基因總覽
ANAPC11(anaphase promoting complex subunit 11)是蛋白質編碼基因,其產物為 APC/C 的一個次單元。APC/C 是受細胞週期調控的 E3 ubiquitin ligase 複合體,ANAPC11 與 ANAPC2 共同形成其催化成分。蛋白質家族分類上,ANAPC11 屬於 RING-box family;其蛋白質長 84 個胺基酸,含有 RING-type zinc finger。這些特徵界定了它作為 APC/C 組成蛋白及催化成分之一的基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344877 ★ | 81,891,723–81,900,255 | 4 |
| ENST00000571570 | 81,890,669–81,900,255 | 4 |
| ENST00000926462 | 81,890,669–81,900,254 | 3 |
| ENST00000572639 | 81,891,645–81,900,255 | 4 |
| ENST00000877741 | 81,891,645–81,900,255 | 3 |
| ENST00000926467 | 81,891,645–81,900,255 | 5 |
| ENST00000572851 | 81,891,683–81,900,356 | 3 |
| ENST00000357385 | 81,891,683–81,900,254 | 4 |
| ENST00000584314 | 81,891,683–81,894,839 | 3 |
| ENST00000571874 | 81,891,683–81,900,254 | 4 |
| ENST00000926463 | 81,891,683–81,900,355 | 4 |
| ENST00000926479 | 81,891,683–81,900,254 | 5 |
顯示 12/79 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ANAPC11 參與 APC/C 的 E3 ubiquitin ligase 活性;它與 ANAPC2 一同構成複合體的催化成分。APC/C 受細胞週期調控,藉由促使目標蛋白質泛素化,進而促進其降解,協助控制細胞週期進程。
APC/C 主要促進以 Lys-11 相連的多聚泛素鏈形成,也能以較低程度促進 Lys-48 與 Lys-63 相連的多聚泛素鏈形成。此外,APC/C 可在目標蛋白質上組裝分枝的 Lys-11/Lys-48 相連泛素鏈。這些描述指向 APC/C 介導蛋白質修飾與後續降解的作用;來源未進一步說明 ANAPC11 單獨執行各種鏈型形成的程度。
在細胞週期中期至後期轉換時,CDC20 活化 APC/C,使其靶向 cyclin B 與 securin 並促進其降解。此調控也受 mitotic checkpoint complex(MCC)影響:MCC 抑制 APC/C,並延緩染色體分離。ANAPC11 因而是 APC/C 催化功能的一部分,其功能脈絡與細胞週期轉換及檢查點調控相連。
Promoter 與基因調控
>ANAPC11 ENST00000344877 GRCh38 chr17:81890723-81891823 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGGACACCAGCAGTTTCCCACCTGTCTCCACGCCGGCACCACCGCCGAAGCCACTGTCGAAAAGATCGT GCTGCCACTTGTCGGGAAGTTGTTTTGGCTGAAAAAAAAACCGCAACAAGAGCAGATCTGTGAGTCTCAG TCCAGGGCTTTCCTGACCCTCACGGCTACTCCGGACCCTTCCTCTTCCCGGCCTGAGAGGATCCGGCCGA AACGGGGCCGCCAGCGCTCCCTCCGGCGCTGCAGCTGCCCCAGCCCGAGGCCGCACGGTCCCACCGCGGC CGCACAACTTCAGTTCCCTTAGACTAACTTCCCGCCGCCTGTGCCGCGCCCAGCGTCCCCTCCTCTCCTG CCACGAGGCCCCAACGTCCGGAACAAACAAAGAGCTGGGAAGGGTCTCAGCCTCCGGGACCGGACCCCGA AAGAACGACCTCGCTCCCGCCCACCACCCCCTCCGCGCCCACACGCACCCTCCGGACCTCCGGGCGGCCG CTCCACCAGCCTTATCCACCCGCCGGCCCGGGTCTCCGCCGCGAGCGGCCCCGGCCCCAGCCCCGGCTGG CCCCCTCCCACTCTCCGGCGCGGCCGGCCTCCGCACTCACCCTGCTGTAGGGCGCCGGTCGGTTCCTGCC GCCTCCGCCGGCCGCGCCGCGGGCGATGGCCGGCCGGTTCCGGATGGGCCCGCCGCCTCGATTCACTCGC GCGGCGGCCTGCGCCCCACCGCCGCGGCCGCCCTGGGAGCCGGCCCGGCCGCGGCCCCGGCCCCCGCCCC GGCCGCCTCGCTGGCTCCGGTTCAGTTTAATGATGTCGTCCAGAGACATGTCCATTTTGTCGGCCATGGC GGGCGCGGAATCGGGCATCGGCTCGAGCCCGCGCGTCAGCACGCCGGCACGTCACTTCCGGCGCCGCGTG AGGCCTTCCGGTGCCACGGCCTCGGAGCGGCTGCTGATTGGCCGCTGGCGGACGGCTGCGCGCGCGGGAC GGGGTGAGGCGGGGAGGCGCGTGCGCACTGGCGTGCGAGACTCGGCGGGCGCTGTTGAGGGAGTCGGGCC GCGACTGTGGTCGTTTTTATACCTTCCCGCGCGGACGCCGGCGCTGCCAAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ANAPC11_1 ↗ | 17:81,891,735 | 正股 | 81,891,686–81,891,745 |
| ANAPC11_2 ↗ | 17:81,892,029 | 正股 | 81,891,980–81,892,039 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_CB5DG · enhancer · 81885462–81886741 · regulatory
ENSR17_937HL7 · promoter · 81890482–81890800 · regulatory
ENSR17_937HLJ · promoter · 81891576–81892073 · regulatory
ENSR17_BL8RT · enhancer · 81892074–81892644 · regulatory
· motif · 81890762–81890779 · motif
· motif · 81890830–81890838 · motif
· motif · 81890830–81890847 · motif
· motif · 81891556–81891566 · motif
· motif · 81891615–81891624 · motif
· motif · 81891615–81891626 · motif
· motif · 81891635–81891644 · motif
· motif · 81891718–81891729 · motif
· motif · 81891718–81891729 · motif
· motif · 81892065–81892082 · motif
· motif · 81892122–81892131 · motif
· motif · 81894111–81894122 · motif
· motif · 81894261–81894272 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:84 aa
ANAPC11 蛋白質長 84 個胺基酸,屬於 RING-box family。其第 34 至 77 位胺基酸區段註解為 RING-type zinc finger。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ANAPC11 的定位記錄包括細胞質與細胞核。 來源未提供不同細胞週期階段、條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PEX1O43933 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEND2Q8NDZ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB5Q02930-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRYBA2P53672 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DTX2Q86UW9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP1Q12805 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP2O95967 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPANK1O95872 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSD3B7Q9H2F3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IQUBQ8NA54 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP11-1Q8IUC1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP13-2Q52LG2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-2Q3LHN2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP3-1Q9BYR8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP3-3Q9BYR6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-1Q3LI64 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-2Q3LI66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OXER1Q8TDS5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- P4HA3Q7Z4N8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAA2P54646 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAB2O43741 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ANAPC11 是由多個次單元組成的 APC/C 成員。它與 ANAPC2 的 cullin domain 及 UBE2D2 有互作記錄。APC/C 可與 CDC20 結合形成 CDC20-APC/C 複合體;此關聯依賴 APC/C 磷酸化,並與中期至後期轉換相關。APC/C 也與 MCC 結合,該複合體抑制 APC/C 並延緩染色體分離;此外,APC/C 與 FZR1、FBXO5 有互作記錄。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ANAPC11 是受細胞週期調控的 APC/C 成員,並與 ANAPC2 共同構成其 E3 ubiquitin ligase 催化成分。APC/C 促使目標蛋白質泛素化並降解,主要形成 Lys-11 相連多聚泛素鏈,較少形成 Lys-48 或 Lys-63 相連鏈,也可組裝分枝的 Lys-11/Lys-48 鏈。CDC20 在中期至後期轉換時活化 APC/C,使其靶向 cyclin B 與 securin;MCC 則抑制 APC/C 並延緩染色體分離。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the anaphase promoting complex/cyclosome (APC/C), a cell cycle-regulated E3 ubiquitin ligase that controls progression through the cell cycle. Together with ANAPC2, forms the catalytic component of the E3 ubiquitin ligase complex. APC/C acts by mediating ubiquitination and subsequent degradation of target proteins: it mainly mediates the formation of 'Lys-11'-linked polyubiquitin chains and, to a lower extent, the formation of 'Lys-48'- and 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains. APC/C catalyzes assembly of branched 'Lys-11'-/'Lys-48'-linked branched ubiquitin chains on target proteins. APC/C is activated by CDC20 in the metaphase/anaphase transition of cell cycle, targeting the degradation of cyclin B and securin. APC/C is regulated by the mitotic checkpoint complex (MCC), which inhibits APC/C and delays chromosome segregation PMID 11739784 ↗ · PMID 18485873 ↗ · PMID 27120157 ↗ · PMID 27509861 ↗ · PMID 29033132 ↗ |
| 分子活性 | ANAPC11 的功能註記包括蛋白質修飾與蛋白質泛素化;此項活動資料未提供更具體的作用條件或分子細節。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | ANAPC11 是 APC/C 的組成次單元之一。APC/C 與 CDC20 形成的複合體參與細胞週期中期至後期轉換,且此互作依賴 APC/C 磷酸化;APC/C 與 MCC 的關聯則可抑制 APC/C 並延緩染色體分離。APC/C 也與 FZR1、FBXO5 有互作記錄;ANAPC11 與 ANAPC2 的 cullin domain 及 UBE2D2 有互作記錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the anaphase promoting complex/cyclosome (APC/C), composed of ANAPC1, ANAPC2, CDC27/ANAPC3, ANAPC4, ANAPC5, CDC16/ANAPC6, ANAPC7, CDC23/ANAPC8, ANAPC10, ANAPC11, CDC26/ANAPC12, ANAPC13, ANAPC15 and ANAPC16. APC/C associates with CDC20 to form the CDC20-APC/C complex, which is crucial for metaphase/anaphase transition in cell cycle; this interaction is dependent on APC/C phosphorylation. APC/C associates with mitotic checkpoint complex (MCC), which inhibits APC/C and delays chromosome segregation. APC/C interacts with FZR1 and FBXO5. Interacts with the cullin domain of ANAPC2. Interacts with UBE2D2 PMID 10922056 ↗ · PMID 11739784 ↗ · PMID 25043029 ↗ · PMID 26083744 ↗ · PMID 27120157 ↗ · PMID 27509861 ↗ |
| 細胞定位 | ANAPC11 的細胞定位註記為細胞質與細胞核;此資料未區分特定條件或細胞狀態。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGCGCACTGGCGTGCGAGACTCGGCGGGCGCTGTTGAGG40GAGTCGGGCCGCGACTGTGGTCGTTTTTATACCTTCCCGC80GCGGACGCCGGCGCTGCCAACGGAAGGGCGGGTAGGGCGA120GACGGAGTTTCGTCATGTTGGCCAGGCCCATTTGAGATCT160TTGAAGATATCCTCAACGTGAGGCTCTGCTGCCATGAAGG200TGAAGATTAAGTGCTGGAACGGCGTGGCCACTTGGCTCTG240GGTGGCCAACGATGAGAACTGTGGCATCTGCAGGATGGCA280TTTAACGGATGCTGCCCTGACTGCAAGGTGCCCGGCGACG320ACTGCCCGCTGGTGTGGGGCCAGTGCTCCCACTGCTTCCA360CATGCATTGCATCCTCAAGTGGCTGCACGCACAGCAGGTG400CAGCAGCACTGCCCCATGTGCCGCCAGGAATGGAAGTTCA440AGGAGTGAGGCCCGACCTGGCTCTCGCTGGAGGGGCATCC480TGAGACTCCTTCCTCATGCTGGCGCCGATGGCTGCTGGGG520ACAGCGCCCCTGAGCTGCAACAAGGTGGAAACAAGGGCTG560GAGCTGCGTTTGTTTTGCCATCACTATGTTGACACTTTTA600TCCAATAAGTGAAAACTCATTAAACTACTCAAATCTTG638cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。