基因總覽
ANP32A(acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 ANP32 family。來源將其描述為多功能蛋白質,涉及細胞凋亡、細胞週期進程、腫瘤抑制與轉錄等調控,也參與部分病毒的基因組複製或 mRNA 輸出。這些功能涵蓋細胞內調節與感染相關過程;各項作用的具體方式與條件,依不同生物學情境而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000465139 ★ | 68,778,535–68,820,895 | 7 |
| ENST00000882106 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000882107 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000882108 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000882109 | 68,778,534–68,820,924 | 5 |
| ENST00000882110 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000882111 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000882112 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000882113 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000923059 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
| ENST00000923060 | 68,778,534–68,820,924 | 6 |
| ENST00000923062 | 68,778,534–68,820,924 | 7 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ANP32A 參與多種細胞調控過程,包括腫瘤抑制、細胞凋亡、細胞週期進程與轉錄。細胞凋亡方面,它可促進 caspase-9/CASP9 活化,並有助於 apoptosome 形成。這些作用與其對細胞命運調控的參與有關,但來源未將其描述為單一途徑的專一性因子。
在染色質與轉錄調控中,ANP32A 是 INHAT(inhibitor of histone acetyltransferases)複合體的一部分,可調節組蛋白乙醯化。它藉由遮蔽組蛋白,抑制 EP300/CREBBP 與 EP300/CREBBP-associated factor 的組蛋白乙醯轉移酶活性;此外,ANP32A 優先結合未修飾的組蛋白 H3,從空間阻礙其乙醯化與磷酸化。這些作用與細胞生長抑制相關。ANP32A 也參與 E4F1 介導的轉錄抑制,並可抑制 protein phosphatase 2A。
ANP32A 亦與 RNA 調控有關。它與 ELAVL1(Hu-antigen R)相互作用,參與 mRNA 在細胞核與細胞質間的運輸及其穩定性調節。病毒感染情境下,ANP32A 對 influenza A、B、C 病毒的基因組複製具有重要作用;其 N 端區域可介導由 PB1、PB2 與 PA 組成的病毒 replicase 非對稱二聚體組裝。另有來源指出,ANP32A 對 foamy virus mRNA 從細胞核輸出也具有重要作用。
Promoter 與基因調控
>ANP32A ENST00000465139 GRCh38 chr15:68820795-68821895 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACCGTGCGCCGTTCTCTTTCACTAGGTCTATAAAGCCCAGAAATTATGTTTGGTCCAGAAAACCAGGAG TTATGAGCACCTTCCTTTTCCACCTTTTAATATTCTACATATCTAGCAACGGTTCTTAATCCATGGTCTT CATTCATTTATTGCCTAAACAAGATCTTGGGTGTCTCTTGGTGATCACTTCTTCCAAGCTGACCTAATAT GACAGCAAAGTGAAAAGCCTCTTCGTGGGAAGGGTCGCGACCGCGCGGTAAGTCATCCAAAAGTGGAAGC ATCTTGCTTTTACTGACTTATGTATACGAGGGTGGCGATGGTGGCGGCCTGACAGGGACGAGGCCGGAGG GGAAGGGGCGCGCGGGCTGCTGGGCAGCCGCGGTGGGGGTGACGGGGGCAGCCACGCTCCCCAGCGCGAG CCGCCGGACCCGGGACCCGACGAGCCCCTCCCGGCATTGCACCCTGACCCCTCTCCTCCTTCCAGGCCTT TCATCTGCCCTCCCGCTGGGCAGCCCGCGGTCCCCGGACCTCAAGCCGCCCGCCTCCTTCCGCAACCCCG TCGCGCCGCCCCGCGAAGCCCTCGGCCGGGCGGGGACCCCGACCCGACCCCTCCGGCCGCGCCCCTCCCC CTCGCAGAACGCACCTGCGGCCCCGCCCCCGGCCGAACGCTGAGGCGGCGGCTGGCTGGCAAGGCCGGGC GGCTCGGCCCTCGAGGCACAGTCACCTTCCCTTCCCCCGCCATTCCGCCCACCCCCCTCACTCAGCCACA GAGCAGCCGCCGCGCTCCTCAGCCGCCCCGAAATCTAAAGGGGTCCGTCTCCGGCACCACTACCAAATGG CCGAGCCTCCCTGGCCGGCTGCGCAGCCCGCCCATTGGTCCCTTCCCCCCCCCGCCGCCACTGCCATTGG CTGTTGCCCGGAGACCCTCGGCGGCGATTGGCTCGGGCCGCTGCCGCTCGTCCATGGGGCCGCAGATCCC GCCTCCACGGCGATCAGGTTAGTGTGCGCCGCGGGTGCTGGGGGCTCGAGAACCGAGCGGAGCTGGTTGA GCCTTCAAAGTCCTAAAACGCGCGGCCGTGGGTTCGGGGTTTATTGATTGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ANP32A_2 ↗ | 15:68,784,426 | 負股 | 68,784,416–68,784,475 |
| ANP32A_1 ↗ | 15:68,820,895 | 負股 | 68,820,885–68,820,944 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:249 aa
ANP32A 蛋白質長 249 個胺基酸,屬於 ANP32 family。序列註解標示四個 leucine-rich repeat(LRR)區段,以及一個 LRRCT 結構域。其第 147–249 位胺基酸區段被註記為無序區;第 150–174 位區段與腫瘤抑制功能相關,第 165–249 位區段則與 E4F1 互作相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ANP32A 可在細胞核與細胞質間穿梭;在神經突生成過程中,據相似性推定會轉移至細胞質。 來源亦列出細胞核、細胞質與內質網等定位,但未提供各定位間轉換的其他條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AXIN1O15169 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- E4F1Q66K89 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPP2CAP67775 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Ppp2caP63331 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ANP32A 是 SET complex(至少含 ANP32A、APEX1、HMGB2、NME1、SET 與 TREX1)及 INHAT complex 的組成部分,並直接與 SET 互作;另與 ATXN1/SCA1、MAP1B、ELAVL1 和 E4F1 互作。感染相關方面,ANP32A 以 C 端與 influenza A、B、C 病毒的 PB2 蛋白互作;這些互作與病毒複製促進有關,其中 influenza C 的 PB2 互作還可橋接病毒 replicase 二聚體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ANP32A 參與腫瘤抑制、細胞凋亡、細胞週期進程與轉錄調控;可促進 caspase-9/CASP9 活化及 apoptosome 形成。作為 INHAT 複合體的一部分,它藉組蛋白遮蔽抑制 EP300/CREBBP 與 EP300/CREBBP-associated factor 的組蛋白乙醯轉移酶活性,並優先結合未修飾組蛋白 H3、阻礙其乙醯化與磷酸化,與細胞生長抑制相關。它也參與 mRNA 運輸與穩定性調節、E4F1 介導的轉錄抑制及 protein phosphatase 2A 抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Multifunctional protein that is involved in the regulation of many processes including tumor suppression, apoptosis, cell cycle progression or transcription. Promotes apoptosis by favouring the activation of caspase-9/CASP9 and allowing apoptosome formation. In addition, plays a role in the modulation of histone acetylation and transcription as part of the INHAT (inhibitor of histone acetyltransferases) complex. Inhibits the histone-acetyltransferase activity of EP300/CREBBP (CREB-binding protein) and EP300/CREBBP-associated factor by histone masking. Preferentially binds to unmodified histone H3 and sterically inhibiting its acetylation and phosphorylation leading to cell growth inhibition. Participates in other biochemical processes such as regulation of mRNA nuclear-to-cytoplasmic translocation and stability by its association with ELAVL1 (Hu-antigen R). Plays a role in E4F1-mediated transcriptional repression as well as inhibition of protein phosphatase 2A PMID 10400610 ↗ · PMID 11360199 ↗ · PMID 11830591 ↗ · PMID 15642345 ↗ · PMID 16341127 ↗ · PMID 17557114 ↗ · PMID 18180367 ↗ · PMID 18439902 ↗ |
| 功能 | 在病毒感染相關情境中,ANP32A 對 influenza A、B、C 病毒基因組複製具有重要作用;其 N 端區域可介導由 PB1、PB2 與 PA 組成的病毒 replicase 非對稱二聚體組裝。來源也指出,ANP32A 對 foamy virus mRNA 從細胞核輸出具有重要作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Plays an essential role in influenza A, B and C viral genome replication. Mechanistically, mediates the assembly of the viral replicase asymmetric dimers composed of PB1, PB2 and PA via its N-terminal region. Also plays an essential role in foamy virus mRNA export from the nucleus PMID 21159877 ↗ · PMID 30666459 ↗ · PMID 32694517 ↗ · PMID 33045004 ↗ · PMID 33208942 ↗ |
| 交互作用 | ANP32A 是 SET complex 的組成部分;該複合體至少包含 ANP32A、APEX1、HMGB2、NME1、SET 與 TREX1。ANP32A 與 SET 直接互作,也與 ATXN1/SCA1、MAP1B、ELAVL1 及 E4F1 互作,並屬於 INHAT 複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the SET complex, composed of at least ANP32A, APEX1, HMGB2, NME1, SET and TREX1. Directly interacts with SET. Interacts with ATXN1/SCA1. Interacts with MAP1B. Interacts with ELAVL1. Part of the INHAT (inhibitor of histone acetyltransferases) complex. Interacts with E4F1 PMID 11163245 ↗ · PMID 11555662 ↗ · PMID 11729309 ↗ · PMID 12628186 ↗ · PMID 16818237 ↗ · PMID 17557114 ↗ · PMID 18180367 ↗ |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中,ANP32A 透過 C 端與 influenza A virus 的 PB2 蛋白互作;此互作促進病毒複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via C-terminus) with influenza virus A protein PB2; this interaction promotes viral replication PMID 30666459 ↗ |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中,ANP32A 透過 C 端與 influenza B virus 的 PB2 蛋白互作;此互作促進病毒複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via C-terminus) with influenza virus B protein PB2; this interaction promotes viral replication PMID 33045004 ↗ |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中,ANP32A 透過 C 端與 influenza C virus 的 PB2 蛋白互作。此互作可促進病毒複製,並藉由橋接病毒 replicase 二聚體使其連接在一起。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via C-terminus) with influenza virus C protein PB2; this interaction promotes viral replication by bridging viral replicase dimers together PMID 33208942 ↗ |
| 細胞定位 | ANP32A 可在細胞核與細胞質間穿梭;在神經突生成過程中,據相似性推定會轉移至細胞質。來源另列出細胞核、細胞質與內質網定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Endoplasmic reticulum; Translocates to the cytoplasm during the process of neuritogenesis (By similarity). Shuttles between nucleus and cytoplasm PMID 11830591 ↗ · PMID 18180367 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTGTGCGCCGCGGGTGCTGGGGGCTCGAGAACCGAGCGG40AGCTGGTTGAGCCTTCAAAGTCCTAAAACGCGCGGCCGTG80GGTTCGGGGTTTATTGATTGAATTCCGCCGGCGCGGGAGC120CTCTGCAGAGAGAGAGCGCGAGAGATGGAGATGGGCAGAC160GGATTCATTTAGAGCTGCGGAACAGGACGCCCTCTGATGT200GAAAGAACTTGTCCTGGACAACAGTCGGTCGAATGAAGGC240AAACTCGAAGGCCTCACAGATGAATTTGAAGAACTGGAAT280TCTTAAGTACAATCAACGTAGGCCTCACCTCAATCGCAAA320CTTACCAAAGTTAAACAAACTTAAGAAGCTTGAACTAAGC360GATAACAGAGTCTCAGGGGGCCTGGAAGTATTGGCAGAAA400AGTGTCCGAACCTCACGCATCTAAATTTAAGTGGCAACAA440AATTAAAGACCTCAGCACAATAGAGCCACTGAAAAAGTTA480GAAAACCTCAAGAGCTTAGACCTTTTCAATTGCGAGGTAA520CCAACCTGAACGACTACCGAGAAAATGTGTTCAAGCTCCT560CCCGCAACTCACATATCTCGACGGCTATGACCGGGACGAC600AAGGAGGCCCCTGACTCGGATGCTGAGGGCTACGTGGAGG640GCCTGGATGATGAGGAGGAGGATGAGGATGAGGAGGAGTA680TGATGAAGATGCTCAGGTAGTGGAAGACGAGGAGGACGAG720GATGAGGAGGAGGAAGGTGAAGAGGAGGACGTGAGTGGAG760AGGAGGAGGAGGATGAAGAAGGTTATAACGATGGAGAGGT800AGATGACGAGGAAGATGAAGAAGAGCTTGGTGAAGAAGAA840AGGGGTCAGAAGCGAAAACGAGAACCTGAAGATGAGGGAG880AAGATGATGACTAAGTGGAATAACCTATTTTGAAAAATTC920CTATTGTGATTTGACTGTTTTTACCCATATCCCCTCTCCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。