演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ATP8B2ATPID

ATPase phospholipid transporting 8B2

ATP8B2(ATPase phospholipid transporting 8B2)是 P4-ATPase 家族的蛋白質,作為翻轉酶複合體的催化成分,參與磷脂醯膽鹼跨越細胞膜的運輸。

Homo sapiens1q21.3UniProt P98198
OFFICIAL SYMBOL
ATP8B2
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P98198
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ATP8B2(ATPase phospholipid transporting 8B2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於陽離子運輸 ATPase(P-type)家族的 Type IV 子家族。這類蛋白質參與膜磷脂運輸;ATP8B2 是 P4-ATPase flippase complex 的催化成分。其蛋白質含多段跨膜區,並具有位於細胞質側與膜外側的區段,符合多重跨膜蛋白的拓樸特徵。來源所述的主要運輸底物為磷脂醯膽鹼;ATP8B2 的詳細催化作用與運輸方向見功能說明。

Official symbol
ATP8B2
Gene name
ATPase phospholipid transporting 8B2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13534
UniProt
P98198
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ATPIDKIAA1137

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegATP8B2pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:154,325,511–154,351,307
Gene span
25,797 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368489 ★154,325,525–154,351,30428
ENST00000368487154,325,520–154,337,84612
ENST00000933585154,325,520–154,351,30728
ENST00000933586154,325,520–154,351,30728
ENST00000933587154,325,520–154,351,30728
ENST00000972148154,325,520–154,351,30729
ENST00001145619154,325,520–154,351,30728
ENST00000672630154,327,800–154,351,30328
ENST00000696573154,328,800–154,351,30727

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ATP8B2 是 P4-ATPase flippase complex 的催化成分,能將 ATP 水解與磷脂運輸耦合。來源指出,該複合體可促使磷脂醯膽鹼(PC)由細胞膜外層移至內層,因此運輸具有明確方向,而非單純描述磷脂在膜兩側間移動。

此反應以 ATP 和水為反應物,產生 ADP 與磷酸鹽,並伴隨磷脂由一側轉移至另一側。針對磷脂醯膽鹼的反應描述則指出,1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine 由膜外側移至內側,同時生成 ADP、磷酸鹽及 H⁺。這些反應式呈現 ATP 水解與特定磷脂運輸相連的關係。

ATP8B2 所參與的膜脂運輸可能有助於維持膜脂不對稱性;來源對此以「可能」表述,並未將其列為確定結果。因而,現有資料支持 ATP8B2 參與磷脂醯膽鹼由膜外層至內層的運輸,並指出這項作用可能與細胞膜兩側脂質分布的維持有關。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 154325525 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ATP8B2 ENST00000368489 GRCh38 chr1:154324525-154325625 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGACCCCGCCTGGGAACAACAGTCATTCTTCCTCTTTGTTAATGTGCCAGAACCTGGGAGGCTTCTCTGT
TTATCTGTTTGGCATCCCTTCCTCCTAAACTAAGAAGGATCCTGGACAGGGAGAAGTGGAGGAGGATAAG
GTACCAGGACTCAGGCTTCTCATCCCCTCCTCCCGCAAAGCGGTTTTCTGACCCTCAGGGCCTCTCGGAA
TGTAGTTGCTCGAGGTAACCGCTAGAGGGTGCGCACCTGGATGCTGGATGGGGACGGCTGCGGGCATCTG
CAGGGTGGAGGGGGCCACCATCCAGTGTAGGGCACAACCCTGGGGACTGCCCTCCATAGCCTGTCCCGAC
TGCCGACTCCTAGCTCTCATCGCCTCGGCGCCTCCCACCTTCACCCTCTCGGGGATGCCTCCCCAAGAGG
GTAGTTAGGGGTGGGGAAGCCGCCTCCACCCAGGGGGCGTGGTGGGGGCGGAGGGAAGGAGGGCGGCGGG
GCACAGAGACAGAGAGCAAGGCTGTGAAACTGAGGCACCGTTCCTAGACATCTCGGTGCTGTGTCGTTCA
TTCAAGGAGAGTTGAGATACAGTGAAATGAGCCAGGGCGAGGAGGGAGGGTGAAGGAACGGAGGGCGGGC
GGCTCCGAGGAGCGAGAGTCGGGCTGAGGGCAACCTGGCGCCAGGGAAAATTCTGGTTATTCACCACTTC
TACAGCTCTCCTGCCGCTCCCTGCAGAGGATGCTCGTTTTGCAGAGAAGGCAGTGTTCCTCTATTCCCTT
CTTCCGAATTAAAAATACCCCCTCAGAGCGATCTAGCCTCCCGAATTGTTTTTTCTTTTAAGATGCGGAT
GGACGTACGTGTGGGGGCATCCCAGCCCAGCCACGCCGAGGCTCGGAAGGGCTAAGACCCTCCCACTGCC
CCGCACAAAGATGGCTGCTCCCTCCTCCCCGCTCCTTCTCCCCTCCCCAAAACCCCCTCCCGCCCCCCGG
CCCCCGCCGCCGGCTCCGTCACTTCCGCCCCGCCGTGGCCGAAACTGACACAAAGTAGCGGGCCGAGGCC
CCGGGGGAGCGGGGCCGCAGCTGGGGGGGCGGGAGCCCGTGGGGAGCCGAG
ATP8B2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ATP8B2_1 ↗1:154,325,525正股154,325,476–154,325,535
ATP8B2_3 ↗1:154,326,062正股154,326,013–154,326,072
ATP8B2_2 ↗1:154,327,734正股154,327,685–154,327,744

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_9498S3 · promoter · 154320826–154321130 · regulatory

ENSR1_53CB34M · CTCF_binding_site · 154321111–154321132 · regulatory

ENSR1_53CB353 · CTCF_binding_site · 154321200–154321221 · regulatory

ENSR1_53CB3PG · CTCF_binding_site · 154324749–154324770 · regulatory

ENSR1_B35LX6 · promoter · 154325035–154325563 · regulatory

ENSR1_B35LX8 · enhancer · 154325564–154326309 · regulatory

ENSR1_53CB3ZX · CTCF_binding_site · 154326363–154326384 · regulatory

ENSR1_9498TZ · promoter · 154327310–154327810 · regulatory

ENSR1_9498W8 · promoter · 154328310–154328810 · regulatory

ENSR1_53CB4CS · CTCF_binding_site · 154328501–154328522 · regulatory

ENSR1_53CB4F2 · CTCF_binding_site · 154328755–154328776 · regulatory

ENSR1_53CB4GT · CTCF_binding_site · 154329151–154329172 · regulatory

ENSR1_9498WJ · promoter · 154329309–154329809 · regulatory

ENSR1_53CB4HL · CTCF_binding_site · 154329310–154329331 · regulatory

· motif · 154321064–154321070 · motif

· motif · 154321113–154321129 · motif

· motif · 154321202–154321218 · motif

· motif · 154321328–154321334 · motif

· motif · 154324524–154324531 · motif

· motif · 154324751–154324767 · motif

· motif · 154324839–154324852 · motif

· motif · 154324839–154324852 · motif

· motif · 154325428–154325441 · motif

· motif · 154325524–154325533 · motif

· motif · 154325524–154325535 · motif

· motif · 154325571–154325584 · motif

· motif · 154325571–154325584 · motif

· motif · 154325594–154325607 · motif

· motif · 154325720–154325733 · motif

· motif · 154325743–154325758 · motif

· motif · 154326365–154326381 · motif

· motif · 154327816–154327829 · motif

· motif · 154328408–154328414 · motif

· motif · 154328503–154328519 · motif

· motif · 154328535–154328548 · motif

· motif · 154328648–154328661 · motif

· motif · 154328673–154328690 · motif

· motif · 154328696–154328709 · motif

· motif · 154328757–154328773 · motif

· motif · 154328775–154328788 · motif

· motif · 154329153–154329169 · motif

· motif · 154329312–154329328 · motif

· motif · 154329467–154329480 · motif

· motif · 154329467–154329480 · motif

· motif · 154329592–154329605 · motif

· motif · 154329795–154329808 · motif

· motif · 154329795–154329808 · motif

· motif · 154329833–154329846 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1209 aa

1 aa1209 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 P98198 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ATP8B2 蛋白質長 1209 個胺基酸,屬於 Type IV P-type 陽離子運輸 ATPase。序列註解包含多段螺旋跨膜區,並在膜內外兩側分布多個拓樸區段;N 端與 C 端各有一段被註記為無序區。這些註解描述蛋白質的序列與膜拓樸特徵。

拓樸區域Cytoplasmic1–64 aa
跨膜區Helical65–86 aa
拓樸區域Exoplasmic loop87–92 aa
跨膜區Helical93–112 aa
拓樸區域Cytoplasmic113–295 aa
跨膜區Helical296–317 aa
拓樸區域Exoplasmic loop318–346 aa
跨膜區Helical347–368 aa
拓樸區域Cytoplasmic369–889 aa
跨膜區Helical890–910 aa
拓樸區域Exoplasmic loop911–922 aa
跨膜區Helical923–942 aa
拓樸區域Cytoplasmic943–972 aa
跨膜區Helical973–994 aa
拓樸區域Exoplasmic loop995–1008 aa
跨膜區Helical1009–1031 aa
拓樸區域Cytoplasmic1032–1037 aa
跨膜區Helical1038–1058 aa
拓樸區域Exoplasmic loop1059–1078 aa
跨膜區Helical1079–1103 aa
拓樸區域Cytoplasmic1104–1209 aa
功能區域Disordered1–36 aa
功能區域Disordered1181–1209 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P98198…

AlphaFold · P98198

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Endoplasmic reticulum membrane

ATP8B2 被註記為多重跨膜蛋白,定位於細胞膜與內質網膜。 其由內質網有效輸出需要 CDC50A 或 CDC50B;此條件描述的是 ATP8B2 的運輸依賴性,並不表示它只定位於其中一處。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ATPIDATP8B2TMEM30ATMEM30B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ATP8B2 是 P4-ATPase flippase complex 的催化 α 次單元;此複合體另含 CDC50A 或 CDC50B 作為輔助 β 次單元。資料描述的是複合體組成與次單元角色,未進一步列出 ATP8B2 和任一 CDC50 蛋白之間的直接結合細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ATP8B2 是 P4-ATPase flippase complex 的催化成分,該複合體將 ATP 水解與磷脂醯膽鹼(PC)由細胞膜外層運至內層相連;此作用可能有助於維持膜脂不對稱性。含實驗來源
證據與來源

Catalytic component of P4-ATPase flippase complex, which catalyzes the hydrolysis of ATP coupled to the transport of phosphatidylcholine (PC) from the outer to the inner leaflet of the plasma membrane. May contribute to the maintenance of membrane lipid asymmetry

PMID 25315773 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O + phospholipidSide 1 = ADP + phosphate + phospholipidSide 2.含實驗來源
證據與來源

ATP + H2O + phospholipidSide 1 = ADP + phosphate + phospholipidSide 2.

PMID 25315773 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(out) + ATP + H2O = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(in) + ADP + phosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(out) + ATP + H2O = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(in) + ADP + phosphate + H(+)

PMID 25315773 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用P4-ATPase flippase complex 由催化 α 次單元 ATP8B2 與輔助 β 次單元組成;β 次單元可為 CDC50A 或 CDC50B。含實驗來源
證據與來源

Component of a P4-ATPase flippase complex which consists of a catalytic alpha subunit ATP8B2 and an accessory beta subunit CDC50A or CDC50B

PMID 20961850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ATP8B2 是多重跨膜蛋白,定位於細胞膜與內質網膜;其由內質網有效輸出需要 CDC50A 或 CDC50B。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Efficient exit from the endoplasmic reticulum requires the presence of CDC50A or CDC50B

PMID 20947505 ↗ · PMID 20961850 ↗ · PMID 25315773 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368489 · 5,974 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCGCCCCGCCGTGGCCGAAACTGACACAAAGTAGCG40
41GGCCGAGGCCCCGGGGGAGCGGGGCCGCAGCTGGGGGGGC80
81GGGAGCCCGTGGGGAGCCGAGCCGAGCGCCCCCCGCCCCA120
121GCCCCCGGCATGGGCAGTACGGGGCCGCCGGGGCGGGCGC160
161CGAGCGCTGAGCGCTGAGGGTCTCCCATGGGATTGCTGGG200
201ATCTTGCTGGGTGAGATGGCAGTGTGTGCAAAAAAGCGCC240
241CCCCAGAAGAAGAAAGGAGGGCGCGGGCTAATGACCGAGA280
281ATACAATGAGAAATTCCAGTATGCGAGTAACTGCATCAAG320
321ACCTCCAAGTACAATATTCTCACCTTCCTGCCTGTCAACC360
361TCTTTGAGCAGTTCCAGGAAGTTGCCAACACTTACTTCCT400
401GTTCCTCCTCATTCTGCAGTTGATCCCCCAGATCTCTTCC440
441CTGTCCTGGTTCACCACCATTGTGCCTTTGGTTCTTGTCC480
481TCACCATCACAGCTGTTAAAGATGCCACTGATGACTATTT520
521CCGCCACAAGAGCGATAACCAGGTGAATAACCGCCAGTCT560
561CAGGTGCTGATCAATGGAATCCTCCAGCAGGAGCAGTGGA600
601TGAATGTCTGTGTTGGTGATATTATCAAGCTAGAAAATAA640
641CCAGTTTGTGGCGGCGGATCTCCTCCTCCTTTCCAGCAGT680
681GAGCCCCATGGGCTGTGTTACATAGAGACAGCAGAACTTG720
721ATGGCGAGACCAACATGAAAGTACGTCAGGCGATTCCAGT760
761CACCTCAGAATTGGGAGACATCAGTAAGCTTGCCAAGTTT800
801GACGGTGAAGTGATCTGTGAACCTCCCAACAACAAACTGG840
841ACAAATTCAGCGGAACCCTCTACTGGAAGGAAAATAAGTT880
881CCCTCTGAGCAACCAGAACATGCTGCTGCGGGGCTGTGTG920
921CTGCGAAACACCGAGTGGTGCTTCGGGCTGGTCATCTTTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。