基因總覽
ATP5MG 是蛋白質編碼基因,其產物 ATP synthase membrane subunit g 屬於 ATPase g subunit family。此蛋白質是粒線體膜上 ATP synthase 的組成單元,歸於複合體的 F(0) 膜部,而非可溶性的 F(1) 催化頭部。ATP synthase 又稱 F(1)F(0) ATP synthase 或 Complex V;其整體由催化與膜通道等結構區組成,ATP5MG 所屬的膜部與其他亞基共同構成複合體。現有資料未提供此蛋白質的胺基酸長度或更細部的序列結構註解。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300688 ★ | 118,401,606–118,409,847 | 3 |
| ENST00000690793 | 118,401,345–118,433,278 | 3 |
| ENST00000689460 | 118,401,345–118,409,828 | 2 |
| ENST00000533172 | 118,401,345–118,409,199 | 3 |
| ENST00000524422 | 118,401,345–118,433,278 | 2 |
| ENST00000917010 | 118,401,345–118,409,848 | 3 |
| ENST00000917011 | 118,401,345–118,409,845 | 3 |
| ENST00001091479 | 118,401,345–118,409,847 | 3 |
| ENST00001091480 | 118,401,345–118,409,203 | 2 |
| ENST00001091481 | 118,401,345–118,409,203 | 3 |
| ENST00001091482 | 118,401,345–118,409,199 | 3 |
| ENST00001091483 | 118,401,345–118,409,203 | 3 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ATP5MG 的產物是粒線體膜 ATP synthase 的 g 亞基,屬於複合體 F(0) 膜部。ATP synthase 的整體功能是在跨膜質子梯度存在時,將 ADP 轉換為 ATP;該質子梯度由呼吸鏈的電子傳遞複合體建立。ATP5MG 因而是參與此能量轉換機器的膜部組成單元,而不是資料所述的 F(1) 催化核心亞基。
ATP synthase 包含可溶性的 F(1) 頭部與膜內的 F(0) 部分:F(1) 是催化核心,F(0) 則構成膜質子通道。兩者由中央柄與周邊柄連接;中央柄在 F(1) 區域內旋轉,周邊柄則維持固定。ATP5MG 被列為 F(0) 的成員,與此膜部架構相關。
催化時,F(1) 催化區的 ATP 合成,據推測會透過中央柄亞基的旋轉機制與質子轉運耦聯。這使跨膜質子梯度所提供的能量能與 ATP 生成相連。此處的旋轉耦聯描述標註為可能機制,並非以確定語氣提出。
在體內,ATP synthase 只能合成 ATP;雖然其 ATP 水解活性可在體外以人工方式活化,但這不代表體內具有相同的水解作用。這項限制區分了生理條件下的主要方向與實驗條件下可誘發的活性。現有資料將 ATP5MG 定位為複合體 F(0) 的構成亞基,並未單獨指定它在質子轉運或催化中的特定分子作用。
Promoter 與基因調控
>ATP5MG ENST00000300688 GRCh38 chr11:118400606-118401706 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAAACTGTGTGGCCATTTTTCAAGCCCAGTCTCAATGGGGACAATGCCTTACAGGCTTTCTTTAAATTC CAAAATGCCTGGCATAGTGTGGGCGTTCAATACAGGTGATTTTTTCCTCACATCTGCACAGCTCCTTGTG GTTAACTAGGGAATTAGGGGAAATGGATTCCAATCGTGATACAGCACTTTGGGGAGATTGGGATTACAAA AAATCAACTTTAAAAGGGCTATGGGGCCAGGCGCGGTGATTCACGCCTGTAATCCCAGCACCAAGGCGGG TGGATCACTTGAAGCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACCGTCTCTACTAAAAGT ACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCATCTACTAGGGAGACTGAGGCACAACAAT CGCTGGAACCCGGGGGACAGAGGTTGCAGTGAGCCGAAGTCGTGCCACTGCACTTCAGCCTGGGCGACAG AGCGAGACTGTCTCAAATAAAAAGGGCTATGGGTTGAGCCTGGTGACAGCCTGTGTGGTGATTGCTCGGC CCCTAACTTTATATGTTTGGCCTTGGACCCTCTCTACCTCTGTACAACGATCGTGTTGGACTAGAAGAAT CTCAGCGAATCCTTCTCCAGTACTGACTTCAAAGGTTCTCAGAATCGCGGCGAAAGCACCCTACGCAAAA TAGCGGAGGTCGGCGCCAAGAAAAGCACTGCAGGTTCAGGGCGCATGCGCATTTCCGCTCCTTGCCGGTT TTCCGGACCTCTACGAGTGGCTGCCCCACAAAATGCCTGCTTCTCTGCGGAATCCTACTGTTCTTCACAT GCTCTCTAATACCATCTTTTCATATCCACTTTCTCTTCCATGTTGAAAAATTAAATTGACAGGCTGGATT CTGCAAAGATCTTTGGACATTTAAGTATCTTCGACCGGCGCGAAAAGAGGCGGCCTGACCTTGGAAGTGG GACGGGGTCCTGCAGCGGGTCCTTCCGGCGGGTGACATTCAGCCGGCGGTTCGGGGCGACGGACTCTCCA TTCCAGAACCATGGCCCAATTTGTCCGTAACCTTGTGGAGAAGACCCCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ATP5L_1 ↗ | 11:118,401,607 | 正股 | 118,401,558–118,401,617 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_85GZNX · enhancer · 118398898–118399150 · regulatory
ENSR11_93PZT4 · enhancer · 118399280–118399539 · regulatory
ENSR11_532SWTQ · CTCF_binding_site · 118400551–118400572 · regulatory
ENSR11_BTHFR · promoter · 118400856–118401636 · regulatory
ENSR11_BTHFX · enhancer · 118401637–118402638 · regulatory
· motif · 118397633–118397644 · motif
· motif · 118397637–118397651 · motif
· motif · 118400553–118400569 · motif
· motif · 118401345–118401356 · motif
· motif · 118401345–118401356 · motif
· motif · 118401355–118401364 · motif
· motif · 118401605–118401614 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:103 aa
ATP synthase membrane subunit g 屬於 ATPase g subunit family。現有蛋白質註解僅指出其家族歸屬,未提供可描述的結構域、功能區域或序列特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ATP synthase membrane subunit g 位於粒線體,並定位於粒線體內膜。 來源未描述定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- LAMP2P13473-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRYD4Q8WW59 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ATP5MG 是 ATP synthase 複合體的組成亞基,與 ATP5F1A、ATP5F1B、ATP5MC1、MT-ATP6、MT-ATP8、ATP5ME、ATP5MF、ATP5MK、ATP5MJ、ATP5F1C、ATP5F1D、ATP5F1E、ATP5PF、ATP5PB、ATP5PD 與 ATP5PO 等亞基同列於複合體組成中。資料將 ATP5MG 歸入 F(0) 膜部;未提供它與個別亞基直接結合的證據。複合體的 F(1) 頭部由 alpha 與 beta 亞基構成,中央柄和固定的周邊柄則連接 F(1) 與 F(0)。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ATP5MG 產物是粒線體膜 ATP synthase(F(1)F(0) ATP synthase 或 Complex V)的 g 亞基,屬於 F(0) 膜部。此複合體利用呼吸鏈電子傳遞複合體建立的跨膜質子梯度,促使 ADP 生成 ATP。複合體由可溶性 F(1) 催化頭部與膜內 F(0) 質子通道構成,並以可旋轉的中央柄及固定的周邊柄連接;ATP 合成據推測透過中央柄旋轉與質子轉運耦聯。在體內複合體只能合成 ATP;其 ATP 水解活性則可在體外人工活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Subunit g, of the mitochondrial membrane ATP synthase complex (F(1)F(0) ATP synthase or Complex V) that produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane which is generated by electron transport complexes of the respiratory chain. ATP synthase complex consist of a soluble F(1) head domain - the catalytic core - and a membrane F(1) domain - the membrane proton channel. These two domains are linked by a central stalk rotating inside the F(1) region and a stationary peripheral stalk. During catalysis, ATP synthesis in the catalytic domain of F(1) is coupled via a rotary mechanism of the central stalk subunits to proton translocation (Probable). In vivo, can only synthesize ATP although its ATP hydrolase activity can be activated artificially in vitro (By similarity). Part of the complex F(0) domain PMID 37244256 ↗ |
| 交互作用 | ATP5MG 是 ATP synthase 複合體的組成亞基之一;列出的其他成員包括 ATP5F1A、ATP5F1B、ATP5MC1、MT-ATP6、MT-ATP8、ATP5ME、ATP5MF、ATP5MK、ATP5MJ、ATP5F1C、ATP5F1D、ATP5F1E、ATP5PF、ATP5PB、ATP5PD 與 ATP5PO。複合體的可溶性 F(1) 頭部由 alpha(3) 與 beta(3) 構成,膜內 F(0) 部包含 c、a、8、e、f、g、k 與 j 亞基。中央柄由 gamma、delta、epsilon 構成並在 F(1) 區域內旋轉;周邊柄由 F6、b、d 與 OSCP 構成並保持固定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ATP synthase complex composed at least of ATP5F1A/subunit alpha, ATP5F1B/subunit beta, ATP5MC1/subunit c (homooctamer), MT-ATP6/subunit a, MT-ATP8/subunit 8, ATP5ME/subunit e, ATP5MF/subunit f, ATP5MG/subunit g, ATP5MK/subunit k, ATP5MJ/subunit j, ATP5F1C/subunit gamma, ATP5F1D/subunit delta, ATP5F1E/subunit epsilon, ATP5PF/subunit F6, ATP5PB/subunit b, ATP5PD/subunit d, ATP5PO/subunit OSCP. ATP synthase complex consists of a soluble F(1) head domain (subunits alpha(3) and beta(3)) - the catalytic core - and a membrane F(0) domain - the membrane proton channel (subunits c, a, 8, e, f, g, k and j). These two domains are linked by a central stalk (subunits gamma, delta, and epsilon) rotating inside the F1 region and a stationary peripheral stalk (subunits F6, b, d, and OSCP) PMID 37244256 ↗ |
| 細胞定位 | ATP5MG 蛋白質定位於粒線體,並位於粒線體內膜。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CCTTCCGGCGGGTGACATTCAGCCGGCGGTTCGGGGCGAC40GGACTCTCCATTCCAGAACCATGGCCCAATTTGTCCGTAA80CCTTGTGGAGAAGACCCCGGCGCTGGTGAACGCTGCTGTG120ACTTACTCGAAGCCTCGATTGGCCACATTTTGGTACTACG160CCAAGGTTGAGCTGGTTCCTCCCACCCCTGCTGAGATCCC200TAGAGCTATTCAGAGCCTGAAAAAAATAGTCAATAGTGCT240CAGACTGGTAGCTTCAAACAGCTCACAGTTAAGGAAGCTG280TGCTGAATGGTTTGGTGGCCACTGAGGTGTTGATGTGGTT320TTATGTCGGAGAGATTATAGGCAAGCGGGGCATCATTGGC360TATGATGTTTGAAGACCAATCTTTAACATCTGATTATATT400TGATTTATTATTTGAGTGTTGTTGGACCATGTGTGATCAG440ACTGCTATCTGAATAAAATAAGATTTGTCAAAACTCAGTG480TTTTCTCCATCAGATACTCCATGAAAGGTCACAATTTCTC520TTGATATTAAGCTGGGTTGTCTTTAAACAACCCTAAATAC560ACGTCTGTTTAGCCCGCAATTGGAAAGGATATATGTGGCA600ATATTAACCTGGTACATGAATATATGGGGATAACATTTTA640ATTTGAAGGTTTGGAATATATATATTTAAGCTTTATTTCC680AGAACAGTGAGGGTTAGGTCTTGGGAAAACTATAACTTGC720CAAAGTAGAAGAAATAGTAGTACCATATGCCAAAGTGATA760GAGATGAATCATGTCAGTAGTTAGAATAACATTTCAACTG800TTTTCTTTGCTAAAATCACAGAAAGACCCTATTGACAACA840TCTATGTCTGTAAAAATGTTAGAGTACTTGTCATCTTGAA880TATAGCCTCCCCAAGAGAGAACAGGGTGGTATTCTAAGTA920TGTTTCTTTGTAACATCTTTAGCAGTAGGACAGAGCCATA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。