基因總覽
ARFGAP2（ARF GTPase activating protein 2）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 GTPase 活化蛋白（GAP）。來源指出，ARFGAP2 的作用標的包括 ADP ribosylation factor 1（ARF1），並與 COPI 被膜囊泡形成及高基氏體至內質網的逆向運輸相關。它也被描述為 STING1 活性的調節因子。這些資訊顯示，ARFGAP2 涉及膜運輸相關過程，並具有調節另一蛋白活性的角色；具體作用方式與生物學過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000524782 ★ | 47,164,301–47,176,879 | 16 |
| ENST00001112654 | 47,135,667–47,177,474 | 4 |
| ENST00001112655 | 47,153,448–47,177,474 | 16 |
| ENST00001112656 | 47,153,449–47,177,474 | 16 |
| ENST00000527927 | 47,164,299–47,177,474 | 11 |
| ENST00000426335 | 47,164,299–47,177,474 | 15 |
| ENST00000892878 | 47,164,301–47,177,474 | 17 |
| ENST00000892879 | 47,164,301–47,177,474 | 17 |
| ENST00000892881 | 47,164,301–47,177,474 | 15 |
| ENST00000892882 | 47,164,301–47,177,474 | 15 |
| ENST00000892883 | 47,164,301–47,177,474 | 16 |
| ENST00000892884 | 47,164,301–47,177,474 | 16 |
顯示 12/40 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ARFGAP2 是 ARF1 的 GTPase 活化蛋白，參與 COPI 被膜囊泡形成，以及高基氏體至內質網的逆向運輸。ARF1 結合的 GTP 水解後，coatomer 會從高基氏體來源的膜解離，使膜得以與目標膜融合；因此，ARFGAP2 所參與的調控與囊泡運輸過程中的被膜移除及膜融合相連。
ARFGAP2 的作用不只是依膜曲率變化運作的 GAP。它還能促進 COPI 被膜晶格適當組裝，這項作用與 ARFGAP1 所述的單純曲率依賴型 GAP 活性有所區別，指出 ARFGAP2 也參與被膜結構的組織。
此外，ARFGAP2 會調節 STING1 活性：在某些細胞類型中促進細胞激素分泌，並促進 STING1 在反高基氏體（trans-Golgi）的質子通道活性。來源未進一步說明這些效應所涉及的細胞類型或完整分子步驟，因此不宜將其延伸為普遍適用的作用。
Promoter 與基因調控
>ARFGAP2 ENST00000524782 GRCh38 chr11:47176779-47177879 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTCTCCTGGAGAGCCGGACCCTCAGGGCCCTGAACCGTCGCTCTCTGGCTGCTCCTCTGTCCCTTGAGG GAGGAAGTCCTGGGACCCAGGGAGGGGAGGGGCCTTTGTCTAGGGAAGGGACTGGTAGGGAAGGGACGAG TCTAGGCTGAGGGCAAGATGGGAGGTCAGAGGTGACAGAAGCGTTCAGGGGTGCCTGGGCCTCCCCAGGA GCTGTGGACTCAGTTCCTGACCTCTGCTTTGGGGTTCCTGGGGTGGGCTTGGGGTGAGTGTAGTTCTGGC CTAGCAGCACCCTCTTGTGGCTTGTTCTAGCGTGTATTAAAACTTGACACACACCCACACACAAAAACAA AAACACCACTGTCGGGCTCATGTGCATTTTTTTGATAGGACACCCTTGCCAGGCCACCAGAGGGCATCTA GAGAGAGGCCTAGCGTCTGTTATGGGGCCGGGGTTGGAAAAGGGTTTGCCTGCTTGGTACCTGCTCTGGA ACTTCGAGATACTAATCTGGAGTGGAGGGGACTCGCTGTCAGGCTTGCTGTTAACCGAGAACGGCTGAAG GCTGGGCGAGACGCGGGCCAATGCGTCTGCCCGTTCGGGCCGGAGGGACGAGGAGTGTTTGGGCAGCCTA ATCCTTATTCATCGATCTGTAATTAGCTGGAGTGGGGGTCCCCGCCCCCAGCCTCCCGCAGCCTGCGCGG CGTGGGGGCGACTCCACCTGGGGGTTGCGGCGTGGGAGGGGCGGGGGGAAGGGTACTACGCGCGCGAGGA GGTTTGGGCCGGTCCGCGCGCCGTCGCCCCGCCCCGGCTGCGGATTGGCCCGGCGCGGCGTTGATTCTTG CGGCCGCGGTTGTCGTCGCCGCCCCCGTCCCGCCGGCTGCCCATTGGTCCAGATCGGACTCCAATCACCC CACCCCTCGGCTGGCCCAGGCACCGCTGAGGCCGGCCTGGTGAGCCCGCCCTCCCCGCCGTGGATTGGCC CGCGGCGGGACCCGTCAGCCGCGGTTGTGTCTGGGAAGGAGAGAAAATGGCGGCGGAGCCGAACAAGACC GAAATCCAGACTCTTTTTAAGAGGCTTCGCGCAGTTCCAACCAACAAGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ARFGAP2_1 ↗ | 11:47,176,879 | 負股 | 47,176,869–47,176,928 |
| ARFGAP2_2 ↗ | 11:47,177,157 | 負股 | 47,177,147–47,177,206 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BCCRF · promoter · 47176843–47177615 · regulatory
ENSR11_5F4LF7 · CTCF_binding_site · 47177460–47177481 · regulatory
ENSR11_5F4LFQ · CTCF_binding_site · 47177576–47177597 · regulatory
ENSR11_5F4LMZ · CTCF_binding_site · 47178924–47178945 · regulatory
· motif · 47176708–47176718 · motif
· motif · 47176845–47176855 · motif
· motif · 47176963–47176973 · motif
· motif · 47177074–47177084 · motif
· motif · 47177133–47177143 · motif
· motif · 47177138–47177148 · motif
· motif · 47177140–47177153 · motif
· motif · 47177147–47177162 · motif
· motif · 47177462–47177478 · motif
· motif · 47177578–47177594 · motif
· motif · 47177644–47177656 · motif
· motif · 47177646–47177653 · motif
· motif · 47177646–47177659 · motif
· motif · 47177705–47177718 · motif
· motif · 47177708–47177720 · motif
· motif · 47177711–47177718 · motif
· motif · 47177842–47177855 · motif
· motif · 47178926–47178942 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：521 aa
ARFGAP2 蛋白長 521 個胺基酸。其 Arf-GAP 結構域位於第 11–127 位胺基酸，其中第 26–49 位為 C4-type zinc finger。第 97–521 位區域為 coatomer 交互作用所需；另有三段被註記為無序區，分別位於第 143–202、218–241 與 397–420 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ARFGAP2 位於高基氏體膜的周邊膜位置，朝向細胞質的一側，也見於細胞質。 另有報告在周邊點狀結構中發現 ARFGAP2；這些結構可能是內質網－高基氏體中間區室，但此定位為推測。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ARFGAP2 與 coatomer 複合體有交互作用，也與 COPG1 的 C 端附屬結構域交互作用。來源未提供這些交互作用的其他條件或其對功能的具體影響。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ARFGAP2 是 ARF1 的 GTPase 活化蛋白，參與 COPI 囊泡形成及高基氏體至內質網的逆向運輸；ARF1 結合的 GTP 水解促使 coatomer 從高基氏體來源的膜解離，讓其與目標膜融合。ARFGAP2 也促進 COPI 被膜晶格適當組裝，並可在某些細胞類型中促進細胞激素分泌及反高基氏體 STING1 的質子通道活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源GTPase-activating protein (GAP) for ADP ribosylation factor 1 (ARF1), which is essential for COPI vesicle formation and retrograde transport between the Golgi and the endoplasmic reticulum. Hydrolysis of ARF1-bound GTP leads to dissociation of coatomer from Golgi-derived membranes to allow fusion with target membranes. Promotes the proper assembly of the COPI coat lattice, rather than just acting as a simple curvature-dependent GAP like ARFGAP1. Also acts as a regulator of STING1 activity, both by promoting cytokine secretion in certain cell types and promoting the proton channel activity of STING1 in the trans-Golgi PMID 17760859 ↗ · PMID 20858901 ↗ · PMID 39947179 ↗ |
| 交互作用 | ARFGAP2 與 coatomer 複合體交互作用，也與 COPG1 的 C 端附屬結構域交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the coatomer complex. Interacts with the C-terminal appendage domain of COPG1 PMID 14690497 ↗ · PMID 17760859 ↗ |
| 細胞定位 | ARFGAP2 位於高基氏體膜的周邊膜位置、朝向細胞質的一側，也存在於細胞質；此外，它出現在周邊點狀結構，而這些結構可能是內質網－高基氏體中間區室。 | 含實驗來源 | 證據與來源Golgi apparatus membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Cytoplasm; Also found on peripheral punctate structures likely to be endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment PMID 17760859 ↗ · PMID 20858901 ↗ · PMID 39947179 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGGTTGTGTCTGGGAAGGAGAGAAAATGGCGGCGGAGCC40GAACAAGACCGAAATCCAGACTCTTTTTAAGAGGCTTCGC80GCAGTTCCAACCAACAAGGCCTGTTTCGACTGCGGCGCCA120AGAATCCGAGTTGGGCCAGCATCACGTACGGTGTTTTCTT160GTGCATTGACTGTTCCGGGGTGCACCGCTCCCTGGGCGTC200CATCTGAGCTTCATCAGGTCCACAGAGTTGGATTCCAACT240GGAACTGGTTCCAGCTGAGGTGTATGCAGGTCGGCGGGAA280TGCCAATGCGACGGCTTTTTTTCGCCAACATGGATGCACA320GCCAATGATGCCAACACCAAATATAATAGCCGAGCTGCCC360AGATGTACCGGGAGAAGATCCGGCAGCTGGGGAGTGCGGC400CCTGGCTAGGCATGGCACTGATCTTTGGATAGACAACATG440AGTAGTGCCGTTCCTAATCACTCCCCAGAGAAGAAGGACT480CTGATTTCTTCACAGAACACACTCAACCCCCTGCCTGGGA520TGCGCCAGCCACTGAGCCTTCAGGGACCCAGCAGCCAGCC560CCGTCTACAGAGAGCAGTGGCCTGGCACAGCCGGAGCATG600GCCCCAACACAGACCTGCTTGGCACCTCACCCAAAGCCTC640ACTGGAACTGAAAAGCTCCATCATTGGCAAGAAGAAGCCA680GCAGCAGCTAAGAAAGGGCTGGGTGCCAAGAAAGGCCTAG720GGGCCCAGAAGGTGAGCAGCCAGAGCTTCAGTGAGATTGA760GCGGCAGGCTCAGGTGGCAGAGAAGCTCCGTGAGCAGCAG800GCAGCCGATGCCAAGAAGCAGGCGGAGGAGTCCATGGTCG840CCTCCATGCGTCTGGCCTACCAGGAGCTCCAGATTGATCG880TAAGAAAGAGGAAAAGAAGCTACAGAATCTGGAAGGGAAG920AAGCGAGAGCAGGCAGAAAGGTTGGGCATGGGCTTGGTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。