基因總覽
APMAP(adipocyte plasma membrane associated protein)是蛋白質編碼基因,產物屬於 strictosidine synthase family。現有資料指出,APMAP 具有 arylesterase 活性,並可能與 adipocyte 分化有關。蛋白質長 416 個胺基酸,含有單次跨膜區段;其拓撲結構包括短的細胞質端,以及位於膜外側的較長區域。這些資料提供了 APMAP 的基本家族、尺寸與膜相關結構資訊,但未進一步說明其在細胞分化中的作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000217456 ★ | 24,962,925–24,992,751 | 9 |
| ENST00000881535 | 24,962,924–24,992,784 | 8 |
| ENST00000881536 | 24,962,924–24,992,784 | 9 |
| ENST00000881537 | 24,962,924–24,992,784 | 8 |
| ENST00000881539 | 24,962,924–24,992,784 | 10 |
| ENST00000881540 | 24,962,924–24,992,784 | 9 |
| ENST00000932672 | 24,962,924–24,992,784 | 9 |
| ENST00000932673 | 24,962,924–24,992,784 | 7 |
| ENST00000932674 | 24,962,924–24,992,784 | 11 |
| ENST00000932675 | 24,962,924–24,992,784 | 10 |
| ENST00000999383 | 24,962,924–24,992,784 | 8 |
| ENST00000999386 | 24,962,924–24,992,784 | 10 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
APMAP 具有 arylesterase 活性;在 beta-naphthyl acetate 與 phenyl acetate 作為受質時,資料描述其活性強。這項功能資訊指出 APMAP 可作用於這兩種酯類受質,但未提供反應產物、催化機制或活性比較數值,因此不宜延伸推定其他受質或反應特性。
此外,APMAP 可能參與 adipocyte 分化。此項描述表示其與脂肪細胞分化過程存在可能的功能關聯,但現有資料沒有進一步界定參與的階段、分子途徑或作用方向,也未說明此關聯是否由 arylesterase 活性所介導。因此,APMAP 的酵素活性與其可能參與分化應視為來源分別提出的功能資訊。
Promoter 與基因調控
>APMAP ENST00000217456 GRCh38 chr20:24992651-24993751 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GATAATTCCTCGTGCCACTGGTAACGGGCTTTGATTTCTTCTGCCTGTCACTTCCTCCAGATTCGATTCC TCTTTGAATCTCAAATGCTCTCACAAGATTCAGCTCTTCCCTTTTGAAGCAATTATTACGTTTGATAATT TTACGTCTATTTTATGATGATGATCTGATTAAAGTCATCTTTCCCACTAGTTTAATTTCTATAAGGAGGG GCCTTGTCTGTGATTTGCCCACCATCGTCTCCCAGCACCTGGGAACATTTCTGGTTTCCTGCAATACTGT TGAAAGAACAATGCCTCTCTATGCTTTCTTAAACTTTGTTAGTGATAATTTCTACTTCTACCTGGACTTT ACTTAAGGGTAATCCTTAATAAACTTTATCAAAACTTAATAAACTTTATCAAAACTTAATAAACTTTATC AAATGTCTGTTGTAATCGTCACAAAAAGATTTAATACTCAACATCTGGCCTTAACCAGAGGGAAACATTT TCTAGCCCAAGTTTTCCCCTTAACCGGCTGAGTCGGGGAAGGATGTAATTTTCAGGCAGAGGTGACTTCG TTCCAAGGGTGTGAATGCATTATTTTTGACGCTGCCTGTAAGAGCAGGGTCGCTGACACTGAATAAACAG CGCTATCCTCTCCAACGATAAAAGTGGCCAACATCTCGTGCTAGCAATTCCCAAGTGCGTCATGAGCATC CCCGTCCTCAGAAACGTGAGACGAAGGCGGCATGCGCAGGCACTGGGCTAGACGAGCCCGAGGTTGAACC ACTCGCGTTCTGGGCCCCGGAGTCCGAGACAGGCGGGGACCCCGGCAGCTCCCGGTGCTATCTCTGAGCG GGTTCCGAGCCCCACTTCCGGGCGGTCAGAATTAGCCTCAGAGCGCCGAGCAACGACGCGCCGGGGACCT CCCGCCCATGAGGCCGGAAGGGGCGGGGAGAACGCTGCGGAATGGTCCCTGGGCGCAACGTCATTTCCGC GTACGGGGGAGGGCGGGCCTGGAGTCTGAGCCGGCGCCGCTCAGTGTGAGGTGGTTTCTGCGGGTGAGGC TGGCGCCCGTACCATGAGCGAGGCGGACGGGCTGCGACAGCGCCGGCCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| APMAP_1 ↗ | 20:24,992,729 | 負股 | 24,992,719–24,992,778 |
| APMAP_2 ↗ | 20:24,992,884 | 負股 | 24,992,874–24,992,933 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_8PSMG · enhancer · 24991023–24991234 · regulatory
ENSR20_9CWSH · promoter · 24991861–24992322 · regulatory
ENSR20_9CWSQ · promoter · 24992741–24993241 · regulatory
ENSR20_57TPM6 · CTCF_binding_site · 24993817–24993838 · regulatory
ENSR20_C4GZ4 · enhancer · 24994242–24995561 · regulatory
ENSR20_57TPSM · CTCF_binding_site · 24995000–24995021 · regulatory
ENSR20_9CWTP · enhancer · 24996114–24996385 · regulatory
· motif · 24988064–24988079 · motif
· motif · 24988124–24988137 · motif
· motif · 24988124–24988137 · motif
· motif · 24988168–24988183 · motif
· motif · 24988170–24988183 · motif
· motif · 24988173–24988185 · motif
· motif · 24988276–24988291 · motif
· motif · 24988281–24988293 · motif
· motif · 24988312–24988323 · motif
· motif · 24988470–24988485 · motif
· motif · 24988998–24989013 · motif
· motif · 24988998–24989013 · motif
· motif · 24989482–24989495 · motif
· motif · 24989519–24989534 · motif
· motif · 24992706–24992723 · motif
· motif · 24992769–24992780 · motif
· motif · 24992769–24992780 · motif
· motif · 24992820–24992829 · motif
· motif · 24992888–24992899 · motif
· motif · 24992888–24992899 · motif
· motif · 24992890–24992899 · motif
· motif · 24993819–24993835 · motif
· motif · 24995002–24995018 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:416 aa
APMAP 蛋白質長 416 個胺基酸,屬於 strictosidine synthase family。其第 41–61 位胺基酸構成螺旋型跨膜區,並作為 type II 膜蛋白的 signal-anchor;第 2–40 位位於細胞質側,第 62–416 位位於細胞外側。第 1–32 位另註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
APMAP 被註記為膜相關的單次跨膜 type II 蛋白。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | APMAP 對 beta-naphthyl acetate 與 phenyl acetate 表現出強 arylesterase 活性;此外,來源指出它可能參與 adipocyte 分化,但未提供更具體的作用階段或機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Exhibits strong arylesterase activity with beta-naphthyl acetate and phenyl acetate. May play a role in adipocyte differentiation PMID 18513186 ↗ |
| 細胞定位 | APMAP 被描述為膜上的單次跨膜 type II 蛋白;此定位描述未提供條件變化或異構型差異資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGAGTCTGAGCCGGCGCCGCTCAGTGTGAGGTGGTTTCTG40CGGGTGAGGCTGGCGCCCGTACCATGAGCGAGGCGGACGG80GCTGCGACAGCGCCGGCCCCTGCGGCCGCAGGTCGTCACA120GACGATGATGGCCAGGCCCCGGAGGCTAAGGACGGCAGCT160CCTTTAGCGGCAGAGTTTTCCGAGTGACCTTCTTGATGCT200GGCTGTTTCTCTCACCGTTCCCCTGCTTGGAGCCATGATG240CTGCTGGAATCTCCTATAGATCCACAGCCTCTCAGCTTCA280AAGAACCCCCGCTCTTGCTTGGTGTTCTGCATCCAAATAC320GAAGCTGCGACAGGCAGAAAGGCTGTTTGAAAATCAACTT360GTTGGACCGGAGTCCATAGCACATATTGGGGATGTGATGT400TTACTGGGACAGCAGATGGCCGGGTCGTAAAACTTGAAAA440TGGTGAAATAGAGACCATTGCCCGGTTTGGTTCGGGCCCT480TGCAAAACCCGAGATGATGAGCCTGTGTGTGGGAGACCCC520TGGGTATCCGTGCAGGGCCCAATGGGACTCTCTTTGTGGC560CGATGCATACAAGGGACTATTTGAAGTAAATCCCTGGAAA600CGTGAAGTGAAACTGCTGCTGTCCTCCGAGACACCCATTG640AGGGGAAGAACATGTCCTTTGTGAATGATCTTACAGTCAC680TCAGGATGGGAGGAAGATTTATTTCACCGATTCTAGCAGC720AAATGGCAAAGACGAGACTACCTGCTTCTGGTGATGGAGG760GCACAGATGACGGGCGCCTGCTGGAGTATGATACTGTGAC800CAGGGAAGTAAAAGTTTTATTGGACCAGCTGCGGTTCCCG840AATGGAGTCCAGCTGTCTCCTGCAGAAGACTTTGTCCTGG880TGGCAGAAACAACCATGGCCAGGATACGAAGAGTCTACGT920TTCTGGCCTGATGAAGGGCGGGGCTGATCTGTTTGTGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。