基因總覽
ARHGEF12 的正式名稱為 Rho guanine nucleotide exchange factor 12，是位於人類第 11 號染色體 11q23.3 的蛋白質編碼基因。其蛋白質產物屬於鳥嘌呤核苷酸交換因子（GEF）相關蛋白，來源資料指出它可作用於 RhoA GTPase。蛋白質序列具有 PDZ、RGSL、DH 與 PH 結構域，並包含數段被註記為無序的區域，顯示其結構由多個具註解的區域組成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397843 ★ | 120,336,413–120,489,937 | 41 |
| ENST00000356641 | 120,336,238–120,489,937 | 40 |
| ENST00000884473 | 120,336,238–120,489,937 | 39 |
| ENST00000884474 | 120,336,238–120,489,937 | 39 |
| ENST00000884475 | 120,336,238–120,489,937 | 39 |
| ENST00000884476 | 120,336,238–120,489,937 | 40 |
| ENST00000884477 | 120,336,238–120,489,937 | 41 |
| ENST00000884478 | 120,336,238–120,489,937 | 39 |
| ENST00000884479 | 120,336,238–120,489,937 | 40 |
| ENST00000980303 | 120,336,238–120,489,937 | 41 |
| ENST00001109489 | 120,336,238–120,437,497 | 11 |
| ENST00001109490 | 120,336,238–120,411,830 | 4 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ARHGEF12 的蛋白質產物可作為 RhoA GTPase 的鳥嘌呤核苷酸交換因子（GEF）。此類作用涉及調節 RhoA 的核苷酸狀態；來源將 ARHGEF12 的 GEF 活性指向 RhoA，但未進一步說明具體反應步驟或其在不同細胞情境中的作用差異。
ARHGEF12 也可能具有 GTPase 活化蛋白（GAP）作用，作用對象為 GNA12 與 GNA13。來源以「可能」描述此功能，因此不宜視為已確定的活性。此外，ARHGEF12 可能參與 GNA12、GNA13 對 RhoA GTPase 的調節；這項描述指出三者之間可能存在調控關係，但未提供更細緻的機制或方向性資訊。
在機械訊號轉導的相關描述中，ARHGEF12 被報告可促進內皮細胞及肌動蛋白壓力纖維重新定向。這項功能註記標示為相似性推論（By similarity），因此應保留其推論性質；資料未詳述刺激條件、實驗系統或重新定向的具體方式。
Promoter 與基因調控
>ARHGEF12 ENST00000397843 GRCh38 chr11:120335413-120336513 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAACTGAAGAACTGTATTACATGTGGTACCTAAATTGCCAAAATACTGAATTATTCAATCATAAAACTA GATGGGTATCTAAAGCTCTCTACCCAGTAGGGGAAAAAACCGAAAAACCGTTTGGGAATCCTTCAGAGAG AACCGTAATGCTATTTACTGGATAAATATACTTCATTTTCTTCTCCCAGTTCTTTCCACAACACGCTTGT TAAGTCGCCATGGAAAGCACCATGCTTTATCAATTTGGCAAATAACACATTTCATTTTGCCAAGGCAGAA ACAGCCTAAAAGTAATATTTATACCGAGAAACCCTGGCTGCAGTCCCCAGCTGCTCTCCCGCAGCCCTGC GCCTCCGGCTCATGCAGCGCTCTCCCCCCGGAGCCGGCAGGTGCCCAGGTGAGCGGGGCCTGCGGAGGCA GCGAGGGGCGCCGGCCGGGAACCGGCAGAACGCGTGCAGCCAGAAGACAGGAGAGATAATACATTCCCTT AAGTAATAAAAGTTTCCAGGACAAGGGGGGCTGGTAATTTTCAAAGAGCCTCCCGGCACGATGTCCTCGG GATCTGGGGGGCGCTCTCGGGCGGTCTCTGGTGAAAGTCGACTTAGTACAAACTGGACTCGAAGGGGCAT GTCTCGGCACTCAGGGGCCCAGGCGCCGCGGGAGGTGGGTGGGCCTCCCGGGGCTGCACGGGTCCCACCT CCCTCTGCCCCGTAGGACTACTTTGCCGCTCTCCCAAACCGGGCTCCGGCGGAGGCGTCCGTTCAAGGGC GAGAGCGCGGCCCTGAGCGGCGGAGGGATCCCGGGTGAGGCGGCTTCCCGAAGTCAGAGGGGAGGGGGCC ATAAAGTCGGCGGGGGACGGGAAGCGCGAGCTCGCGCCGGACGCGGCCAGGGCCGGGAAACCAGAACCGG AACCGGAACCCGCGCGCGCGCCCGCGGTTGCGCGGCCCCCACGGCCGCCGGCCTCCTCCGCTGTCTGCGC GCGCGCCCGCGAGGGCCTCCAGAACCCGGCGAGCCGGCCCTGCGCCGGGAGACGCCGCCGCCTCCGCCTC CCGGACCAGGGCTTCCAGGCCGGGCCGGACGGGCATCTCCCGCCCCTCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ARHGEF12_4 ↗ | 11:120,335,816 | 正股 | 120,335,767–120,335,826 |
| ARHGEF12_5 ↗ | 11:120,336,550 | 正股 | 120,336,501–120,336,560 |
| ARHGEF12_3 ↗ | 11:120,336,954 | 正股 | 120,336,905–120,336,964 |
| ARHGEF12_1 ↗ | 11:120,385,331 | 正股 | 120,385,282–120,385,341 |
| ARHGEF12_2 ↗ | 11:120,391,453 | 正股 | 120,391,404–120,391,463 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BTTR4 · enhancer · 120331236–120332095 · regulatory
ENSR11_BTTRB · enhancer · 120333024–120333545 · regulatory
ENSR11_533B7KF · CTCF_binding_site · 120334975–120334996 · regulatory
ENSR11_BTTRR · promoter · 120335923–120336924 · regulatory
ENSR11_CFXDZ · enhancer · 120336925–120338653 · regulatory
ENSR11_533B7WM · CTCF_binding_site · 120336967–120336988 · regulatory
ENSR11_CFXF5 · enhancer · 120339320–120340366 · regulatory
ENSR11_93QQMS · enhancer · 120340573–120341046 · regulatory
· motif · 120332591–120332606 · motif
· motif · 120333022–120333035 · motif
· motif · 120333479–120333493 · motif
· motif · 120333479–120333493 · motif
· motif · 120333482–120333490 · motif
· motif · 120333486–120333497 · motif
· motif · 120334912–120334921 · motif
· motif · 120334912–120334923 · motif
· motif · 120334977–120334993 · motif
· motif · 120335047–120335058 · motif
· motif · 120335928–120335938 · motif
· motif · 120336035–120336045 · motif
· motif · 120336073–120336083 · motif
· motif · 120336077–120336087 · motif
· motif · 120336158–120336171 · motif
· motif · 120336240–120336250 · motif
· motif · 120336307–120336327 · motif
· motif · 120336313–120336327 · motif
· motif · 120336313–120336333 · motif
· motif · 120336314–120336334 · motif
· motif · 120336319–120336333 · motif
· motif · 120336322–120336337 · motif
· motif · 120336443–120336456 · motif
· motif · 120336449–120336462 · motif
· motif · 120336451–120336465 · motif
· motif · 120336547–120336558 · motif
· motif · 120336969–120336985 · motif
· motif · 120337521–120337529 · motif
· motif · 120339745–120339751 · motif
· motif · 120341276–120341291 · motif
· motif · 120341281–120341293 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1544 aa
ARHGEF12 蛋白質長 1,544 個胺基酸，具有 PDZ（72–151）、RGSL（367–558）、DH（787–977）及 PH（1019–1132）結構域。序列另有四段註記為無序區：1–62、247–346、570–706 與 1138–1179。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ARHGEF12 位於細胞質與膜；受到刺激後，蛋白質會轉位至膜。 來源未指出促成此定位變化的特定刺激或條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- GIPC1O14908 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- IGF1RP08069 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- RHOAP61586 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- Lpar1P61793 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHG4BQ96PX9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTENP60484 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RPS6KA1Q15418 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- E6P03126 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- E6P06463 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- E6P27228 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TaxP03409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ARHGEF12 與 GNA12、GNA13 的互作可能經由 RGSL 結構域介導，並與 RHOA、PLXNB1、PLXNB2、GCSAM 及 IGF1R beta subunit 互作；與 IGF1R beta subunit 的互作涉及 PDZ 結構域。另有報告指出，ARHGEF12 與 PLEKHG4B 互作可解除 PLEKHG4B 的自我抑制，並導致 CDC42 活化。
疾病與遺傳關聯
涉及 ARHGEF12 的染色體異常可能是急性白血病的成因之一。所列異常為與 KMT2A/MLL1 相關的 t(11;11)(q23;23) 易位；來源描述的是可能的疾病關聯，並未將其表述為確定因果。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ARHGEF12 可作為 RhoA GTPase 的鳥嘌呤核苷酸交換因子；也可能對 GNA12 與 GNA13 具有 GTPase 活化蛋白作用，並可能參與這兩者對 RhoA 的調節。相似性推論另指出，它可促進機械訊號轉導反應中的內皮細胞及肌動蛋白壓力纖維重新定向。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as guanine nucleotide exchange factor (GEF) for RhoA GTPase and may act as GTPase-activating protein (GAP) for GNA12 and GNA13. May play a role in the regulation of RhoA GTPase by guanine nucleotide-binding alpha-12 (GNA12) and alpha-13 (GNA13). Promotes endothelial cell and actin stress fiber reorientation in response to mechanotransduction (By similarity) PMID 11094164 ↗ |
| 交互作用 | ARHGEF12 可能透過 RGSL 結構域與 GNA12、GNA13 互作，也與 RHOA、PLXNB1、PLXNB2、GCSAM 及 IGF1R beta subunit 互作；後者涉及 PDZ 結構域。ARHGEF12 與 PLEKHG4B 的互作可解除 PLEKHG4B 自我抑制，並導致 CDC42 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (probably via RGSL domain) with GNA12 and GNA13. Interacts with RHOA. Interacts with PLXNB1. Interacts with PLXNB2. Interacts (via PDZ domain) with IGF1R beta subunit. Interacts with GCSAM. Interacts with PLEKHG4B; the interaction releases PLEKHG4B autoinhibition and results in activation of CDC42 PMID 11094164 ↗ · PMID 11724822 ↗ · PMID 12183458 ↗ · PMID 12372594 ↗ · PMID 15331592 ↗ · PMID 18411422 ↗ · PMID 20844236 ↗ · PMID 32203420 ↗ |
| 細胞定位 | ARHGEF12 位於細胞質與膜，並會在受到刺激後轉位至膜；來源未列出促成轉位的具體刺激條件。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 涉及 ARHGEF12 的染色體異常可能是急性白血病的成因之一。所述異常為與 KMT2A/MLL1 相關的 t(11;11)(q23;23) 易位，來源以可能性描述此疾病關聯。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving ARHGEF12 may be a cause of acute leukemia. Translocation t(11;11)(q23;23) with KMT2A/MLL1 PMID 10681437 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAACCCGGCGAGCCGGCCCTGCGCCGGGAGACGCCGCCG40CCTCCGCCTCCCGGACCAGGGCTTCCAGGCCGGGCCGGAC80GGGCATCTCCCGCCCCTCGCGGGGAGCGTCGGGGAGGAGC120CGCCGCCTCTGGCGATTGCGGAAGAGTCCGGGCCTCAAAG160GGATGGGGAGCAGTCCGCGGCGCTGAGAGACCCGGGTCCC200TGTCACCTCGGGCCGCGGGACCTCTCCGCCGGCGCCAGCG240GCTCGTCCCAGCACCGGGAGCCTGGTGAGGGCGGCGAGCA280CAGAAGGAGCCCCGGGCCCGGGACATGGAATCGCGCGAGC320CCGGCGCGGGACGGCCGGAGACGCGGCCAACGCTGCGGCC360ACGAGCAGCCGGCAGCCCCAGATAGAGAGCCGGGAGGGAG400GGCCCCGGCCCTTGCCGCGGCGGGGAGTTCGAGGCCCCGA440GACTCCGGAGGAGGAGCCGACACCCGTCCGTGAGCTGATC480CCGCCCCAGCCCCGGCGGGAGTCCCGGGTCCCCTTCCCAC520TGCGCGCGGATTTCCCTCTCTGAGGAAGTTTATCCTTGTG560CCTTCTGGAGGATTTCTCTCTAGCTCGACTCACTCTGGAC600TGACTCGCTCCCTGGCTTTCTCAGTTCGTTTTGGGAGATA640ACTTGTTTTGCTCCAAGCCGCATCCGTTGACCCCTTACAG680TCGGATGGTCTAGATGACTGAATGGAGTTTTGAGTTGGAC720TTTTGTGTCCCTGACGGAGTTGGGCCTGATCCCAGAGCAC760TGGGGGTGGGGAGGAGGTGTTACTGTAAAATGCAAGTTGG800ATAAAAGGAGGACCTCTCGCCAAGGGCCCCAATGAGTGGC840ACACAGTCTACTATCACCGACAGGTTTCCCCTCAAAAAAC880CTATAAGGCATGGAAGTATTTTGAACCGAGAGTCACCAAC920AGATAAGAAGCAGAAAGTTGAGCGCATTGCATCACATGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。