基因總覽
APOM（apolipoprotein M）是蛋白質編碼基因，產物屬於高度分化的 lipocalin family，並歸於 calycin superfamily。來源資料指出，APOM 可能參與脂質運輸，且能與多種脂質及維生素 A 衍生物結合。這些資訊勾勒出其作為脂質相關蛋白的基本性質；來源未提供更詳細的結構或作用機制說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375916 ★ | 31,655,894–31,658,210 | 6 |
| ENST00000375918 | 31,652,416–31,658,082 | 5 |
| ENST00000375920 | 31,652,417–31,658,210 | 6 |
| ENST00000988827 | 31,655,894–31,658,209 | 5 |
| ENST00000988834 | 31,655,894–31,658,209 | 6 |
| ENST00001118948 | 31,655,894–31,658,214 | 6 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
APOM 可能參與脂質運輸；來源以「可能」描述此功能，因此不能視為已確立的作用。已列出的分子結合能力涵蓋不同類型的脂質與維生素 A 衍生物，顯示其可與多種小分子配體結合，但資料並未進一步說明這些結合如何促成脂質運輸，也未指出各配體在此作用中的相對重要性。
可與 APOM 結合的分子包括 sphingosine-1-phosphate，以及 myristic acid、palmitic acid 和 stearic acid。其結合對象也包括 retinol、all-trans-retinoic acid 與 9-cis-retinoic acid。來源未提供這些分子結合的細胞或生理條件、運輸方向，或其對特定生物學過程的影響，因此不宜據此推定更具體的運輸機制或生理結果。
Promoter 與基因調控
>APOM ENST00000375916 GRCh38 chr6:31654894-31655994 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGATTTGCCAATTTTACAGATGAAAAAACAGACATAGCAGTTAGGGGTTGGTGGTGTTTTGTTTGTTTG GAGACAGAGTCTCTGTCGCCCAAGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCAGGGCTCATTGCAGCCTCGACATCC CAGGCTCAAGCAATCCTCCCTCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCCACCACATCGG CTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGAGTTTTGCCATGTAGCCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGGGCT CAAGCCATCCGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCTACCTGCCCTGCCTGTA GTTAGGGTTTGGACACATTCTGCCTGACACCAACATCTATCCTCTCTAACAGCCAGATTACATAGCCTCT TTGTAGTAATAAATGTTGAGTGAATGTGTCAGTGAACACTGCCAGGGTATACATATTTTTCTAATTGTAA ACTAAAGAGAGCAATCCACCGTGCCCCAGCACCTGCATCATACCTGTTCTAAAGCATTTACCAAGTTGTA TTGCAATGGTTTGTCTACACAGCTAGTTTTCCCTCTAACGACTTCTTCAAGATCAGGGGCTATGTCTTAT TCGTTTTTTTATGTCCCCGGGGATTAGCTAGTTCTTGGGAAACAACTGGGACTTGGGATTCAAAACAGTT TGCTAAGTGAATGAATGAGAGGCCCAGTCAAGCTACTTCCCTTCAGTGCTGCACAGTGCAACAAATAACC AGCTCAGATACAGGTTCAAAGACCACAGGCTTCTCCCTGGACAGCTCAGCTCTCCTCATAACTCCTGAGA AACCCTGGACATGCCAGGGTGTACTATGGAGTGGTTGCATCCGGAAGAGGGGGAGGAAGTCCCAAACACT AAGTAATCCAGGTTTGGGTTGGAAAACAAGGTTGAAGTTACTCATTAGCAGGTGAAAGGGTCAAGGGTCG AACGCAAGGGAGCTGAAAGCAGAGTGGACTGAGCAGCCAGTAGGGGAGAGAGCAGTTAAGGCACACAGAG CACCAGCTCCCTCCTGCCTGAAGATGTTCCACCAAATTTGGGCAGCTCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| APOM_1 ↗ | 6:31,652,404 | 正股 | 31,652,355–31,652,414 |
| APOM_2 ↗ | 6:31,655,894 | 正股 | 31,655,845–31,655,904 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_65PHNG · promoter · 31652383–31652427 · regulatory
ENSR6_8X5FF · enhancer · 31652428–31652650 · regulatory
ENSR6_B89LF · promoter · 31652651–31653195 · regulatory
ENSR6_9GKB6 · promoter · 31660768–31661268 · regulatory
· motif · 31651641–31651656 · motif
· motif · 31651702–31651724 · motif
· motif · 31651702–31651724 · motif
· motif · 31651892–31651904 · motif
· motif · 31651895–31651908 · motif
· motif · 31652073–31652086 · motif
· motif · 31652154–31652171 · motif
· motif · 31652172–31652183 · motif
· motif · 31652172–31652183 · motif
· motif · 31652376–31652389 · motif
· motif · 31652403–31652412 · motif
· motif · 31652403–31652414 · motif
· motif · 31652403–31652414 · motif
· motif · 31652403–31652417 · motif
· motif · 31652412–31652423 · motif
· motif · 31652438–31652447 · motif
· motif · 31652438–31652449 · motif
· motif · 31652438–31652449 · motif
· motif · 31652438–31652452 · motif
· motif · 31652479–31652488 · motif
· motif · 31652479–31652490 · motif
· motif · 31652479–31652490 · motif
· motif · 31652479–31652493 · motif
· motif · 31652621–31652634 · motif
· motif · 31652649–31652660 · motif
· motif · 31652649–31652660 · motif
· motif · 31652669–31652680 · motif
· motif · 31652669–31652680 · motif
· motif · 31652695–31652705 · motif
· motif · 31652697–31652707 · motif
· motif · 31652701–31652711 · motif
· motif · 31652839–31652854 · motif
· motif · 31652839–31652854 · motif
· motif · 31652840–31652854 · motif
· motif · 31652985–31652996 · motif
· motif · 31652987–31652996 · motif
· motif · 31653074–31653087 · motif
· motif · 31653079–31653089 · motif
· motif · 31653128–31653141 · motif
· motif · 31653738–31653747 · motif
· motif · 31653926–31653938 · motif
· motif · 31655675–31655689 · motif
· motif · 31655675–31655690 · motif
· motif · 31655852–31655867 · motif
· motif · 31655853–31655867 · motif
· motif · 31655858–31655870 · motif
· motif · 31655860–31655867 · motif
· motif · 31655860–31655873 · motif
· motif · 31655860–31655874 · motif
· motif · 31655860–31655875 · motif
· motif · 31657798–31657811 · motif
· motif · 31657798–31657811 · motif
· motif · 31657830–31657843 · motif
· motif · 31657830–31657843 · motif
· motif · 31658378–31658389 · motif
· motif · 31658382–31658396 · motif
· motif · 31658382–31658396 · motif
· motif · 31659824–31659835 · motif
· motif · 31659824–31659835 · motif
· motif · 31660273–31660284 · motif
· motif · 31660273–31660284 · motif
· motif · 31660744–31660761 · motif
· motif · 31660753–31660764 · motif
· motif · 31660753–31660764 · motif
· motif · 31660755–31660764 · motif
· motif · 31660786–31660799 · motif
· motif · 31660791–31660801 · motif
· motif · 31660832–31660845 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：188 aa
APOM 蛋白長 188 個胺基酸，屬於高度分化的 lipocalin family，並歸於 calycin superfamily。序列第 1 至 22 位被註記為 signal 區段，且標示為不會被切除。
蛋白質三維結構
細胞內定位
APOM 為分泌蛋白，主要存在於高密度脂蛋白（HDL）；在富含三酸甘油酯的脂蛋白（TGRLP）及低密度脂蛋白（LDL）中也可檢出，但含量較少。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
APOM 與 LRP2 有交互作用。資料指出，LRP2 介導 APOM 在腎臟的攝取，之後 APOM 會被送往溶酶體降解；未提供兩者是否共同構成複合體的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | APOM 可能參與脂質運輸，並可結合 sphingosine-1-phosphate、myristic acid、palmitic acid、stearic acid、retinol、all-trans-retinoic acid 與 9-cis-retinoic acid；脂質運輸的描述保留可能性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Probably involved in lipid transport. Can bind sphingosine-1-phosphate, myristic acid, palmitic acid and stearic acid, retinol, all-trans-retinoic acid and 9-cis-retinoic acid PMID 17525477 ↗ · PMID 19733574 ↗ |
| 交互作用 | APOM 與 LRP2 有交互作用；LRP2 介導 APOM 在腎臟的攝取，並接續促成其溶酶體降解。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with LRP2; LRP2 mediates APOM renal uptake and subsequent lysosomal degradation |
| 細胞定位 | APOM 為分泌蛋白，主要存在於高密度脂蛋白（HDL）；在富含三酸甘油酯的脂蛋白（TGRLP）及低密度脂蛋白（LDL）中也有分布，但程度較低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Present in high density lipoprotein (HDL) and to a lesser extent in triglyceride-rich lipoproteins (TGRLP) and low density lipoproteins (LDL) PMID 17525477 ↗ · PMID 18279674 ↗ · PMID 18460466 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGTGGACTGAGCAGCCAGTAGGGGAGAGAGCAGTTAAG40GCACACAGAGCACCAGCTCCCTCCTGCCTGAAGATGTTCC80ACCAAATTTGGGCAGCTCTGCTCTACTTCTATGGTATTAT120CCTTAACTCCATCTACCAGTGCCCTGAGCACAGTCAACTG160ACAACTCTGGGCGTGGATGGGAAGGAGTTCCCAGAGGTCC200ACTTGGGCCAGTGGTACTTTATCGCAGGGGCAGCTCCCAC240CAAGGAGGAGTTGGCAACTTTTGACCCTGTGGACAACATT280GTCTTCAATATGGCTGCTGGCTCTGCCCCGATGCAGCTCC320ACCTTCGTGCTACCATCCGCATGAAAGATGGGCTCTGTGT360GCCCCGGAAATGGATCTACCACCTGACTGAAGGGAGCACA400GATCTCAGAACTGAAGGCCGCCCTGACATGAAGACTGAGC440TCTTTTCCAGCTCATGCCCAGGTGGAATCATGCTGAATGA480GACAGGCCAGGGTTACCAGCGCTTTCTCCTCTACAATCGC520TCACCACATCCTCCCGAAAAGTGTGTGGAGGAATTCAAGT560CCCTGACTTCCTGCCTGGACTCCAAAGCCTTCTTATTGAC600TCCTAGGAATCAAGAGGCCTGTGAGCTGTCCAATAACTGA640CCTGTAACTTCATCTAAGTCCCCAGATGGGTACAATGGGA680GCTGAGTTGTTGGAGGGAGAAGCTGGAGACTTCCAGCTCC720AGCTCCCACTCAAGATAATAAAGATAATTTTTCAATCCTC760A761cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。