演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ADAMTS10ADAM-TS10

ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 10

ADAMTS10 是一種金屬蛋白酶,參與細胞外基質微纖維的組裝;其變異與 Weill-Marchesani syndrome 1 有關。

Homo sapiens19p13.2UniProt Q9H324
OFFICIAL SYMBOL
ADAMTS10
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9H324
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ADAMTS10(ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 10)是蛋白質編碼基因,產物屬於含 thrombospondin type 1 motif 的 ADAM metallopeptidase 家族。其蛋白質具有金屬蛋白酶特性,並含有多個 thrombospondin type 1 motif。已知它參與細胞外基質微纖維的組裝;微纖維可獨立存在,也可與 elastin 一同構成彈性組織。

Official symbol
ADAMTS10
Gene name
ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13201
UniProt
Q9H324
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ADAM-TS10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ADAMTS10pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:8,580,240–8,610,846
Gene span
30,607 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000597188 ★8,580,240–8,610,71526
ENST000005958388,580,240–8,592,19613
ENST000002703288,580,240–8,608,26525
ENST000009064128,580,240–8,610,84625
ENST000011369568,580,240–8,610,84626
ENST000011066378,593,173–8,610,84611
ENST000011164258,593,175–8,610,84612
ENST000011164288,604,212–8,610,8464
ENST000011164278,604,228–8,610,8463
ENST000011301388,604,642–8,610,8464

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ADAMTS10 是參與細胞外基質微纖維組裝的金屬蛋白酶。微纖維是細胞外基質的組成部分,可單獨形成結構,也能與 elastin 一同參與彈性組織的形成。因此,ADAMTS10 的功能與微纖維構築,以及含有這類基質成分的彈性組織形成相關。

其酵素亞基可結合一個鋅離子。現有資料支持它具有金屬蛋白酶性質,但未在此處提供特定受質、切割反應或更多酵素作用條件,因而不能據此進一步指定其催化機制。ADAMTS10 與 FBN1 的交互作用會促進微纖維組裝,指出這種蛋白質間的關係與其基質組裝角色相連。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 8610715 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ADAMTS10 ENST00000597188 GRCh38 chr19:8610615-8611715 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTCACCGCAAAGGAGTTAAGGCACAGAGACCAAGGCCAGGCCCAGGACCGATCAAACCCCCCTGAGAGCT
CGGAGAGGGCGGGGCCGAGCTGGGACTTATTTCCCGCCCCGGGCACCGTGCCTGGCACACGGGAGGCGCC
CAATAAATGCTTGTTTGAGCCAGGCCCAGCCCTCAATAAATAACAGCTGTTGTTGATGCCGCAGAGGCTG
GCGAGGAAGTGGGCTCTCCCCTCCCCAACCCCAGCATCTCATGCTCCCATCCCCCCTCCAGCCCCATTCC
TTACCCCCCTCCATTCCTTCCCGTGGCCCCCAACCCAACTCAGCCCCTTCCTCCAGGCCCCCACCTCCCC
CCAACCCACTCAGCCCCTCCTCCAGGGCCCCACCTCCCCCAACCCCACTCAGCCCCTCCTCAAGGGCCCC
ACCTCCCCCCACCCCACTCAGCCCCTTCCTCCAGGCCCCCACCTCCCCCCACCCCACTCAGCCCCTCCTC
CAGGCCCCCACTTCCCCCCACCCCACTCAGCCCTTCCTCCAGGCCCCCACCTCCCCCCACCTCACTCAGC
CCCTTCCTCCAGGCCTCCATCTCCCCCTACCCCTTCCCATTCAAACTTCCCCCTCCCCCAACCTCTCCCT
TCTCTTCCTCCCTTTCCCCGAACCCCCACCCACCCAATTCTGCCTCCATCCCCATCCCCCACCTGATTCT
TTCTCCCCTCCCCCACCCATTCTCCCCGCCGCCACTCGATTTCTCCCGCTTCGTCCCCTCCCCGCCCCCC
GCGGTTCCCCAGCCCCCTCCCACGCGGCGGGGGCGCTGGTCCCGGGCGGGGCGGCCCGAGTTCCCGGGTC
CCTGGCTGGGGTCCAGCCCGCGGCCCAGGCCGGGCGGCGGCAGGCGGGCGGGGTTTCTGGCCGCGCGCAG
TTTGGGGGTTTTTTTATAACCCTGGCAGGCGGCTCAGGAAGTGCCTTCCCCGCGCCCCCTCCCCTGGCCA
CGCCGCCGCGCTCGCTCGCTCCCTCCCTTCCTGCGCGCGCGGGGCGGCGAGACAGCGGCGGCGACGGCGC
GGAGGCCCCGGGCGCGGCGCAGGTAGCGGCGCGGGCGGGGGGCCCGGGGGT
ADAMTS10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_95F8L · enhancer · 8607329–8607727 · regulatory

ENSR19_95F97 · promoter · 8609326–8609826 · regulatory

ENSR19_542N95 · CTCF_binding_site · 8609565–8609586 · regulatory

ENSR19_B3P5N · enhancer · 8609827–8610704 · regulatory

ENSR19_95F9L · promoter · 8610705–8611205 · regulatory

ENSR19_95FB2 · enhancer · 8612206–8612566 · regulatory

ENSR19_95FB7 · enhancer · 8612847–8613147 · regulatory

ENSR19_542P4J · CTCF_binding_site · 8614399–8614420 · regulatory

ENSR19_542P56 · CTCF_binding_site · 8614537–8614558 · regulatory

ENSR19_88SMN · enhancer · 8615139–8615385 · regulatory

· motif · 8609567–8609583 · motif

· motif · 8611937–8611944 · motif

· motif · 8612286–8612299 · motif

· motif · 8612286–8612299 · motif

· motif · 8612722–8612733 · motif

· motif · 8612769–8612784 · motif

· motif · 8612774–8612786 · motif

· motif · 8612777–8612784 · motif

· motif · 8612801–8612808 · motif

· motif · 8612966–8612979 · motif

· motif · 8614401–8614417 · motif

· motif · 8614539–8614555 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1103 aa

1 aa1103 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 Q9H324 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ADAMTS10 蛋白質長 1,103 個胺基酸,N 端具訊號胜肽(第 1–25 位)。註解列出 Peptidase M12B、Disintegrin、五個 TSP type-1 domain,以及 C 端 PLAC domain;另有一段預測為無序區域,並標示一段 spacer 區域。

訊號胜肽1–25 aa
結構域Peptidase M12B239–457 aa
結構域Disintegrin460–546 aa
結構域TSP type-1 1547–602 aa
結構域TSP type-1 2825–883 aa
結構域TSP type-1 3884–945 aa
結構域TSP type-1 4947–1001 aa
結構域TSP type-1 51003–1058 aa
結構域PLAC1065–1103 aa
功能區域Disordered213–233 aa
功能區域Spacer706–828 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H324…

AlphaFold · Q9H324

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space, extracellular matrix

ADAMTS10 為分泌蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。 資料未指出定位變化的條件或不同異構型間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ADAM-TS10ADAMTS10Lox
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ADAMTS10 與 FBN1 有交互作用;此交互作用會促進微纖維組裝。來源未進一步說明兩者是否形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ADAMTS10 的變異與 Weill-Marchesani syndrome 1(WMS1)相關;來源將此疾病描述為由影響該基因的變異所致。WMS1 是罕見結締組織疾病,特徵包括身材矮小、短指(趾)及關節僵硬,也可有眼部異常,如 microspherophakia、ectopia lentis、嚴重近視與青光眼。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ADAMTS10 是參與微纖維組裝的金屬蛋白酶。微纖維屬於細胞外基質,可獨立存在,也可與 elastin 一同參與彈性組織的形成。含實驗來源
證據與來源

Metalloprotease that participate in microfibrils assembly. Microfibrils are extracellular matrix components occurring independently or along with elastin in the formation of elastic tissues

PMID 21402694 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ADAMTS10 每個蛋白質亞基可結合一個鋅離子;此項資料說明其亞基的鋅離子結合數量。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ADAMTS10 與 FBN1 有交互作用,而這項蛋白質間的交互作用會促進微纖維組裝;來源未進一步描述其結合方式或複合體組成。含實驗來源
證據與來源

Interacts with FBN1; this interaction promotes microfibrils assembly

PMID 21402694 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ADAMTS10 被描述為分泌蛋白,定位於細胞外空間與細胞外基質;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Secreted, extracellular space, extracellular matrix

PMID 21402694 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Weill-Marchesani syndrome 1(WMS1)是罕見結締組織疾病,特徵包括身材矮小、短指(趾)、關節僵硬,以及 microspherophakia、ectopia lentis、嚴重近視和青光眼等眼部異常。來源指出,影響 ADAMTS10 的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

Weill-Marchesani syndrome 1 WMS1 A rare connective tissue disorder characterized by short stature, brachydactyly, joint stiffness, and eye abnormalities including microspherophakia, ectopia lentis, severe myopia and glaucoma. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 277600

PMID 15368195 ↗ · PMID 18567016 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000597188 · 4,251 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCTCCCTTCCTGCGCGCGCGGGGCGGCGAGACAGCGGCG40
41GCGACGGCGCGGAGGCCCCGGGCGCGGCGCAGGCTCCAAA80
81GAAGAAGAAACCAAGGCCCAGAGAGGGAGGCCCAGGTGCA120
121GGGAGCAGGCGAGGGAAGGATCCGTACAGGGGCCCAACAC160
161TACTCCACCAACCGAAGCCCCCAAAAGGAGCCCGGTGATG200
201CTGCGAAGGCTGTGAACAGGGGAGGCGGCACTGTGGGGGC240
241TGCCGGCAGCCGGGGCTGGGGAGAGACATGTGGACACGTG280
281GCCTCTATGGCTCCCGCCTGCCAGATCCTCCGCTGGGCCC320
321TCGCCCTGGGGCTGGGCCTCATGTTCGAGGTCACGCACGC360
361CTTCCGGTCTCAAGATGAGTTCCTGTCCAGTCTGGAGAGC400
401TATGAGATCGCCTTCCCCACCCGCGTGGACCACAACGGGG440
441CACTGCTGGCCTTCTCGCCACCTCCTCCCCGGAGGCAGCG480
481CCGCGGCACGGGGGCCACAGCCGAGTCCCGCCTCTTCTAC520
521AAAGTGGCCTCGCCCAGCACCCACTTCCTGCTGAACCTGA560
561CCCGCAGCTCCCGTCTACTGGCAGGGCACGTCTCCGTGGA600
601GTACTGGACACGGGAGGGCCTGGCCTGGCAGAGGGCGGCC640
641CGGCCCCACTGCCTCTACGCTGGTCACCTGCAGGGCCAGG680
681CCAGCAGCTCCCATGTGGCCATCAGCACCTGTGGAGGCCT720
721GCACGGCCTGATCGTGGCAGACGAGGAAGAGTACCTGATT760
761GAGCCCCTGCACGGTGGGCCCAAGGGTTCTCGGAGCCCGG800
801AGGAAAGTGGACCACATGTGGTGTACAAGCGTTCCTCTCT840
841GCGTCACCCCCACCTGGACACAGCCTGTGGAGTGAGAGAT880
881GAGAAACCGTGGAAAGGGCGGCCATGGTGGCTGCGGACCT920
921TGAAGCCACCGCCTGCCAGGCCCCTGGGGAATGAAACAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。