演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ADGRA1KIAA1828

adhesion G protein-coupled receptor A1

ADGRA1(adhesion G protein-coupled receptor A1)是 G protein-coupled receptor 2 family 中 Adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族的蛋白質編碼基因,其受體目前被註記為孤兒受體。

Homo sapiens10q26.3UniProt Q86SQ6
OFFICIAL SYMBOL
ADGRA1
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q86SQ6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ADGRA1 的正式名稱為 adhesion G protein-coupled receptor A1,屬於蛋白質編碼基因。其蛋白質歸入 G protein-coupled receptor 2 family,並屬 Adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。現有資料將其描述為孤兒受體,未提供已知配體或更具體的生物學角色,因此不宜據此推定其作用機制。蛋白質註解顯示此產物由 560 個胺基酸組成,含七段跨膜螺旋,並具有細胞外與細胞質區域;細胞質端延伸至蛋白質末端。

Official symbol
ADGRA1
Gene name
adhesion G protein-coupled receptor A1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13838
UniProt
Q86SQ6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA1828GPR123

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q26.3
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegADGRA1pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:133,087,814–133,131,675
Gene span
43,862 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000392607 ★133,087,924–133,131,6757
ENST00001123129133,087,814–133,107,3836
ENST00001141384133,087,814–133,131,6757
ENST00000864054133,088,191–133,131,6756
ENST00000392606133,102,246–133,131,6754

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前提供的功能資料僅將 ADGRA1 標示為孤兒受體。這表示資料未列出其已知配體或更細緻的功能描述,不能僅憑受體的家族歸屬推定其結合對象、訊號傳遞方式或參與的生物學過程。因此,現有來源尚不足以說明 ADGRA1 如何作用,或其作用對細胞與生理功能具有何種意義。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133087924 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ADGRA1 ENST00000392607 GRCh38 chr10:133086924-133088024 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTCTGTGAGTCTTCATGACAACCTCCCAATAGTACATCCTTCAGGCCCCTCAAAATCCATGGCAGCAGG
GCCTGGGGACCCCCTGAACAGGCGCCAGTGTCACAGAACCTGGGGCAGAAGTAGCCATGCAAGGGTGGAG
GCCAAGGAGGGAACAGGTGGAGGGGTGTGGGGTCACCCAGGGCCAAAGGGGGAACAGGTGGAGGGGTGTG
GGGTCACCCAGGGCCAAAGGGGGAACAGGTGGAGGGGTGTGGAGTCCCCCAGGGCAGTTCCTGAGACTCT
TGCTGAGGCTGCCACCAGGCCAGCACGTGCCCCAGAAAACGGAGTTTGTGACGAAAACTGGAGTGGACTT
GGACCCACCTTGTCGGGTAGGAGGCCCCTTGGGGCAGGATAGGGACCTGTGGGATGTGTGCAGAGCCCAA
ACCTCGCTGCGGGTGGGAGGCTGGGCTGCGCCGCCCCTGGCACCCTGGCCTCCACACTCGCCTTGGCTCT
GGATGCCCAGCTCTGTGGCCCAGGATGCAGGAGGGTTGGGGTAGGGGGACAGGGACGCTTTCTGCACAGC
CACAGGCCCTGTCTGTCTACACCGGCTGCGGCTGCCCTGCTGACTCACACTCAGACGGGTTCACGACAGG
TGCACCTCGGTTCTGGCATATCTGGACTTGAGAATGTTAAATAAAGGATGGAAAATTCCTTCCAAATCCA
TTTTCTTGTGTATATTTCTGTTCCTGCAGCTTCTCCACGGATGGAGATTGTCTTTGGGAATAACACAGGG
TCGTGCAGTCCGCCCGGCGGCGTTTTCGGGCGAGGGTCTGGTGCTGGGGAGCGAGCGCGGAGCGAGGTGT
CTCTTTAAATACGCTCTGCAGTGTGACGGCGGCCGCCCGGCTGGAAGAGCCATCCCCACCCTGCGGCAGG
AGCCCGCCCGCCGCCATCGCCCGCCCCGGTCCCCATGGTTACGCGCCTGCCTCCGGCCCCGGGTCCCCGC
TGTCGCCGCGGGAGGTGCGCGCAGAGGCGGCGGCGCTGCTGGCCGGGCTGGGCCGCTCGTGCGCGGGGCT
GTGACTCACCGGCCGGCGCCGCAGCCCCGCAATCTGTTGATAACTCGGTCC
ADGRA1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_536B6TG · CTCF_binding_site · 133085462–133085483 · regulatory

ENSR10_536B6TR · CTCF_binding_site · 133085535–133085556 · regulatory

ENSR10_536B6XM · CTCF_binding_site · 133085940–133085961 · regulatory

ENSR10_93XS95 · enhancer · 133087432–133087779 · regulatory

ENSR10_536B78R · CTCF_binding_site · 133087699–133087720 · regulatory

ENSR10_85WMJF · promoter · 133087780–133087934 · regulatory

ENSR10_85WMJJ · enhancer · 133087935–133088179 · regulatory

ENSR10_85WMJP · enhancer · 133088283–133088483 · regulatory

ENSR10_85WMKG · enhancer · 133089508–133089733 · regulatory

· motif · 133083331–133083341 · motif

· motif · 133085464–133085480 · motif

· motif · 133085537–133085553 · motif

· motif · 133085942–133085958 · motif

· motif · 133087701–133087717 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:560 aa

1 aa560 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q86SQ6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ADGRA1 蛋白長 560 個胺基酸,屬 G protein-coupled receptor 2 family 的 Adhesion G protein-coupled receptor(ADGR)亞家族。序列註解標示七段跨膜螺旋,並交替分布細胞外與細胞質區域;C 端大段位於細胞質側。另有數段區域被註解為無序區。

拓樸區域Extracellular1–19 aa
跨膜區Helical; Name=120–40 aa
拓樸區域Cytoplasmic41–53 aa
跨膜區Helical; Name=254–74 aa
拓樸區域Extracellular75–84 aa
跨膜區Helical; Name=385–105 aa
拓樸區域Cytoplasmic106–134 aa
跨膜區Helical; Name=4135–155 aa
拓樸區域Extracellular156–175 aa
跨膜區Helical; Name=5176–196 aa
拓樸區域Cytoplasmic197–257 aa
跨膜區Helical; Name=6258–278 aa
拓樸區域Extracellular279–284 aa
跨膜區Helical; Name=7285–305 aa
拓樸區域Cytoplasmic306–560 aa
功能區域Disordered210–242 aa
功能區域Disordered438–473 aa
功能區域Disordered521–560 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q86SQ6…

AlphaFold · Q86SQ6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

ADGRA1 被註記為膜蛋白及多次跨膜蛋白。 來源未提供定位變化條件或異構型差異。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 21 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA1828ADGRA1APBA1APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZPATJPDZK1SCRIBTJP1WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ADGRA1 被描述為孤兒受體;此項註記未提供其已知配體、具體作用方式或參與的生物學過程,因此不能據此進一步判定其分子機制或生理功能。資料庫紀錄
證據與來源

Orphan receptor

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ADGRA1 被註記為膜蛋白,且屬多次跨膜蛋白;此定位資料未說明其定位變化條件、細胞內動態或不同異構型之間的差異。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000392607 · 4,264 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCAGAGGCGGCGGCGCTGCTGGCCGGGCTGGGCCGCTCGT40
41GCGCGGGGCTGTGACTCACCGGCCGGCGCCGCAGCCCCGC80
81AATCTGTTGATAACTCGGTCCCAGCTCGGCCGCTGCCCTC120
121GCGAATGGAGAGCGGGTCCCCGGCGGGGGGAGCGCAGCGC160
161GTCTGTCTCCGGGAGCGCGGCCCGGCCGCCCCGGCAGCCG200
201CTTCGGCCACAGCAGATGGGAGCAGCTCCCGGACTGCGCC240
241CGCCCCGCCGCGGTCACCCTGAGGCCAGGGGCCCGGGAGC280
281GCGACCTCCTGGCCGCCGTCTGGGACTTTGACCTTCCAGA320
321GGCCATGGAGGCTGGCGGGGAGCAGGGCGCCACCTGATCG360
361CCTCCCCCTGGACGCCTCCTCCAGCGGCGCTCACGCTTCC400
401GCAACTTTGCAGCGCTCATGGATCTGAAGACAGTGCTCTC440
441CCTGCCCCGCTACCCAGGGGAGTTCCTGCACCCCGTGGTG480
481TACGCGTGCACGGCCGTCATGCTGCTCTGCCTCCTGGCCT520
521CCTTCGTCACCTACATCGTGCACCAGAGCGCCATCCGCAT560
561CAGCCGCAAGGGCCGGCACACGCTCCTGAATTTCTGCTTC600
601CACGCGGCCCTGACCTTCACTGTGTTCGCCGGCGGCATCA640
641ATCGCACCAAGTACCCCATCCTGTGCCAGGCGGTGGGCAT680
681CGTGCTGCACTATTCTACACTGTCCACCATGCTGTGGATA720
721GGAGTGACCGCCAGGAACATCTACAAGCAGGTGACCAAGA760
761AGGCCCCTCTGTGCCTGGACACAGACCAGCCACCGTACCC800
801CAGGCAGCCCCTGCTCAGGTTTTACCTCGTCAGCGGAGGG840
841GTCCCCTTTATCATCTGTGGGGTCACGGCTGCCACGAACA880
881TCAGGAATTACGGGACAGAGGACGAGGACACGGCGTACTG920
921CTGGATGGCCTGGGAGCCCAGCCTGGGCGCCTTCTACGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。