基因總覽
ALOXE3（arachidonate epidermal lipoxygenase 3）是蛋白質編碼基因，其產物屬於脂氧合酶家族，為含非血基質鐵的酵素。此蛋白質具有 PLAT 結構域及脂氧合酶結構域；相較於典型脂氧合酶，其脂氧合酶活性較低，而氫過氧化物異構酶活性較突出。這些特性使它能參與脂質轉化，並在皮膚脂質屏障形成中扮演角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000448843 ★ | 8,095,900–8,118,514 | 16 |
| ENST00000380149 | 8,095,900–8,118,489 | 15 |
| ENST00000714145 | 8,095,900–8,118,514 | 14 |
| ENST00000318227 | 8,095,900–8,119,047 | 16 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ALOXE3 是脂質代謝相關酵素，含非血基質鐵，並呈現不同於典型脂氧合酶的活性特徵：其氫過氧化物異構酶活性突出，脂氧合酶活性則較低。它可將由 ALOX12B 作用於花生四烯酸或亞油酸所產生的氫過氧化物，異構化為 hepoxilin 類環氧醇及酮；在有氧條件下，也能使包括花生四烯酸在內的多元不飽和脂肪酸氧化，形成脂肪酸氫過氧化物。
在皮膚中，ALOXE3 位於 ALOX12B 下游，作用於酯化 omega-hydroxyacyl-sphingosine（EOS）神經醯胺中的亞油酸部分，生成環氧酮衍生物。這是 omega-hydroxyceramide 與膜蛋白結合的重要步驟，因而有助於形成角質細胞脂質包膜，並建立減少水分流失的皮膚屏障。來源也指出，ALOXE3 可能透過產生 hepoxilin 代謝物，在屏障形成中具有訊號功能。
此外，ALOXE3 可能經由產生 hepoxilin A3 和 hepoxilin B3 參與脂肪細胞分化，這些代謝物可活化 PPARG；此功能註記為相似性推論。脊髓中的 hepoxilin 生成亦可能調節發炎性觸覺痛覺過敏，同樣屬相似性推論。
Promoter 與基因調控
>ALOXE3 ENST00000448843 GRCh38 chr17:8118414-8119514 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAATGTTGATTATATGTTAAAATAAGATTTTGGTATATTAGGGTAAGTAAAATAGATCCGTGAAATTAAT TTCGCTTGCTTTTTATTCTTTGTAATGTGGCTACCAGAAAATGTAAATTCGATAATACGGCTCGCGTTTG TACTGTTTTAAAGTATGTTTATTACCCTCCACCGTCGTTTGCTGTATTTTGTGGAAATCAAGTTTCTGTA TCACCTAGCTTTAAAAACTAGTAACTATTTTTGTTACCATTTTATGCGAAGTGCGGTACCCAAAAGCAAA GACATGCCGCCCGAACAGGGACTTGAACCCTGGACCCTCAGATTAAAAGTCTGATGCTCTACCGACTGAG CTATCCGGGCTCTTCACGAGAGCTTTACTTTTTGCTTATAAGAGGGTTCTCTATAGGAAAAGCCAGGCTT GTAGAACCGACAGAGGATTTTATCTGTGCAGCATAGAATATTTTGGCACAGATTTGGAAGCAGCGGGTGA AGCTCGCCTGCTGCTGATTGAGCTTTTTCTGCCTCCCGTTCTTAGAGCCCCCGCCGAGGCTGCGACGCAG GGACTGTACCATAGTAGAGGCTGGAACAGTGCGGCGCCGGAACCGGCCGCGCGGGGCCGCTGCGGGCTAT GGGCTTCTCTGAGAGGTTCCTCCCCAGTCCCTAGTGGCCCAGATCCCGGACACCTGGGCTCCCGCCCAGG ATCCTGCAGGCCCAGGGCGGTCCTGGAGCGGAAAGAATGCCACGCGGGGCATTCAGACCCTGTTTGCCGG CGCTGTATTTCGCTTTCCTGACCTGCCCTACTCCAGAGCAGAGAATGAGGTCGGGCGTGCCAAAGGCTGG GGACAAAGAGGGCCATGCGTGGGGGGATCGGTGTATGGGGTGACAGGGAGCTGTTCCTGACCATTTGACA TGTGCTGGAATGCGTGTGCGACTCACCTGCGTGTGGCTGCAGTCACGTGTGATTTATGACCAAGTGCAAC TCTCCACTGTTTAGTGATTCACACGGATGATTCACACGTAGGAATGCAGGTGCCCTGTGCTCATCTCTGC CTGGGAATGGGGAGGAACAGATCTTGGGGGACATTGGGGAGTGGGCGGACA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ALOXE3_2 ↗ | 17:8,118,397 | 負股 | 8,118,387–8,118,446 |
| ALOXE3_1 ↗ | 17:8,118,514 | 負股 | 8,118,504–8,118,563 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B3LHK · promoter · 8118479–8119004 · regulatory
ENSR17_9582B · promoter · 8119037–8119537 · regulatory
ENSR17_53WKF5 · CTCF_binding_site · 8120538–8120559 · regulatory
ENSR17_53WKLQ · CTCF_binding_site · 8121752–8121773 · regulatory
· motif · 8118576–8118592 · motif
· motif · 8118576–8118592 · motif
· motif · 8118720–8118740 · motif
· motif · 8119000–8119014 · motif
· motif · 8119000–8119014 · motif
· motif · 8119198–8119212 · motif
· motif · 8119513–8119524 · motif
· motif · 8119770–8119785 · motif
· motif · 8120181–8120192 · motif
· motif · 8120181–8120192 · motif
· motif · 8120205–8120218 · motif
· motif · 8120205–8120218 · motif
· motif · 8120247–8120262 · motif
· motif · 8120247–8120262 · motif
· motif · 8120540–8120556 · motif
· motif · 8120931–8120940 · motif
· motif · 8121754–8121770 · motif
· motif · 8122032–8122049 · motif
· motif · 8122057–8122066 · motif
· motif · 8122256–8122273 · motif
· motif · 8122675–8122689 · motif
· motif · 8122678–8122686 · motif
· motif · 8122678–8122693 · motif
· motif · 8122821–8122833 · motif
· motif · 8123070–8123085 · motif
· motif · 8123077–8123085 · motif
· motif · 8123077–8123094 · motif
· motif · 8123467–8123483 · motif
· motif · 8123467–8123483 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：711 aa
ALOXE3 蛋白質長 711 個胺基酸，位於第 2–119 位的 PLAT 結構域與第 120–711 位的脂氧合酶結構域構成其註解的主要區域。此蛋白質屬脂氧合酶家族，每個亞基結合一個 Fe 陽離子。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ALOXE3 註記位於細胞質；此定位資料未提供條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- GLIPR1P48060 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MORN3Q6PF18 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- YY1P25490 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF76P36508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
ALOXE3 變異與常染色體隱性先天性魚鱗癬 3（ARCI3）相關。此角化異常疾病可造成表皮分化與脫屑異常，並出現全身皮膚鱗屑；主要表型包括板層型魚鱗癬及非大疱性先天性魚鱗癬樣紅皮症，同一患者或同一家族成員間可能有表型重疊。板層型患者出生時常見類似膠膜的包裹，之後發展為全身鱗屑；非大疱性表型則可見紅皮背景上的細白鱗屑，臀部、頸部及腿部可能有較大的棕色鱗屑。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 23 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ALOXE3 是含非血基質鐵的脂氧合酶，氫過氧化物異構酶活性突出而脂氧合酶活性較低；可轉化 ALOX12B 由花生四烯酸或亞油酸產生的氫過氧化物，也能在有氧時氧化多元不飽和脂肪酸。於皮膚中，它參與 EOS 神經醯胺衍生物形成及角質細胞脂質包膜、皮膚屏障建立。其對脂肪細胞分化及脊髓痛覺調節的作用屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-heme iron-containing lipoxygenase which is atypical in that it displays a prominent hydroperoxide isomerase activity and a reduced lipoxygenases activity. The hydroperoxide isomerase activity catalyzes the isomerization of hydroperoxides, derived from arachidonic and linoleic acid by ALOX12B, into hepoxilin-type epoxyalcohols and ketones. In presence of oxygen, oxygenates polyunsaturated fatty acids, including arachidonic acid, to produce fatty acid hydroperoxides. In the skin, acts downstream of ALOX12B on the linoleate moiety of esterified omega-hydroxyacyl-sphingosine (EOS) ceramides to produce an epoxy-ketone derivative, a crucial step in the conjugation of omega-hydroxyceramide to membrane proteins. Therefore plays a crucial role in the synthesis of corneocytes lipid envelope and the establishment of the skin barrier to water loss. In parallel, it may have a signaling function in barrier formation through the production of hepoxilins metabolites. Also plays a role in adipocyte differentiation through hepoxilin A3 and hepoxilin B3 production which in turn activate PPARG (By similarity). Through the production of hepoxilins in the spinal cord, it may regulate inflammatory tactile allodynia (By similarity) PMID 12881489 ↗ · PMID 17045234 ↗ · PMID 20921226 ↗ · PMID 20923767 ↗ · PMID 21558561 ↗ |
| 分子活性 | a hydroperoxyeicosatetraenoate = a hydroxy-epoxy-eicosatetraenoate | 含實驗來源 | 證據與來源a hydroperoxyeicosatetraenoate = a hydroxy-epoxy-eicosatetraenoate PMID 12881489 ↗ · PMID 17045234 ↗ · PMID 21558561 ↗ |
| 分子活性 | (12R)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = (8R)-hydroxy-(11R,12R)-epoxy-(5Z,9E,14Z)-eicosatrienoate | 含實驗來源 | 證據與來源(12R)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = (8R)-hydroxy-(11R,12R)-epoxy-(5Z,9E,14Z)-eicosatrienoate PMID 12881489 ↗ |
| 分子活性 | (12S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = (8R)-hydroxy-(11S,12S)-epoxy-(5Z,9E,14Z)-eicosatrienoate | 含實驗來源 | 證據與來源(12S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = (8R)-hydroxy-(11S,12S)-epoxy-(5Z,9E,14Z)-eicosatrienoate PMID 12881489 ↗ |
| 分子活性 | (12S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = (10R)-hydroxy-(11S,12S)-epoxy-(5Z,8Z,14Z)-eicosatrienoate | 含實驗來源 | 證據與來源(12S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = (10R)-hydroxy-(11S,12S)-epoxy-(5Z,8Z,14Z)-eicosatrienoate PMID 12881489 ↗ |
| 分子活性 | (15S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate = (13R)-hydroxy-(14S,15S)-epoxy-(5Z,8Z,11Z)-eicosatrienoate | 含實驗來源 | 證據與來源(15S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate = (13R)-hydroxy-(14S,15S)-epoxy-(5Z,8Z,11Z)-eicosatrienoate PMID 12881489 ↗ |
| 分子活性 | (5S)-hydroperoxy-(6E,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = 7R-hydroxy-5S,6S-epoxy-(8Z,11Z,14Z)-eicosatrienoate | 含實驗來源 | 證據與來源(5S)-hydroperoxy-(6E,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = 7R-hydroxy-5S,6S-epoxy-(8Z,11Z,14Z)-eicosatrienoate PMID 17045234 ↗ |
| 分子活性 | (13S)-hydroperoxy-(9Z,11E)-octadecadienoate = 11-hydroxy-(12S,13S)-epoxy-(9Z)-octadecenoate | 含實驗來源 | 證據與來源(13S)-hydroperoxy-(9Z,11E)-octadecadienoate = 11-hydroxy-(12S,13S)-epoxy-(9Z)-octadecenoate PMID 20923767 ↗ |
| 分子活性 | N-[omega-(9R)-hydroperoxy-(10E,12Z)-octadecadienoyloxy]acyl-beta-D-glucosyl-(1<->1)-octadecasphing-4E-enine = a N-[omega-(9R,10R)-epoxy-(13R)-hydroxy-(11E)-octadecenoyloxy]acyl-beta-D-glucosyl-(1<->1)-sphing-4E-enine | 含實驗來源 | 證據與來源N-[omega-(9R)-hydroperoxy-(10E,12Z)-octadecadienoyloxy]acyl-beta-D-glucosyl-(1<->1)-octadecasphing-4E-enine = a N-[omega-(9R,10R)-epoxy-(13R)-hydroxy-(11E)-octadecenoyloxy]acyl-beta-D-glucosyl-(1<->1)-sphing-4E-enine PMID 21558561 ↗ |
| 分子活性 | a N-[omega-(9R)-hydroperoxy-(10E,12Z)-octadecadienoyloxy]-acylsphin-4E-enine = a N-[omega-(9R,10R)-epoxy-(13R)-hydroxy-(11E)-octadecenoyloxy]-acylsphing-4E-enine | 含實驗來源 | 證據與來源a N-[omega-(9R)-hydroperoxy-(10E,12Z)-octadecadienoyloxy]-acylsphin-4E-enine = a N-[omega-(9R,10R)-epoxy-(13R)-hydroxy-(11E)-octadecenoyloxy]-acylsphing-4E-enine PMID 21558561 ↗ |
| 分子活性 | a hydroperoxyeicosatetraenoate = an oxoeicosatetraenoate + H2O | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | (12R)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = 12-oxo-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + H2O | 含實驗來源 | 證據與來源(12R)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = 12-oxo-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + H2O PMID 12881489 ↗ · PMID 21558561 ↗ |
| 分子活性 | (12S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = 12-oxo-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + H2O | 含實驗來源 | 證據與來源(12S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate = 12-oxo-(5Z,8Z,10E,14Z)-eicosatetraenoate + H2O PMID 12881489 ↗ |
| 分子活性 | (15S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate = 15-oxo-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate + H2O | 含實驗來源 | 證據與來源(15S)-hydroperoxy-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate = 15-oxo-(5Z,8Z,11Z,13E)-eicosatetraenoate + H2O PMID 12881489 ↗ |
| 分子活性 | (13S)-hydroperoxy-(9Z,11E)-octadecadienoate = 13-oxo-(9Z,11E)-octadecadienoate + H2O | 含實驗來源 | 證據與來源(13S)-hydroperoxy-(9Z,11E)-octadecadienoate = 13-oxo-(9Z,11E)-octadecadienoate + H2O PMID 20923767 ↗ |
| 分子活性 | (8S)-hydroperoxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = (10R)-hydroxy-(8S,9S)-epoxy-(5Z,11Z,14Z)-eicosatrienoate | 推論支持 | 證據與來源(8S)-hydroperoxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = (10R)-hydroxy-(8S,9S)-epoxy-(5Z,11Z,14Z)-eicosatrienoate |
| 分子活性 | (8R)-hydroperoxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = 8-oxo-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + H2O | 推論支持 | 證據與來源(8R)-hydroperoxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = 8-oxo-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + H2O |
| 分子活性 | (8S)-hydroperoxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = 8-oxo-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + H2O | 推論支持 | 證據與來源(8S)-hydroperoxy-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate = 8-oxo-(5Z,9E,11Z,14Z)-eicosatetraenoate + H2O |
| 分子活性 | 每個 ALOXE3 蛋白質亞基可結合一個 Fe 陽離子；此註記描述其金屬結合數量，未提供其他反應條件或生物學結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | ALOXE3 的功能註記涵蓋脂質代謝，並列有氫過氧化二十碳四烯酸生合成；這項資料未進一步說明具體條件、反應步驟或生物學結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | ALOXE3 的功能註記將鞘脂代謝列為相關生物學過程之一；此條目未提供反應條件、具體機制或此過程所造成的結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | ALOXE3 的細胞內定位註記為細胞質；這筆資料未提供定位改變的條件、異構型差異或其他細胞位置資訊。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | ALOXE3 變異可造成常染色體隱性先天性魚鱗癬 3，疾病特徵為角化、表皮分化與脫屑異常，造成全身皮膚鱗屑。表型包括板層型魚鱗癬及非大疱性先天性魚鱗癬樣紅皮症，患者間可能重疊；前者常於出生時有類膠膜包裹，之後出現全身鱗屑，後者可有紅皮背景細白鱗屑及局部較大棕色鱗屑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ichthyosis, congenital, autosomal recessive 3 ARCI3 A form of autosomal recessive congenital ichthyosis, a disorder of keratinization with abnormal differentiation and desquamation of the epidermis, resulting in abnormal skin scaling over the whole body. The main skin phenotypes are lamellar ichthyosis (LI) and non-bullous congenital ichthyosiform erythroderma (NCIE), although phenotypic overlap within the same patient or among patients from the same family can occur. Lamellar ichthyosis is a condition often associated with an embedment in a collodion-like membrane at birth; skin scales later develop, covering the entire body surface. Non-bullous congenital ichthyosiform erythroderma characterized by fine whitish scaling on an erythrodermal background; larger brownish scales are present on the buttocks, neck and legs. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 606545 PMID 11773004 ↗ · PMID 15629692 ↗ · PMID 16116617 ↗ · PMID 19131948 ↗ · PMID 19890349 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACACGGATGATTCACACGTAGGAATGCAGTGGAACCCAGG40CTCCTGATATCCATCTGGGTGAGCCAGCCAGAGGGACCGG80CTGTGTCAGAGGCAAGCAAACAAGTATTAGAGTGCAAGAC120TGTGGGCGGAGAGAGGAAGCCCGAGCCGCCAGCAGGGAGC160TTCGGAGAGAGAAAGCCCAGGAACATCCCAGAGAGAGCTG200GGCCCATCCTCAGCCCTACCCAGCCCCGCAGCCCCTAGCC240CTCCGCCCAGAAACCCAGCCCTGTCCGGCGTGCCGCTCTT280CTCCTCCAGGCCGGCTGCTGCTGCGGCCAGCGTTGCCGGG320GCATCCCTTCCTCCTTCCCATCATGGCAGTGTACCGCCTG360TGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGG400ACAACATCTCTGTCACACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAG440CCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCC480CCTGGATCGGTACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGG520AGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCG560CTACGCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGC600ATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTTCC640CCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCT680GAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGGACTCTCTT720CCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCC760GACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATCTATGCCCCTGGCTT800CCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAG840TCAGACAAGAAATTTGCCTTGACAAAGACGACAACTTGTG880TAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGG920CTTCCCCATGAAAATTGACATCCCATCCCTGATGTACATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。