基因總覽
ADGRG3(adhesion G protein-coupled receptor G3)是蛋白質編碼基因,產物亦稱 GPR97,屬於 G protein-coupled receptor 2 family 中的 Adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。其蛋白質長 549 個胺基酸,具有細胞外區域與七段跨膜螺旋,符合多次穿膜受體的特徵。細胞外部分包含 GAIN-B 結構域及 GPS 區域,並具有 Stachel 區段。ADGRG3 位於細胞膜,作為受體接收外部訊息,並與 G 蛋白訊號傳遞相連。其家族歸屬與細胞膜受體架構,構成理解其分子角色的基本背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000333493 ★ | 57,668,306–57,689,378 | 12 |
| ENST00000858859 | 57,668,272–57,689,378 | 10 |
| ENST00000945139 | 57,668,272–57,689,378 | 13 |
| ENST00001120294 | 57,668,272–57,689,378 | 3 |
| ENST00001127308 | 57,668,272–57,689,378 | 8 |
| ENST00001137411 | 57,668,272–57,689,378 | 12 |
| ENST00000450388 | 57,668,308–57,689,378 | 11 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ADGRG3 可作為多種糖皮質激素的受體,包括 cortisol、cortisone 與 11-deoxycortisol。配體結合會引起受體構形改變,進而啟動由鳥嘌呤核苷酸結合蛋白(G 蛋白)介導的訊號,調節下游效應分子。已報告 ADGRG3/GPR97 與 G(o)/GNAO1 偶聯,並透過抑制 adenylate cyclase 活性傳遞訊號。另有研究提出其可能透過 G-alpha(q)-proteins 傳遞訊號,但仍需要更多證據確認此結果是否適用於體內。
ADGRG3 也參與多種免疫相關過程的調節,包括 B 細胞發育、發炎與先天免疫。抗體與受體結合可促進抗微生物介質的產生與活化,例如活性氧(ROS)及 myeloperoxidase(MPO);在粒細胞中,這也與細菌攝取及殺菌能力增強相關。這些觀察顯示,ADGRG3 的訊號可連結受體辨識與免疫細胞的抗微生物反應。
在體外研究中,ADGRG3 透過小型 GTPase RhoA 與 CDC42 調節淋巴管內皮細胞的遷移。此外,ADGRG3 可與 protease-activated receptor 2(PAR2)協同,促進嗜中性球驅動的抗微生物反應及內皮細胞活化。這些功能指出 ADGRG3 涉及免疫反應及細胞行為的調節;其中淋巴管內皮細胞遷移的證據來自體外實驗,相關結果不應直接視為已確認的體內作用。
Promoter 與基因調控
>ADGRG3 ENST00000333493 GRCh38 chr16:57667306-57668406 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACACCTTGGTGGGATGCCCTTCACCTTCCAATTGCCAAGTGGCCATGGCCTCATGCACAGTGCATCCGTG GGGCCTCCAGAGTTGGCCCGAGTGGCTGGCGCCCTAATTCCTTTAGGCTGAAGCCCAGGAGTGTTTGCCA CCCCCACCTCCCACCTGATCAGTGACCATTTGGGGTGTAAAGACAACAATTTCACAGCTCTGATGATCAG AAATGATGTAATGGCCACAGGCGGCTCCGCCTGCGTCATCCATGATTTCATCACACACCTCGGGAGGCTC AGGGTGACAGACAGTGCATGCAAGGTCACCCGGCCAGGAAGTGGCCAGGATGGATGTTAGCTCAGGCCTG ACCAGCCCCCGGGGCCGCACTGCTGTCTTCCCGCTACCCTGCCTCTGGGTCCGTCCTGTTATCCAGGCTG GTGGGGGAAGCTCAGGCTGCAGGGCCAGCTCCTGCTCTCCTCCCACACCCTCCAGCCTGGTTCAAGCCAT AGGCACCATCTGGGTCTTCGTCCTCATGCCCAGAGCCAGGCTCTGTGCCCAGCTTGTTGCAGGTCTCATC AAACCCTGACACAGCCTTAGGAGGCAGCCCCATTGCCATCTTCACTTTACAGAGGAGGAAACTGAGGCTC AGAGAGGCTCCCAGCTTGTGAGAGGAGGGGTCTGAGTAGGTGCGCCTGACTCCAAAGCCTGTGCTCACCA CAGTTCCCAGGGATCCGCTCTGAGCCAGGCCCCTGTGGCCACCCAGCCCCTAGCCCCGTAGATCCCACCC CAGTGGGGCCCCGGGGGCACATACCTGGGTGGGCTCAGCAGCTCCCTCTGCAGGTGGACCCAGGGTGCGG TGAGACTGGGAGCACTGCCCAGTTCCCCACACTCACCTTTCACAACCCAACCAATGGCGCCATCGAGCAG GAAGGGTGAGAAAGAGGACACAGGAAGCCAGAGTGGTGGGGCTGCAGGGTGGGGGCAGGCCAGCTCAGCA GAGCCTGGGGCCAGAGGGCCAGACAGCCACAGAGCTCCTGGCGTGGGCAAGGCTGGCCAAGGATGGCGAC GCCCAGGGGCCTGGGGGCCCTGCTCCTGCTCCTCCTGCTCCCGACCTCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ADGRG3_1 ↗ | 16:57,668,306 | 正股 | 57,668,257–57,668,316 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_83NQZS · enhancer · 57666430–57666645 · regulatory
ENSR16_83NR2B · enhancer · 57667221–57667457 · regulatory
ENSR16_9SW28 · promoter · 57667458–57667958 · regulatory
ENSR16_5HK883 · CTCF_binding_site · 57668113–57668134 · regulatory
ENSR16_83NR2S · promoter · 57668142–57668318 · regulatory
ENSR16_83NR3K · enhancer · 57669442–57669627 · regulatory
· motif · 57667605–57667617 · motif
· motif · 57668115–57668131 · motif
來源指出 ADGRG3 與發炎條件相關,但未提供其表現量或活性如何隨發炎變化的具體調控方式。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:549 aa
ADGRG3 蛋白質長 549 個胺基酸,含七段跨膜螺旋;其 N 端包含訊號胜肽,細胞外區域具有 GAIN-B 結構域、GPS 區域及 Stachel 區段。GAIN-B 與 GPS 的註解來自規則資料,Stachel 區段則依相似性註解。蛋白質屬於 G protein-coupled receptor 2 family 的 Adhesion G protein-coupled receptor 亞家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ADGRG3 被註解為細胞膜上的多次穿膜蛋白;來源未描述其定位會隨條件改變,也未提供異構型間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- ARLNQ8WVX3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP6V0BQ99437 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTXN3Q4LDR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GIMAP5Q96F15 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHFPL5Q8TAF8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLP1P60201-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPRMQ9NS64 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEC22AQ96IW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEX264Q9Y6I9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTMPQ5BVD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UPK2O00526 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VSTM1Q6UX27-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ADGRG3 經蛋白水解處理後形成兩條鏈;大型細胞外 N 端片段與膜結合的 C 端片段通常仍以非共價方式相連,此描述標示為相似性推定。ADGRG3 與 PRTN3 有交互作用,且此交互作用會誘導 PAR2 活化;另在 GNAO1 棕櫚醯化時,ADGRG3 可與之交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ADGRG3 是可辨識 cortisol、cortisone 與 11-deoxycortisol 等糖皮質激素的黏附型 G 蛋白偶聯受體。配體結合引起構形改變,促發 G 蛋白訊號並調節 adenylate cyclase;ADGRG3/GPR97 與 G(o)/GNAO1 偶聯且抑制 adenylate cyclase。其可能另經 G-alpha(q)-proteins 傳訊,但體內證據尚待確認。ADGRG3 參與 B 細胞發育、發炎及先天免疫調節;在體外透過 RhoA、CDC42 調控淋巴管內皮細胞遷移。抗體結合可促進 ROS、MPO 活化及粒細胞攝菌與殺菌,並可與 PAR2 協同促進嗜中性球抗微生物反應及內皮細胞活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adhesion G protein-coupled receptor (aGPCR) for glucocorticoid hormones such as cortisol, cortisone and 11-deoxycortisol. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors, such as adenylate cyclase. ADGRG3/GPR97 is coupled to G(o)/GNAO1 G proteins and mediates signaling by inhibiting adenylate cyclase activity. May also signal through G-alpha(q)-proteins; additional evidence are however required to confirm this result in vivo. Plays a role in the regulation of various processes including B-cell development, inflammation or innate immunity. Regulates migration of lymphatic endothelial cells in vitro via the small GTPases RhoA and CDC42. Antibody ligation leads to the production and activation of antimicrobial mediators like reactive oxygen species (ROS) and myeloperoxidase (MPO) as well as enhanced bacteria uptake and killing by granulocytes. Additionally, collaborates with protease-activated receptor 2/PAR2 to stimulate neutrophil-driven antimicrobial responses and endothelial cell activation PMID 22575658 ↗ · PMID 24178298 ↗ · PMID 30559745 ↗ · PMID 33408414 ↗ · PMID 36302784 ↗ |
| 交互作用 | ADGRG3 經蛋白水解處理形成兩條鏈;大型細胞外 N 端片段與膜結合的 C 端片段通常仍以非共價方式相連,此組成描述為相似性推定。ADGRG3 與 PRTN3 交互作用可誘導 PAR2 活化;此外,當 GNAO1 經棕櫚醯化時,ADGRG3 會與其交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer of 2 chains generated by proteolytic processing; the large extracellular N-terminal fragment and the membrane-bound C-terminal fragment predominantly remain associated and non-covalently linked (By similarity). Interacts with PRTN3; this interaction induces the activation of PAR2. Interacts with GNAO1 (when palmitoylated) PMID 33408414 ↗ · PMID 36302784 ↗ |
| 細胞定位 | ADGRG3 被註解為細胞膜上的多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | ADGRG3 與發炎條件相關;此項敘述未進一步說明其調控方向或具體機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACAGCCACAGAGCTCCTGGCGTGGGCAAGGCTGGCCAA40GGATGGCGACGCCCAGGGGCCTGGGGGCCCTGCTCCTGCT80CCTCCTGCTCCCGACCTCAGGTCAGGAAAAGCCCACCGAA120GGGCCAAGAAACACCTGCCTGGGGAGCAACAACATGTACG160ACATCTTCAACTTGAATGACAAGGCTTTGTGCTTCACCAA200GTGCAGGCAGTCGGGCAGCGACTCCTGCAATGTGGAAAAC240TTGCAGAGATACTGGCTAAACTACGAGGCCCATCTGATGA280AGGAAGGTTTGACGCAGAAGGTGAACACGCCTTTCCTGAA320GGCTTTGGTCCAGAACCTCAGCACCAACACTGCAGAAGAC360TTCTATTTCTCTCTGGAGCCCTCTCAGGTTCCGAGGCAGG400TGATGAAGGACGAGGACAAGCCCCCTGACAGAGTGCGACT440TCCCAAGAGCCTTTTTCGATCCCTGCCAGGCAACAGGTCT480GTGGTCCGCTTGGCCGTCACCATTCTGGACATTGGTCCAG520GGACTCTCTTCAAGGGCCCCCGGCTCGGCCTGGGAGATGG560CAGCGGCGTGTTGAACAATCGCCTGGTGGGTTTGAGTGTG600GGACAAATGCATGTCACCAAGCTGGCTGAGCCTCTGGAGA640TCGTCTTCTCTCACCAGCGACCGCCCCCTAACATGACCCT680CACCTGTGTATTCTGGGATGTGACTAAAGGGACCACTGGA720GACTGGTCTTCTGAGGGCTGCTCCACGGAGGTCAGACCTG760AGGGGACCGTGTGCTGCTGTGACCACCTGACCTTTTTCGC800CCTGCTCCTGAGACCCACCTTGGACCAGTCCACGGTGCAT840ATCCTCACACGCATCTCCCAGGCGGGCTGTGGGGTCTCCA880TGATCTTCCTGGCCTTCACCATTATTCTTTATGCCTTTCT920GAGGCTTTCCCGGGAGAGGTTCAAGTCAGAAGATGCCCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。