演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ARHGEF10KIAA0294

Rho guanine nucleotide exchange factor 10

ARHGEF10(Rho guanine nucleotide exchange factor 10)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與周邊神經的發育性髓鞘形成。

Homo sapiens8p23.3UniProt O15013
OFFICIAL SYMBOL
ARHGEF10
CHROMOSOME
8
UNIPROT
O15013
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ARHGEF10 是位於人類第 8 號染色體 8p23.3 的蛋白質編碼基因,正式名稱為 Rho guanine nucleotide exchange factor 10。其蛋白質長 1,369 個胺基酸,含有 DH 結構域,並有數段被註記為無序區。現有資料指出,這個基因產物可能參與周邊神經的發育性髓鞘形成;相關作用的詳細機制尚未由所列資料說明。

Official symbol
ARHGEF10
Gene name
Rho guanine nucleotide exchange factor 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14103
UniProt
O15013
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA0294Gef10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p23.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegARHGEF10pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:1,823,332–1,958,642
Gene span
135,311 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000349830 ★1,823,926–1,958,64129
ENST000008628631,823,332–1,958,64229
ENST000008628641,823,344–1,958,64228
ENST000008628651,823,372–1,958,64229
ENST000005182881,823,919–1,958,64230
ENST000011158941,823,919–1,872,2567
ENST000009267311,823,924–1,958,64230
ENST000009267301,823,926–1,958,64229
ENST000011381591,823,926–1,958,64229
ENST000009267321,823,945–1,958,64228
ENST000008628661,823,947–1,958,64228
ENST000011158921,823,958–1,903,92716

顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ARHGEF10 的蛋白質產物可能參與周邊神經的發育性髓鞘形成。這項功能描述指向神經發育期間髓鞘形成的可能參與,但資料未進一步交代其作用方式、涉及的細胞或具體調控步驟,因此不宜將其解讀為已確立的分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1823926 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ARHGEF10 ENST00000349830 GRCh38 chr8:1822926-1824026 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAAAATTACTTCTATGATTCGGAGATTTGGGTAGGAGAAGGCATAGAAATAAATCTAGCATCTGCGAAC
ACACTTGTTAAATGTGCTGACCAGGTAAAAGATAACATCCTTTAGTTATTTTGGTTAAAAATGTCTTTGT
TTCTCGTTTTTTTTTTTCTTTAATAGTAATTATAACGATAATCTGTTTCCTTTTTAAAAGTATAAGACAA
ATAAATGCTCAAAGTAAACAATTCCAATAACTCAGAAGGGGCCATTCCCTGGAAAGGTCCCGGGAAAAAC
GAGCGCTTCCTGGCAAGAAGCAAGCTTCAAAAACTGCCTCGGAAACGTGGCTGAAGTCATCGCATTTCCA
AACGCCCAAGCCTTGGCTGGTCCAGGGCAGCTGGCGCGGAAGACCCGGAACGCCCTGTGGGCAGGGCCAG
CTGCGGACGGAGGGACGGGGGCTCAAGGGCGGGTCGGGTGGGGTCCCGACGCCCCCTCCTCGGCTGGGCG
CACCCCGGGTGTCCGCAGGGAGGGGCGATGTTCTGGGGGGGGGAGCGTCTGCCCGACGCCCCCTCCCTCA
GGTGAGCTCAGCCCGTGGGGGTCCGCAGAAAGGGCGGTGCTCTGGGAGAGGGTTAGGGTCTGCCCGGCGC
ACCCTCCCCAAGGGGCGCAGCTCTGAGCCGGGAGCAGGCTCTGCGGGGAGGATCCAGATGTTGGGGGCGG
GGAGGGCACTCGGTCTGCCCAGCGACCCCTCCCGAAGTGAGCGCGGCCCGGGGTCCGCGGGGCAGGAGAT
GATCCGGGGGCGGGAGCCTCTGCCGCGCGCCCCCTCCCACGCGTGCGCAGCCTGGGCCGGGCGTTGGGCA
GCGGGAGGGGGCGCGGGCGGCCACGTGGCCTCGAAGGAATGCGCGGGCGCGAGGGCAGGGCGCTGCCGAG
AAACCGGCAGGCTCTGCGGCCAATGGGCGCCCGGAACGGTCTGGGCCCGCCAATGACAGCATGGTGGGTG
GAGCAGGCCGTCCGGGCGGGAGGGGCTGGGCGCATCCCTGTAGCCGGCGGGCGCGCGATCCGGGACGGAC
GGGGTCGCGGGGGACGCGGGGGACGCGGGGGACGGCGGGGAACGGCGGGGG
ARHGEF10 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 10 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ARHGEF10_1 ↗8:1,823,947正股1,823,898–1,823,957
ARHGEF10_6 ↗8:1,824,076正股1,824,027–1,824,086
ARHGEF10_7 ↗8:1,832,799正股1,832,750–1,832,809
ARHGEF10_5 ↗8:1,858,775正股1,858,726–1,858,785
ARHGEF10_8 ↗8:1,926,465正股1,926,416–1,926,475
ARHGEF10_9 ↗8:1,928,604正股1,928,555–1,928,614
ARHGEF10_10 ↗8:1,945,590正股1,945,541–1,945,600
ARHGEF10_4 ↗8:1,952,693正股1,952,644–1,952,703
ARHGEF10_11 ↗8:1,957,028正股1,956,979–1,957,038
ARHGEF10_3 ↗8:1,957,388正股1,957,339–1,957,398

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_BCQS · promoter · 1823436–1824025 · regulatory

ENSR8_5FKNS · CTCF_binding_site · 1823644–1823665 · regulatory

ENSR8_5FKPD · CTCF_binding_site · 1823762–1823783 · regulatory

ENSR8_BCQX · enhancer · 1824026–1824610 · regulatory

ENSR8_9PKJ · enhancer · 1826457–1826821 · regulatory

ENSR8_9PKZ · enhancer · 1827983–1828291 · regulatory

· motif · 1820464–1820473 · motif

· motif · 1823005–1823016 · motif

· motif · 1823474–1823484 · motif

· motif · 1823618–1823628 · motif

· motif · 1823646–1823662 · motif

· motif · 1823701–1823711 · motif

· motif · 1823725–1823735 · motif

· motif · 1823733–1823744 · motif

· motif · 1823733–1823744 · motif

· motif · 1823764–1823780 · motif

· motif · 1823772–1823782 · motif

· motif · 1823785–1823794 · motif

· motif · 1823785–1823794 · motif

· motif · 1823799–1823808 · motif

· motif · 1823805–1823816 · motif

· motif · 1823805–1823816 · motif

· motif · 1823899–1823909 · motif

· motif · 1823921–1823931 · motif

· motif · 1823926–1823936 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1369 aa

1 aa1369 aa結構域功能區域
依 O15013 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ARHGEF10 蛋白質長 1,369 個胺基酸。序列註解在第 421 至 608 位標示 DH 結構域;另有四段區域被註記為無序區,分別位於第 1–106、第 184–254、第 1,226–1,260 及第 1,277–1,297 位。

結構域DH421–608 aa
功能區域Disordered1–106 aa
功能區域Disordered184–254 aa
功能區域Disordered1226–1260 aa
功能區域Disordered1277–1297 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15013…

AlphaFold · O15013

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA0294ARHGEF10KIF3B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ARHGEF10 相關變異被列為常染色體顯性遺傳的 Slowed nerve conduction velocity(SNCV)病因。患者神經傳導速度降低,但沒有周邊或中樞神經系統功能障礙的臨床徵象;此資料描述的是變異與疾病的因果關係。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ARHGEF10 可能參與周邊神經的發育性髓鞘形成。這項描述指出的是可能角色,未提供更具體的作用機制、實驗系統或其他條件,因此不能視為已確立的詳細機制。含實驗來源
證據與來源

May play a role in developmental myelination of peripheral nerves

PMID 14508709 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Slowed nerve conduction velocity(SNCV)患者的神經傳導速度降低,但沒有周邊或中樞神經系統功能障礙的臨床徵象。此疾病為常染色體顯性遺傳,資料指出影響 ARHGEF10 的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

Slowed nerve conduction velocity SNCV Affected individuals present a reduction in nerve conduction velocities without any clinical signs of peripheral or central nervous system dysfunction. SNCV inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 608236

PMID 14508709 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000349830 · 5,648 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGGGGCTGGGCGCATCCCTGTAGCCGGCGGGCGCGCGATC40
41CGGGACGGACGGGGTCGCGGGGGACGCGGGGGACGCGGGG80
81GACGGCGGGGAACGGCGGGGGACGGCGGGGAACAGCGGGG120
121GACGGCGGGGAACAGCGGGGGACGGCGGGGAACAGCAGGG160
161GACTGCGGGTCGCGTCCTGGCCGCCGAGGAGCTCCTTCCC200
201TTAACAGAGCTGAGAGAGGCATCTGGAGCTGCAGCATGGA240
241CCAGCGAGAGCCCCTGCCTCCCGCTCCTGCAGAAAATGAA280
281ATGAAATATGATACCAATAATAATGAAGAGGAAGAGGGAG320
321AACAGTTCGATTTTGACAGTGGAGATGAAATCCCAGAAGC360
361GGACAGACAGGCCCCATCCGCCCCTGAGACAGGAGGTGCT400
401GGAGCCAGTGAAGCCCCTGCACCCACAGGAGGTGAGGATG440
441GAGCTGGAGCAGAAACCACCCCAGTGGCAGAGCCTACTAA480
481GCTGGTGCTCCCGATGAAAGTCAACCCATATTCTGTCATC520
521GACATCACGCCATTCCAGGAGGACCAGCCGCCCACCCCCG560
561TGCCCAGCGCTGAGGAGGAGAATGTGGGTCTCCATGTGCC600
601CTGCGGGTACTTGGTGCCTGTACCCTGCGGCTATGCGGTG640
641CCCTCCAACCTGCCCCTCCTGCTGCCCGCCTACTCCAGCC680
681CGGTCATCATCTGCGCCACGTCCCTGGACGAAGAAGAAAC720
721ACCAGAAGTCACAGAAGATCGCCAGCCCAATTCTCTGAGT760
761TCCGAGGAGCCTCCAACCAGTGAAGATCAAGTCGGTCGAG800
801AGGACAGCGCACTTGCCCGCTGGGCCGCAGACCCGGCCAA840
841CACAGCCTGGATGGAGAATCCAGAGGAAGCAATTTACGAT880
881GACGTTCCAAGGGAAAACTCAGACTCTGAACCAGATGAAA920
921TGATTTATGATGATGTTGAGAATGGGGATGAAGGTGGAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。