演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ADAMTS13VWFCP

ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13

ADAMTS13 編碼可分解血漿中 von Willebrand factor(vWF)多聚體的蛋白酶,藉此調節 vWF 介導的血小板血栓形成;其基因變異與遺傳性血栓性血小板減少性紫斑症相關。

Homo sapiens9q34.2UniProt Q76LX8
OFFICIAL SYMBOL
ADAMTS13
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q76LX8
PDB / ALPHAFOLD
6QIG
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ADAMTS13(ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13)是蛋白質編碼基因,產物屬於含 thrombospondin type 1 motif 的 ADAM metallopeptidase。此蛋白質全長 1,427 個胺基酸,具有多個不同類型的結構區域:N 端包含訊號序列與 Peptidase M12B、Disintegrin 區域,後續排列多個 TSP type-1 重複序列,C 端則有兩個 CUB 結構域。這種多區域架構構成 ADAMTS13 的基本分子特徵;其主要角色是處理血漿中的 vWF 多聚體。

Official symbol
ADAMTS13
Gene name
ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1366
UniProt
Q76LX8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
VWFCPTTPvWF-CPFLJ42993MGC118899MGC118900DKFZp434C2322C9orf8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q34.2
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegADAMTS13pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:133,414,358–133,459,402
Gene span
45,045 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000355699 ★133,422,367–133,459,38629
ENST00000908290133,418,283–133,459,40230
ENST00000371929133,422,000–133,459,40229
ENST00000371916133,422,000–133,459,40226
ENST00000356589133,422,000–133,459,40229
ENST00001134857133,422,000–133,459,40229
ENST00000371911133,422,324–133,429,9108
ENST00000371910133,455,648–133,459,4025

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ADAMTS13 的主要作用是切割血漿中的 von Willebrand factor(vWF)多聚體,使其轉變為較小形式。這項處理可調節 vWF 介導的血小板血栓形成,說明 ADAMTS13 透過改變 vWF 多聚體大小,參與血小板血栓形成的控制。

在分子切割位置上,ADAMTS13 可於 vWF 的 A2 結構域切開第 842 位 Tyr 與第 843 位 Met 之間的鍵結。此位點資訊補充了它如何將 vWF 多聚體分解為較小形式;來源未提供其他切割條件或底物範圍,因此不延伸推論其作用情境。

ADAMTS13 每個次單元可結合 1 個鋅離子,並可結合 4 個 Ca(2+) 離子。這些是來源記載的金屬離子結合特徵;資料未進一步說明各離子對酵素活性或底物辨識的具體影響。

透過切割 vWF 多聚體並調節其介導的血小板血栓形成,ADAMTS13 的作用與血液中血小板血栓形成控制相連。來源支持其切割作用及相應的調節角色,但未提供更廣泛的生理機制或其他功能主張。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133422367 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ADAMTS13 ENST00000355699 GRCh38 chr9:133421367-133422467 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGCCTCCTTACCTTCCTGCATGAAAGCACACCCTTCCCTCCAGTCCCCCATTCCTTTATTCTGCTGTAT
TTTTCTCCATAACACTTACCACCTTTGAACATACTACATATACAACATGTGTCTGTCTAGCAACTTTGCT
GTCTGGCTCTCTTCCCTAGAATTTAAGCTGTGAGAGGCCGAGGCTGCTGTCTGCCTGGCTTGGGGCTGCT
TTCCTGGTGTCTAGCACAGAGCCTGGCCTGTTTCAGGGGCTCAGTGAAACATTTGTTGGCTGAAGGAATG
AATGAATGGCTCTAGCAGAGGGGCAGAAACTAACGATGCAGGAGGAGAGAGCTGGGAAGGGATCCAGAGC
CAGGGCCTGGCAGGAAGTGTAGGTGTGTCCTCCCTGATCGCAGAGGAGGAGAGAGGCTGCACTTTGAGGG
GTGGAAAGACAAGGTGAATCCCCCTGCTGGTCATCAGCTTGTGCGGCTCTGTGGGTGTAAAAGAGTGGTT
TGGAGCATGTGAAGTGAGTCTTCCAGGAGATGAAGGGGATTGCCAGGCCGTTTGTGATGATGCTGAGATC
TGGTGCCGTGCAGCCTGCTTCTGCGACTCTCCTCATCAGGCGCAGGCACAGAGTAGGTGGAGAGTTGAGC
CAGAACCACGATGTCTTTGGCACAGCCTCTCATCTGTCAGATGGGAGCGGGGACCCCGGAGAGGGAGTCA
GCCGAGGTCCTGGCATTCCTTGTGAACCCCCGTCTGTGGGTTTCTGGTCCAGTGTCCCTTCTCCAGATTA
GATGGCTTAGGCCTCCTCTAAGGGGGTGGGCGTGCACATCCGGAGAGCTGTCTGGTGTGCAGGACTGGGC
TGCAGGTTACCCTGAACTGCAACCATCTTAGAGCAAGGCCCAGCTTGCAGCAGGAGGAGCTGCAGGCCGC
CCACCCTAGCCACGGCCCCTGCCCTGGCAGGAAGCTTCCAAGAGTAAACACTGCCTAATCGTCCCGCCCA
GTAGTGAGCAGGCCTGTCCCATTCCATACTGACCAGATTCCCAGTCACCAAGGCCCCCTCTCACTCCGCT
CCACTCCTCGGGCTGGCTCTCCTGAGGATGCACCAGCGTCACCCCCGGGCA
ADAMTS13 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ADAMTS13_2 ↗9:133,414,350正股133,414,301–133,414,360
ADAMTS13_1 ↗9:133,422,367正股133,422,318–133,422,377

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_536D9S8 · CTCF_binding_site · 133417625–133417646 · regulatory

ENSR9_BZGWF · promoter · 133418000–133418586 · regulatory

ENSR9_85WWLX · enhancer · 133418699–133418831 · regulatory

ENSR9_85WWM7 · enhancer · 133419145–133419366 · regulatory

ENSR9_93XXSH · enhancer · 133420352–133420796 · regulatory

ENSR9_93XXSS · promoter · 133421543–133422010 · regulatory

· motif · 133417568–133417579 · motif

· motif · 133417627–133417643 · motif

· motif · 133417951–133417968 · motif

· motif · 133418018–133418029 · motif

· motif · 133418032–133418043 · motif

· motif · 133418034–133418043 · motif

· motif · 133418152–133418159 · motif

· motif · 133418152–133418165 · motif

· motif · 133418230–133418239 · motif

· motif · 133418263–133418272 · motif

· motif · 133419306–133419318 · motif

· motif · 133419308–133419330 · motif

· motif · 133419308–133419330 · motif

· motif · 133420259–133420274 · motif

· motif · 133420264–133420276 · motif

· motif · 133420267–133420274 · motif

· motif · 133420267–133420282 · motif

· motif · 133420334–133420349 · motif

· motif · 133420516–133420529 · motif

· motif · 133420522–133420535 · motif

· motif · 133420697–133420709 · motif

· motif · 133420807–133420819 · motif

· motif · 133421384–133421399 · motif

· motif · 133423508–133423519 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1427 aa

1 aa1427 aa結構域功能區域基序訊號胜肽
依 Q76LX8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ADAMTS13 蛋白質長 1,427 個胺基酸,N 端有訊號序列,並含 Peptidase M12B、Disintegrin、8 個 TSP type-1 結構域及 C 端的 CUB 1、CUB 2。另註記有 Cysteine-rich 區域、Spacer 區域、短暫無序區,以及 Cell attachment site 基序。

訊號胜肽1–29 aa
結構域Peptidase M12B80–286 aa
結構域Disintegrin287–383 aa
結構域TSP type-1 1384–439 aa
結構域TSP type-1 2682–730 aa
結構域TSP type-1 3742–805 aa
結構域TSP type-1 4808–859 aa
結構域TSP type-1 5896–950 aa
結構域TSP type-1 6951–1011 aa
結構域TSP type-1 71012–1068 aa
結構域TSP type-1 81072–1131 aa
結構域CUB 11192–1298 aa
結構域CUB 21299–1427 aa
功能區域Disordered51–70 aa
功能區域Cysteine-rich440–556 aa
功能區域Spacer556–685 aa
基序Cell attachment site498–500 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6QIG…

PDB · 6QIG

X-ray · 2.80 A · A=79-682

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

ADAMTS13 為分泌型蛋白質。 其分泌會因 TSP type-1 重複序列的 O-fucosylation 而增強;來源未提供其他定位或異構型差異資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
VWFCPADAMTS13VWF
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ADAMTS13 基因變異與遺傳性血栓性血小板減少性紫斑症(thrombotic thrombocytopenic purpura, TTP)相關;來源將此疾病描述為常染色體隱性遺傳的血液疾病。其特徵包括溶血性貧血與紅血球碎裂、血小板減少、瀰漫性且非局灶性的神經學表現、腎功能下降及發燒。資料指出此病由影響 ADAMTS13 的變異造成。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ADAMTS13 會切割血漿中的 vWF 多聚體,使其成為較小形式,進而調節由 vWF 介導的血小板血栓形成。含實驗來源
證據與來源

Cleaves the vWF multimers in plasma into smaller forms thereby controlling vWF-mediated platelet thrombus formation

PMID 19880749 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性此酵素在 vWF 的 A2 結構域切割第 842 位 Tyr 與第 843 位 Met 之間的鍵結。含實驗來源
證據與來源

The enzyme cleaves the von Willebrand factor at bond 842-Tyr-|-Met-843 within the A2 domain.

PMID 11535495 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性每個次單元可結合 1 個鋅離子。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性可結合 4 個 Ca(2+) 離子。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 4 Ca(2+) ions.

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ADAMTS13 為分泌型蛋白質;TSP type-1 重複序列的 O-fucosylation 會增強其分泌。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Secretion enhanced by O-fucosylation of TSP type-1 repeats

PMID 12791682 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯遺傳性血栓性血小板減少性紫斑症(TTP)是常染色體隱性遺傳的血液疾病,特徵包括溶血性貧血及紅血球碎裂、血小板減少、瀰漫且非局灶性的神經學表現、腎功能下降與發燒。此病由影響 ADAMTS13 的基因變異造成。含實驗來源
證據與來源

Thrombotic thrombocytopenic purpura, hereditary TTP An autosomal recessive hematologic disease characterized by hemolytic anemia with fragmentation of erythrocytes, thrombocytopenia, diffuse and non-focal neurologic findings, decreased renal function and fever. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 274150

PMID 11586351 ↗ · PMID 12181489 ↗ · PMID 12393505 ↗ · PMID 12614216 ↗ · PMID 12753286 ↗ · PMID 14512317 ↗ · PMID 14563640 ↗ · PMID 15009458 ↗ · PMID 15126318 ↗ · PMID 15327386 ↗ · PMID 16160007 ↗ · PMID 16449289 ↗ · PMID 16453338 ↗ · PMID 16796708 ↗ · PMID 16807643 ↗ · PMID 17003922 ↗ · PMID 18443791 ↗ · PMID 19055667 ↗ · PMID 19116307 ↗ · PMID 22075512 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000355699 · 4,399 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTCCATACTGACCAGATTCCCAGTCACCAAGGCCCCCTC40
41TCACTCCGCTCCACTCCTCGGGCTGGCTCTCCTGAGGATG80
81CACCAGCGTCACCCCCGGGCAAGATGCCCTCCCCTCTGTG120
121TGGCCGGAATCCTTGCCTGTGGCTTTCTCCTGGGCTGCTG160
161GGGACCCTCCCATTTCCAGCAGAGTTGTCTTCAGGCTTTG200
201GAGCCACAGGCCGTGTCTTCTTACTTGAGCCCTGGTGCTC240
241CCTTAAAAGGCCGCCCTCCTTCCCCTGGCTTCCAGAGGCA280
281GAGGCAGAGGCAGAGGCGGGCTGCAGGCGGCATCCTACAC320
321CTGGAGCTGCTGGTGGCCGTGGGCCCCGATGTCTTCCAGG360
361CTCACCAGGAGGACACAGAGCGCTATGTGCTCACCAACCT400
401CAACATCGGGGCAGAACTGCTTCGGGACCCGTCCCTGGGG440
441GCTCAGTTTCGGGTGCACCTGGTGAAGATGGTCATTCTGA480
481CAGAGCCTGAGGGTGCTCCAAATATCACAGCCAACCTCAC520
521CTCGTCCCTGCTGAGCGTCTGTGGGTGGAGCCAGACCATC560
561AACCCTGAGGACGACACGGATCCTGGCCATGCTGACCTGG600
601TCCTCTATATCACTAGGTTTGACCTGGAGTTGCCTGATGG640
641TAACCGGCAGGTGCGGGGCGTCACCCAGCTGGGCGGTGCC680
681TGCTCCCCAACCTGGAGCTGCCTCATTACCGAGGACACTG720
721GCTTCGACCTGGGAGTCACCATTGCCCATGAGATTGGGCA760
761CAGCTTCGGCCTGGAGCACGACGGCGCGCCCGGCAGCGGC800
801TGCGGCCCCAGCGGACACGTGATGGCTTCGGACGGCGCCG840
841CGCCCCGCGCCGGCCTCGCCTGGTCCCCCTGCAGCCGCCG880
881GCAGCTGCTGAGCCTGCTCAGCGCAGGACGGGCGCGCTGC920
921GTGTGGGACCCGCCGCGGCCTCAACCCGGGTCCGCGGGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。