演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ANTKMTMGC2494

adenine nucleotide translocase lysine methyltransferase

ANTKMT 是粒線體蛋白質賴胺酸甲基轉移酶,可三甲基化特定 adenine nucleotide translocase,並與粒線體呼吸調節有關。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9BQD7
OFFICIAL SYMBOL
ANTKMT
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9BQD7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ANTKMT(adenine nucleotide translocase lysine methyltransferase)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 ANT/ATPSC lysine N-methyltransferase 家族。此蛋白質為 235 個胺基酸長,具有一段跨膜螺旋,並含有標註為 methyltransferase(MTase)及 pre-methyltransferase(preMT)的區域;其 C 端末段則被註記為無序區。這些特徵勾勒出一種與膜相關的甲基轉移酶基本性質,而其已知作用對象為 adenine nucleotide translocase。

Official symbol
ANTKMT
Gene name
adenine nucleotide translocase lysine methyltransferase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14152
UniProt
Q9BQD7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MGC2494C16orf24FAM173A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegANTKMTpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:720,581–722,590
Gene span
2,010 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000569529 ★721,146–722,5905
ENST00000564000721,097–722,5854
ENST00000219535721,097–722,5904
ENST00000853259721,097–722,5905
ENST00000853260721,097–722,5905
ENST00000853261721,097–722,5904
ENST00000994823721,097–722,5895
ENST00001118423721,097–722,5905
ENST00001136990721,097–722,5905
ENST00000994822721,146–722,5905
ENST00000568916721,672–722,5903

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ANTKMT 是粒線體蛋白質賴胺酸 N-甲基轉移酶,可對 adenine nucleotide translocase 家族成員進行甲基化。已知其能使 ANT2/SLC25A5 與 ANT3/SLC25A6 的賴胺酸殘基形成三甲基化修飾;此作用與粒線體呼吸調節相關。對 ANT1/SLC25A4 的作用則仍以可能性描述,來源指出它可能也會被 ANTKMT 三甲基化,並未將此項作用表述為確定結果。

此反應以蛋白質上的 L-賴胺酸及 S-腺苷甲硫胺酸為底物:賴胺酸的 ε-胺基接受三個甲基,生成 N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysyl-[protein],同時產生三分子的 S-腺苷同半胱胺酸及三個質子。這項反應描述了 ANTKMT 所催化的化學修飾,修飾發生於受質蛋白,而非轉運蛋白的胺基酸序列改變。

已知受質包括 ANT2 與 ANT3,且其三甲基化與粒線體呼吸調節相連。現有資料支持 ANTKMT 參與此蛋白質修飾及其呼吸相關調節,但未進一步說明修飾如何改變轉運蛋白性質,或其對呼吸的具體影響方向,因此不宜將作用延伸解讀為特定的促進或抑制效果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 721146 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ANTKMT ENST00000569529 GRCh38 chr16:720146-721246 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCTAGACCCCAGCCACGGATGGCTAAGGAGGAGCTAGGCCAGGGCACGCATAGACAACCCCCGACATTCA
CGGGTGTTCAGCCCTACCCTGGGTGTGGAGGTCGTGGCCCAGCTGCCTGACCCAGAGCTCGGCTCTTCCA
CTTGCGCTTCCCACCCCCAGCTTCACAAGGTCACCTCCAGGAACTCAGTCTTTTTGTGTGTTGTTTTCTG
GAGAAGGAAGGTGATCTCCCCACTCCCGGGGCTGTCTGCCTTCCCTGTAGCTGGCAGGTGCCAGAGGCCC
CCGCCTGTGACATCCGGCTTTCCTCCCACCACACTCGCCTGAGAGCCAGCATCTGTCTTCTTGGGCCTGC
TCAAGCTCTCCTCCGTGTCAGCCCCTCCTCCATGCCCTTCTCCCTCAGACCCCACCCCCCATCCCTTCAC
CGCCCACTGGGGCTCATCGCTCAGGCTGTAGGAGGGAAATGGAAGGATGTCCTCCCGGGCTCTGGCTGGC
GCTGGGTGTCCGAGTCAGCGGAGCGCCCCCAGCAGTCTCCCCGAGGCAGAGTCATGGGGGTGCTGGCGCC
TGGACGCTGTCTCATCCCGGGGAGCCGCTTTCCCACCGGCTCCCTGGGCTCCAGCCGCCCCACGCGAGCC
CCCGGCTGGTTCTGGGGCCAGGACCGCCCCTCTCCAAGGCAGACTTCCCTTCATTCCACGACAAAGACGC
GCAGCCCCGTTTCCCTGGGGCTCTAGCCCGTGAGATCGCCGGGTGTATCCCGACTCCCGCCGGCACGTGC
GCTCCCCCAGGGCAGGGCCTGCCTGTCCCCTTCCGCGGGTCGCCAGCAGCCAGCACAGGCCGCAAACGGC
GGTCCGCAGAGCGGACCAACGGAGCCGACCCTCGCAGGCTTGGAGCCGGACGCGGCGGGGCAGAGCCCCC
GAGGCTGCAGCTCGCCGGAACCCGCGGGAGGGCAGCCGGGCTGGGCGGAGCGCACAGCGCCACGGACCGA
CCGCGCAGGCTCTGCCGGCCACTTCCGGTGTCGCGCGGCGGCTCCCGGCAGGAGGCAGAGGGCACACCGC
CAGCCCCAGGCCAGGCTGCGAGGGCCGCGGACCCGAGCCGGGAAGGACCTT
ANTKMT 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FAM173A_2 ↗16:720,588正股720,539–720,598
FAM173A_1 ↗16:721,146正股721,097–721,156

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_99N9 · promoter · 716084–716584 · regulatory

ENSR16_56JWX · CTCF_binding_site · 716883–716904 · regulatory

ENSR16_B5SS · enhancer · 717322–718281 · regulatory

ENSR16_8KDT · enhancer · 718516–718693 · regulatory

ENSR16_B5T3 · enhancer · 718864–719481 · regulatory

ENSR16_56KG5 · CTCF_binding_site · 719946–719967 · regulatory

ENSR16_B5T9 · promoter · 720607–721156 · regulatory

· motif · 716326–716338 · motif

· motif · 716329–716344 · motif

· motif · 716330–716343 · motif

· motif · 716457–716469 · motif

· motif · 716492–716505 · motif

· motif · 716885–716901 · motif

· motif · 719948–719964 · motif

· motif · 720086–720101 · motif

· motif · 720093–720108 · motif

· motif · 720278–720292 · motif

· motif · 720284–720298 · motif

· motif · 720304–720319 · motif

· motif · 720434–720443 · motif

· motif · 720593–720613 · motif

· motif · 720598–720612 · motif

· motif · 720965–720980 · motif

· motif · 720972–720987 · motif

· motif · 721127–721138 · motif

· motif · 721145–721154 · motif

· motif · 721145–721156 · motif

· motif · 721145–721156 · motif

· motif · 721145–721159 · motif

· motif · 721255–721272 · motif

· motif · 721271–721287 · motif

· motif · 721407–721416 · motif

· motif · 721432–721441 · motif

· motif · 721482–721497 · motif

· motif · 721632–721641 · motif

· motif · 721632–721641 · motif

· motif · 721632–721641 · motif

· motif · 721632–721641 · motif

· motif · 721741–721750 · motif

· motif · 721796–721805 · motif

· motif · 721813–721822 · motif

· motif · 721989–721998 · motif

· motif · 723230–723244 · motif

· motif · 723230–723244 · motif

· motif · 724317–724326 · motif

· motif · 724802–724811 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:235 aa

1 aa235 aa功能區域跨膜區
依 Q9BQD7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ANTKMT 蛋白質長 235 個胺基酸,屬於 ANT/ATPSC lysine N-methyltransferase 家族。序列註解包含跨膜螺旋、N 端序列(NTS),以及標註為 methyltransferase(MTase)和 pre-methyltransferase(preMT)的區域;C 端 215–235 位胺基酸則被預測為無序區。

跨膜區Helical20–42 aa
功能區域N-terminal sequence (NTS)1–22 aa
功能區域Methyltransferase (MTase)43–77 aa
功能區域Pre-methyltransferase (preMT)43–77 aa
功能區域Disordered215–235 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BQD7…

AlphaFold · Q9BQD7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion membrane

ANTKMT 位於粒線體膜,並被註記為單次跨膜蛋白。 此定位描述的是 ANTKMT 本身;現有資料未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 15 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MGC2494ANTKMTAIRIMBANPCCDC24CTNNA3DTX2EFCAB2FANCLHDAC7HGSMEIS2MKRN3PARVGPIK3R3PPP1R16AZNF76
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ANTKMT 是粒線體蛋白質賴胺酸 N-甲基轉移酶,可三甲基化 ANT2/SLC25A5 與 ANT3/SLC25A6,並藉此調節粒線體呼吸。ANT1/SLC25A4 也可能是其三甲基化受質,但此作用仍屬可能性描述。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrial protein-lysine N-methyltransferase that trimethylates adenine nucleotide translocases ANT2/SLC25A5 and ANT3/SLC25A6, thereby regulating mitochondrial respiration. Probably also trimethylates ANT1/SLC25A4

PMID 31213526 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-lysyl-[protein] + 3 S-adenosyl-L-methionine = N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysyl-[protein] + 3 S-adenosyl-L-homocysteine + 3 H(+)含實驗來源
證據與來源

L-lysyl-[protein] + 3 S-adenosyl-L-methionine = N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysyl-[protein] + 3 S-adenosyl-L-homocysteine + 3 H(+)

PMID 31213526 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ANTKMT 位於粒線體膜,且屬於單次跨膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion membrane / Single-pass membrane protein

PMID 31213526 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000569529 · 870 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTTCCGGTGTCGCGCGGCGGCTCCCGGCAGGAGGCAGAG40
41GGCACACCGCCAGCCCCAGGCCAGGCTGCGAGGGCCGCGG80
81ACCCGAGCCGGGAAGGACCTTGGGCGGACGAGCCGCGCGT120
121CCCGCAGCCATGGAGCAGGACGACCCGGTCGAGGCGCTGA160
161CGGAGCTGCGCGAGCGGCGGCTGGGCGCGCTGGAGCTGCT200
201GCAGGCGGCGGCCGGCTCGGGCTTGGCAGCCTACGCGGTG240
241TGGGCGCTGCTGCTCCAGCCCGGCTTCCGGCGCGTGCCGC280
281TGCGGCTGCAGGTGCCCTACGTCGGCGCGAGCGCGCGGCA320
321GGTGGAGCACGTGTTGTCGCTGCTGCGAGGACGCCCCGGA360
361AAAACGGTGGATCTGGGCTCTGGCGACGGCAGGATCGTGC400
401TGGCGGCCCACAGGTGCGGCCTCCGCCCGGCCGTGGGCTA440
441CGAGCTGAACCCCTGGCTGGTGGCGCTGGCGCGGCTGCAC480
481GCCTGGAGGGCCGGCTGTGCCGGCAGCGTCTGCTATCGCC520
521GCAAGGATCTCTGGAAGGTGAGCCTGAGGGACTGCCGCAA560
561CGTGTCTGTGTTCCTGGCCCCTAGCGTGCTCCCGCTGCTG600
601GAGGACAAGCTGCGGACAGAGCTGCCTGCTGGGGCCCGCG640
641TGGTGTCTGGGCGCTTCCCACTCCCCACCTGGCAGCCTGT680
681GACCGCGGTTGGCGAGGGCCTGGACCGAGTATGGGCTTAT720
721GATGTTCCTGAGGGTGGGCAGGCTGGGGAGGCCGCCTCCT760
761CGCGGATACCCATCCAGGCTGCCCCCGGACCTAGTTCTGC800
801CCCCATCCCGGGGGGCCTTATTTCTCAGGCCAGCTGAGTA840
841TTAGACACGATAAAGACTCTGTGGGTTCTA870

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。