演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACTC1CMD1R

actin alpha cardiac muscle 1

ACTC1 編碼 actin alpha cardiac muscle 1,屬於高度保守的 actin 家族;actin 參與多種細胞運動,並存在於所有真核細胞。

Homo sapiens15q14UniProt P68032
OFFICIAL SYMBOL
ACTC1
CHROMOSOME
15
UNIPROT
P68032
PDB / ALPHAFOLD
9B3Q
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACTC1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 actin alpha cardiac muscle 1。其產物屬於高度保守的 actin 家族;actin 廣泛存在於真核細胞,並與多種細胞運動相關。就現有資料而言,這些資訊界定了 ACTC1 產物的家族歸屬與基本生物學範疇,但未提供其序列長度、胺基酸組成或其他特定結構細節。

Official symbol
ACTC1
Gene name
actin alpha cardiac muscle 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:143
UniProt
P68032
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CMD1RACTC

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q14
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegACTC1pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr15:34,790,107–34,795,912
Gene span
5,806 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000290378 ★34,790,230–34,795,5497
ENST0000086840534,790,224–34,795,5496
ENST0000071361334,790,225–34,795,7178
ENST0000086840634,790,225–34,795,7177
ENST0000086840734,790,225–34,795,7176
ENST0000086840834,790,225–34,795,7177
ENST0000092092034,790,225–34,795,7177
ENST0000110290834,790,225–34,795,7177
ENST0000095368934,790,229–34,795,7177
ENST0000071361534,790,230–34,795,7177
ENST0000071361634,790,230–34,795,7176
ENST0000113446734,790,230–34,795,7177

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ACTC1 的產物屬於 actin 蛋白家族。來源指出,actin 是高度保守的蛋白質,參與多種細胞運動,且普遍存在於真核細胞中。這些描述支持其與細胞運動相關的廣泛功能定位;但資料未進一步列明 ACTC1 在特定運動形式中的作用,也未提供其在不同細胞或組織中的功能差異。

actin 可由球狀 actin(G-actin)聚合形成絲狀 actin(F-actin)。形成的 F-actin 呈雙股螺旋狀結構,說明 actin 除了以球狀形式存在,也能組裝成具有特定排列的結構性絲狀物。來源描述的是 actin 的聚合與構型,未指出此過程在何種細胞條件下發生,或 ACTC1 是否具有不同於其他 actin 的聚合特性。

每個 actin 分子可與另外四個 actin 結合,這項描述提供了 actin 組裝時分子間關聯的資訊。結合與聚合共同構成 G-actin 轉變為 F-actin 的結構基礎;然而,現有資料未說明各結合位置、反應步驟或調控因子,因此不宜據此推定更細緻的分子機制。

來源亦列出 ATP 水解反應:ATP 與水反應生成 ADP、磷酸與氫離子。此項酵素活性資訊呈現 actin 相關的核苷酸轉化反應,但資料沒有進一步交代反應與聚合、細胞運動或特定生理過程之間的直接關係。綜合而言,現有證據支持 actin 具有廣泛的細胞運動關聯、可聚合形成雙股螺旋絲狀結構,並涉及所列 ATP 水解反應;更具體的 ACTC1 專一功能仍未由這些資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 34795549 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACTC1 ENST00000290378 GRCh38 chr15:34795449-34796549 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTTGCTATGTTCTCCATCAAAGTATTTGCCTTTGCAGTCTTGTCTCCACCTGGAGTGAGGGCCTCTGCC
CCCAGTTTAAAGATGCTCATCTCCCCACCATCAAGTGGGCAAGCTACTTTTGGCATTTGTTCCTTTATTC
ACTTTGGCAGCAGGGGATCCTTTTCTGGCCTGAAGACCAGAGTCTGAATTTGAGCAAAACCCTGCAGCAT
GGATGAGGGCTACCCAATAACTGGGCTGGGGTAAACCTGGTCCCTTCTCCAGCAAGACTTGGCCAAGCTC
TCACAGAAACCCTTTTCTGACTCTTCCCTGGCCAGACCCTGATCCATGCATGGGTTGGAACTCGGGTGGC
CTTGGTTAATCTCAGCTTTCTGACCTAGATGAGCCCAGCACCAGCTCTCTGAGTAAAGCCATTCAGGCTG
GCGGGGACTAGACCAGAAGGGTGCCCTGTCCTGGGTGCCCCTTTTGCAGCCACTCAGATGTGCTGCTGCG
GTGTCCTTTGTGCTGGTGGCAGCCCTGGAAGATGAGAAGCCGCTGTTGCTCCCCTGCTGCCCTGGCCCAG
CTGTCAGGACCCCTCAGCAGAGGGCAGGGCGCCAAGCCTTCCCACTGCATGTGGCTTATTGTCCCCAAGG
CTGGCAGGGCTGCGGAGGACCGAATCCACAGACCATCCAGGGAGCACCCACACCCCAGAAAGGGGGAGGG
GTGGGCTGGCGTCACTTAGTCTTCCCCTGCCCCCTACCCTTCAGCGCCTGCCCCTCCCCAGCTCCCTATT
TGGCCATCCCCCTGACTGCCCCCTCCCCTTCCTTACATGGTCTGGGGGCTCCCTGGCTGATCCTCTCCCC
TGCCCTTGGCTCCATGAATGGCCTCGGCAGTCCTAGCGGGTGCGAAGGGGACCAAATAAGGCAAGGTGGC
AGACCGGGCCCCCCACCCCTGCCCCCGGCTGCTCCAACTGACCCTGTCCATCAGCGTTCTATAAAGCGGC
CCTCCTGGAGCCAGCCACCCAGAGCCCGCTGCCGCCGGAGCCGAGCCGACCCGCCCCGCCGACGGTGAGT
CAGCGCCCGGCCCTCCGCGTTCACTCCTCGCCTGGTCCGCGGGCCGCGCCG
ACTC1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACTC1_1 ↗15:34,795,549負股34,795,539–34,795,598

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_832LQH · enhancer · 34793989–34794236 · regulatory

ENSR15_B8WG2 · enhancer · 34794792–34795332 · regulatory

ENSR15_B8WG4 · promoter · 34795333–34796039 · regulatory

ENSR15_9HRWL · enhancer · 34796895–34797276 · regulatory

ENSR15_C5G8C · enhancer · 34799093–34800204 · regulatory

ENSR15_9HRXL · enhancer · 34800487–34800766 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:377 aa

ACTC1 的蛋白質產物屬於 actin 家族。現有資料未提供特定結構域、功能區域或序列註解,因此無法進一步描述其蛋白質結構細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9B3Q…

PDB · 9B3Q

EM · 3.60 A · A/D/E=1-377

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

ACTC1 蛋白質定位於細胞質與細胞骨架。 來源未提供定位變化的條件、細胞狀態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CMD1RACTC1CFL1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

球狀 actin(G-actin)聚合後形成雙股螺旋狀的絲狀 actin(F-actin)。來源指出,每個 actin 可與另外四個 actin 結合;這描述的是 actin 間的結合與聚合關係,未列出其他結合夥伴或複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 ACTC1 的變異與數種心臟疾病相關。擴張型心肌病 1R 的特徵包括心室擴大與收縮功能受損,可導致充血性心衰竭及心律不整,並有早逝風險。家族性肥厚型心肌病 11 通常呈不對稱心室肥厚,常涉及心室中隔;症狀可包括呼吸困難、昏厥、心悸及胸痛,且可能由運動誘發,嚴重程度可由良性至惡性,並有心衰竭與猝死風險。此外,影響 ACTC1 的變異也與先天性心房中隔缺損 5 相關,其特徵為左右心房間隔未完全閉合,造成血流由左心房流向右心房。來源將這些疾病歸因於影響該基因的變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Actin 是高度保守的蛋白質,參與多種細胞運動,並廣泛存在於所有真核細胞。資料庫紀錄
證據與來源

Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and are ubiquitously expressed in all eukaryotic cells

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)

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交互作用球狀 actin(G-actin)聚合後會形成絲狀 actin(F-actin),其結構呈雙股螺旋;每個 actin 可與另外四個 actin 結合。資料庫紀錄
證據與來源

Polymerization of globular actin (G-actin) leads to a structural filament (F-actin) in the form of a two-stranded helix. Each actin can bind to 4 others

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細胞定位ACTC1 蛋白質定位於細胞質與細胞骨架。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

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疾病關聯影響 ACTC1 的變異與擴張型心肌病 1R 相關。此病以心室擴大及收縮功能受損為特徵,可導致充血性心衰竭與心律不整,患者有早逝風險。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, dilated, 1R CMD1R A disorder characterized by ventricular dilation and impaired systolic function, resulting in congestive heart failure and arrhythmia. Patients are at risk of premature death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613424

PMID 9563954 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 ACTC1 的變異與家族性肥厚型心肌病 11 相關。此遺傳性心臟病通常造成不對稱心室肥厚,常涉及心室中隔;症狀可包括呼吸困難、昏厥、倒下、心悸與胸痛,且可由運動誘發。疾病嚴重程度在家族內及家族間不一,從良性至惡性,並可能有心衰竭與猝死的高風險。含實驗來源
證據與來源

Cardiomyopathy, familial hypertrophic, 11 CMH11 A hereditary heart disorder characterized by ventricular hypertrophy, which is usually asymmetric and often involves the interventricular septum. The symptoms include dyspnea, syncope, collapse, palpitations, and chest pain. They can be readily provoked by exercise. The disorder has inter- and intrafamilial variability ranging from benign to malignant forms with high risk of cardiac failure and sudden cardiac death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612098

PMID 10330430 ↗ · PMID 10966831 ↗ · PMID 14729850 ↗ · PMID 18403758 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 ACTC1 的變異與先天性心房中隔缺損 5 相關。此心臟畸形源於心房間隔未完全閉合,造成血液由左心房流向右心房。含實驗來源
證據與來源

Atrial septal defect 5 ASD5 A congenital heart malformation characterized by incomplete closure of the wall between the atria resulting in blood flow from the left to the right atria. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612794

PMID 17947298 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000290378 · 1,382 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGAGCCCGCTGCCGCCGGAGCCGAGCCGACCCGCCCCGCC40
41GACGAACCCCCTGAAGCTGTGCCAAGATGTGTGACGACGA80
81GGAGACCACCGCCCTGGTGTGCGACAACGGCTCTGGGCTG120
121GTGAAGGCCGGCTTTGCGGGCGATGACGCGCCCCGCGCTG160
161TCTTCCCGTCCATCGTGGGCCGCCCGCGGCACCAGGGAGT200
201TATGGTGGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTAGGTGAT240
241GAAGCCCAGAGCAAGAGAGGCATCCTGACCCTGAAGTATC280
281CCATCGAGCATGGTATCATCACCAACTGGGACGACATGGA320
321GAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAGCTCCGTGTG360
361GCTCCCGAGGAGCACCCCACCCTGCTCACAGAGGCCCCGC400
401TGAACCCCAAGGCCAACCGGGAGAAGATGACTCAGATCAT440
441GTTTGAGACCTTCAATGTCCCTGCCATGTACGTGGCCATC480
481CAGGCAGTGCTATCCCTGTATGCTTCTGGCCGTACCACAG520
521GCATTGTTCTGGACTCTGGGGATGGTGTAACTCACAATGT560
561CCCCATCTATGAGGGCTACGCTTTGCCCCATGCCATCATG600
601CGTCTGGATCTGGCTGGTCGGGACCTCACTGACTACCTCA640
641TGAAGATCCTCACTGAGCGTGGCTACTCCTTTGTCACCAC680
681TGCTGAACGTGAAATTGTCCGTGACATTAAAGAGAAGCTG720
721TGCTATGTCGCCCTGGATTTTGAGAATGAGATGGCCACAG760
761CTGCCTCTTCCTCCTCCCTGGAGAAGAGCTATGAACTGCC800
801TGATGGCCAAGTCATCACTATTGGCAATGAGCGCTTCCGC840
841TGTCCTGAGACACTCTTCCAGCCCTCCTTCATTGGTATGG880
881AATCTGCTGGCATCCATGAAACAACTTACAATAGCATCAT920
921GAAGTGTGACATTGATATCCGCAAGGACCTGTATGCCAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。