演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACTA2ACTSA

actin alpha 2, smooth muscle

ACTA2 編碼平滑肌 α-actin,屬於 actin 家族;actin 蛋白參與細胞運動,並可形成絲狀結構。

Homo sapiens10q23.31UniProt P62736
OFFICIAL SYMBOL
ACTA2
CHROMOSOME
10
UNIPROT
P62736
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACTA2(actin alpha 2, smooth muscle)是蛋白質編碼基因,其產物屬於高度保守的 actin 家族。Actin 在真核細胞中普遍存在,並與多種細胞運動形式相關。此來源將 ACTA2 的產物歸入 actin 家族,並指出 actin 可由球狀形式組成絲狀結構;這些基本特性構成理解其分子性質的背景。

Official symbol
ACTA2
Gene name
actin alpha 2, smooth muscle
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:130
UniProt
P62736
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ACTSA

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q23.31
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegACTA2pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:88,934,815–88,991,339
Gene span
56,525 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000224784 ★88,935,074–88,952,7739
ENST0000071359788,934,822–88,952,85810
ENST0000071359888,934,822–88,952,8589
ENST0000071359988,934,822–88,952,8589
ENST0000045815988,934,822–88,991,3329
ENST0000071360088,934,822–88,952,8588
ENST0000071360188,934,822–88,952,8588
ENST0000071360288,934,822–88,991,33210
ENST0000041555788,934,822–88,991,3399
ENST0000090337588,934,822–88,952,85810
ENST0000090337688,934,822–88,952,8588
ENST0000090337788,934,822–88,949,1628

顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ACTA2 的產物屬於 actin 蛋白家族。來源指出,actin 參與多種細胞運動形式,並廣泛存在於真核細胞中;因此,這類蛋白與細胞運動相關的基本特性,是理解 ACTA2 產物功能的主要依據。

Actin 可在球狀形式(G-actin)聚合後形成絲狀 actin(F-actin)。F-actin 的結構為雙股螺旋,顯示 actin 單體能組成具特定形態的聚合絲。來源並指出,每個 actin 可與另外四個 actin 結合;此描述說明了 actin 組成絲狀結構時的分子排列關係。

來源列出的反應為 ATP 與水生成 ADP、磷酸及氫離子,表示 actin 相關的 ATP 水解反應。此反應資訊與 G-actin 聚合形成 F-actin 的結構描述,分別提供其分子反應與組裝性質的資料;來源未進一步說明 ATP 水解與聚合之間的具體關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 88952773 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACTA2 ENST00000224784 GRCh38 chr10:88952673-88953773 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGTGAGAACTCACTCACTTTCATGAGAACAGCATGGGAGAAAACGCCCCCATGATCCAGTCACCTCCCAC
CTAGCCTTTCTCTGGACATGGGATTATGGAGATTAGAATTCGAGACGAGATTTGGGTGGGGACGTAGAAC
CAAACCATATCACCTGGTCTCTCTACTTCCTGTCAAGGAGGTTAGTGGGCAGAGAGGAGGGCTACAGAGG
CTTCCTTTGAACAATCTCCTTTCTTTTCCAAACTACTTCTTTGACAGGCTGCTGGGTAGACTCTCTGGTC
AAAGGATGGTCCCTACTTATGCTGCTAAATTGCTCGGTGACAAATTAGTAGACAAAGCTAATGCACCAAA
AAAATGAATGTAGTTATAGTAATGCTAACATCCAAATTCCTCTTTGTAAGACATAGGCCTGTCAACCTTG
TCTCCATACTTCAATTCCTATTTCCACTCACCTCCCTCAAGAACTTGATTTATAAACAGTGTGCCTACCA
TAAAATCATCACTCCCTCTATGTATTTATAGACGACTGAAGGAATATCTTTCTTCTTTGCATGCTACCGT
GGTAGAAGGGTTTTAAAAGTCCGTGCTAGGCAGAGGCAGCCCTTTCTGCCCCTTTCTGTTCTCAGTTTAT
TAGGAAATGGCCTGAAATTCCAGCATGATAGCAAGCTGGCATCCTCTGTGGAATGTGCAAACCATGCCTG
CATCTGCCCATTACCCTAGCTCAGTGTCTCTGGGCATTTCTGCAGTTGTTCTGAAGGCTTGGCGTGTTTA
TCTCCCACAGGCGGCTGAACCGCCTCCCGTTTCATGAGCAGACCAGTGGAATGCAGTGGAAGAGACCCAG
GCCTCCGGCCACCCAGATTAGAGAGTTTTGTGCTGAGGTCCCTATATGGTTGTGTTAGACTGAACGACAG
GCTCAAGTCTGTCTTTGCTCCTTGTTTGGGAAGCAAGTGGGAGGAGAGCAGGCCAAGGGGCTATATAACC
CTTCAGCTTTCAGCTTCCCTGAACACCACCCAGTGTGGAGCAGCCCAGCCAAGCACTGTCAGGGTAAGTG
GCGCCAGGCCAAGGATGTGACTTATAGATTCCAGTGGCTCTTTTAATTACC
ACTA2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACTA2_1 ↗10:88,952,773負股88,952,763–88,952,822
ACTA2_2 ↗10:88,991,332負股88,991,322–88,991,381

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_93BB92 · enhancer · 88950331–88950730 · regulatory

ENSR10_CBSBK · enhancer · 88950986–88952229 · regulatory

ENSR10_84LLK8 · enhancer · 88952553–88952762 · regulatory

ENSR10_93BB9P · promoter · 88952763–88953232 · regulatory

· motif · 88951659–88951674 · motif

· motif · 88951659–88951674 · motif

· motif · 88951766–88951776 · motif

· motif · 88951816–88951831 · motif

· motif · 88951816–88951831 · motif

ACTA2 表現會在腸病毒71型(enterovirus 71,EV71)感染的反應中上調;來源未提供其他調控條件或其作用機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:377 aa

ACTA2 的蛋白質產物屬於 actin 家族。來源未提供更詳細的結構域或序列區域註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P62736…

AlphaFold · P62736

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton

ACTA2 蛋白質位於細胞質與細胞骨架;來源未描述其定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ACTSAACTA2GM2AMAP1LC3CSCGB1A1TCP11L2YIPF2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源描述的是 actin 的聚合與結構關係:球狀 actin(G-actin)聚合形成雙股螺旋狀的絲狀 actin(F-actin),且每個 actin 可與另外四個 actin 結合。這是 actin 分子彼此組裝的描述,未提供其他特定結合夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ACTA2 變異與多種血管疾病、早發性冠狀動脈疾病、早發性缺血性中風及 Moyamoya disease 有關。資料亦將特定 ACTA2 變異列為家族性胸主動脈瘤 6、Moyamoya disease 5 與平滑肌功能障礙症候群的致病原因;這些疾病關聯應依各疾病條目的變異證據理解。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

9 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 9 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Actin 是高度保守的蛋白質,參與多種細胞運動形式,並普遍存在於所有真核細胞中。資料庫紀錄
證據與來源

Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and are ubiquitously expressed in all eukaryotic cells

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用球狀 actin(G-actin)聚合後會形成結構性的絲狀 actin(F-actin),其形態為雙股螺旋;每個 actin 可與另外四個 actin 結合。資料庫紀錄
證據與來源

Polymerization of globular actin (G-actin) leads to a structural filament (F-actin) in the form of a two-stranded helix. Each actin can bind to 4 others

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ACTA2 蛋白質的定位記錄為細胞質與細胞骨架。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton

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調控腸病毒71型(EV71)感染時,ACTA2 表現會上調。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in response to enterovirus 71 (EV71) infection

PMID 16548883 ↗

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疾病關聯ACTA2 變異與多種不同類型的血管疾病相關,也使患者易罹患早發性冠狀動脈疾病、早發性缺血性中風及 Moyamoya disease;此處描述的是易感關聯。含實驗來源
證據與來源

ACTA2 mutations predispose patients to a variety of diffuse and diverse vascular diseases, premature onset coronary artery disease (CAD), premature ischemic strokes and Moyamoya disease

PMID 19409525 ↗

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疾病關聯家族性胸主動脈瘤 6(AAT6)以胸主動脈永久性擴張為特徵,通常與主動脈壁退化有關。其組織學表現可見「中膜壞死」或 Erdheim 囊性中膜壞死,包括彈性纖維退化與斷裂、平滑肌細胞減少,以及嗜鹼性基質物質堆積。此病由影響該基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Aortic aneurysm, familial thoracic 6 AAT6 A disease characterized by permanent dilation of the thoracic aorta usually due to degenerative changes in the aortic wall. It is primarily associated with a characteristic histologic appearance known as 'medial necrosis' or 'Erdheim cystic medial necrosis' in which there is degeneration and fragmentation of elastic fibers, loss of smooth muscle cells, and an accumulation of basophilic ground substance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 611788

PMID 17994018 ↗ · PMID 19409525 ↗ · PMID 19639654 ↗

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疾病關聯Moyamoya disease 5(MYMY5)是進行性腦血管病變,特徵包括雙側顱內頸動脈狹窄及基底核區域的毛細血管擴張樣血管,腦血管攝影呈「煙霧」樣。患者可能出現短暫性腦缺血發作、腦梗塞或側枝血管破裂所致的顱內出血;兒童常見突發偏癱與癲癇,成人較常有蛛網膜下腔出血。此病由影響該基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Moyamoya disease 5 MYMY5 A progressive cerebral angiopathy characterized by bilateral intracranial carotid artery stenosis and telangiectatic vessels in the region of the basal ganglia. The abnormal vessels resemble a 'puff of smoke' (moyamoya) on cerebral angiogram. Affected individuals can develop transient ischemic attacks and/or cerebral infarction, and rupture of the collateral vessels can cause intracranial hemorrhage. Hemiplegia of sudden onset and epileptic seizures constitute the prevailing presentation in childhood, while subarachnoid bleeding occurs more frequently in adults. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614042

PMID 20970362 ↗

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疾病關聯平滑肌功能障礙症候群(SMDYS)為常染色體顯性疾病,涉及全身平滑肌細胞功能障礙,可導致主動脈與腦血管疾病、瞳孔固定散大、低張力膀胱、腸旋轉不良、腸道蠕動減弱及肺動脈高壓。此病由影響該基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Smooth muscle dysfunction syndrome SMDYS An autosomal dominant syndrome characterized by dysfunction of smooth muscle cells throughout the body, leading to aortic and cerebrovascular disease, fixed dilated pupils, hypotonic bladder, malrotation, and hypoperistalsis of the gut and pulmonary hypertension. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613834

PMID 20734336 ↗ · PMID 27481187 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 9 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000224784 · 1,349 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAACACCACCCAGTGTGGAGCAGCCCAGCCAAGCACTGTC40
41AGGAATCCTGTGAAGCAGCTCCAGCTATGTGTGAAGAAGA80
81GGACAGCACTGCCTTGGTGTGTGACAATGGCTCTGGGCTC120
121TGTAAGGCCGGCTTTGCTGGGGACGATGCTCCCAGGGCTG160
161TTTTCCCATCCATTGTGGGACGTCCCAGACATCAGGGGGT200
201GATGGTGGGAATGGGACAAAAAGACAGCTACGTGGGTGAC240
241GAAGCACAGAGCAAAAGAGGAATCCTGACCCTGAAGTACC280
281CGATAGAACATGGCATCATCACCAACTGGGACGACATGGA320
321AAAGATCTGGCACCACTCTTTCTACAATGAGCTTCGTGTT360
361GCCCCTGAAGAGCATCCCACCCTGCTCACGGAGGCACCCC400
401TGAACCCCAAGGCCAACCGGGAGAAAATGACTCAAATTAT440
441GTTTGAGACTTTCAATGTCCCAGCCATGTATGTGGCTATC480
481CAGGCGGTGCTGTCTCTCTATGCCTCTGGACGCACAACTG520
521GCATCGTGCTGGACTCTGGAGATGGTGTCACCCACAATGT560
561CCCCATCTATGAGGGCTATGCCTTGCCCCATGCCATCATG600
601CGTCTGGATCTGGCTGGCCGAGATCTCACTGACTACCTCA640
641TGAAGATCCTGACTGAGCGTGGCTATTCCTTCGTTACTAC680
681TGCTGAGCGTGAGATTGTCCGGGACATCAAGGAGAAACTG720
721TGTTATGTAGCTCTGGACTTTGAAAATGAGATGGCCACTG760
761CCGCATCCTCATCCTCCCTTGAGAAGAGTTACGAGTTGCC800
801TGATGGGCAAGTGATCACCATCGGAAATGAACGTTTCCGC840
841TGCCCAGAGACCCTGTTCCAGCCATCCTTCATCGGGATGG880
881AGTCTGCTGGCATCCATGAAACCACCTACAACAGCATCAT920
921GAAGTGTGATATTGACATCAGGAAGGACCTCTATGCTAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。