基因總覽
ADGRA1 的正式名稱為 adhesion G protein-coupled receptor A1,屬於蛋白質編碼基因。其蛋白質歸入 G protein-coupled receptor 2 family,並屬 Adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。現有資料將其描述為孤兒受體,未提供已知配體或更具體的生物學角色,因此不宜據此推定其作用機制。蛋白質註解顯示此產物由 560 個胺基酸組成,含七段跨膜螺旋,並具有細胞外與細胞質區域;細胞質端延伸至蛋白質末端。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000392607 ★ | 133,087,924–133,131,675 | 7 |
| ENST00001123129 | 133,087,814–133,107,383 | 6 |
| ENST00001141384 | 133,087,814–133,131,675 | 7 |
| ENST00000864054 | 133,088,191–133,131,675 | 6 |
| ENST00000392606 | 133,102,246–133,131,675 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前提供的功能資料僅將 ADGRA1 標示為孤兒受體。這表示資料未列出其已知配體或更細緻的功能描述,不能僅憑受體的家族歸屬推定其結合對象、訊號傳遞方式或參與的生物學過程。因此,現有來源尚不足以說明 ADGRA1 如何作用,或其作用對細胞與生理功能具有何種意義。
Promoter 與基因調控
>ADGRA1 ENST00000392607 GRCh38 chr10:133086924-133088024 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTCTGTGAGTCTTCATGACAACCTCCCAATAGTACATCCTTCAGGCCCCTCAAAATCCATGGCAGCAGG GCCTGGGGACCCCCTGAACAGGCGCCAGTGTCACAGAACCTGGGGCAGAAGTAGCCATGCAAGGGTGGAG GCCAAGGAGGGAACAGGTGGAGGGGTGTGGGGTCACCCAGGGCCAAAGGGGGAACAGGTGGAGGGGTGTG GGGTCACCCAGGGCCAAAGGGGGAACAGGTGGAGGGGTGTGGAGTCCCCCAGGGCAGTTCCTGAGACTCT TGCTGAGGCTGCCACCAGGCCAGCACGTGCCCCAGAAAACGGAGTTTGTGACGAAAACTGGAGTGGACTT GGACCCACCTTGTCGGGTAGGAGGCCCCTTGGGGCAGGATAGGGACCTGTGGGATGTGTGCAGAGCCCAA ACCTCGCTGCGGGTGGGAGGCTGGGCTGCGCCGCCCCTGGCACCCTGGCCTCCACACTCGCCTTGGCTCT GGATGCCCAGCTCTGTGGCCCAGGATGCAGGAGGGTTGGGGTAGGGGGACAGGGACGCTTTCTGCACAGC CACAGGCCCTGTCTGTCTACACCGGCTGCGGCTGCCCTGCTGACTCACACTCAGACGGGTTCACGACAGG TGCACCTCGGTTCTGGCATATCTGGACTTGAGAATGTTAAATAAAGGATGGAAAATTCCTTCCAAATCCA TTTTCTTGTGTATATTTCTGTTCCTGCAGCTTCTCCACGGATGGAGATTGTCTTTGGGAATAACACAGGG TCGTGCAGTCCGCCCGGCGGCGTTTTCGGGCGAGGGTCTGGTGCTGGGGAGCGAGCGCGGAGCGAGGTGT CTCTTTAAATACGCTCTGCAGTGTGACGGCGGCCGCCCGGCTGGAAGAGCCATCCCCACCCTGCGGCAGG AGCCCGCCCGCCGCCATCGCCCGCCCCGGTCCCCATGGTTACGCGCCTGCCTCCGGCCCCGGGTCCCCGC TGTCGCCGCGGGAGGTGCGCGCAGAGGCGGCGGCGCTGCTGGCCGGGCTGGGCCGCTCGTGCGCGGGGCT GTGACTCACCGGCCGGCGCCGCAGCCCCGCAATCTGTTGATAACTCGGTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_536B6TG · CTCF_binding_site · 133085462–133085483 · regulatory
ENSR10_536B6TR · CTCF_binding_site · 133085535–133085556 · regulatory
ENSR10_536B6XM · CTCF_binding_site · 133085940–133085961 · regulatory
ENSR10_93XS95 · enhancer · 133087432–133087779 · regulatory
ENSR10_536B78R · CTCF_binding_site · 133087699–133087720 · regulatory
ENSR10_85WMJF · promoter · 133087780–133087934 · regulatory
ENSR10_85WMJJ · enhancer · 133087935–133088179 · regulatory
ENSR10_85WMJP · enhancer · 133088283–133088483 · regulatory
ENSR10_85WMKG · enhancer · 133089508–133089733 · regulatory
· motif · 133083331–133083341 · motif
· motif · 133085464–133085480 · motif
· motif · 133085537–133085553 · motif
· motif · 133085942–133085958 · motif
· motif · 133087701–133087717 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:560 aa
ADGRA1 蛋白長 560 個胺基酸,屬 G protein-coupled receptor 2 family 的 Adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。序列註解標示七段跨膜螺旋,並交替分布細胞外與細胞質區域;C 端大段位於細胞質側。另有數段區域被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ADGRA1 被註記為膜蛋白及多次跨膜蛋白。 來源未提供定位變化條件或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAGAGGCGGCGGCGCTGCTGGCCGGGCTGGGCCGCTCGT40GCGCGGGGCTGTGACTCACCGGCCGGCGCCGCAGCCCCGC80AATCTGTTGATAACTCGGTCCCAGCTCGGCCGCTGCCCTC120GCGAATGGAGAGCGGGTCCCCGGCGGGGGGAGCGCAGCGC160GTCTGTCTCCGGGAGCGCGGCCCGGCCGCCCCGGCAGCCG200CTTCGGCCACAGCAGATGGGAGCAGCTCCCGGACTGCGCC240CGCCCCGCCGCGGTCACCCTGAGGCCAGGGGCCCGGGAGC280GCGACCTCCTGGCCGCCGTCTGGGACTTTGACCTTCCAGA320GGCCATGGAGGCTGGCGGGGAGCAGGGCGCCACCTGATCG360CCTCCCCCTGGACGCCTCCTCCAGCGGCGCTCACGCTTCC400GCAACTTTGCAGCGCTCATGGATCTGAAGACAGTGCTCTC440CCTGCCCCGCTACCCAGGGGAGTTCCTGCACCCCGTGGTG480TACGCGTGCACGGCCGTCATGCTGCTCTGCCTCCTGGCCT520CCTTCGTCACCTACATCGTGCACCAGAGCGCCATCCGCAT560CAGCCGCAAGGGCCGGCACACGCTCCTGAATTTCTGCTTC600CACGCGGCCCTGACCTTCACTGTGTTCGCCGGCGGCATCA640ATCGCACCAAGTACCCCATCCTGTGCCAGGCGGTGGGCAT680CGTGCTGCACTATTCTACACTGTCCACCATGCTGTGGATA720GGAGTGACCGCCAGGAACATCTACAAGCAGGTGACCAAGA760AGGCCCCTCTGTGCCTGGACACAGACCAGCCACCGTACCC800CAGGCAGCCCCTGCTCAGGTTTTACCTCGTCAGCGGAGGG840GTCCCCTTTATCATCTGTGGGGTCACGGCTGCCACGAACA880TCAGGAATTACGGGACAGAGGACGAGGACACGGCGTACTG920CTGGATGGCCTGGGAGCCCAGCCTGGGCGCCTTCTACGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。