演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ATP8B3ATPIK

ATPase phospholipid transporting 8B3

ATP8B3 編碼 P4-ATPase 家族的磷脂翻轉酶,利用 ATP 水解將胺基磷脂由膜外層移至內層。它可能參與精子膜磷脂分布維持,以及頂體反應和精子與透明帶的結合。

Homo sapiens19p13.3UniProt O60423
OFFICIAL SYMBOL
ATP8B3
CHROMOSOME
19
UNIPROT
O60423
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ATP8B3(ATPase phospholipid transporting 8B3)是蛋白質編碼基因,其產物屬於陽離子運輸型 P-type ATPase 家族的 Type IV subfamily。這類蛋白質具有跨膜結構,與膜脂質運輸相關;ATP8B3 的蛋白質序列註解顯示其含有多段跨膜螺旋,並在膜兩側分布胞質區域與短的非胞質迴圈。這些結構特徵構成其膜內運作的基本架構。

Official symbol
ATP8B3
Gene name
ATPase phospholipid transporting 8B3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13535
UniProt
O60423
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ATPIK

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ATP8B3pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:1,781,761–1,812,295
Gene span
30,535 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000310127 ★1,782,075–1,812,27629
ENST000011350711,781,761–1,812,27929
ENST000005255911,783,028–1,812,20029
ENST000010409941,798,759–1,812,27914
ENST000005260921,798,761–1,812,27914
ENST000005871601,807,168–1,812,2376

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ATP8B3 被註解為 P4-ATPase flippase,能將 ATP 水解與胺基磷脂跨膜轉位相連,使脂質由膜的外層移至內層。此方向性運輸有助於維持不同膜層之間的磷脂不對稱分布。反應描述指出,磷脂轉位伴隨 ATP 轉為 ADP 與 phosphate;其中一項反應明確列出 phosphatidylserine(PS)由膜外側移至內側,並產生 H(+)。

磷脂由一側轉移至另一側,除了維持膜脂質的不對稱性,也被認為可能與囊泡形成及脂質訊號分子的攝取有關。來源以「似乎」描述這些關聯,未進一步提供具體作用機制或條件,因此不宜將其解讀為已確立的直接因果關係。

在精子中,ATP8B3 可能負責維持膜上 PS 的不對稱分布。來源亦指出它參與頂體反應,以及精子與透明帶的結合;這些註解將磷脂運輸功能與精子相關的膜事件連結起來,但沒有提供更細的實驗條件或作用步驟。整體而言,現有描述支持 ATP8B3 具有以 ATP 驅動的磷脂轉位功能,並提示其在精子膜脂質組成及相關反應中的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1812276 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ATP8B3 ENST00000310127 GRCh38 chr19:1812176-1813276 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGCCACTTCTTCAGTAAGGATCCCTGAGCCCCTGCCACCTGCTGGAAAGAACCCTGCGGGCTTCCTCTT
GGCCTTAGGGTGGTCTCAATGGCTATAACCGCCTCTCCCCAGCCTGGTGCTCAGCCCTGCATCTGCGCCT
AGGAGGCGCTCGTTGAACGTGTATGGGATGAATGAACGAACCCAGGACACGGATCAGACATGACTTACAT
AACCGCCGTTACCTGTGGTCCTTCCTCCTGCACTCTGCCACGCTGGCCGCACCAGCCTCAGCCCCGTCAG
GTCTGCAAGGCCCATTCCGACCTGACCCAGGCCCACCTTTCCAAGAACCCTTCCAACCCCGCCCTGCGGT
GCAGGTTCTTTCTGCTCCCTGACCAAGCCCGGCCCGGCCCTGCCCTGACACCCTCTTCCCTTTCAGGCTC
CGCCCCTGCACTGGCACTGCTCCCTAAGGCCCTCCCAAGGCCCTGCCTTCTGTCCTGGACCCACCCTGAG
CGCCCTCCTACCCTGACCCTGCTCTGCGCGGCCCCGCCTTCCTCCTTTGTAACGGCTCCGGATCCCAGCC
CCGCCCCTACCATAACACTGCTCCGCAAGGCCATGCTCAACCCCGCTTCCCGCTCTGGCCAAGCCCCTGA
GTCCTGGCCCCGCCCCTACTCTGACTTTGCTCAGCGAGACCCCGCTCGTCCTCGCCTTCCTTCTAGTCCC
TTCCCCAAAGTCCCGGCCCCTCCCCAGACCCAGGCACTGCTCCCGAGCGTCTTCTATCCCGGCCTGTTCT
GCGAGGCTCTGCGAGGCCCCGCCCTTCGGCCGTGACCGCGTCCCTGAGGCCTGGCCCCCATCCTGCTCGG
CCGTGCTCCGCTCGGCCCCACCCTCGAGGCCCCGCCCCTTCTTCGCCTTGGCCCCACCCACCCCCTCCAG
GCCCCGCCCCCGGCCCCCTTCCGGGGTCCGAACTGGCTCCACCTTCGCCTTGGCCGGGCCCCGAGGCCCC
GCCCCGAGATCCCGCCCCCCGTTTCAGGACCGTTGGCACCGGGCTAACGGTTCCACCACGTCCGCCGCCC
TGGACGCCCGCGGCCTGCCCCCCCCTGCCTCTCCTGCGCCGGTGAGCGGCG
ATP8B3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ATP8B3_1 ↗19:1,812,276負股1,812,266–1,812,325

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BCP7 · promoter · 1812190–1812766 · regulatory

ENSR19_5FHWL · CTCF_binding_site · 1813227–1813248 · regulatory

ENSR19_83FTN · enhancer · 1813767–1813977 · regulatory

· motif · 1812342–1812351 · motif

· motif · 1812398–1812408 · motif

· motif · 1812412–1812422 · motif

· motif · 1812470–1812486 · motif

· motif · 1812630–1812640 · motif

· motif · 1812649–1812659 · motif

· motif · 1812709–1812719 · motif

· motif · 1813006–1813023 · motif

· motif · 1813229–1813245 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1300 aa

1 aa1300 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O60423 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ATP8B3 蛋白質長 1,300 個胺基酸,屬於陽離子運輸型 P-type ATPase 家族的 Type IV subfamily。序列註解標示多段跨膜螺旋,並由胞質區域及較短的非胞質迴圈交錯連接;N 端與 C 端部分區段則被註解為無序區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–149 aa
跨膜區Helical150–171 aa
拓樸區域Exoplasmic loop172–177 aa
跨膜區Helical178–197 aa
拓樸區域Cytoplasmic198–381 aa
跨膜區Helical382–403 aa
拓樸區域Exoplasmic loop404–430 aa
跨膜區Helical431–452 aa
拓樸區域Cytoplasmic453–995 aa
跨膜區Helical996–1016 aa
拓樸區域Exoplasmic loop1017–1028 aa
跨膜區Helical1029–1048 aa
拓樸區域Cytoplasmic1049–1078 aa
跨膜區Helical1079–1100 aa
拓樸區域Exoplasmic loop1101–1112 aa
跨膜區Helical1113–1135 aa
拓樸區域Cytoplasmic1136–1141 aa
跨膜區Helical1142–1162 aa
拓樸區域Exoplasmic loop1163–1182 aa
跨膜區Helical1183–1207 aa
拓樸區域Cytoplasmic1208–1300 aa
功能區域Disordered1–98 aa
功能區域Disordered1272–1300 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O60423…

AlphaFold · O60423

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome membrane;Endoplasmic reticulum membrane

ATP8B3 被註解位於胞質囊泡、分泌囊泡及頂體膜,也位於內質網膜;各位置均描述為多次跨膜蛋白。 來源未說明這些定位是否隨細胞狀態或條件改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ATPIKATP8B3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ATP8B3 是 P4-ATPase 翻轉酶,藉由水解 ATP 驅動胺基磷脂由多種膜的外層移至內層,維持磷脂的不對稱分布。磷脂轉位似乎也與囊泡形成及脂質訊號分子的攝取有關;在精子中,它可能維持膜上 phosphatidylserine(PS)的不對稱分布,並參與頂體反應及精子與透明帶的結合。推論支持
證據與來源

P4-ATPase flippase which catalyzes the hydrolysis of ATP coupled to the transport of aminophospholipids from the outer to the inner leaflet of various membranes and ensures the maintenance of asymmetric distribution of phospholipids. Phospholipid translocation also seems to be implicated in vesicle formation and in uptake of lipid signaling molecules. May be responsible for the maintenance of asymmetric distribution of phosphatidylserine (PS) in spermatozoa membranes. Involved in acrosome reactions and binding of spermatozoa to zona pellucida

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O + phospholipidSide 1 = ADP + phosphate + phospholipidSide 2.推論支持
證據與來源

ATP + H2O + phospholipidSide 1 = ADP + phosphate + phospholipidSide 2.

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(out) + ATP + H2O = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(in) + ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(out) + ATP + H2O = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(in) + ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ATP8B3 被註解為多次跨膜蛋白,定位於胞質囊泡、分泌囊泡、頂體膜及內質網膜。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome membrane / Multi-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 20947505 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000310127 · 5,095 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTTCAGGACCGTTGGCACCGGGCTAACGGTTCCACCACG40
41TCCGCCGCCCTGGACGCCCGCGGCCTGCCCCCCCCTGCCT80
81CTCCTGCGCCGATACACTTCGAGTGGATTCTGGCCATTTG120
121AGCATTCTCTCCAACTCTCCAATCCCCAGTCTGCCCCCAC160
161GGGGGTCTCCCCCACCTCTCCCCCGTCCCACAGCCTAAAC200
201CCCTCTTCGCCCTGAACCTCCCTTTTCCTCATGCGGTGAA240
241TGGGCACTGGCCCCGCTCAGACTCCCAGGAGCACCAGAGC280
281TGGCCCTGAGCCAAGCCCTGCCCCACCAGGACCTGGGGAC320
321ACGGGTGACTCAGACGTGACTCAGGAAGGCTCAGGTCCTG360
361CTGGCATCCGCGGAGGTGAGACGGTGATCAGAGCTGGGAT400
401GGGAGACTCCCCAGGCAGAGGGGCACCTGAGAGGAGGCAC440
441AAGGCCCAGCCTGGCCGGGCTAGGAAGTATGAATGGAGAC480
481CAGAAGGCCCCACCAGCATGGGCAGCCTCGGCCAGAGAGA520
521AGATCTCCAAGATGAGGACAGGAACTCAGCATTCACCTGG560
561AAGGTCCAGGCCAACAACCGTGCCTACAACGGGCAGTTCA600
601AGGAGAAGGTGATCCTGTGCTGGCAAAGGAAGAAATACAA640
641GACCAATGTCATCCGCACGGCCAAGTACAACTTCTACTCG680
681TTCCTGCCGCTGAACCTGTACGAGCAGTTCCACCGCGTGT720
721CCAACCTGTTCTTCCTCATCATCATCATCCTGCAGAGCAT760
761TCCCGACATCTCCACGCTGCCCTGGTTCTCGCTCAGTACC800
801CCTATGGTCTGCCTCCTCTTCATCCGTGCCACCCGGGACC840
841TGGTGGACGACATGGGGAGACACAAGAGTGACAGAGCCAT880
881CAACAACAGACCCTGCCAGATTCTGATGGGGAAGAGCTTC920
921AAGCAGAAGAAATGGCAGGATCTGTGCGTGGGGGATGTGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。