基因總覽
ASIC3（acid sensing ion channel subunit 3）是蛋白質編碼基因，產物屬於 amiloride-sensitive sodium channel 家族的 ASIC3 subfamily。這是一種多次穿越膜的離子通道蛋白，具有大型細胞外區段，兩端則位於細胞質側。ASIC3 可組成對 pH 變化有反應的通道，並作為神經系統中的突觸後興奮性受體。其通道可由 ASIC3 形成同源三聚體，也可與其他亞基構成異源三聚體；不同組成會形成性質不同的功能性通道。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000349064 ★ | 151,048,531–151,052,754 | 11 |
| ENST00000357922 | 151,048,292–151,052,754 | 10 |
| ENST00000962796 | 151,048,292–151,052,754 | 8 |
| ENST00001142058 | 151,048,292–151,052,754 | 11 |
| ENST00000297512 | 151,048,886–151,052,754 | 11 |
| ENST00000485929 | 151,050,920–151,052,754 | 7 |
| ENST00000490540 | 151,051,213–151,052,756 | 6 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ASIC3 形成由 pH 門控的鈉離子通道，在神經系統中可作為突觸後興奮性受體。細胞外環境酸化時，通道開啟並產生雙相電流：一部分快速失活，另一部分則維持較久。這種持續相與快速失活相共同構成酸刺激下的電流反應。ASIC3 對質子的敏感度高於其他 ASIC，且在關閉、開啟與去敏化狀態之間轉換較快；這些比較性質屬於相似性推論。
ASIC3 對鈉離子具有高度選擇性，但也允許其他陽離子通過。所列活性資料另指出鈉離子、鉀離子及鈣離子可通過相關通道；其中鈣離子通透性的證據屬於相似性推論。與 ASIC2 組成異源三聚體時，通道可產生快速失活及持續的雙相電流；此組成在感覺神經元中被推測與酸中毒引起的疼痛有關，而該酸化可發生於缺血、受損或發炎組織。
作為神經元的酸感測器，ASIC3 可能參與機械感受、酸性傷害感受與熱傷害感受。這些生理角色，以及 ASIC2 異源通道在感覺神經元中的疼痛作用，均以相似性推論描述，並非來源所述的確定結論。
Promoter 與基因調控
>ASIC3 ENST00000349064 GRCh38 chr7:151047531-151048631 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCCTGCCCCCATGAAGCTTGTGTCCTGTTGGGAGGACAGACAGGTGGCCCAGCAGTTGCAGCATGGTGT GTGCACACGTTTGGCTGGTGGAACCATGTTTCTACCACTCATGGTCAAAAAAAGCCCACCAAAGTCCTGG GAGTTCACATCTGTGTGATGATACGGCAACATTGTTTGTAATGGAAAGACTGGACACCCCCAGTGCCCAT CAGTGGGGGAGTCATTAAATAAACTATGGTATGTGCACATAATGGGTGGTATGCAGCCCTTTGGAAAAAT GTAGGTTTTCCAGGTCCTGGATATAGCAGCGTAAGATGGGAAATCACAGAATACCCATGTTGTGCCTGAG ATGGCAGGTGGGGTACCCGTGGTACCCGGGAGGGTGGCAGGTGGGGCACCCATGTTCTACCTGGGGTGGC AGGTGAGCCCATAACCATTGTAGAGGCCAACATCCTCAGAGGCCTGAGTGTGGGGAGGTAGGCTTTGACT CCCTAGGGAGAGAGGGACACTTAGGAAACAGACGGGCCCTGGAAGTGGGACATGAAGAGTGCCCTGGCCA TCCAGTGTAGGCTGAGATGCTAGGGGCACAGAAAGAAGAGATCTGCTGATGCCAGCCTTCCAACCATTTC CCAGCTTGGCCAAGAGCCAGCTCTGGTATTCGTGAAGGAACAGATCCTGGGTGAAGCTAGAGGGAAGGCC GCAGAGGCAAAAGGAGAGAGGAGCTAGGCCAGGGGTCAGCGACTGACCCTCGCGGCCAGTGTACAGGGGT TGCAACTGGGAGCCTAGGGGGCCCCAAGGCATCTCCAGGCCCAATCTACCTCTGGGCTTTTCTCAAGCTC TCCCTAGGATTACTGCGGTTTCCTCCTGGCGCCTCTCGTCTTGGACAGCCATGCCCCCCTCCATGCTGCA CTAATGGCTCAGCCTGGGGCCCTAGGGACCTCTCCTACCCCCCAGACTGCTCTGTCGGCCCCCTTTCCCC CCTACTGCTGAAACCCAATCCTCTGCAGCAGCGCCGGCTCAGCACCGCCGGCTCAGCACCGCTCCGCAGC CCCTGCCTGCCACGGTCAGCTACGTCCCACCTGGTCTGCTGCGGAGTCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ASIC3_1 ↗ | 7:151,048,726 | 正股 | 151,048,677–151,048,736 |
| ASIC3_2 ↗ | 7:151,048,828 | 正股 | 151,048,779–151,048,838 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_CJZNF · enhancer · 151046464–151047644 · regulatory
· motif · 151051286–151051295 · motif
· motif · 151051317–151051333 · motif
· motif · 151051317–151051333 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：531 aa
ASIC3 蛋白質長 531 個胺基酸，含兩段螺旋型跨膜區；兩端為細胞質區，中間的大型區段位於細胞外。第二段跨膜區包含 GAS motif，註解為離子選擇性濾器；蛋白質末端另有 PDZ-binding motif。細胞外區有一段被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ASIC3 是多次穿膜蛋白，位於細胞膜及細胞質。 依相似性推論，它偏向分布於神經元胞體與細胞突起的質膜，也見於特殊感覺神經末梢；在耳蝸細胞中則有一部分位於細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 37 個夥伴
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA3O96018 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DLG5Q8TDM6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MAGI3Q5TCQ9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MAST2Q6P0Q8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- NHERF1O14745 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHERF2Q15599 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PARD3Q8TEW0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PARD3BQ8TEW8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PDZD2O15018 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PDZD7Q9H5P4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PDZRN3Q9UPQ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ASIC3 可形成同源三聚體，也能與其他亞基組成性質不同的功能性異源三聚體；與 ASIC2 組成異源三聚體時，會產生雙相電流，且持續電流對 Na(+) 與 K(+) 的區分能力較弱。STOM 與 ASIC3 互作並抑制其酸誘發電流。LIN7B 經 PDZ domain 與 ASIC3 互作，可增加 ASIC3 在質膜的表現；DLG4 經 PDZ domain 互作則會降低其質膜表現。MAGI1 與 GOPC 也經 PDZ domain 互作，可能調節 ASIC3。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ASIC3 可形成 pH 門控的異源三聚體鈉通道，作為神經系統的突觸後興奮性受體。細胞外酸化會引發快速失活與緩慢持續的雙相電流。ASIC3 對質子較敏感，狀態轉換較快（相似性推論）；通道高度選擇鈉離子，也可通透其他陽離子。它可能參與機械感受、酸性及熱傷害感受；與 ASIC2 組成的通道則被推測可能介導缺血、受損或發炎組織酸化所致的疼痛。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms pH-gated heterotrimeric sodium channels that act as postsynaptic excitatory receptors in the nervous system. Upon extracellular acidification, these channels generate a biphasic current with a fast inactivating and a slow sustained phase. ASIC3 is more sensitive to protons and gates between closed, open, and desensitized states faster than other ASICs (By similarity). Displays high selectivity for sodium ions but can also permit the permeation of other cations. As a neuronal acid sensor, probably contributes to mechanoreception, acid nociception, and heat nociception (By similarity). By forming heterotrimeric channels with ASIC2, generates a biphasic current with a fast inactivating and a slow sustained phase, which in sensory neurons is proposed to mediate the pain induced by acidosis that occurs in ischemic, damaged or inflamed tissues (By similarity) PMID 10842183 ↗ · PMID 11587714 ↗ · PMID 9744806 ↗ · PMID 9886053 ↗ |
| 分子活性 | Na(+)(in) = Na(+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | K(+)(in) = K(+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 推論支持 | |
| 交互作用 | ASIC3 可形成同源三聚體，也可與其他亞基形成性質不同的功能性異源三聚體；與 ASIC2 組成通道會產生雙相電流，且持續電流對 Na(+) 與 K(+) 的區分較弱。STOM 抑制 ASIC3 酸誘發電流。LIN7B 與 ASIC3 互作並增加其質膜表現；DLG4 互作則降低質膜表現。MAGI1 與 GOPC 也可能調節 ASIC3；相關作用依來源所述保留相似性推論的不確定性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Can form homotrimeric channels (By similarity). Heterotrimer; forms functional heterotrimers producing channel with different properties. Forms heterotrimers with ASIC2; gives rise to a biphasic current with a sustained current which discriminates poorly between Na(+) and K(+). Interacts with STOM; inhibits ASIC3 acid-evoked current (By similarity). Interacts with LIN7B (via PDZ domain); increases ASIC3 expression at the plasma membrane. Interacts with MAGI1 (via PDZ domain); probably regulates ASIC3. Interacts with GOPC (via PDZ domain); probably regulates ASIC3. Interacts with DLG4 (via PDZ domain); reduces ASIC3 expression at the plasma membrane (By similarity) PMID 10842183 ↗ · PMID 11587714 ↗ · PMID 15317815 ↗ |
| 細胞定位 | ASIC3 是多次穿膜蛋白，位於細胞膜及細胞質。依相似性推論，它偏向分布於神經元胞體與細胞突起的質膜，也定位於特殊感覺神經末梢；在耳蝸細胞中則有一部分位於細胞質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasm; Preferentially expressed at the plasma membrane of the soma and cellular processes of neurons (By similarity). In part cytoplasmic in cochlea cells (By similarity). Localized in specialized sensory nerve endings (By similarity) PMID 10842183 ↗ · PMID 15317815 ↗ · PMID 9744806 ↗ · PMID 9886053 ↗ |
| 功能 | 酸敏感離子通道（ASIC）家族的質子受體存在於感覺神經元，可能參與偵測有害酸化。研究者將人類及囓齒類 ASIC2a 與 ASIC3 共同注入 Xenopus 卵母細胞；兩者共同表現時，酸誘發的雙相反應幅度最高可達各自同源通道電流的 20 倍，支持其具有功能性組合。ASIC2a+3 電流的反轉電位至少為 +20 mV，主要呈鈉離子選擇性；其對 pH 或 amiloride 的敏感性與單獨表現的亞基沒有顯著差異，但 gadolinium 抑制 ASIC3 與 ASIC2a+3 的效力高於對 ASIC2a 的抑制。研究亦在轉染細胞與卵母細胞中證實亞基間的生化互作；大鼠腦部 ASIC2a、ASIC3 轉錄本共定位，而人類三叉神經節、腦及睪丸可檢出兩者共同表現，可能組成對 gadolinium 敏感的新型質子門控通道。 | 文獻摘要 | 證據與來源Proton receptors of the acid-sensing ion channel (ASIC) family are expressed in sensory neurons and thus could play a critical role in the detection of noxious acidosis. To investigate the subunit composition of native ASICs in peripheral and central neurons, we co-injected human as well as rodent ASIC2a and ASIC3 subunits in Xenopus oocytes. The amplitudes of acid-induced biphasic responses mediated by co-expressed ASIC2a and ASIC3 subunits were much larger (as much as 20-fold) than the currents mediated by the respective homomers, clearly indicating functional association. The reversal potential of the ASIC2a+3 current (>/=+20 mV) reflected a cationic current mainly selective for sodium. The sensitivity to pH or amiloride of single versus co-expressed ASIC subunits was not significantly different; however, gadolinium ions inhibited ASIC3 and ASIC2a+3 responses with much higher potency (IC(50) approximately 40 microm) than the ASIC2a response (IC(50) >/=1 mm). Biochemical interaction between ASIC2a and ASIC3 subunits was demonstrated by co-purification from transfected human embryonic kidney (HEK293) cells and Xenopus oocytes. Our in situ hybridization data showed that rat ASIC2a and ASIC3 transcripts are co-localized centrally, whereas reverse transcription-polymerase chain reaction data led us to detect co-expression of human ASIC2a and ASIC3 subunits in trigeminal sensory ganglia, brain, and testis where they might co-assemble into a novel subtype of proton-gated channels sensitive to gadolinium. PMID 10842183 ↗Mammalian ASIC2a and ASIC3 subunits co-assemble into heteromeric proton-gated channels sensitive to Gd3+. · cc by |
核酸與蛋白質序列
CTCTGCAGCAGCGCCGGCTCAGCACCGCCGGCTCAGCACC40GCTCCGCAGCCCCTGCCTGCCACGGTCAGCTACGTCCCAC80CTGGTCTGCTGCGGAGTCCCCAGCCCAGTGCCTAGCCCAG120TGGAGCCACCGCCTGTTCCTCGGGAAGGAACAGTGGGACC160TGACCGGCCAGATCACCTCCTCCAATCCTGCCAGGCTAGT200GCCTCCCTGCCTTCCAACCTTGGCTGTCTCCCACCCTCTC240TTCTCCTCTCCTTGCCTGGCCTCCTGAATCCTATCTTAGC280CTCCTTAGCCCCCTGACTGACTCTCTCTCGCTTCTTCCAA320GCCTCTGTAGCTGGTTCCGCTCCTGGGTTCTGGCCATGAA360GCCCACCTCAGGCCCAGAGGAGGCCCGGCGGCCAGCCTCG400GACATCCGCGTGTTCGCCAGCAACTGCTCGATGCACGGGC440TGGGCCACGTCTTCGGGCCAGGCAGCCTGAGCCTGCGCCG480GGGGATGTGGGCAGCGGCCGTGGTCCTGTCAGTGGCCACC520TTCCTCTACCAGGTGGCTGAGAGGGTGCGCTACTACAGGG560AGTTCCACCACCAGACTGCCCTGGATGAGCGAGAAAGCCA600CCGGCTCATCTTCCCGGCTGTCACCCTGTGCAACATCAAC640CCACTGCGCCGCTCGCGCCTAACGCCCAACGACCTGCACT680GGGCTGGGTCTGCGCTGCTGGGCCTGGATCCCGCAGAGCA720CGCCGCCTTCCTGCGCGCCCTGGGCCGGCCCCCTGCACCG760CCCGGCTTCATGCCCAGTCCCACCTTTGACATGGCGCAAC800TCTATGCCCGTGCTGGGCACTCCCTGGATGACATGCTGCT840GGACTGTCGCTTCCGTGGCCAACCTTGTGGGCCTGAGAAC880TTCACCACGATCTTCACCCGGATGGGAAAGTGCTACACAT920TTAACTCTGGCGCTGATGGGGCAGAGCTGCTCACCACTAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。