基因總覽
ADIPOQ 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 adiponectin, C1Q and collagen domain containing,產物 adiponectin 為脂肪激素。其蛋白質具有 collagen-like 與 C1q 結構域,並可組成不同大小的多聚體。這些特性是認識其分子性質的基礎;其代謝與其他生物學作用則由下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000320741 ★ | 186,842,710–186,858,463 | 3 |
| ENST00000444204 | 186,842,674–186,858,463 | 4 |
| ENST00001142392 | 186,842,674–186,858,463 | 3 |
| ENST00000881747 | 186,845,493–186,858,463 | 3 |
| ENST00000956685 | 186,852,461–186,858,463 | 2 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
adiponectin 是參與脂肪代謝及胰島素敏感性調控的重要脂肪激素。與受體 ADIPOR1 或 ADIPOR2 結合後,具有直接抗糖尿病作用;此作用及其抗動脈粥樣硬化、抗發炎活性均標註為依相似性推定,並非此處列出的直接實驗證據。
在肝臟與骨骼肌中,adiponectin 可促進 AMPK 磷酸化與活化,進而增強葡萄糖利用及脂肪酸燃燒;這些作用同樣屬依相似性推定。來源亦指出,它可在多種組織(包括肝臟與巨噬細胞)負向調節 TNF 表現,並抵銷 TNF 的作用。
adiponectin 還能透過依賴 cAMP 的路徑抑制內皮細胞中的 NF-kappa-B 訊號傳遞。另有依相似性推定指出,它可能藉由結合並隔離多種生長因子,參與細胞生長、血管新生及組織重塑;其對不同生長因子的結合親和力,會隨低、中或高分子量複合體型態而異。這些作用顯示其功能涵蓋代謝調節及其他細胞過程,但來源對部分作用保留推定性質。
Promoter 與基因調控
>ADIPOQ ENST00000320741 GRCh38 chr3:186841710-186842810 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAAGAAAGTCCAAGGTGTTGAATGTTGCCACTTCAAGCCTAAACTTTCTAGGAACACCTAAGTGGGTGG CAGCTTCCAGTTCTCCAGGCTGCTTCTAGGCCAGAGCTGGGTTCCACAAGAGACAGAATAGGCATATATA TGCTTAAGGAACTGGAAAAACAGGCTCTCTCTCTCTCACAAACACACACACACACATACCAAGGTAGCTG TCAAAATGTTATCCGAAATTTTGGAACCAAAAAATCTTGAAAGATGGTATTCCAATATCACATTTTATGT AAGTTTTCTATTATATTAGATTCAAATTACGATTCGAGGCCACAAGCTTTAAGAATTCAGGGCCTTTTTA ACTTGCCAAGCCCCACACCACTCCAGGAACTTCCCCACACCCCAGTTCTCAGAATTCATGTGCAAGGTCT TTCCTAAATCCAGGGTCCAGGTCAGAGAGTGGAGGATGTGCTCTATTTCTTACCTGATTGCAGACCCCTC TGACAGTGCTCCCTTCTGAAGCACTCACTGTCTGAACGTACACAGTCTCAGACTTAATCATGCACAGTGA GCAAGACTGTGGTGTGATAATTGGCGTCCCTGACTTATTAGGGCAAATCTATGGGAGGGGGAGACCTCCT GGACCACTGAGCAATTAATTCATTTACATTAGGAAGTTTCTCCGTCAGATGCAGGAAAAAAATCTTGTTT TCCTGCTGTGGTTTTGACTTTTGCCCCATCTTCTGTTGCTGTTGTAGGAGGCAAAATAAGGGTCAAGGCC TGGAAACACAAGTGCTTTGACTGAAGCTCCACTTGGCTTCCGAAGCCCAAGCTGGGTTGTACCAGGTTCC CTAGGGTGCAGGCTGTGGGCAACTGCCAGGGACATGTGCCTGCCCACCGGCCTCTGGCCCTCACTGAGTT GGCCAATGGGAAATGACAATTGTGAGGTGGGGACTGCCTGCCCCCGTGAGTACCAGGCTGTTGAGGCTGG GCCATCTCCTCCTCACTTCCATTCTGACTGCAGTCTGTGGTTCTGATTCCATACCAGAGGGTAAGAGCAA TTCTGTGAAGTTCCAGGCTGGGTGGGGGATGCATGCATAGCCTCTGGCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ADIPOQ_1 ↗ | 3:186,842,710 | 正股 | 186,842,661–186,842,720 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_94Q6BH · enhancer · 186839860–186840231 · regulatory
ENSR3_87HBN3 · enhancer · 186841754–186841949 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:244 aa
adiponectin 長 244 個胺基酸,N 端第 1–18 位為訊號胜肽。第 42–107 位是 collagen-like 結構域;第 40–101 位另標註為無序區。C 端第 108–244 位為 C1q 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
adiponectin 被標註為分泌型蛋白質;此定位資料未指出其他條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 59 個夥伴
- AMIGO1Q86WK6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASGR2P07307-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BCL2L13Q9BXK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIKQ13323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BNIP3LO60238 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BSNDQ8WZ55 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BTNL9Q6UXG8-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAMLGP49069 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC107Q8WV48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD200R1Q8TD46-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN9O95484 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLEC10AQ8IUN9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLEC2DQ9UHP7-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNR2P34972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COQ9O75208 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPLX4Q7Z7G2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L1Q96BA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYBC1Q9BQA9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERP29P30040 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FASNP49327 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCGR1AP12314 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FKBP7Q9Y680 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
adiponectin 可形成同源三聚體、六聚體及 12 至 18 聚體。三聚體由 collagen-like 結構域的非共價三股螺旋作用,以及 C1q 結構域內的疏水作用組成;多個三聚體可進一步形成以雙硫鍵連結的六聚體及更大型複合體。較大型複合體的形成亦受 lysine 羥基化與糖基化程度調節。不同分子量型態與生長因子的結合有所差異:低、中及高分子量複合體均結合 HBEGF;中、高分子量型態結合 PDGFB;高分子量型態結合 FGF2。此外,adiponectin 透過 C1q 結構域與 CTRP9 形成異源三聚體複合體。
疾病與遺傳關聯
adiponectin deficiency(ADPOD)為常染色體顯性疾病,其特徵是血漿 adiponectin 濃度極低;來源指出此疾病由影響 ADIPOQ 的變異所致。肥胖時 adiponectin 濃度會降低,這種降低可能促成慢性發炎狀態,並與胰島素阻抗、第二型糖尿病、冠狀動脈疾病、心肌梗塞、非酒精性脂肪性肝炎及腎臟疾病相連。這些疾病關聯並未被表述為 adiponectin 降低必然造成相關疾病。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | adiponectin 與 ADIPOR1 或 ADIPOR2 結合後參與脂肪代謝及胰島素敏感性調控,並具有直接抗糖尿病作用;抗動脈粥樣硬化與抗發炎作用、促進肝臟及骨骼肌 AMPK 活化並增強葡萄糖利用和脂肪酸燃燒,均為依相似性推定。它也可負向調節多種組織中的 TNF 表現、抵銷 TNF 作用,並經 cAMP 依賴路徑抑制內皮 NF-kappa-B 訊號。另可能依複合體型態結合生長因子,參與細胞生長、血管新生與組織重塑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Important adipokine involved in the control of fat metabolism and insulin sensitivity upon binding to its receptors ADIPOR1 or ADIPOR2, with direct anti-diabetic effect. Also has anti-atherogenic and anti-inflammatory activities (By similarity). Stimulates AMPK phosphorylation and activation in the liver and the skeletal muscle, enhancing glucose utilization and fatty-acid combustion (By similarity). Antagonizes TNF by negatively regulating its expression in various tissues such as liver and macrophages, and also by counteracting its effects. Inhibits endothelial NF-kappa-B signaling through a cAMP-dependent pathway. May play a role in cell growth, angiogenesis and tissue remodeling by binding and sequestering various growth factors with distinct binding affinities, depending on the type of complex, LMW, MMW or HMW (By similarity) PMID 10982546 ↗ |
| 交互作用 | adiponectin 可形成三聚體、六聚體及 12 至 18 聚體。三聚體由 collagen-like 結構域的非共價三股螺旋作用及 C1q 結構域內的疏水作用組成;多個三聚體可連成雙硫鍵連結的六聚體與更大型複合體,其組裝受 lysine 羥基化及糖基化程度調節。不同分子量複合體結合 HBEGF、PDGFB 或 FGF2 的型態不同;adiponectin 也可經 C1q 結構域與 CTRP9 形成異源三聚體。 | 推論支持 | 證據與來源Homomultimer. Forms trimers, hexamers and 12- to 18-mers. The trimers (low molecular weight complexes / LMW) are assembled via non-covalent interactions of the collagen-like domains in a triple helix and hydrophobic interactions within the globular C1q domain. Several trimers can associate to form disulfide-linked hexamers (middle molecular weight complexes / MMW) and larger complexes (higher molecular weight / HMW). The HMW-complex assembly is also modulated by the degree of lysine hydroxylation and glycosylation. LMW, MMW and HMW complexes bind to HBEGF, MMW and HMW complexes bind to PDGFB, and HMW complex binds to FGF2. Interacts with CTRP9 via the C1q domain (heterotrimeric complex) |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | adiponectin deficiency(ADPOD)是常染色體顯性疾病,特徵為血漿 adiponectin 濃度極低,且由影響 ADIPOQ 的變異所致。肥胖者 adiponectin 濃度降低,可能促成慢性發炎,並與胰島素阻抗、第二型糖尿病、冠狀動脈疾病、心肌梗塞、非酒精性脂肪性肝炎及腎臟疾病相關;這些關聯不等同於 adiponectin 降低必然造成上述疾病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adiponectin deficiency ADPOD An autosomal dominant condition characterized by very low concentrations of plasma adiponectin. Levels of adiponectin are decreased in obesity and may contribute to a chronic state of inflammation that leads to insulin resistance, type 2 diabetes, coronary artery disease, myocardial infarction, non-alcoholic steatohepatitis, and kidney disease. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612556 PMID 10918532 ↗ · PMID 11812766 ↗ · PMID 12086969 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATTCTGACTGCAGTCTGTGGTTCTGATTCCATACCAGAGG40GGCTCAGGATGCTGTTGCTGGGAGCTGTTCTACTGCTATT80AGCTCTGCCCGGTCATGACCAGGAAACCACGACTCAAGGG120CCCGGAGTCCTGCTTCCCCTGCCCAAGGGGGCCTGCACAG160GTTGGATGGCGGGCATCCCAGGGCATCCGGGCCATAATGG200GGCCCCAGGCCGTGATGGCAGAGATGGCACCCCTGGTGAG240AAGGGTGAGAAAGGAGATCCAGGTCTTATTGGTCCTAAGG280GAGACATCGGTGAAACCGGAGTACCCGGGGCTGAAGGTCC320CCGAGGCTTTCCGGGAATCCAAGGCAGGAAAGGAGAACCT360GGAGAAGGTGCCTATGTATACCGCTCAGCATTCAGTGTGG400GATTGGAGACTTACGTTACTATCCCCAACATGCCCATTCG440CTTTACCAAGATCTTCTACAATCAGCAAAACCACTATGAT480GGCTCCACTGGTAAATTCCACTGCAACATTCCTGGGCTGT520ACTACTTTGCCTACCACATCACAGTCTATATGAAGGATGT560GAAGGTCAGCCTCTTCAAGAAGGACAAGGCTATGCTCTTC600ACCTATGATCAGTACCAGGAAAATAATGTGGACCAGGCCT640CCGGCTCTGTGCTCCTGCATCTGGAGGTGGGCGACCAAGT680CTGGCTCCAGGTGTATGGGGAAGGAGAGCGTAATGGACTC720TATGCTGATAATGACAATGACTCCACCTTCACAGGCTTTC760TTCTCTACCATGACACCAACTGATCACCACTAACTCAGAG800CCTCCTCCAGGCCAAACAGCCCCAAAGTCAATTAAAGGCT840TTCAGTACGGTTAGGAAGTTGATTATTATTTAGTTGGAGG880CCTTTAGATATTATTCATTCATTTACTCATTCATTTATTC920ATTCATTCATCGAGTAACTTTAAAAAAATCATATGCTATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。