演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ADGRA3FLJ38547

adhesion G protein-coupled receptor A3

ADGRA3 編碼 adhesion G protein-coupled receptor A3,屬於 adhesion G protein-coupled receptor 家族;資料指出它可能參與平面細胞極性路徑。

Homo sapiens4p15.2UniProt Q8IWK6
OFFICIAL SYMBOL
ADGRA3
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q8IWK6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ADGRA3 是蛋白質編碼基因,產物 adhesion G protein-coupled receptor A3 屬於 G protein-coupled receptor 2 family 中的 adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。此受體長 1,321 個胺基酸,具有大型細胞外區域、七個跨膜螺旋,以及延伸的細胞質區域。細胞外部分包含多個 LRR、LRRCT、Ig-like 與 GAIN-B 結構域;GAIN-B 區域內標註有 GPS。這些序列與結構特徵描繪出 ADGRA3 作為黏附型 G protein-coupled receptor 的基本架構。

Official symbol
ADGRA3
Gene name
adhesion G protein-coupled receptor A3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13839
UniProt
Q8IWK6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ38547PGR21GPR125

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44p15.2
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25ADGRA3pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:22,345,071–22,516,131
Gene span
171,061 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000334304 ★22,387,376–22,516,06619
ENST0000111590222,382,767–22,516,13119
ENST0000087843622,387,376–22,516,13118
ENST0000102971222,387,376–22,516,13119
ENST0000113477922,387,376–22,516,13119
ENST0000087843522,387,377–22,516,13118
ENST0000105994322,387,377–22,516,13118
ENST0000087843422,387,380–22,516,13119
ENST0000111590322,392,065–22,516,13117
ENST0000105994522,395,854–22,516,13117
ENST0000110890322,400,529–22,516,13116
ENST0000110890422,411,989–22,516,13114

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ADGRA3 的功能資料將其描述為孤兒受體,表示目前提供的資訊未指定其配體。資料指出它可能在平面細胞極性路徑中發揮作用;這項敘述保留「可能」的限定,並未進一步界定它在路徑中的具體位置、作用方式或調控方向。

平面細胞極性路徑是來源所連結的生物學脈絡,但現有註記沒有說明 ADGRA3 是否直接參與訊號傳遞、如何影響細胞極性,或其作用發生於何種細胞與條件。因此,對 ADGRA3 的功能理解應限於它是可能參與該路徑的孤兒受體;不能據此推定特定配體、下游分子機制或細胞層級的結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22516066 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ADGRA3 ENST00000334304 GRCh38 chr4:22515966-22517066 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAGGCCAAAGGTTTGGATCTGACTCTTTCCCACCTGCCATGTTTCAGGGAGAAACTCCAAGGTGTCTGA
GAATCCTGCTTACAAACCTTCCAGGTTGTTATGAAGGTAATTTCTCAAGGCAGGAGCACAGAATATATTT
TATTAGCATGATATAGTCCTTGTAAAATTTTAAACATAGGGTAGGTAAGCCCTGGGCTTGCAAATGTTAG
GGCGAGGCTGGAAGTCAGAGTAATCAATTCTGTTGGGGTTTCTTGGAGGGTTTGCTCATTATTGCTCGAA
CTGGTGAACATCTCAAGTATCTTTGCCTGTCGAATTTCTTTCAAAAGGCTGCCTTTCTAGTGAGGTCCAG
ATGCATCCTTTAGAGACCATCGCTGTTGTTGCTGAAGGCCAGAAACAGCTTCAGATTGTTCACTGTATTG
AAGAGGAACCTGTTTACTGGCTCCAGTGTATTTGGGACAAATAAGACTACCATAATGAGGTGAGAAGGCG
ATTCCTTCCGAAACACTTGGTTTTGGGTACTTTTCCCATAGGGTTGGTCAGGGAAATTCCCTACTCTCGT
CCCTACTCCATCCTCCGGGCCAGGCTCCTTGGGCCACATGGGCAGTCTCCAGGAGCGCACAAGACTGCTT
TGTCCTGTGCCCGCGGTGCGAGCGCGGTGGCGGCGAAGGGAAACGAGCAGGAGAGTGGCCACCGCGGGTG
GAGTTTGGACTCGAACTTTCCTCCGTTCGGACTCGAACTTTCCTCCGTTCTCTCTACGAGTTACTGCCTT
CCCGCGGGCTCCCCACAACTCCTGCCCGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCACCGGGTCGGAGTCGGGCTCG
GCAGGTCCCGGGAGCGCGCGCCTCCTCCCCGAGGTCCCGGGCAGCTGCAGACACGGGGAGAGCAGGAGAG
CCGGGAAAGAGGAGGGGAAGGGGCGGGGGCGGCCGCCGGCGGCGGGCGGGGAGGAGCCGCCGCGCGCGGG
TCCTGGCCAGGGGAGGAGGCAGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGCGGTGCTCGCGC
CGGGCGGTAGAGCGGCGCTGGGACCCATGCGGCCGTGACCCCCGGCTCCCT
ADGRA3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ADGRA3_2 ↗4:22,443,135負股22,443,125–22,443,184
ADGRA3_1 ↗4:22,516,066負股22,516,056–22,516,115

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_579ZMK · CTCF_binding_site · 22515305–22515326 · regulatory

ENSR4_579ZN2 · CTCF_binding_site · 22515401–22515422 · regulatory

ENSR4_B6GMK · promoter · 22515987–22516556 · regulatory

· motif · 22513374–22513389 · motif

· motif · 22513379–22513391 · motif

· motif · 22513382–22513389 · motif

· motif · 22513730–22513745 · motif

· motif · 22513735–22513747 · motif

· motif · 22513738–22513745 · motif

· motif · 22513759–22513771 · motif

· motif · 22513762–22513769 · motif

· motif · 22515230–22515239 · motif

· motif · 22515230–22515239 · motif

· motif · 22515307–22515323 · motif

· motif · 22515372–22515388 · motif

· motif · 22515372–22515388 · motif

· motif · 22515403–22515419 · motif

· motif · 22515629–22515642 · motif

· motif · 22515629–22515642 · motif

· motif · 22515892–22515902 · motif

· motif · 22515959–22515972 · motif

· motif · 22515959–22515972 · motif

· motif · 22515975–22515982 · motif

· motif · 22516320–22516335 · motif

· motif · 22516342–22516357 · motif

· motif · 22516355–22516369 · motif

· motif · 22516355–22516370 · motif

· motif · 22516355–22516370 · motif

· motif · 22517018–22517040 · motif

· motif · 22517018–22517040 · motif

· motif · 22517167–22517179 · motif

· motif · 22518201–22518214 · motif

· motif · 22518201–22518214 · motif

· motif · 22518285–22518296 · motif

· motif · 22521038–22521050 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1321 aa

1 aa1321 aa結構域功能區域基序重複區訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q8IWK6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

adhesion G protein-coupled receptor A3 長 1,321 個胺基酸,含七個跨膜螺旋;N 端具有訊號序列,並以大型細胞外區域為主。此區域標註 LRR 重複、LRRCT、Ig-like 與 GAIN-B 結構域,並包含 GPS 區域。C 端細胞質區域延伸至蛋白質末端,部分片段被註記為無序區;末端另有 PDZ-binding motif。

訊號胜肽1–33 aa
拓樸區域Extracellular34–761 aa
跨膜區Helical; Name=1762–782 aa
拓樸區域Cytoplasmic783–796 aa
跨膜區Helical; Name=2797–817 aa
拓樸區域Extracellular818–826 aa
跨膜區Helical; Name=3827–847 aa
拓樸區域Cytoplasmic848–876 aa
跨膜區Helical; Name=4877–897 aa
拓樸區域Extracellular898–919 aa
跨膜區Helical; Name=5920–940 aa
拓樸區域Cytoplasmic941–996 aa
跨膜區Helical; Name=6997–1017 aa
拓樸區域Extracellular1018–1024 aa
跨膜區Helical; Name=71025–1045 aa
拓樸區域Cytoplasmic1046–1321 aa
重複區LRR 182–103 aa
重複區LRR 2106–127 aa
重複區LRR 3130–151 aa
重複區LRR 4154–175 aa
結構域LRRCT187–237 aa
結構域Ig-like242–340 aa
結構域GAIN-B583–750 aa
重複區LRR 5594–620 aa
功能區域GPS701–750 aa
功能區域Disordered1073–1094 aa
功能區域Disordered1198–1219 aa
功能區域Disordered1231–1265 aa
功能區域Disordered1294–1321 aa
基序PDZ-binding1319–1321 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8IWK6…

AlphaFold · Q8IWK6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

ADGRA3 被註記為膜蛋白,且屬於多次跨膜蛋白;其序列特徵包括七個跨膜螺旋。 現有定位資料未提供細胞條件、定位變化或異構型差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 18 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ38547ADGRA3APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX2MAGI1MAGI2MPDZPATJPDZK1SCRIBTJP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ADGRA3 透過其 PDZ-binding motif 與 DLG1 互作。此註記支持兩者之間的互作關係,但未進一步說明互作是否構成特定複合體,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ADGRA3 被描述為孤兒受體,並可能參與平面細胞極性路徑。此註記未指出其配體,也未界定它在該路徑中的具體作用方式,因此相關功能仍屬可能性,而非已明確描述的機制。推論支持
證據與來源

Orphan receptor that may have a role in planar cell polarity pathway

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ADGRA3 可透過 PDZ-binding motif 與 DLG1 互作。資料指出互作所涉及的受體區域,但未提供此關係是否形成特定複合體或造成何種功能結果的資訊。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via PDZ-binding motif) with DLG1

PMID 15021905 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ADGRA3 被註記為膜上的多次跨膜蛋白;此定位描述未提供細胞條件、定位變化或不同異構型間的差異。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000334304 · 4,577 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGCG40
41GTGCTCGCGCCGGGCGGTAGAGCGGCGCTGGGACCCATGC80
81GGCCGTGACCCCCGGCTCCCTAGAGGCCCAGCGCAGCCGC120
121AGCGGACAAAGGAGCATGTCCGCGCCGGGGAAGGCCCGTC160
161CTCCGGCCGCCATAAGGCTCCGGTCGCCGCTGGGCCCGCG200
201CCGCGCTCCTGCCCGCCCGGGCTCCGGGGCGGCCCGCTAG240
241GCCAGTGCGCCGCCGCTCGCCCCGCAGGCCCCGGCCCGCA280
281GCATGGAGCCACCCGGACGCCGGCGGGGCCGCGCGCAGCC320
321GCCGCTGTTGCTGCCGCTCTCGCTGTTAGCGCTGCTCGCG360
361CTGCTGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCGCGGCGCTGC400
401CCGCCGGCTGCAAGCACGATGGGCGGCCCCGAGGGGCTGG440
441CAGGGCGGCGGGCGCCGCCGAGGGCAAGGTGGTGTGCAGC480
481AGCCTGGAACTCGCGCAGGTCCTGCCCCCAGATACTCTGC520
521CCAACCGCACGGTCACCCTGATTCTGAGTAACAATAAGAT560
561ATCCGAGCTGAAGAATGGCTCATTTTCTGGGTTAAGTCTC600
601CTTGAAAGATTGGACCTCCGAAACAATCTTATTAGTAGTA640
641TAGATCCAGGTGCCTTCTGGGGACTGTCATCTCTAAAAAG680
681ATTGGATCTGACAAACAATCGAATAGGATGTCTGAATGCA720
721GACATATTTCGAGGACTCACCAATCTGGTTCGGCTAAACC760
761TTTCGGGGAATTTGTTTTCTTCATTATCTCAAGGAACTTT800
801TGATTATCTTGCGTCATTACGGTCTTTGGAATTCCAGACT840
841GAGTATCTTTTGTGTGACTGTAACATACTGTGGATGCATC880
881GCTGGGTAAAGGAGAAGAACATCACGGTACGGGATACCAG920
921GTGTGTTTATCCTAAGTCACTGCAGGCCCAACCAGTCACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。