演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

AOPEPC90RF3

aminopeptidase O (putative)

AOPEP(aminopeptidase O (putative))是蛋白質編碼基因,其產物可切除胜肽或蛋白質底物N端的胺基酸殘基。

Homo sapiens9q22.32UniProt Q8N6M6
OFFICIAL SYMBOL
AOPEP
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q8N6M6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

AOPEP是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為aminopeptidase O (putative)。其產物Aminopeptidase O屬於peptidase M1家族,是一種胺基肽酶;來源將其催化作用描述為可從胜肽或蛋白質底物的N端水解胺基酸殘基。蛋白質長819個胺基酸,並註有核仁定位訊號。名稱中的「putative」保留了來源對其身分的限定;現有資料未提供更多序列結構或家族特徵細節。

Official symbol
AOPEP
Gene name
aminopeptidase O (putative)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1361
UniProt
Q8N6M6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C90RF3FLJ14675APOAP-OC9orf3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q22.32
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegAOPEPpq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:94,726,604–95,151,793
Gene span
425,190 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000375315 ★94,726,699–95,087,15917
ENST0000027719894,726,634–94,931,8338
ENST0000029797994,726,634–95,087,15915
ENST0000093909194,726,634–95,087,15913
ENST0000093909294,726,634–95,087,15513
ENST0000093909394,726,634–95,087,15714
ENST0000093909494,726,634–95,087,15518
ENST0000095198694,726,634–95,087,15817
ENST0000095198794,726,634–95,087,15818
ENST0000095198894,726,634–95,087,15816
ENST0000095198994,726,634–95,087,15915
ENST0000098398794,726,634–95,088,19014

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Aminopeptidase O的來源註解指出,它能催化胜肽或蛋白質底物N端胺基酸殘基的水解。這項反應涉及從底物末端移除胺基酸殘基;資料未進一步列出可辨識的特定底物、被切除胺基酸種類或反應效率,因此其底物範圍與催化特性無法由這些資訊確定。

每個次單元結合一個鋅離子,這是來源所列的金屬結合資訊;資料未說明鋅離子在反應中的具體作用,也未提供結合或催化的實驗條件。現有功能註解亦未描述其參與的特定細胞過程或生理結果,因此不宜由胺基肽酶活性進一步推定其生物學功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 94726699 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>AOPEP ENST00000375315 GRCh38 chr9:94725699-94726799 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTTCTACTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTGTCGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGCGAT
CTCGGCTCACTGCAGGCTCCGCCCCCCGGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGG
GACTACAGGCGCCCACCACCTCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGT
TAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTTGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC
AAGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTTCCTTCTACATTTAATGTTTGCTTTCTCAACTAGAAAGTAATCC
CCATGAGGGAAGGCACAGCGTCTGTCTTGTTCCTGGTTGTTTCCCCAGCTTTTGTTAAGGGTGCTTGCCT
GGCACACAGGAGGACCTTAAATTGTGGTGGAATTAATATGTGAACAATAGTCACATGCAGCAGAGGTGAG
ACTAGGCTAAGGAATAAAATTGCACATCTGTATTTCAGTAACTTTTTTTAAATTTTATTTGAAACAGGGT
CTTGCTCTGTGGCTCAGGGTGGAGTGTAGTGGCACGTTCATAGCTCATTGCAGCCTCGAACTCCTGGACC
TAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCATAGTAGCTGGACCACAGGTGCACGCCACCACACTCGGCTAATT
TTTTAATTTTTTTGTAGAGACGGGGCCTCCCCAGGTTGCCCAGGCTGGTGATTTTTTTCTTAAGCTTCAT
AAAGATTTTGCAATTAGGAATACTAGGGTACCAGGGCAACTCTACAAGCCCTAGCCAGCCAAGCTGCTCG
CGCCCTCCTATGACCGCGGCAGCTCCGCGCCTGCGCAGATCTCCCCCGGGCGGTCTCGCCCTCTCATCCT
AAGGGGGCGGGCCTAGCGGAAGGCGGGTCAGGCAGAATGCGGCCCCGGGCGCGTGTGGATGACGTCACCC
GGCGCGTGCCGGGGTAGCCCGTAGTAACCCCGAGTCTGCGGAAGTGGTGACCCGTGGGACGCGGCTGAGA
CAGGTAACCTGTTCGCTCCCTGTTGGGTCCCTGCCTTCCTCTCCTCCGGCG
AOPEP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C9orf3_1 ↗9:94,726,718正股94,726,669–94,726,728
C9orf3_2 ↗9:94,752,914正股94,752,865–94,752,924

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_84R79K · enhancer · 94724711–94724880 · regulatory

ENSR9_93DL68 · enhancer · 94726146–94726564 · regulatory

ENSR9_84R7BM · promoter · 94726565–94726722 · regulatory

ENSR9_5S9KK2 · CTCF_binding_site · 94726575–94726596 · regulatory

ENSR9_93DL6D · enhancer · 94726723–94727043 · regulatory

ENSR9_93DL6H · promoter · 94727044–94727425 · regulatory

· motif · 94726564–94726575 · motif

· motif · 94726564–94726575 · motif

· motif · 94726577–94726593 · motif

· motif · 94726665–94726678 · motif

· motif · 94726665–94726678 · motif

· motif · 94726713–94726724 · motif

· motif · 94727774–94727785 · motif

· motif · 94728660–94728671 · motif

· motif · 94728907–94728918 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:819 aa

1 aa819 aa基序
依 Q8N6M6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Aminopeptidase O長819個胺基酸,屬於peptidase M1家族。蛋白質特徵註解列出位於第689至699位胺基酸的核仁定位訊號;來源未提供其他結構域或功能區域資訊。

基序Nucleolar localization signal689–699 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8N6M6…

AlphaFold · Q8N6M6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus, nucleolus;Cytoplasm

資料將Aminopeptidase O定位於細胞核及核仁;另列出Isoform 3位於細胞質,顯示定位資訊依異構型而異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C90RF3AOPEP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

AOPEP的變異與Dystonia 31(DYT31)相關。DYT31為常染色體隱性、會進展的肌張力不全,通常自兒童期至青年期發病;表現包括不自主肌肉扭轉及姿勢異常,可影響四肢、頸部、臉部與軀幹。部分患者可能有口面部運動障礙,造成發音及吞嚥困難。來源指出致病原因涉及AOPEP變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Aminopeptidase O可催化胜肽或蛋白質底物N端胺基酸殘基的水解;來源未進一步說明底物種類或切除殘基的特異性。推論支持
證據與來源

Aminopeptidase which catalyzes the hydrolysis of amino acid residues from the N-terminus of peptide or protein substrates

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性每個次單元結合一個鋅離子;來源未說明鋅離子結合的反應條件或功能。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

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細胞定位Aminopeptidase O的定位註解為細胞核及核仁。推論支持
證據與來源

Nucleus, nucleolus

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細胞定位Isoform 3的定位註解為細胞質。推論支持
證據與來源

Isoform 3; Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Dystonia 31(DYT31)是常染色體隱性且會進展的肌張力不全,通常於兒童期至青年期發病;不自主扭轉動作與姿勢異常可影響四肢、頸部、臉部及軀幹,部分患者有口面部運動障礙並出現發音或吞嚥困難。來源指出此病由AOPEP變異引起。含實驗來源
證據與來源

Dystonia 31 DYT31 A form of dystonia, a disorder defined by the presence of sustained involuntary muscle contraction, often leading to abnormal postures. DYT31 is an autosomal recessive, progressive form with onset from childhood to young adulthood. Involuntary muscle twisting movements and postural abnormalities affect the upper and lower limbs, neck, face, and trunk. Some patients may have orofacial dyskinesia resulting in articulation and swallowing difficulties. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619565

PMID 34596301 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000375315 · 3,130 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTAGTAACCCCGAGTCTGCGGAAGTGGTGACCCGTGGGAC40
41GCGGCTGAGACAGGAGACTGAAAGGAACCATAATTTGTGA80
81CATCAGTTGTTTTCTTTGATAAGCAGCTATTTATGATTCT120
121GGAAGATTAAGGCAGATAGGAAACCCCATCTGAGATTTTA160
161ATAAATCCCTCAAACAATAAACCACATCATGGACATACAG200
201CTGGACCCTGCCAGAGATGACCTGCCTCTCATGGCCAACA240
241CCAGCCACATACTTGTGAAGCACTATGTACTGGATTTGGA280
281TGTGGATTTTGAAAGTCAAGTCATTGAGGGGACCATAGTG320
321CTTTTCCTCGAGGATGGAAACAGATTCAAGAAACAGAATA360
361GCTCTATTGAGGAAGCCTGCCAATCAGAATCAAACAAAGC400
401CTGCAAATTTGGGATGCCTGAACCCTGCCATATTCCCGTG440
441ACAAATGCAAGGACCTTCTCATCTGAAATGGAATATAATG480
481ATTTTGCAATCTGTAGTAAAGGTGAAAAAGATACTTCTGA520
521TAAAGATGGTAACCATGACAACCAGGAACATGCTTCTGGG560
561ATTTCTAGCTCAAAGTACTGCTGTGACACAGGGAATCATG600
601GGAGTGAGGATTTTTTGCTAGTGTTGGACTGCTGTGATTT640
641ATCTGTGTTAAAAGTCGAGGAGGTGGATGTTGCTGCTGTG680
681CCAGGTCTGGAAAAATTTACAAGGTCTCCTGAGCTCACGG720
721TTGTTTCTGAGGAGTTCAGGAATCAGATTGTACGTGAACT760
761TGTGACTTTGCCTGCAAATCGTTGGAGGGAGCAGTTAGAC800
801TATTACGCTCGCTGCAGCCAGGCTCCTGGCTGTGGGGAAC840
841TCCTCTTTGACACTGACACTTGGAGCTTGCAGATAAGGAA880
881GACAGGGGCTCAGACAGCTACTGACTTTCCTCATGCTATC920
921AGGATATGGTACAAAACTAAACCTGAAGGGCGATCGGTTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。