基因總覽
ADGRA3 是蛋白質編碼基因,產物 adhesion G protein-coupled receptor A3 屬於 G protein-coupled receptor 2 family 中的 adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。此受體長 1,321 個胺基酸,具有大型細胞外區域、七個跨膜螺旋,以及延伸的細胞質區域。細胞外部分包含多個 LRR、LRRCT、Ig-like 與 GAIN-B 結構域;GAIN-B 區域內標註有 GPS。這些序列與結構特徵描繪出 ADGRA3 作為黏附型 G protein-coupled receptor 的基本架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000334304 ★ | 22,387,376–22,516,066 | 19 |
| ENST00001115902 | 22,382,767–22,516,131 | 19 |
| ENST00000878436 | 22,387,376–22,516,131 | 18 |
| ENST00001029712 | 22,387,376–22,516,131 | 19 |
| ENST00001134779 | 22,387,376–22,516,131 | 19 |
| ENST00000878435 | 22,387,377–22,516,131 | 18 |
| ENST00001059943 | 22,387,377–22,516,131 | 18 |
| ENST00000878434 | 22,387,380–22,516,131 | 19 |
| ENST00001115903 | 22,392,065–22,516,131 | 17 |
| ENST00001059945 | 22,395,854–22,516,131 | 17 |
| ENST00001108903 | 22,400,529–22,516,131 | 16 |
| ENST00001108904 | 22,411,989–22,516,131 | 14 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ADGRA3 的功能資料將其描述為孤兒受體,表示目前提供的資訊未指定其配體。資料指出它可能在平面細胞極性路徑中發揮作用;這項敘述保留「可能」的限定,並未進一步界定它在路徑中的具體位置、作用方式或調控方向。
平面細胞極性路徑是來源所連結的生物學脈絡,但現有註記沒有說明 ADGRA3 是否直接參與訊號傳遞、如何影響細胞極性,或其作用發生於何種細胞與條件。因此,對 ADGRA3 的功能理解應限於它是可能參與該路徑的孤兒受體;不能據此推定特定配體、下游分子機制或細胞層級的結果。
Promoter 與基因調控
>ADGRA3 ENST00000334304 GRCh38 chr4:22515966-22517066 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAGGCCAAAGGTTTGGATCTGACTCTTTCCCACCTGCCATGTTTCAGGGAGAAACTCCAAGGTGTCTGA GAATCCTGCTTACAAACCTTCCAGGTTGTTATGAAGGTAATTTCTCAAGGCAGGAGCACAGAATATATTT TATTAGCATGATATAGTCCTTGTAAAATTTTAAACATAGGGTAGGTAAGCCCTGGGCTTGCAAATGTTAG GGCGAGGCTGGAAGTCAGAGTAATCAATTCTGTTGGGGTTTCTTGGAGGGTTTGCTCATTATTGCTCGAA CTGGTGAACATCTCAAGTATCTTTGCCTGTCGAATTTCTTTCAAAAGGCTGCCTTTCTAGTGAGGTCCAG ATGCATCCTTTAGAGACCATCGCTGTTGTTGCTGAAGGCCAGAAACAGCTTCAGATTGTTCACTGTATTG AAGAGGAACCTGTTTACTGGCTCCAGTGTATTTGGGACAAATAAGACTACCATAATGAGGTGAGAAGGCG ATTCCTTCCGAAACACTTGGTTTTGGGTACTTTTCCCATAGGGTTGGTCAGGGAAATTCCCTACTCTCGT CCCTACTCCATCCTCCGGGCCAGGCTCCTTGGGCCACATGGGCAGTCTCCAGGAGCGCACAAGACTGCTT TGTCCTGTGCCCGCGGTGCGAGCGCGGTGGCGGCGAAGGGAAACGAGCAGGAGAGTGGCCACCGCGGGTG GAGTTTGGACTCGAACTTTCCTCCGTTCGGACTCGAACTTTCCTCCGTTCTCTCTACGAGTTACTGCCTT CCCGCGGGCTCCCCACAACTCCTGCCCGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCACCGGGTCGGAGTCGGGCTCG GCAGGTCCCGGGAGCGCGCGCCTCCTCCCCGAGGTCCCGGGCAGCTGCAGACACGGGGAGAGCAGGAGAG CCGGGAAAGAGGAGGGGAAGGGGCGGGGGCGGCCGCCGGCGGCGGGCGGGGAGGAGCCGCCGCGCGCGGG TCCTGGCCAGGGGAGGAGGCAGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGCGGTGCTCGCGC CGGGCGGTAGAGCGGCGCTGGGACCCATGCGGCCGTGACCCCCGGCTCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ADGRA3_2 ↗ | 4:22,443,135 | 負股 | 22,443,125–22,443,184 |
| ADGRA3_1 ↗ | 4:22,516,066 | 負股 | 22,516,056–22,516,115 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_579ZMK · CTCF_binding_site · 22515305–22515326 · regulatory
ENSR4_579ZN2 · CTCF_binding_site · 22515401–22515422 · regulatory
ENSR4_B6GMK · promoter · 22515987–22516556 · regulatory
· motif · 22513374–22513389 · motif
· motif · 22513379–22513391 · motif
· motif · 22513382–22513389 · motif
· motif · 22513730–22513745 · motif
· motif · 22513735–22513747 · motif
· motif · 22513738–22513745 · motif
· motif · 22513759–22513771 · motif
· motif · 22513762–22513769 · motif
· motif · 22515230–22515239 · motif
· motif · 22515230–22515239 · motif
· motif · 22515307–22515323 · motif
· motif · 22515372–22515388 · motif
· motif · 22515372–22515388 · motif
· motif · 22515403–22515419 · motif
· motif · 22515629–22515642 · motif
· motif · 22515629–22515642 · motif
· motif · 22515892–22515902 · motif
· motif · 22515959–22515972 · motif
· motif · 22515959–22515972 · motif
· motif · 22515975–22515982 · motif
· motif · 22516320–22516335 · motif
· motif · 22516342–22516357 · motif
· motif · 22516355–22516369 · motif
· motif · 22516355–22516370 · motif
· motif · 22516355–22516370 · motif
· motif · 22517018–22517040 · motif
· motif · 22517018–22517040 · motif
· motif · 22517167–22517179 · motif
· motif · 22518201–22518214 · motif
· motif · 22518201–22518214 · motif
· motif · 22518285–22518296 · motif
· motif · 22521038–22521050 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1321 aa
adhesion G protein-coupled receptor A3 長 1,321 個胺基酸,含七個跨膜螺旋;N 端具有訊號序列,並以大型細胞外區域為主。此區域標註 LRR 重複、LRRCT、Ig-like 與 GAIN-B 結構域,並包含 GPS 區域。C 端細胞質區域延伸至蛋白質末端,部分片段被註記為無序區;末端另有 PDZ-binding motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ADGRA3 被註記為膜蛋白,且屬於多次跨膜蛋白;其序列特徵包括七個跨膜螺旋。 現有定位資料未提供細胞條件、定位變化或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ADGRA3 透過其 PDZ-binding motif 與 DLG1 互作。此註記支持兩者之間的互作關係,但未進一步說明互作是否構成特定複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ADGRA3 被描述為孤兒受體,並可能參與平面細胞極性路徑。此註記未指出其配體,也未界定它在該路徑中的具體作用方式,因此相關功能仍屬可能性,而非已明確描述的機制。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | ADGRA3 可透過 PDZ-binding motif 與 DLG1 互作。資料指出互作所涉及的受體區域,但未提供此關係是否形成特定複合體或造成何種功能結果的資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ADGRA3 被註記為膜上的多次跨膜蛋白;此定位描述未提供細胞條件、定位變化或不同異構型間的差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGCG40GTGCTCGCGCCGGGCGGTAGAGCGGCGCTGGGACCCATGC80GGCCGTGACCCCCGGCTCCCTAGAGGCCCAGCGCAGCCGC120AGCGGACAAAGGAGCATGTCCGCGCCGGGGAAGGCCCGTC160CTCCGGCCGCCATAAGGCTCCGGTCGCCGCTGGGCCCGCG200CCGCGCTCCTGCCCGCCCGGGCTCCGGGGCGGCCCGCTAG240GCCAGTGCGCCGCCGCTCGCCCCGCAGGCCCCGGCCCGCA280GCATGGAGCCACCCGGACGCCGGCGGGGCCGCGCGCAGCC320GCCGCTGTTGCTGCCGCTCTCGCTGTTAGCGCTGCTCGCG360CTGCTGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCGCGGCGCTGC400CCGCCGGCTGCAAGCACGATGGGCGGCCCCGAGGGGCTGG440CAGGGCGGCGGGCGCCGCCGAGGGCAAGGTGGTGTGCAGC480AGCCTGGAACTCGCGCAGGTCCTGCCCCCAGATACTCTGC520CCAACCGCACGGTCACCCTGATTCTGAGTAACAATAAGAT560ATCCGAGCTGAAGAATGGCTCATTTTCTGGGTTAAGTCTC600CTTGAAAGATTGGACCTCCGAAACAATCTTATTAGTAGTA640TAGATCCAGGTGCCTTCTGGGGACTGTCATCTCTAAAAAG680ATTGGATCTGACAAACAATCGAATAGGATGTCTGAATGCA720GACATATTTCGAGGACTCACCAATCTGGTTCGGCTAAACC760TTTCGGGGAATTTGTTTTCTTCATTATCTCAAGGAACTTT800TGATTATCTTGCGTCATTACGGTCTTTGGAATTCCAGACT840GAGTATCTTTTGTGTGACTGTAACATACTGTGGATGCATC880GCTGGGTAAAGGAGAAGAACATCACGGTACGGGATACCAG920GTGTGTTTATCCTAAGTCACTGCAGGCCCAACCAGTCACA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。