基因總覽
ARID3B（AT-rich interaction domain 3B）是蛋白質編碼基因，其產物屬於轉錄因子。現有資料指出，ARID3B 可能參與神經母細胞瘤的生長與惡性轉化，並可促進 ARID3A 靶向細胞核。來源未提供更完整的家族關係或其他基本生化性質，因此不進一步推定其特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000346246 ★ | 74,541,220–74,598,131 | 9 |
| ENST00000918002 | 74,541,188–74,598,131 | 8 |
| ENST00000622429 | 74,541,188–74,598,131 | 9 |
| ENST00000918003 | 74,541,188–74,598,131 | 9 |
| ENST00000918004 | 74,541,188–74,598,131 | 9 |
| ENST00001077446 | 74,541,188–74,598,131 | 9 |
| ENST00001136288 | 74,541,188–74,598,131 | 9 |
| ENST00000918005 | 74,541,622–74,598,131 | 8 |
| ENST00000918006 | 74,541,671–74,598,131 | 9 |
| ENST00000918007 | 74,541,671–74,598,131 | 9 |
| ENST00000918008 | 74,541,671–74,598,131 | 8 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ARID3B 的資料註記將其列為轉錄因子，並指出它可能參與神經母細胞瘤生長及惡性轉化。這些描述提示 ARID3B 與腫瘤相關生物學過程有關，但「可能參與」並不代表已確立其作用方向、必要性或充分性；現有資訊也未說明它如何影響腫瘤細胞生長或轉化。
另一項具體功能描述是，ARID3B 有助於 ARID3A 靶向細胞核。此處支持的是 ARID3B 對 ARID3A 核內定位的促進作用，並未提供其分子機制、作用條件或是否改變 ARID3A 的其他功能等資訊。因此，不能據此推定 ARID3B 本身如何調控轉錄，或將 ARID3A 的定位結果延伸為特定基因表現效應。
整體而言，來源支持的功能重點限於 ARID3B 作為轉錄因子的身分、其可能與神經母細胞瘤生長及惡性轉化相關，以及其促進 ARID3A 靶向細胞核的作用；更細節的調控途徑與生物學後果尚未由所提供資料說明。
Promoter 與基因調控
>ARID3B ENST00000346246 GRCh38 chr15:74540220-74541320 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCCAAGAGATTCGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGAAATTACAGGCGTGAGCTACTGCATCAGGC CTATAATTCAAAAGTAGTCAAGCTGAGAGAATAGCAGGCTGTGGTTGAAAAGAGGGTTGTTCAAATTACT GAGTCGTGACGCGATAGCGTTTGGAGGGACAAGGTCCAGGTTTTAACTGGGATTGGGAGGCTGATATAAG GGTCGCTAAAGACGAGGCCCGATGTTGAATGGGTTGGCCACATAGGCTCTGAAATTATCAAAGATGGTCA GACGGGAGACAGACAAGGAGCTGGATACACAGATCGGCAGATTATCTCCAAACGGGGTGAAGTAGGTGAC AGAGTCTAAGGGGAAGGGCTGAAGAAGCAAGTGTTTTTACAAGAGGTGACAGCACCTGGCACATAATCCC GACCTCTGCAAACTGAGACCTGAGAATACTAATTCATGTGAGAAAGTTTCAAGGGACGCAACATTCTCGG GACAGCCAGGTCTCTGTCCCAGGAAGGAGCGGAGAAGTTTAGAGACAAGCTGATCTAAACACGAGAACCT CTGAGGAAGACCGGCTTGAAGGCAGGAGATTGAGGAGGGGACCGAAGCGACGGCAAACCCTACACTCCTC TGCTCTTTAGTTACTTTCCTCCCAGCCAACCGCCCAAGCCACACCAACCTCCGCAATAGAAAACGCTCGG AGAACACGATCTCCCGCCCAGCTCTTTTCAACTCCCCGCGGAAGTGCTCACACCGGAACCCCTCTGTGTC CGCACTTTGCCATTGGCCGAGGCTTCCGCCCGCTTCCATTCGCTTCCTCCCACAACTCAGTCGGGCTGCG CGGTCCGTAGGAGTCACTTCCGCCTCGTCCCACCCCGCCCCCCGGTCCCTTTCTAGCAGCTTCCGGCTTC GGTCCCGCCCCGCCCCCTGTGGCCCCGCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCTGGCTGGCGGTCCAGCCCCGCG GCGCCGCTTCCGGTGCGGGCCCCGCCCCGGCTGTGGCCCCCGGCTGCGGAGGAGTCCGAGACGCAGCTGC CGCGCCGGGGCCTGAGCTGCCGCCTCCTCCGCCGCCCGAAAACCCGGAGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ARID3B_1 ↗ | 15:74,541,257 | 正股 | 74,541,208–74,541,267 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_BJRF7 · enhancer · 74540047–74541040 · regulatory
ENSR15_8476N8 · promoter · 74541041–74541230 · regulatory
ENSR15_C9DP8 · enhancer · 74541231–74542941 · regulatory
ENSR15_5MJDJH · CTCF_binding_site · 74541912–74541933 · regulatory
ENSR15_8476QM · enhancer · 74545218–74545415 · regulatory
ENSR15_C9DPJ · enhancer · 74545613–74546860 · regulatory
· motif · 74537121–74537132 · motif
· motif · 74537213–74537224 · motif
· motif · 74540827–74540842 · motif
· motif · 74540876–74540893 · motif
· motif · 74540885–74540902 · motif
· motif · 74540929–74540940 · motif
· motif · 74540954–74540965 · motif
· motif · 74540954–74540965 · motif
· motif · 74540956–74540965 · motif
· motif · 74541074–74541083 · motif
· motif · 74541074–74541085 · motif
· motif · 74541074–74541085 · motif
· motif · 74541117–74541126 · motif
· motif · 74541117–74541128 · motif
· motif · 74541117–74541128 · motif
· motif · 74541158–74541171 · motif
· motif · 74541164–74541177 · motif
· motif · 74541204–74541213 · motif
· motif · 74541242–74541255 · motif
· motif · 74541413–74541422 · motif
· motif · 74541914–74541930 · motif
· motif · 74542355–74542367 · motif
· motif · 74542868–74542880 · motif
· motif · 74543671–74543683 · motif
· motif · 74543836–74543844 · motif
· motif · 74545978–74545994 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：561 aa
ARID3B 蛋白質長 561 個胺基酸。其 ARID 結構域位於第 215–307 個胺基酸，REKLES 結構域位於第 419–517 個胺基酸。另有多段區域被註記為無序區：第 1–36、53–122、136–179、370–397 及 523–561 個胺基酸。第 203–365 個胺基酸區域與 RB1 互作，第 490–513 個胺基酸區域與 ARID3A 互作。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ARID3B 的定位註記為細胞核。 現有資料未描述其在不同條件下的定位變化，也未提供異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- HCN1O60741 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TINF2Q9BSI4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ARID3B 與 ARID3A 形成異源二聚體，並與未磷酸化的 RB1 互作。資料未進一步說明這些互作是否構成更大型複合體，或其對各自功能的影響。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ARID3B 是一種轉錄因子，可能參與神經母細胞瘤的生長與惡性轉化；此外，它有助於 ARID3A 靶向細胞核。來源未說明這些作用的具體分子機制或成立條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor which may be involved in neuroblastoma growth and malignant transformation. Favors nuclear targeting of ARID3A PMID 16951138 ↗ · PMID 17400556 ↗ |
| 交互作用 | ARID3B 與 ARID3A 形成異源二聚體，並與未磷酸化的 RB1 互作。來源未提供這些互作的條件或其功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ARID3B 的細胞定位記錄為細胞核；該註記未提供其他定位部位或定位變化條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCGCCCCGGCTGTGGCCCCCGGCTGCGGAGGAGTCCGAG40ACGCAGCTGCCGCGCCGGGGCCTGAGCTGCCGCCTCCTCC80GCCGCCCGAAAACCCGGAGTGCCCCGCACAGGTTTAGACC120CAGTGTGCCTGGTGGGCTGTGCCCAGGTTCAGAGTCATGC160CACTCTGTGGGTGAAGCTTGAGGCAAAAATGGAGCCACTT200CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGAAGCAGC240CACACCTGGCTCCTCTGCAGATGGATGCCAGAGAGAAGCA280GGGCCAGCAGATGAGAGAAGCCCAGTTCTTGTATGCCCAA320AAGCTGGTCACACAGCCGACTCTCCTTTCCGCCACAGCTG360GGAGACCTTCTGGCAGCACTCCCTTAGGTCCCTTAGCCAG400AGTTCCACCCACCGCAGCAGTGGCCCAAGTGTTTGAACGG440GGCAACATGAACTCAGAGCCTGAGGAAGAGGACGGAGGTT480TGGAAGATGAGGATGGGGATGATGAAGTTGCAGAGGTGGC520TGAGAAAGAAACCCAGGCTGCTTCAAAATATTTTCATGTG560CAGAAAGTAGCTCGCCAAGATCCCAGAGTGGCACCCATGT600CCAATCTACTTCCAGCACCAGGGCTCCCACCACATGGACA640ACAAGCTAAAGAAGACCATACCAAAGATGCTTCCAAGGCC680TCACCTTCTGTCTCCACAGCAGGACAGCCGAACTGGAATC720TGGATGAGCAGCTCAAGCAGAATGGTGGTTTGGCCTGGAG760TGATGATGCAGATGGAGGCCGGGGAAGAGAGATCTCTCGA800GATTTTGCCAAGCTGTATGAACTGGACGGTGATCCTGAAA840GGAAAGAGTTCCTGGATGACCTCTTCGTCTTTATGCAGAA880GAGGGGGACCCCCATCAACCGAATCCCCATCATGGCCAAA920CAGATCCTGGACCTGTACATGCTGTATAAGCTGGTGACCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。