基因總覽
AGTRAP 是位於人類第 1 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 angiotensin II receptor associated protein。其蛋白質產物長 159 個胺基酸,具有多段跨膜區,並分布於膜性細胞區室。現有資料將它描述為 type-1 angiotensin II receptor 訊號的負向調節因子;其功能涉及受體內化與去敏化,並與細胞增殖及 angiotensin II 刺激的轉錄活性降低相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000314340 ★ | 11,736,136–11,750,769 | 5 |
| ENST00000376637 | 11,736,070–11,750,771 | 4 |
| ENST00000400895 | 11,736,070–11,750,316 | 6 |
| ENST00000376629 | 11,736,070–11,750,771 | 5 |
| ENST00000376627 | 11,736,070–11,750,578 | 7 |
| ENST00000452018 | 11,736,070–11,750,771 | 6 |
| ENST00000510878 | 11,736,070–11,750,771 | 4 |
| ENST00000856549 | 11,736,070–11,750,771 | 5 |
| ENST00000856550 | 11,736,070–11,750,771 | 6 |
| ENST00000856551 | 11,736,070–11,750,771 | 6 |
| ENST00000929521 | 11,736,070–11,750,771 | 3 |
| ENST00000977952 | 11,736,070–11,750,770 | 5 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
AGTRAP 的資料顯示,它可能負向調節 type-1 angiotensin II receptor 所介導的訊號。其作用與受體內化有關,也涉及受體去敏化的調節;來源舉例指出,去敏化機制包括受體磷酸化。這些描述將 AGTRAP 的角色連結至受體訊號強度或持續性的調節,但未提供更細的分子步驟或反應方向細節,因此不宜進一步推定其如何影響各個訊號環節。
在細胞相關結果方面,AGTRAP 也與細胞增殖降低及 angiotensin II 刺激的轉錄活性下降相關。資料指出這些變化是 AGTRAP 所誘導,但未說明相關實驗的細胞類型、具體測量方式或兩種結果之間是否存在因果關係。因而可將其理解為與受體訊號調節並列的功能觀察,而非據此確定特定下游機制。
總體而言,現有註釋支持 AGTRAP 參與 type-1 angiotensin II receptor 訊號負向調節,並指出受體內化、去敏化(例如磷酸化)、細胞增殖降低及 angiotensin II 刺激轉錄活性下降等相關面向。資料未進一步界定這些作用的先後順序或適用條件。
Promoter 與基因調控
>AGTRAP ENST00000314340 GRCh38 chr1:11735136-11736236 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCAGGTGCACACCACCATGCCCTGCTAATTTTGGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCC AGGCTGGTCTCGAACTACTGAGTTCAGGTGATCCACCCTCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGG GGTGAGCCACTGCGCCCAGCCTCATCTTGTGTTGGTAATAACAATAGCTTGTGTGTCCTGCCCATTTACT AAGTGCCGGGCACTGTTCTCTCCTAGAACAAACCGTAGTTAGACTCCTCTGAGTCCTCATCTTGACTAGG CCTCGGCCTTGGACCTCTGTGTCTTCCTGTCCTTGCTGGGCCTGAGCCTGCATAATAAACCAGTTTCAGC AAGAGTCCTGCTAAGTTAGCAAGAACTCCCCCATCCTTGATGTCTCCTCCTAGGAATCTTCCATTCCTGC TCCCTCATTCTGCTCTGGCTATAAATCCCTCCTTGGTCCTTGTTGTATTCGGTGTTGAGCCCAAACTCTC ACTCCATGGCAATAACCCTACAGCAAGTCTTGAACAGTACTGGTTTAACAACAGTCCCAATAACGTTTTC TTTAACAACAGCAGTTAGCTCATTTAATCCTCATAAGGATCATATGAGGTAGGTAGCCTAAATAGCCCAT TTACACAGGGAAGTGGGAAGGAGAGAGGGTGCCCCCAAGGATGAGACACAAGCTGTTGCCACATCAGCAC TTTGCGCCTGGACGGTCCCCCAGTTGTCCTGGCTGCAGGCAGTCCGAACAGTCCGCTTCCTGGAATATTA GCCAGGCAGGATACGCCCTGGGCGACAGAAACTCCAACTTTCGCCAGCGGCCCCCAAGTACTGCCTGGGC GGTGGCGGGAGTCTGGAGCTTGGCTGAAGGCGCGAGCTGCCGACGCCGTCTCCTAGCAACCAAGCGGCGG TCACGTGACCCGCTCCAGCCCGTTTCACGTGGTCTTGAGCTGCGCTGGGGTTGGAGTGGCCGCAACGGGC GGGGCGGGGCGGGGCCGGGCAAGTTTGTTCCCCGAGTTCGGAGCCTAGGAGCCCCCCGCGGCTGCGGCGC AGGTGCCCTCGGCCTGAGTCGGGATGGAGCTGCCTGCTGTGAACCTGAAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| AGTRAP_1 ↗ | 1:11,736,136 | 正股 | 11,736,087–11,736,146 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_96MPK · enhancer · 11731461–11731895 · regulatory
ENSR1_96MPP · promoter · 11731896–11732326 · regulatory
ENSR1_54QHQR · CTCF_binding_site · 11732631–11732652 · regulatory
ENSR1_8CBGR · enhancer · 11732690–11732892 · regulatory
ENSR1_B4BTW · promoter · 11735594–11736185 · regulatory
ENSR1_96MQX · enhancer · 11736186–11736679 · regulatory
ENSR1_54QJDF · CTCF_binding_site · 11736225–11736246 · regulatory
ENSR1_54QJFK · CTCF_binding_site · 11736473–11736494 · regulatory
ENSR1_96MR4 · promoter · 11736680–11737180 · regulatory
ENSR1_B4BWL · enhancer · 11740407–11741252 · regulatory
· motif · 11732633–11732649 · motif
· motif · 11735493–11735507 · motif
· motif · 11735493–11735507 · motif
· motif · 11735828–11735839 · motif
· motif · 11736036–11736052 · motif
· motif · 11736036–11736052 · motif
· motif · 11736045–11736054 · motif
· motif · 11736045–11736054 · motif
· motif · 11736047–11736063 · motif
· motif · 11736227–11736243 · motif
· motif · 11736293–11736304 · motif
· motif · 11736465–11736478 · motif
· motif · 11736475–11736488 · motif
· motif · 11736475–11736491 · motif
· motif · 11736600–11736613 · motif
· motif · 11736613–11736620 · motif
· motif · 11736920–11736933 · motif
· motif · 11736924–11736933 · motif
· motif · 11736986–11737001 · motif
· motif · 11736986–11737001 · motif
· motif · 11736987–11737001 · motif
· motif · 11737162–11737171 · motif
· motif · 11737325–11737338 · motif
· motif · 11737425–11737436 · motif
· motif · 11737429–11737443 · motif
· motif · 11739007–11739020 · motif
· motif · 11740453–11740466 · motif
· motif · 11740453–11740466 · motif
· motif · 11740956–11740971 · motif
· motif · 11741058–11741067 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:159 aa
AGTRAP 蛋白質長 159 個胺基酸,具有三段螺旋跨膜區,分別位於第 24–44、56–76 與 87–107 位胺基酸。第 110–122 位胺基酸區域註記為與 AGTR1 互作;第 140–159 位則註記為無序區。這些區域註解未提供更細的結構或功能機制。
蛋白質三維結構
細胞內定位
AGTRAP 被記錄於內質網、高基氏體及胞質囊泡膜,並見於核周囊泡膜與胞內體囊泡。 資料將其描述為多次跨膜蛋白,但未指出不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 131 個夥伴
- ACSF2Q96CM8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ALDH18A1P54886 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AP3M1Q9Y2T2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ARAFQ96II5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARFIP2P53365 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- BPIFA2Q96DR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CAPNS1P04632 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD160O95971 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COQ8AQ8NI60 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- CRCT1Q9UGL9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDA1Q9BW61 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDX55Q8NHQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ECPASQ5VYK3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM114A1Q8IWE2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FARS2O95363 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FASTKD3Q14CZ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FATE1Q969F0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FHIP1BQ8N612 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPL2P60520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAD1Q8IVA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAD1Q99259 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- GAD2Q05329 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- GDNFP39905 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF3C1Q12789 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- H4C7Q99525 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
資料記載 AGTRAP 與 RACK1 互作,並與 AGTR1 的 C 端區域互作。來源未進一步說明這些互作是否構成特定複合體,或各自對 AGTRAP 功能的影響。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | AGTRAP 似乎是 type-1 angiotensin II receptor 訊號的負向調節因子,可能透過調節受體內化及受體去敏化機制(例如磷酸化)發揮作用。資料也指出,AGTRAP 會使細胞增殖與 angiotensin II 刺激的轉錄活性降低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Appears to be a negative regulator of type-1 angiotensin II receptor-mediated signaling by regulating receptor internalization as well as mechanism of receptor desensitization such as phosphorylation. Also induces a decrease in cell proliferation and angiotensin II-stimulated transcriptional activity PMID 12960423 ↗ |
| 交互作用 | AGTRAP 與 RACK1 互作,也與 AGTR1 的 C 端區域互作;此註記指出兩項互作對象,但未說明它們是否同屬一個複合體,或互作對功能造成何種影響。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | AGTRAP 被記錄為多次跨膜蛋白,位於內質網膜、高基氏體膜及胞質囊泡膜;另見於核周囊泡膜、內質網、高基氏體與胞內體囊泡。來源未描述定位變動的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Golgi apparatus membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Present in perinuclear vesicular membranes, Endoplasmic reticulum, Golgi and endocytic vesicles PMID 12960423 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AAGTTTGTTCCCCGAGTTCGGAGCCTAGGAGCCCCCCGCG40GCTGCGGCGCAGGTGCCCTCGGCCTGAGTCGGGATGGAGC80TGCCTGCTGTGAACCTGAAGGTGATTCTCCTAGGTCACTG120GCTGCTGACAACCTGGGGCTGCATTGTATTCTCAGGCTCC160TATGCCTGGGCCAACTTCACCATCCTGGCCTTGGGCGTGT200GGGCTGTGGCTCAGCGGGACTCCATCGACGCCATAAGCAT240GTTTCTGGGTGGCTTGCTGGCCACCATCTTCCTGGACATC280GTGCACATCAGCATCTTCTACCCGCGGGTCAGCCTCACGG320ACACGGGCCGCTTTGGCGTGGGCATGGCCATCCTCAGCTT360GCTGCTCAAGCCGCTCTCCTGCTGCTTCGTCTACCACATG400TACCGGGAGCGCGGGGGTGAGCTCCTGGTCCACACTGGTT440TCCTTGGGTCTTCTCAGGACCGTAGTGCCTACCAGACGAT480TGACTCAGCAGAGGCGCCCGCAGATCCCTTTGCAGTCCCA520GAGGGCAGGAGTCAAGATGCCCGAGGGTACTGAAGCCAGC560CACGCTGCGCCCGGCCCTGCCCCGGGCCTTCCTCGTGCCT600GGGAGGTCGTTCTAGGGATGCTCCTGACCTCCGTCTCTTG640GACCTAAGATGGAATGTGTCCCCAGCTCAGGGATTGCCTG680AACCAAGAGGCCAGGAGCCCCCATGGGCCGCCCAGTACCA720TGCACACTCCTGTCCCGAACTCCCTGAGGCCTCCCCTCCC760TTCAGGGCACCCACTGGTTCCCAGGCTGGAACCAGGGTCT800CTCTTTACCTCCTACCCCATGGTGGCACCACAGAGGCCCT840CAGCCGAGTCCTGCCTGAGTGTTGCAAGCTCAGGCCTTTA880AGGACTGCTGATGCCCCCTCAGGCCTCCCCCAAGTTTGCT920GGGCTTTGGTGGAAGCCCTGAGAGCTTCAGGTCCTGCTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。