTCATC
CTCCTGAATTCTTGATTCCCACAGAGGAAGCCATCCTCAGAAGCCAGCCTCTTGGGAGTTTCCTTTTGTT
TCCCCAAGATTAACCAGTTCTGTCCTGTCAGCAGGAGCAGGCAACTAGGGGAGGAGAGGCTCTTCAGGGC
TTTCAGCATTTTTCCAAGGAGTGCTTTTCTCCCTCAATTCCTCACTGACAGTGAAGCTGCTTTCTTGTAA
GGTCTTCCTCTTCTTCTGATGAGATGCTGATTCTGATTGCCATCTAGCAGCTTCCGGTGGTGGTAAGTGG
TCAAGAGTGTTTTTCCAGGAGTTGATCTCAGGTTTTTGAGAATGCCCCCTAGAGACCCAGTTTGTTTTCT
GTATCATCCCTCAAGCTTTCAGAGTAGCCTTGCTTTTCTCCTTGGCATGGTCACGGAATGGATACCTGTT
TGATCTTCCTGCACTGCTGAGAAATCTTCCTTTTGGGGGAGAGGATTAAGT
ATP8B4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ATP8B4_3 ↗15:49,876,531負股49,876,521–49,876,580
ATP8B4_2 ↗15:50,113,379負股50,113,369–50,113,428
ATP8B4_4 ↗15:50,114,505負股50,114,495–50,114,554
ATP8B4_1 ↗15:50,119,233負股50,119,223–50,119,282

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_83GR5H · promoter · 50114494–50114661 · regulatory

ENSR15_9PW4C · enhancer · 50116531–50116807 · regulatory

ENSR15_5FR9DK · CTCF_binding_site · 50116650–50116671 · regulatory

ENSR15_9PW56 · promoter · 50119223–50119669 · regulatory

· motif · 50114558–50114571 · motif

· motif · 50116581–50116594 · motif

· motif · 50116581–50116594 · motif

· motif · 50116583–50116590 · motif

· motif · 50116652–50116668 · motif

· motif · 50116680–50116692 · motif

· motif · 50116727–50116739 · motif

· motif · 50116730–50116744 · motif

· motif · 50116730–50116745 · motif

· motif · 50116731–50116744 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1192 aa

1 aa1192 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q8TF62 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ATP8B4 蛋白質長 1,192 個胺基酸,屬於 P 型陽離子運輸 ATPase 的 IV 型亞家族。序列註解顯示其含多段跨膜螺旋,並由胞質區域與胞外側迴圈交錯排列;C 端另有兩段預測為無序的區域。這些拓樸特徵與其多次穿膜蛋白性質相符。

拓樸區域Cytoplasmic1–44 aa
跨膜區Helical45–66 aa
拓樸區域Exoplasmic loop67–72 aa
跨膜區Helical73–92 aa
拓樸區域Cytoplasmic93–276 aa
跨膜區Helical277–298 aa
拓樸區域Exoplasmic loop299–327 aa
跨膜區Helical328–349 aa
拓樸區域Cytoplasmic350–871 aa
跨膜區Helical872–892 aa
拓樸區域Exoplasmic loop893–904 aa
跨膜區Helical905–924 aa
拓樸區域Cytoplasmic925–954 aa
跨膜區Helical955–976 aa
拓樸區域Exoplasmic loop977–990 aa
跨膜區Helical991–1013 aa
拓樸區域Cytoplasmic1014–1019 aa
跨膜區Helical1020–1040 aa
拓樸區域Exoplasmic loop1041–1060 aa
跨膜區Helical1061–1085 aa
拓樸區域Cytoplasmic1086–1192 aa
功能區域Disordered1104–1130 aa
功能區域Disordered1143–1163 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8TF62…

AlphaFold · Q8TF62

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Golgi apparatus

ATP8B4 被註記位於細胞膜,並屬多次穿膜蛋白;資料也將高基氏體列為其定位。 來源未說明其在不同細胞狀態下是否會於這些位置間動態移動,或各位置所對應的條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ATPIMATP8B4TMEM30A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ATP8B4 是 P4-ATPase 翻轉酶複合體的催化 α 次單元;該複合體另含輔助 β 次單元。資料指出 ATP8B4 與 β 次單元 CDC50A、CDC50B 有交互作用,但未進一步區分這兩者各自參與的複合體或作用條件。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ATP8B4 是 P4-ATPase 翻轉酶複合體的組成部分;該複合體利用 ATP 水解驅動胺基磷脂由膜外側小葉轉至內側小葉,並維持磷脂的不對稱分布。磷脂轉位也可能參與囊泡形成及脂質訊號分子的攝取,這些作用的描述帶有可能性。推論支持
證據與來源

Component of a P4-ATPase flippase complex which catalyzes the hydrolysis of ATP coupled to the transport of aminophospholipids from the outer to the inner leaflet of various membranes and ensures the maintenance of asymmetric distribution of phospholipids. Phospholipid translocation also seems to be implicated in vesicle formation and in uptake of lipid signaling molecules (Probable)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O + phospholipidSide 1 = ADP + phosphate + phospholipidSide 2.資料庫紀錄
證據與來源

ATP + H2O + phospholipidSide 1 = ADP + phosphate + phospholipidSide 2.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ATP8B4 可能是 P4-ATPase 翻轉酶複合體的組成部分;此複合體由催化 α 次單元與輔助 β 次單元構成。ATP8B4 與 β 次單元 CDC50A 和 CDC50B 有交互作用。含實驗來源
證據與來源

Component of a P4-ATPase flippase complex which consists of a catalytic alpha subunit and an accessory beta subunit (Probable). Interacts with beta subunits CDC50A and CDC50B

PMID 20947505 ↗ · PMID 20961850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ATP8B4 被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白,並定位於高基氏體。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Golgi apparatus

PMID 20947505 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000284509 · 5,688 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGTAGCCTTGCTTTTCTCCTTGGCATGGTCACGGAATG40
41GATACCTGTTTGATCTTCCTGCACTGCTGAGAAATCTTCC80
81TTTTGGGGGAGAGGATTAAGTCTGGGTTGAGGTAGGCCAC120
121CTGTTGAGACCTGGTGAAAGATCAGGTATAATAATGTTCT160
161GCAGTGAAAAGAAATTGCGTGAAGTGGAACGGATAGTGAA200
201AGCCAATGACCGTGAATATAATGAAAAGTTCCAGTATGCG240
241GATAATCGTATCCACACATCGAAATATAATATTCTCACCT280
281TCTTGCCAATTAATTTATTTGAACAGTTCCAAAGAGTGGC320
321AAATGCCTATTTTCTTTGCCTTCTGATTTTACAGCTAATT360
361CCAGAAATTTCCTCCTTGACCTGGTTTACCACCATTGTGC400
401CTTTGGTCCTGGTGATAACTATGACAGCTGTCAAAGATGC440
441CACAGATGACTATTTTCGCCACAAGAGTGATAATCAAGTG480
481AATAATCGGCAGTCTGAAGTGCTCATCAACAGCAAACTGC520
521AGAATGAAAAATGGATGAATGTCAAAGTGGGAGACATCAT560
561TAAATTAGAAAATAACCAATTTGTTGCTGCTGATTTACTT600
601CTCCTATCAAGTAGTGAGCCACATGGTCTCTGTTATGTTG640
641AAACTGCTGAGCTTGATGGGGAAACGAACCTAAAAGTCCG680
681CCATGCACTATCAGTTACTTCAGAACTTGGAGCAGATATC720
721AGCAGACTTGCAGGGTTTGATGGGATTGTTGTCTGTGAGG760
761TGCCTAACAACAAGTTAGATAAATTCATGGGAATCCTTTC800
801TTGGAAAGACAGCAAGCATTCCCTCAACAATGAGAAGATA840
841ATCCTGAGAGGCTGCATCCTGAGAAATACCAGCTGGTGTT880
881TTGGAATGGTTATTTTTGCAGGTCCTGACACTAAACTAAT920
921GCAGAATAGTGGTAAGACAAAGTTTAAAAGGACAAGCATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。