基因總覽
ATP5MGL 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ATP synthase membrane subunit g like。其產物屬於 ATPase g subunit family,並被描述為粒線體膜 ATP synthase 複合體 F(0) 部分的次要次單元。現有資料未提供其胺基酸序列、長度或更細部的結構特徵;關於其在複合體中的位置,來源標示為依相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000505920 ★ | 42,639,803–42,640,601 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
粒線體膜 ATP synthase(亦稱 F(1)F(0) ATP synthase 或 Complex V)利用呼吸鏈電子傳遞複合體所建立的膜兩側質子梯度,促使 ADP 生成 ATP。ATP5MGL 的產物被描述為此酵素複合體 F(0) 部分的次要次單元;依相似性資料,它與次單元 a 一同位於膜中。此定位與次單元描述屬於推定資訊,來源未提供直接實驗細節。
F-type ATPase 由兩個結構區域組成:F(1) 含有位於膜外的催化核心,F(0) 則含有膜內質子通道;中央柄與周邊柄連結這兩個區域。催化時,F(1) 催化區的 ATP 合成,透過中央柄次單元的旋轉機制與質子跨膜轉運相耦聯。來源將 ATP5MGL 產物歸入 F(0),但未指出它本身具有催化活性或質子通道功能,因此不宜將整個複合體的作用直接視為該次單元單獨執行的功能。
Promoter 與基因調控
>ATP5MGL ENST00000505920 GRCh38 chr22:42640501-42641601 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCAGGAGAATCGATTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCTGTGAGTTGAGATCTCACCACTGCACTCCAG CCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCATCTCAAAAAAACAAAACAAAACAGAAAATAAAAATTAGCCAAGTGT GGTGGCGTGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATCGCTGGAGCCCAGAAGGCG GAGGTTGGAGTGAGACAAGATCGCGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCCAGATCTGTCTTAAATAAAAGAAA AAAAAAAGAAAATCCATGTATAACTTCTGGTTCCCCCAAAACTTTCCTACTAATATACTATTGACTAGAA GCCTTACCAATAACATATTTGTATATTGTATGTATTATATACTATATTTTTACAGTAAAGTAAGCTAGAG AAAACTGTTATTTTAAAAATCATAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTTGGG AGGCCGAGGCAGGAGGATCACCAGGTCAGGACTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCT CTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGAGTGGTGACGTGCGCCTGTGATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA GACAGAAGAATTGCTTCAACCTGGGAGTTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACCGTGCCACTGCACTCCAGC CTGGGTGACAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAATAAATAAAGAGAAAAAAAAATCATAAGGAAGAGAAAACA TATTTACTATTCATTAAGAGGAAGTGGATCATCATAAAGGTCTTCATCCTTGTTCTCACGTTGAGAAGGC TGAGGAGGAGGCAGGGGGTAGTCTTGCTGTCTCGGGTGACAGAAGAGGAAGAAGATCCTTGTATAAGTGA ACCACTCAGGGTCCTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGG GTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACATTGTCTCTACTAAAAGTA CAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGTGCTCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9LWWP · enhancer · 42635526–42635950 · regulatory
ENSR22_BBGHF · enhancer · 42642824–42643356 · regulatory
ENSR22_9LX2D · promoter · 42644624–42645124 · regulatory
· motif · 42641281–42641292 · motif
· motif · 42642943–42642963 · motif
· motif · 42644102–42644114 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:100 aa
ATP synthase membrane subunit g like 屬於 ATPase g subunit family。來源未提供此蛋白質的序列特徵、結構域、胺基酸長度或其他功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ATP5MGL 產物定位於粒線體膜;此定位證據標示為依相似性推定。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
來源描述 F-type ATPase 包含催化核心 CF(1) 與膜質子通道 CF(0),並指出 CF(0) 似乎由 a、b、c、d、e、f、g、F6 及 8(或 A6L)九個次單元組成。這是複合體組成的描述,未提供 ATP5MGL 與特定次單元直接結合的證據。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 粒線體膜 ATP synthase(F(1)F(0) ATP synthase 或 Complex V)利用呼吸鏈電子傳遞複合體建立的膜兩側質子梯度,使 ADP 生成 ATP。F(1) 含膜外催化核心,F(0) 含膜質子通道,兩者由中央柄與周邊柄連結;催化時,F(1) 的 ATP 合成透過中央柄次單元旋轉而與質子轉運耦聯。ATP5MGL 產物屬於 F(0) 部分,依相似性資料與次單元 a 一同位於膜中。 | 推論支持 | 證據與來源Mitochondrial membrane ATP synthase (F(1)F(0) ATP synthase or Complex V) produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane which is generated by electron transport complexes of the respiratory chain. F-type ATPases consist of two structural domains, F(1) - containing the extramembraneous catalytic core, and F(0) - containing the membrane proton channel, linked together by a central stalk and a peripheral stalk. During catalysis, ATP synthesis in the catalytic domain of F(1) is coupled via a rotary mechanism of the central stalk subunits to proton translocation. Part of the complex F(0) domain. Minor subunit located with subunit a in the membrane (By similarity) |
| 交互作用 | F-type ATPase 包含 CF(1) 催化核心與 CF(0) 膜質子通道。資料指出 CF(0) 似乎包含九個次單元:a、b、c、d、e、f、g、F6,以及 8(或 A6L);此處以「似乎」描述其組成,並未陳述 ATP5MGL 與其中任一次單元直接結合。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源F-type ATPases have 2 components, CF(1) - the catalytic core - and CF(0) - the membrane proton channel. CF(0) seems to have nine subunits: a, b, c, d, e, f, g, F6 and 8 (or A6L) |
| 細胞定位 | 資料將該蛋白質的細胞內定位標示為粒線體膜,並未提供其他定位位置或條件差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
TTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACATTGTCTCT40ACTAAAAGTACAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGTGCTCAC80CTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATC120ACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTCACAGTTAGCCAAGATC160ACACCACTGTACTCCAGCCTGGGTGATAGAGTGAGACTCC200ATCTCAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA240TAAATAAATAAGTGAACCACGCAGGGTCCTTCCGGGGGGT280GACCTTCAGCTGGCCATTCGGGATGATGGACTTTCCATCC320CAGAACCATGGCTCCATTTGTCCGTAACCTTGTGGAGAAG360ACCCCAGCACTGGTGAATGCTGCTGTGACTTACTTGAAGC400CTCGATTGGCCGCATTTTGGTACTACACCACGGTTGAGCT440GGTTCCTCCCACCCCTGCTGAGATCCCTAGAGCTATTCAG480AGCCTGAAAAAAATAGTCAGTAGTGCTCAGACTGGTAGCT520TCAAACAGCTCACAGTTAAGGAAGCTTTGCTGAACGGTTT560GGTGGCCACTGAGGTGTCGACGTGGTTTTATGTCAGAGAG600ATCACAGGCAAGCGTGGCATCATTGGCTAGAATGTTTGAA640GACCAGTCTTAACATCTGATTATATTTGATTTATTATTTG680AGTGTTGTTGGACCAGGTGTGATCAGACTGCTATCTGAAT720AAAATAAGATTTGTCAGAAATTCCAAAAAAAAAAAAAAGT760GAATCAAGCAGTTCCAACCCATGTTCAAGGGTCAACTGT799cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。