演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACTG1ACTG

actin gamma 1

ACTG1 編碼 actin gamma 1,屬於高度保守、廣泛存在於真核細胞的 actin 家族蛋白,參與多種細胞運動。

Homo sapiens17q25.3UniProt P63261
OFFICIAL SYMBOL
ACTG1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P63261
PDB / ALPHAFOLD
6CXI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACTG1 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 actin gamma 1。產物屬於 actin 家族;actins 是高度保守的蛋白質,廣泛存在於各類真核細胞中。來源未提供此蛋白質的長度或更細部的結構特色。作為 actin 家族成員,actin gamma 1 與細胞運動相關;其具體分子作用與來源提出的聽覺相關可能性,另見功能說明。

Official symbol
ACTG1
Gene name
actin gamma 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:144
UniProt
P63261
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ACTGDFNA20DFNA26

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.3
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegACTG1pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:81,509,413–81,523,847
Gene span
14,435 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000573283 ★81,509,971–81,512,7996
ENST0000068105281,509,413–81,514,6297
ENST0000091596981,509,967–81,512,8186
ENST0000091597081,509,970–81,512,8036
ENST0000086304681,509,971–81,513,5236
ENST0000091596181,509,971–81,519,6056
ENST0000091596281,509,971–81,519,5836
ENST0000091596381,509,971–81,514,8746
ENST0000091596481,509,971–81,514,5566
ENST0000091596681,509,971–81,512,8186
ENST0000091596781,509,971–81,512,8116
ENST0000091596881,509,971–81,512,8186

顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

actin 家族蛋白參與多種細胞運動。ACTG1 的產物 actin gamma 1 屬於這個高度保守的蛋白質家族;來源指出,actins 廣泛存在於真核細胞中,並與不同形式的細胞運動有關,但未進一步列明 ACTG1 在各種運動中的具體作用方式。

來源亦列出 actin gamma 1 的 ATP 水解反應:ATP 與水反應後生成 ADP、磷酸鹽及 H⁺。此反應為其分子活性資料,但來源未說明該反應在細胞內如何調節,或如何與特定細胞運動過程相連。

在聽覺方面,資料提出 actin gamma 1 可能參與修復噪音造成的 stereocilia 間隙,並因此協助在強烈噪音損傷後維持聽覺敏感度。這項作用標示為依相似性推定(By similarity),因此應視為可能的功能,而非此處已明確確立的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 81512799 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACTG1 ENST00000573283 GRCh38 chr17:81512699-81513799 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTGAGCGCCCTGGACAAGCCTGTGGCTAAACCCACGCCAGCCCTGATCGCTGCTCTTAACTAGCATCGT
AAACAGAAGAGGGTATCCCCCCGACCGCCCGAAGCTGGGGAGCCGACCTTCAAAAAAGTCAGGGCTCCCA
TTGTCTACCTCAGTTTCCCTATAATGTCTACAGGTGACCAGAATGAAACAAAGGCCTCACTCCACACCAC
CTTCTCAGCACATAAGGGGGCGGGGTAGCCCCAACCCGGAGCGCGCGCCTGGGGACAATCAGGCCTGTGA
TTTGAGGGGCAGGGATGTGTCGGGTCGGGTAGAAAGGGGCCTCGGTCTTCAAACGAACGGAGATCCGGGG
CAGGGCGCCCCGTGGAGGGACCTGCATGGTGGTGGCTGCGCTTGGGGACGGGCGGGCTGTTTCCTATGGT
GACCGGGGCGAGGTGAGGGCTCCTGAGAGCTCCCCCGCGCCCAGGGACGCAGAGCGTCGCGGACCCCCGC
CGCGCCCCTTCCTCAGCCCGGCACTGGCGCCCGAGATCCTCGTGGAGCCCGAGGGGAAAGATTGCAAGGG
ACGTCCCAGGGAGCAAAGCCCCGCAGCGTGGCCGGGGACTCGGGGACCCACCCCAGCTCCGGCGCGGCCC
CGCCCCGGGTCAGGCAGTTTCGGGGCGCAGCAGGGCCCTCCCCACGGCGCGGCAGTCCCGGGGAGGGGCC
AGGCCCGTCAGCCCTTCGGCCCTCCCGGCGACCCTCGGAGGGCGCCCCAACTCAGACCCGCCCGCCGGCC
CGCGCAGGGTCGCGAGCGCGCGGGGGTGGCGCGGGCGGGGCCGTTGGGAGGCGGTGCGGGCTGGGGGCGG
GGCGGGCCGGGGCCCCACGTGTCCCTGCCCGGCGGGCCAATGGGTGCCCGGCTTTCGGAAAGATCGCCAT
ATATGGACATGTTCTGGGGCCGCGCGCGCCGCCGGGCCGCGCGGGCGCGCCGCTTCCGCTTAAATAACGG
CGGGGGAGGCCGCGGTCGGTCTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGCCGCTCCGCCG
TCGCGTTTCTCTGCCGGTGAGCGCCCCGCCCCGGGGCCTGAGCTGGACGTC
ACTG1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACTG1_1 ↗17:81,512,799負股81,512,789–81,512,848

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_5P6MKW · CTCF_binding_site · 81511455–81511476 · regulatory

ENSR17_BL6QZ · promoter · 81512661–81513308 · regulatory

ENSR17_937CK7 · promoter · 81513709–81514209 · regulatory

ENSR17_937CKG · promoter · 81514619–81515072 · regulatory

ENSR17_D637C · enhancer · 81515073–81517549 · regulatory

· motif · 81508702–81508714 · motif

· motif · 81508814–81508825 · motif

· motif · 81508924–81508939 · motif

· motif · 81509082–81509097 · motif

· motif · 81509580–81509592 · motif

· motif · 81510184–81510195 · motif

· motif · 81511457–81511473 · motif

· motif · 81511744–81511764 · motif

· motif · 81512066–81512081 · motif

· motif · 81512419–81512434 · motif

· motif · 81512717–81512727 · motif

· motif · 81512828–81512839 · motif

· motif · 81512828–81512839 · motif

· motif · 81512881–81512896 · motif

· motif · 81512881–81512896 · motif

· motif · 81512888–81512898 · motif

· motif · 81512937–81512946 · motif

· motif · 81513000–81513013 · motif

· motif · 81513575–81513586 · motif

· motif · 81514099–81514114 · motif

· motif · 81514583–81514596 · motif

· motif · 81514589–81514602 · motif

· motif · 81514732–81514744 · motif

· motif · 81514734–81514741 · motif

· motif · 81514734–81514747 · motif

· motif · 81514777–81514792 · motif

· motif · 81514777–81514792 · motif

· motif · 81514815–81514828 · motif

· motif · 81514872–81514880 · motif

· motif · 81514890–81514901 · motif

· motif · 81514892–81514901 · motif

· motif · 81514931–81514946 · motif

· motif · 81514931–81514946 · motif

· motif · 81515393–81515402 · motif

· motif · 81515393–81515404 · motif

· motif · 81515393–81515404 · motif

· motif · 81516062–81516077 · motif

· motif · 81516067–81516079 · motif

· motif · 81516369–81516382 · motif

· motif · 81517050–81517062 · motif

· motif · 81517052–81517059 · motif

· motif · 81517052–81517067 · motif

· motif · 81517314–81517330 · motif

· motif · 81517314–81517330 · motif

· motif · 81517325–81517337 · motif

· motif · 81517594–81517607 · motif

· motif · 81517594–81517607 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:375 aa

actin gamma 1 屬於 actin 家族。來源未提供其結構域、功能區域或序列註解等更細部的蛋白質結構資訊。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6CXI…

PDB · 6CXI

EM · 11.00 A · A/B/C/D/E=1-375

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

來源將 actin gamma 1 標示於細胞質與細胞骨架;未提供其定位隨條件或異構型而改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 13 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ACTGACTG1ACTBCAP2CCDC22CDC37CFL1CFL2CFL2DSTNEHHADHHTTMLH1NTAQ1PS1TP5BP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

球狀 actin(G-actin)聚合後形成雙股螺旋狀的絲狀 actin(F-actin);每個 actin 可與另外四個 actin 結合。資料另列出 actin gamma 1 與 TWF1、CAPZB、cofilin 及 profilin 的交互作用,但未在此說明各交互作用的功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ACTG1 變異與常染色體顯性耳聾 20(DFNA20)及 Baraitser-Winter syndrome 2(BRWS2)相關。另有資料記載一名患者帶有 ACTG1 缺陷並出現單純性眼 coloboma;這項個案描述不應延伸解讀為普遍因果關係。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Actins 是高度保守且廣泛存在於真核細胞的蛋白質,參與多種細胞運動。依相似性推定,actin gamma 1 可能參與修復噪音造成的 stereocilia 間隙,進而在強烈噪音損傷後維持聽覺敏感度。推論支持
證據與來源

Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and are ubiquitously expressed in all eukaryotic cells. May play a role in the repair of noise-induced stereocilia gaps thereby maintains hearing sensitivity following loud noise damage (By similarity)

PMID 29581253 ↗

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分子活性ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)

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交互作用球狀 actin(G-actin)聚合可形成雙股螺旋狀的絲狀 actin(F-actin),每個 actin 可與另外四個 actin 結合。資料亦指出 actin 與 TWF1、CAPZB、cofilin 及 profilin 有交互作用。含實驗來源
證據與來源

Polymerization of globular actin (G-actin) leads to a structural filament (F-actin) in the form of a two-stranded helix. Each actin can bind to 4 others. Interacts with TWF1, CAPZB, cofilin and profilin

PMID 28493397 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位actin gamma 1 的細胞內定位標示為細胞質與細胞骨架。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

PMID 28493397 ↗

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疾病關聯常染色體顯性耳聾 20(DFNA20)是一種非症候群型感音神經性聽力損失;感音神經性耳聾可涉及內耳神經受器、通往大腦的神經路徑,或接收聲音資訊的腦區受損。此病被記載為由影響 ACTG1 的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Deafness, autosomal dominant, 20 DFNA20 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 604717

PMID 13680526 ↗ · PMID 14684684 ↗ · PMID 16773128 ↗ · PMID 18804074 ↗ · PMID 19477959 ↗ · PMID 22938506 ↗ · PMID 25388789 ↗ · PMID 3472224 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Baraitser-Winter syndrome 2(BRWS2)是罕見發育障礙,特徵可包括先天性眼瞼下垂、高弓眉、眼距過寬、眼 colobomata,以及以前部較明顯的無腦回畸形。其他典型表現包括出生後身材矮小、小頭症、智能障礙、癲癇與聽力損失;此病被記載為與影響 ACTG1 的變異有關。含實驗來源
證據與來源

Baraitser-Winter syndrome 2 BRWS2 A rare developmental disorder characterized by the combination of congenital ptosis, high-arched eyebrows, hypertelorism, ocular colobomata, and a brain malformation consisting of anterior-predominant lissencephaly. Other typical features include postnatal short stature and microcephaly, intellectual disability, seizures, and hearing loss. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614583

PMID 22366783 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯有一名帶有 ACTG1 缺陷的患者出現單純性 coloboma,即因視杯與視柄形態發育異常及胎裂(視裂)融合而缺少眼部結構。單純性 coloboma 可能伴隨小眼症或小角膜;此筆資料描述的是患者個案。含實驗來源
證據與來源

Defects in ACTG1 has been found in a patient with isolated coloboma, a defect of the eye characterized by the absence of ocular structures due to abnormal morphogenesis of the optic cup and stalk, and the fusion of the fetal fissure (optic fissure). Isolated colobomas may be associated with an abnormally small eye (microphthalmia) or small cornea

PMID 28493397 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000573283 · 1,919 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCAGTCGCCGCTGCCAGCTCTCGCACTCTGTTCTTCCGC40
41CGCTCCGCCGTCGCGTTTCTCTGCCGGTCGCAATGGAAGA80
81AGAGATCGCCGCGCTGGTCATTGACAATGGCTCCGGCATG120
121TGCAAAGCTGGTTTTGCTGGGGACGACGCTCCCCGAGCCG160
161TGTTTCCTTCCATCGTCGGGCGCCCCAGACACCAGGGCGT200
201CATGGTGGGCATGGGCCAGAAGGACTCCTACGTGGGCGAC240
241GAGGCCCAGAGCAAGCGTGGCATCCTGACCCTGAAGTACC280
281CCATTGAGCATGGCATCGTCACCAACTGGGACGACATGGA320
321GAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAACGAGCTGCGCGTG360
361GCCCCGGAGGAGCACCCAGTGCTGCTGACCGAGGCCCCCC400
401TGAACCCCAAGGCCAACAGAGAGAAGATGACTCAGATTAT440
441GTTTGAGACCTTCAACACCCCGGCCATGTACGTGGCCATC480
481CAGGCCGTGCTGTCCCTCTACGCCTCTGGGCGCACCACTG520
521GCATTGTCATGGACTCTGGAGACGGGGTCACCCACACGGT560
561GCCCATCTACGAGGGCTACGCCCTCCCCCACGCCATCCTG600
601CGTCTGGACCTGGCTGGCCGGGACCTGACCGACTACCTCA640
641TGAAGATCCTCACTGAGCGAGGCTACAGCTTCACCACCAC680
681GGCCGAGCGGGAAATCGTGCGCGACATCAAGGAGAAGCTG720
721TGCTACGTCGCCCTGGACTTCGAGCAGGAGATGGCCACCG760
761CCGCATCCTCCTCTTCTCTGGAGAAGAGCTACGAGCTGCC800
801CGATGGCCAGGTCATCACCATTGGCAATGAGCGGTTCCGG840
841TGTCCGGAGGCGCTGTTCCAGCCTTCCTTCCTGGGTATGG880
881AATCTTGCGGCATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCAT920
921GAAGTGTGACGTGGACATCCGCAAAGACCTGTACGCCAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。